data_6VG4 # _model_server_result.job_id 3j8K5mUFGbqRkrYsm1lfxA _model_server_result.datetime_utc '2024-12-26 22:25:29' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6vg4 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"U","auth_seq_id":720}' # _entry.id 6VG4 # _exptl.entry_id 6VG4 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 180.156 _entity.id 5 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description alpha-D-mannopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 3 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6VG4 _cell.length_a 84.087 _cell.length_b 84.087 _cell.length_c 543.917 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6VG4 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 92 _symmetry.space_group_name_Hall 'P 4abw 2nw' _symmetry.space_group_name_H-M 'P 41 21 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 5 S N N ? 5 T N N ? 5 U N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 2 oligosaccharide 3 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 2 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 3 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 3 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 2 n B NAG 1 B 1 NAG A 700 NAG 2 n B NAG 2 B 2 NAG A 701 NAG 3 n C NAG 1 C 1 NAG D 666 NAG 3 n C NAG 2 C 2 NAG D 667 NAG 3 n C BMA 3 C 3 BMA D 668 BMA # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 68 A CYS 68 1_555 A SG CYS 74 A CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? covale ? covale1 A OG1 THR 214 A THR 214 1_555 S C1 MAN . A MAN 718 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale2 A OG1 THR 216 A THR 216 1_555 T C1 MAN . A MAN 719 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 256 A ASN 256 1_555 C C1 NAG . C NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 540 A ASN 540 1_555 B C1 NAG . B NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale5 A OG SER 652 A SER 652 1_555 U C1 MAN . A MAN 720 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale6 B O4 NAG . B NAG 1 1_555 B C1 NAG . B NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale7 C O4 NAG . C NAG 1 1_555 C C1 NAG . C NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? covale ? covale8 C O4 NAG . C NAG 2 1_555 C C1 BMA . C BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? metalc ? metalc1 A OE1 GLU 9 A GLU 9 1_555 D CA CA . A CA 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.387 ? metalc ? metalc2 A OE2 GLU 9 A GLU 9 1_555 E CA CA . A CA 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.348 ? metalc ? metalc3 A OE1 GLU 10 A GLU 10 1_555 D CA CA . A CA 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.379 ? metalc ? metalc4 A OD1 ASP 63 A ASP 63 1_555 D CA CA . A CA 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.34 ? metalc ? metalc5 A OE2 GLU 65 A GLU 65 1_555 D CA CA . A CA 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.373 ? metalc ? metalc6 A OE1 GLU 65 A GLU 65 1_555 E CA CA . A CA 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.359 ? metalc ? metalc7 A OE2 GLU 65 A GLU 65 1_555 E CA CA . A CA 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.031 ? metalc ? metalc8 A OD1 ASP 97 A ASP 97 1_555 E CA CA . A CA 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.374 ? metalc ? metalc9 A O ILE 98 A ILE 98 1_555 E CA CA . A CA 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? metalc ? metalc10 A OD1 ASN 99 A ASN 99 1_555 F CA CA . A CA 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.479 ? metalc ? metalc11 A OD2 ASP 100 A ASP 100 1_555 D CA CA . A CA 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? metalc ? metalc12 A OD1 ASP 100 A ASP 100 1_555 E CA CA . A CA 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.365 ? metalc ? metalc13 A O ASN 101 A ASN 101 1_555 F CA CA . A CA 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.332 ? metalc ? metalc14 A OE1 GLU 116 A GLU 116 1_555 G CA CA . A CA 706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.35 ? metalc ? metalc15 A OE2 GLU 116 A GLU 116 1_555 H CA CA . A CA 707 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.403 ? metalc ? metalc16 A OD1 ASP 131 A ASP 131 1_555 F CA CA . A CA 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.52 ? metalc ? metalc17 A OD2 ASP 131 A ASP 131 1_555 F CA CA . A CA 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? metalc ? metalc18 A OD1 ASP 133 A ASP 133 1_555 E CA CA . A CA 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.393 ? metalc ? metalc19 A OD2 ASP 133 A ASP 133 1_555 F CA CA . A CA 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.408 ? metalc ? metalc20 A O ASN 137 A ASN 137 1_555 F CA CA . A CA 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.43 ? metalc ? metalc21 A OD1 ASP 173 A ASP 173 1_555 G CA CA . A CA 706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.345 ? metalc ? metalc22 A OE2 GLU 175 A GLU 175 1_555 G CA CA . A CA 706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.442 ? metalc ? metalc23 A OE1 GLU 175 A GLU 175 1_555 H CA CA . A CA 707 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.37 ? metalc ? metalc24 A OD2 ASP 188 A ASP 188 1_555 F CA CA . A CA 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.446 ? metalc ? metalc25 A OD1 ASP 225 A ASP 225 1_555 H CA CA . A CA 707 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.339 ? metalc ? metalc26 A O SER 226 A SER 226 1_555 H CA CA . A CA 707 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.443 ? metalc ? metalc27 A OD1 ASN 227 A ASN 227 1_555 I CA CA . A CA 708 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.397 ? metalc ? metalc28 A OD2 ASP 228 A ASP 228 1_555 G CA CA . A CA 706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.333 ? metalc ? metalc29 A OD1 ASP 228 A ASP 228 1_555 H CA CA . A CA 707 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.289 ? metalc ? metalc30 A O ASN 229 A ASN 229 1_555 I CA CA . A CA 708 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.474 ? metalc ? metalc31 A OE1 GLU 244 A GLU 244 1_555 J CA CA . A CA 709 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.402 ? metalc ? metalc32 A OE2 GLU 244 A GLU 244 1_555 K CA CA . A CA 710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.354 ? metalc ? metalc33 A OD1 ASP 259 A ASP 259 1_555 I CA CA . A CA 708 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.547 ? metalc ? metalc34 A OD2 ASP 259 A ASP 259 1_555 I CA CA . A CA 708 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? metalc ? metalc35 A OD1 ASP 261 A ASP 261 1_555 H CA CA . A CA 707 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.335 ? metalc ? metalc36 A OD2 ASP 261 A ASP 261 1_555 I CA CA . A CA 708 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.443 ? metalc ? metalc37 A O ASN 265 A ASN 265 1_555 I CA CA . A CA 708 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.376 ? metalc ? metalc38 A OD1 ASP 300 A ASP 300 1_555 J CA CA . A CA 709 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.342 ? metalc ? metalc39 A OE1 GLU 302 A GLU 302 1_555 J CA CA . A CA 709 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.446 ? metalc ? metalc40 A OE1 GLU 302 A GLU 302 1_555 K CA CA . A CA 710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.195 ? metalc ? metalc41 A OE2 GLU 302 A GLU 302 1_555 K CA CA . A CA 710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.34 ? metalc ? metalc42 A OD2 ASP 315 A ASP 315 1_555 I CA CA . A CA 708 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.43 ? metalc ? metalc43 A OD1 ASP 333 A ASP 333 1_555 K CA CA . A CA 710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.378 ? metalc ? metalc44 A O ALA 334 A ALA 334 1_555 K CA CA . A CA 710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.565 ? metalc ? metalc45 A OD1 ASN 335 A ASN 335 1_555 L CA CA . A CA 711 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.437 ? metalc ? metalc46 A OD2 ASP 336 A ASP 336 1_555 J CA CA . A CA 709 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? metalc ? metalc47 A OD1 ASP 336 A ASP 336 1_555 K CA CA . A CA 710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? metalc ? metalc48 A O ASN 337 A ASN 337 1_555 L CA CA . A CA 711 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.399 ? metalc ? metalc49 A OE1 GLU 352 A GLU 352 1_555 M CA CA . A CA 712 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.466 ? metalc ? metalc50 A OE2 GLU 352 A GLU 352 1_555 N CA CA . A CA 713 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? metalc ? metalc51 A OD1 ASP 367 A ASP 367 1_555 L CA CA . A CA 711 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.493 ? metalc ? metalc52 A OD2 ASP 367 A ASP 367 1_555 L CA CA . A CA 711 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.421 ? metalc ? metalc53 A OD1 ASP 369 A ASP 369 1_555 K CA CA . A CA 710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? metalc ? metalc54 A OD2 ASP 369 A ASP 369 1_555 L CA CA . A CA 711 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.423 ? metalc ? metalc55 A O ASN 373 A ASN 373 1_555 L CA CA . A CA 711 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.393 ? metalc ? metalc56 A OD1 ASP 405 A ASP 405 1_555 M CA CA . A CA 712 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.275 ? metalc ? metalc57 A OE1 GLU 407 A GLU 407 1_555 M CA CA . A CA 712 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? metalc ? metalc58 A OE1 GLU 407 A GLU 407 1_555 N CA CA . A CA 713 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.889 ? metalc ? metalc59 A OE2 GLU 407 A GLU 407 1_555 N CA CA . A CA 713 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.416 ? metalc ? metalc60 A OD2 ASP 420 A ASP 420 1_555 L CA CA . A CA 711 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.434 ? metalc ? metalc61 A OD1 ASP 438 A ASP 438 1_555 N CA CA . A CA 713 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.371 ? metalc ? metalc62 A O VAL 439 A VAL 439 1_555 N CA CA . A CA 713 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.289 ? metalc ? metalc63 A OD1 ASN 440 A ASN 440 1_555 O CA CA . A CA 714 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.422 ? metalc ? metalc64 A OD1 ASP 441 A ASP 441 1_555 M CA CA . A CA 712 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.998 ? metalc ? metalc65 A OD2 ASP 441 A ASP 441 1_555 M CA CA . A CA 712 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.271 ? metalc ? metalc66 A OD1 ASP 441 A ASP 441 1_555 N CA CA . A CA 713 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.356 ? metalc ? metalc67 A O ASN 442 A ASN 442 1_555 O CA CA . A CA 714 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.378 ? metalc ? metalc68 A OE2 GLU 457 A GLU 457 1_555 P CA CA . A CA 715 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.367 ? metalc ? metalc69 A OE1 GLU 457 A GLU 457 1_555 Q CA CA . A CA 716 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.507 ? metalc ? metalc70 A OD1 ASN 458 A ASN 458 1_555 P CA CA . A CA 715 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.675 ? metalc ? metalc71 A OD1 ASP 472 A ASP 472 1_555 O CA CA . A CA 714 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.459 ? metalc ? metalc72 A OD2 ASP 472 A ASP 472 1_555 O CA CA . A CA 714 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.232 ? metalc ? metalc73 A OD2 ASP 474 A ASP 474 1_555 N CA CA . A CA 713 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.412 ? metalc ? metalc74 A OD1 ASP 474 A ASP 474 1_555 O CA CA . A CA 714 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? metalc ? metalc75 A O ASN 478 A ASN 478 1_555 O CA CA . A CA 714 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.459 ? metalc ? metalc76 A OD1 ASP 515 A ASP 515 1_555 P CA CA . A CA 715 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.358 ? metalc ? metalc77 A OE1 GLU 517 A GLU 517 1_555 P CA CA . A CA 715 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.582 ? metalc ? metalc78 A OE2 GLU 517 A GLU 517 1_555 Q CA CA . A CA 716 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? metalc ? metalc79 A OD2 ASP 530 A ASP 530 1_555 O CA CA . A CA 714 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.448 ? metalc ? metalc80 A OD1 ASP 549 A ASP 549 1_555 Q CA CA . A CA 716 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.375 ? metalc ? metalc81 A O GLN 550 A GLN 550 1_555 Q CA CA . A CA 716 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.372 ? metalc ? metalc82 A OD1 ASN 551 A ASN 551 1_555 R CA CA . A CA 717 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.412 ? metalc ? metalc83 A OD2 ASP 552 A ASP 552 1_555 P CA CA . A CA 715 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.281 ? metalc ? metalc84 A OD1 ASP 552 A ASP 552 1_555 Q CA CA . A CA 716 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.388 ? metalc ? metalc85 A O ASN 553 A ASN 553 1_555 R CA CA . A CA 717 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.396 ? metalc ? metalc86 A OD1 ASP 590 A ASP 590 1_555 R CA CA . A CA 717 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.443 ? metalc ? metalc87 A OD2 ASP 590 A ASP 590 1_555 R CA CA . A CA 717 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.406 ? metalc ? metalc88 A OD1 ASP 592 A ASP 592 1_555 Q CA CA . A CA 716 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? metalc ? metalc89 A OD2 ASP 592 A ASP 592 1_555 R CA CA . A CA 717 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.418 ? metalc ? metalc90 A O ASN 596 A ASN 596 1_555 R CA CA . A CA 717 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.366 ? metalc ? metalc91 A OD2 ASP 645 A ASP 645 1_555 R CA CA . A CA 717 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.42 ? metalc ? metalc92 G CA CA . A CA 706 1_555 Y O HOH . A HOH 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.357 ? metalc ? metalc93 G CA CA . A CA 706 1_555 Y O HOH . A HOH 809 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.472 ? metalc ? metalc94 J CA CA . A CA 709 1_555 Y O HOH . A HOH 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.554 ? # _chem_comp.formula 'C6 H12 O6' _chem_comp.formula_weight 180.156 _chem_comp.id MAN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name alpha-D-mannopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, alpha linking' _chem_comp.pdbx_synonyms alpha-D-mannose;D-mannose;mannose # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 MAN sing 242 n n C1 O1 MAN sing 243 n n C1 O5 MAN sing 244 n n C1 H1 MAN sing 245 n n C2 C3 MAN sing 246 n n C2 O2 MAN sing 247 n n C2 H2 MAN sing 248 n n C3 C4 MAN sing 249 n n C3 O3 MAN sing 250 n n C3 H3 MAN sing 251 n n C4 C5 MAN sing 252 n n C4 O4 MAN sing 253 n n C4 H4 MAN sing 254 n n C5 C6 MAN sing 255 n n C5 O5 MAN sing 256 n n C5 H5 MAN sing 257 n n C6 O6 MAN sing 258 n n C6 H61 MAN sing 259 n n C6 H62 MAN sing 260 n n O1 HO1 MAN sing 261 n n O2 HO2 MAN sing 262 n n O3 HO3 MAN sing 263 n n O4 HO4 MAN sing 264 n n O6 HO6 MAN sing 265 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version MAN DManpa 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 MAN a-D-mannopyranose 'COMMON NAME' GMML 1 MAN a-D-Manp 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 MAN Man 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 6VG4 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.011892 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.011892 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.001839 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code D 4 CA A 1 703 1 CA CA . E 4 CA A 1 704 2 CA CA . F 4 CA A 1 705 3 CA CA . G 4 CA A 1 706 4 CA CA . H 4 CA A 1 707 5 CA CA . I 4 CA A 1 708 6 CA CA . J 4 CA A 1 709 7 CA CA . K 4 CA A 1 710 8 CA CA . L 4 CA A 1 711 9 CA CA . M 4 CA A 1 712 10 CA CA . N 4 CA A 1 713 11 CA CA . O 4 CA A 1 714 12 CA CA . P 4 CA A 1 715 13 CA CA . Q 4 CA A 1 716 14 CA CA . R 4 CA A 1 717 15 CA CA . S 5 MAN A 1 718 1 MAN MAN . T 5 MAN A 1 719 2 MAN MAN . U 5 MAN A 1 720 3 MAN MAN . V 6 TAM A 1 724 1 TAM TAM . W 7 CL A 1 725 1 CL CL . X 8 NA A 1 726 1 NA NA . Y 9 HOH A 1 801 3 HOH HOH . Y 9 HOH A 2 802 19 HOH HOH . Y 9 HOH A 3 803 18 HOH HOH . Y 9 HOH A 4 804 22 HOH HOH . Y 9 HOH A 5 805 15 HOH HOH . Y 9 HOH A 6 806 9 HOH HOH . Y 9 HOH A 7 807 12 HOH HOH . Y 9 HOH A 8 808 6 HOH HOH . Y 9 HOH A 9 809 2 HOH HOH . Y 9 HOH A 10 810 25 HOH HOH . Y 9 HOH A 11 811 13 HOH HOH . Y 9 HOH A 12 812 23 HOH HOH . Y 9 HOH A 13 813 21 HOH HOH . Y 9 HOH A 14 814 11 HOH HOH . Y 9 HOH A 15 815 5 HOH HOH . Y 9 HOH A 16 816 10 HOH HOH . Y 9 HOH A 17 817 4 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 MAN . . . U 5 6.831 15.978 87.762 1 122.08 ? C1 MAN 720 A 1 HETATM 2 C C2 MAN . . . U 5 6.559 16.081 86.24 1 119.63 ? C2 MAN 720 A 1 HETATM 3 C C3 MAN . . . U 5 5.438 17.095 85.97 1 119.94 ? C3 MAN 720 A 1 HETATM 4 C C4 MAN . . . U 5 4.234 16.886 86.914 1 119.19 ? C4 MAN 720 A 1 HETATM 5 C C5 MAN . . . U 5 4.722 16.807 88.366 1 138.19 ? C5 MAN 720 A 1 HETATM 6 C C6 MAN . . . U 5 3.619 16.534 89.364 1 130.14 ? C6 MAN 720 A 1 HETATM 7 O O2 MAN . . . U 5 6.1 14.839 85.697 1 100.57 ? O2 MAN 720 A 1 HETATM 8 O O3 MAN . . . U 5 5.009 17.047 84.615 1 125.19 ? O3 MAN 720 A 1 HETATM 9 O O4 MAN . . . U 5 3.323 17.965 86.782 1 113.32 ? O4 MAN 720 A 1 HETATM 10 O O5 MAN . . . U 5 5.655 15.737 88.459 1 153.85 ? O5 MAN 720 A 1 HETATM 11 O O6 MAN . . . U 5 4.228 16.232 90.617 1 124.59 ? O6 MAN 720 A 1 HETATM 12 H H2 MAN . . . U 5 7.48 16.407 85.74 1 143.56 ? H2 MAN 720 A 1 HETATM 13 H H3 MAN . . . U 5 5.829 18.105 86.134 1 143.93 ? H3 MAN 720 A 1 HETATM 14 H H4 MAN . . . U 5 3.752 15.928 86.658 1 143.03 ? H4 MAN 720 A 1 HETATM 15 H H5 MAN . . . U 5 5.207 17.755 88.635 1 165.83 ? H5 MAN 720 A 1 HETATM 16 H H61 MAN . . . U 5 3.01 15.695 88.995 1 156.17 ? H61 MAN 720 A 1 HETATM 17 H H62 MAN . . . U 5 2.984 17.428 89.419 1 156.17 ? H62 MAN 720 A 1 HETATM 18 H HO2 MAN . . . U 5 5.535 15.018 84.935 1 120.69 ? HO2 MAN 720 A 1 HETATM 19 H HO3 MAN . . . U 5 4.313 17.721 84.542 1 150.23 ? HO3 MAN 720 A 1 HETATM 20 H HO4 MAN . . . U 5 2.483 17.634 87.138 1 135.98 ? HO4 MAN 720 A 1 HETATM 21 H HO6 MAN . . . U 5 4.897 15.553 90.459 1 149.51 ? HO6 MAN 720 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 26 _model_server_stats.parse_time_ms 14 _model_server_stats.create_model_time_ms 7 _model_server_stats.query_time_ms 312 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 21 #