data_6VO0 # _model_server_result.job_id rqy3BcdU_OwYQOnBNQuSYQ _model_server_result.datetime_utc '2024-12-26 16:33:34' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6vo0 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"SA","auth_seq_id":612}' # _entry.id 6VO0 # _exptl.entry_id 6VO0 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 7 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 27 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 7 HA N N ? 7 IA N N ? 7 JA N N ? 7 KA N N ? 7 LA N N ? 7 MA N N ? 7 NA N N ? 7 OA N N ? 7 PA N N ? 7 QA N N ? 7 RA N N ? 7 SA N N ? 7 TA N N ? 7 UA N N ? 7 VA N N ? 7 WA N N ? 7 XA N N ? 7 YA N N ? 7 ZA N N ? 7 AB N N ? 7 BB N N ? 7 CB N N ? 7 DB N N ? 7 EB N N ? 7 FB N N ? 7 GB N N ? 7 HB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 6 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 6 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 5 n M NAG 1 M 1 NAG A 504 NAG 5 n M NAG 2 M 2 NAG A 505 NAG 5 n N NAG 1 N 1 NAG A 506 NAG 5 n N NAG 2 N 2 NAG A 507 NAG 6 n O NAG 1 O 1 NAG A 508 NAG 6 n O NAG 2 O 2 NAG A 509 NAG 6 n O BMA 3 O 3 BMA A 510 BMA 5 n P NAG 1 P 1 NAG A 512 NAG 5 n P NAG 2 P 2 NAG A 513 NAG 5 n Q NAG 1 Q 1 NAG A 518 NAG 5 n Q NAG 2 Q 2 NAG A 519 NAG 5 n R NAG 1 R 1 NAG A 523 NAG 5 n R NAG 2 R 2 NAG A 524 NAG 5 n S NAG 1 S 1 NAG A 525 NAG 5 n S NAG 2 S 2 NAG A 526 NAG 5 n T NAG 1 T 1 NAG C 504 NAG 5 n T NAG 2 T 2 NAG C 505 NAG 5 n U NAG 1 U 1 NAG C 506 NAG 5 n U NAG 2 U 2 NAG C 507 NAG 6 n V NAG 1 V 1 NAG C 508 NAG 6 n V NAG 2 V 2 NAG C 509 NAG 6 n V BMA 3 V 3 BMA C 510 BMA 5 n W NAG 1 W 1 NAG C 512 NAG 5 n W NAG 2 W 2 NAG C 513 NAG 5 n X NAG 1 X 1 NAG C 518 NAG 5 n X NAG 2 X 2 NAG C 519 NAG 5 n Y NAG 1 Y 1 NAG C 523 NAG 5 n Y NAG 2 Y 2 NAG C 524 NAG 5 n Z NAG 1 Z 1 NAG C 525 NAG 5 n Z NAG 2 Z 2 NAG C 526 NAG 5 n AA NAG 1 a 1 NAG D 504 NAG 5 n AA NAG 2 a 2 NAG D 505 NAG 5 n BA NAG 1 b 1 NAG D 506 NAG 5 n BA NAG 2 b 2 NAG D 507 NAG 6 n CA NAG 1 c 1 NAG D 508 NAG 6 n CA NAG 2 c 2 NAG D 509 NAG 6 n CA BMA 3 c 3 BMA D 510 BMA 5 n DA NAG 1 d 1 NAG D 512 NAG 5 n DA NAG 2 d 2 NAG D 513 NAG 5 n EA NAG 1 e 1 NAG D 518 NAG 5 n EA NAG 2 e 2 NAG D 519 NAG 5 n FA NAG 1 f 1 NAG D 523 NAG 5 n FA NAG 2 f 2 NAG D 524 NAG 5 n GA NAG 1 g 1 NAG D 525 NAG 5 n GA NAG 2 g 2 NAG D 526 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 23 L CYS 23 1_555 A SG CYS 88 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf2 B SG CYS 21 H CYS 22 1_555 B SG CYS 95 H CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf3 B SG CYS 35 H CYS 35 1_555 B SG CYS 50 H CYS 50 1_555 A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf4 C SG CYS 24 A CYS 54 1_555 C SG CYS 44 A CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf5 C SG CYS 89 A CYS 119 1_555 C SG CYS 175 A CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.103 ? disulf ? disulf6 C SG CYS 96 A CYS 126 1_555 C SG CYS 166 A CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf7 C SG CYS 101 A CYS 131 1_555 C SG CYS 119 A CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf8 C SG CYS 188 A CYS 218 1_555 C SG CYS 217 A CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf9 C SG CYS 198 A CYS 228 1_555 C SG CYS 209 A CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf10 C SG CYS 266 A CYS 296 1_555 C SG CYS 300 A CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf11 C SG CYS 347 A CYS 378 1_555 C SG CYS 413 A CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf12 C SG CYS 354 A CYS 385 1_555 C SG CYS 386 A CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf13 C SG CYS 469 A CYS 501 1_555 D SG CYS 94 B CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf14 D SG CYS 87 B CYS 598 1_555 D SG CYS 93 B CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf15 E SG CYS 23 J CYS 23 1_555 E SG CYS 88 J CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf16 F SG CYS 21 G CYS 22 1_555 F SG CYS 95 G CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf17 F SG CYS 35 G CYS 35 1_555 F SG CYS 50 G CYS 50 1_555 A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf18 G SG CYS 24 C CYS 54 1_555 G SG CYS 44 C CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf19 G SG CYS 89 C CYS 119 1_555 G SG CYS 175 C CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.104 ? disulf ? disulf20 G SG CYS 96 C CYS 126 1_555 G SG CYS 166 C CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf21 G SG CYS 101 C CYS 131 1_555 G SG CYS 119 C CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf22 G SG CYS 188 C CYS 218 1_555 G SG CYS 217 C CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf23 G SG CYS 198 C CYS 228 1_555 G SG CYS 209 C CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf24 G SG CYS 266 C CYS 296 1_555 G SG CYS 300 C CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf25 G SG CYS 347 C CYS 378 1_555 G SG CYS 413 C CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf26 G SG CYS 354 C CYS 385 1_555 G SG CYS 386 C CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf27 G SG CYS 469 C CYS 501 1_555 H SG CYS 94 E CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf28 H SG CYS 87 E CYS 598 1_555 H SG CYS 93 E CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf29 I SG CYS 23 K CYS 23 1_555 I SG CYS 88 K CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf30 J SG CYS 21 I CYS 22 1_555 J SG CYS 95 I CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf31 J SG CYS 35 I CYS 35 1_555 J SG CYS 50 I CYS 50 1_555 A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf32 K SG CYS 24 D CYS 54 1_555 K SG CYS 44 D CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf33 K SG CYS 89 D CYS 119 1_555 K SG CYS 175 D CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.103 ? disulf ? disulf34 K SG CYS 96 D CYS 126 1_555 K SG CYS 166 D CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf35 K SG CYS 101 D CYS 131 1_555 K SG CYS 119 D CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf36 K SG CYS 188 D CYS 218 1_555 K SG CYS 217 D CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf37 K SG CYS 198 D CYS 228 1_555 K SG CYS 209 D CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf38 K SG CYS 266 D CYS 296 1_555 K SG CYS 300 D CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf39 K SG CYS 347 D CYS 378 1_555 K SG CYS 413 D CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf40 K SG CYS 354 D CYS 385 1_555 K SG CYS 386 D CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf41 K SG CYS 469 D CYS 501 1_555 L SG CYS 94 F CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf42 L SG CYS 87 F CYS 598 1_555 L SG CYS 93 F CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? covale ? covale1 C ND2 ASN 58 A ASN 88 1_555 PA C1 NAG . A NAG 624 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.408 ? covale ? covale2 C ND2 ASN 103 A ASN 133 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.409 ? covale ? covale3 C ND2 ASN 107 A ASN 137 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.412 ? covale ? covale4 C ND2 ASN 118 A ASN 156 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.4 ? covale ? covale5 C ND2 ASN 122 A ASN 160 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.397 ? covale ? covale6 C ND2 ASN 167 A ASN 197 1_555 OA C1 NAG . A NAG 619 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.396 ? covale ? covale7 C ND2 ASN 204 A ASN 234 1_555 NA C1 NAG . A NAG 618 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.401 ? covale ? covale8 C ND2 ASN 232 A ASN 262 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? covale ? covale9 C ND2 ASN 246 A ASN 276 1_555 HA C1 NAG . A NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.426 ? covale ? covale10 C ND2 ASN 265 A ASN 295 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.406 ? covale ? covale11 C ND2 ASN 271 A ASN 301 1_555 IA C1 NAG . A NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.412 ? covale ? covale12 C ND2 ASN 301 A ASN 332 1_555 JA C1 NAG . A NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.416 ? covale ? covale13 C ND2 ASN 332 A ASN 363 1_555 MA C1 NAG . A NAG 617 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.414 ? covale ? covale14 C ND2 ASN 355 A ASN 386 1_555 KA C1 NAG . A NAG 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.406 ? covale ? covale15 C ND2 ASN 361 A ASN 392 1_555 LA C1 NAG . A NAG 614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.409 ? covale ? covale16 C ND2 ASN 416 A ASN 448 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.413 ? covale ? covale17 G ND2 ASN 58 C ASN 88 1_555 YA C1 NAG . C NAG 624 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.407 ? covale ? covale18 G ND2 ASN 103 C ASN 133 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.409 ? covale ? covale19 G ND2 ASN 107 C ASN 137 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.412 ? covale ? covale20 G ND2 ASN 118 C ASN 156 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.399 ? covale ? covale21 G ND2 ASN 122 C ASN 160 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.397 ? covale ? covale22 G ND2 ASN 167 C ASN 197 1_555 XA C1 NAG . C NAG 619 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.396 ? covale ? covale23 G ND2 ASN 204 C ASN 234 1_555 WA C1 NAG . C NAG 618 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.401 ? covale ? covale24 G ND2 ASN 232 C ASN 262 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? covale ? covale25 G ND2 ASN 246 C ASN 276 1_555 QA C1 NAG . C NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.426 ? covale ? covale26 G ND2 ASN 265 C ASN 295 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.406 ? covale ? covale27 G ND2 ASN 271 C ASN 301 1_555 RA C1 NAG . C NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.412 ? covale ? covale28 G ND2 ASN 301 C ASN 332 1_555 SA C1 NAG . C NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.416 ? covale ? covale29 G ND2 ASN 332 C ASN 363 1_555 VA C1 NAG . C NAG 617 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.414 ? covale ? covale30 G ND2 ASN 355 C ASN 386 1_555 TA C1 NAG . C NAG 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.406 ? covale ? covale31 G ND2 ASN 361 C ASN 392 1_555 UA C1 NAG . C NAG 614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.408 ? covale ? covale32 G ND2 ASN 416 C ASN 448 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.413 ? covale ? covale33 K ND2 ASN 58 D ASN 88 1_555 HB C1 NAG . D NAG 624 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.408 ? covale ? covale34 K ND2 ASN 103 D ASN 133 1_555 AA C1 NAG . a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.408 ? covale ? covale35 K ND2 ASN 107 D ASN 137 1_555 GA C1 NAG . g NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.412 ? covale ? covale36 K ND2 ASN 118 D ASN 156 1_555 FA C1 NAG . f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.4 ? covale ? covale37 K ND2 ASN 122 D ASN 160 1_555 BA C1 NAG . b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.397 ? covale ? covale38 K ND2 ASN 167 D ASN 197 1_555 GB C1 NAG . D NAG 619 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.395 ? covale ? covale39 K ND2 ASN 204 D ASN 234 1_555 FB C1 NAG . D NAG 618 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.4 ? covale ? covale40 K ND2 ASN 232 D ASN 262 1_555 CA C1 NAG . c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? covale ? covale41 K ND2 ASN 246 D ASN 276 1_555 ZA C1 NAG . D NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.427 ? covale ? covale42 K ND2 ASN 265 D ASN 295 1_555 DA C1 NAG . d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.406 ? covale ? covale43 K ND2 ASN 271 D ASN 301 1_555 AB C1 NAG . D NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.412 ? covale ? covale44 K ND2 ASN 301 D ASN 332 1_555 BB C1 NAG . D NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.416 ? covale ? covale45 K ND2 ASN 332 D ASN 363 1_555 EB C1 NAG . D NAG 617 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.414 ? covale ? covale46 K ND2 ASN 355 D ASN 386 1_555 CB C1 NAG . D NAG 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.406 ? covale ? covale47 K ND2 ASN 361 D ASN 392 1_555 DB C1 NAG . D NAG 614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.408 ? covale ? covale48 K ND2 ASN 416 D ASN 448 1_555 EA C1 NAG . e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.413 ? covale ? covale49 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.422 ? covale ? covale50 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.412 ? covale ? covale51 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.417 ? covale ? covale52 O O4 NAG . O NAG 2 1_555 O C1 BMA . O BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.482 ? covale ? covale53 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.415 ? covale ? covale54 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.42 ? covale ? covale55 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.411 ? covale ? covale56 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.402 ? covale ? covale57 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.422 ? covale ? covale58 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.412 ? covale ? covale59 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.416 ? covale ? covale60 V O4 NAG . V NAG 2 1_555 V C1 BMA . V BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.482 ? covale ? covale61 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.415 ? covale ? covale62 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.419 ? covale ? covale63 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.411 ? covale ? covale64 Z O4 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.403 ? covale ? covale65 AA O4 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 NAG . a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.422 ? covale ? covale66 BA O4 NAG . b NAG 1 1_555 BA C1 NAG . b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.412 ? covale ? covale67 CA O4 NAG . c NAG 1 1_555 CA C1 NAG . c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.416 ? covale ? covale68 CA O4 NAG . c NAG 2 1_555 CA C1 BMA . c BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.482 ? covale ? covale69 DA O4 NAG . d NAG 1 1_555 DA C1 NAG . d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.415 ? covale ? covale70 EA O4 NAG . e NAG 1 1_555 EA C1 NAG . e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.419 ? covale ? covale71 FA O4 NAG . f NAG 1 1_555 FA C1 NAG . f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.411 ? covale ? covale72 GA O4 NAG . g NAG 1 1_555 GA C1 NAG . g NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.402 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 259 n n C1 O1 NAG sing 260 n n C1 O5 NAG sing 261 n n C1 H1 NAG sing 262 n n C2 C3 NAG sing 263 n n C2 N2 NAG sing 264 n n C2 H2 NAG sing 265 n n C3 C4 NAG sing 266 n n C3 O3 NAG sing 267 n n C3 H3 NAG sing 268 n n C4 C5 NAG sing 269 n n C4 O4 NAG sing 270 n n C4 H4 NAG sing 271 n n C5 C6 NAG sing 272 n n C5 O5 NAG sing 273 n n C5 H5 NAG sing 274 n n C6 O6 NAG sing 275 n n C6 H61 NAG sing 276 n n C6 H62 NAG sing 277 n n C7 C8 NAG sing 278 n n C7 N2 NAG sing 279 n n C7 O7 NAG doub 280 n n C8 H81 NAG sing 281 n n C8 H82 NAG sing 282 n n C8 H83 NAG sing 283 n n N2 HN2 NAG sing 284 n n O1 HO1 NAG sing 285 n n O3 HO3 NAG sing 286 n n O4 HO4 NAG sing 287 n n O6 HO6 NAG sing 288 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 6VO0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code HA 7 NAG A 1 608 511 NAG NAG . IA 7 NAG A 1 611 514 NAG NAG . JA 7 NAG A 1 612 515 NAG NAG . KA 7 NAG A 1 613 516 NAG NAG . LA 7 NAG A 1 614 517 NAG NAG . MA 7 NAG A 1 617 520 NAG NAG . NA 7 NAG A 1 618 521 NAG NAG . OA 7 NAG A 1 619 522 NAG NAG . PA 7 NAG A 1 624 527 NAG NAG . QA 7 NAG C 1 608 511 NAG NAG . RA 7 NAG C 1 611 514 NAG NAG . SA 7 NAG C 1 612 515 NAG NAG . TA 7 NAG C 1 613 516 NAG NAG . UA 7 NAG C 1 614 517 NAG NAG . VA 7 NAG C 1 617 520 NAG NAG . WA 7 NAG C 1 618 521 NAG NAG . XA 7 NAG C 1 619 522 NAG NAG . YA 7 NAG C 1 624 527 NAG NAG . ZA 7 NAG D 1 608 511 NAG NAG . AB 7 NAG D 1 611 514 NAG NAG . BB 7 NAG D 1 612 515 NAG NAG . CB 7 NAG D 1 613 516 NAG NAG . DB 7 NAG D 1 614 517 NAG NAG . EB 7 NAG D 1 617 520 NAG NAG . FB 7 NAG D 1 618 521 NAG NAG . GB 7 NAG D 1 619 522 NAG NAG . HB 7 NAG D 1 624 527 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . SA 7 198.204 169.147 175.192 1 54.56 ? C1 NAG 612 C 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . SA 7 197.939 167.669 175.288 1 53.89 ? C2 NAG 612 C 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . SA 7 198.382 167.154 176.587 1 60.36 ? C3 NAG 612 C 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . SA 7 199.915 167.425 176.705 1 65.47 ? C4 NAG 612 C 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . SA 7 200.171 168.953 176.606 1 63.72 ? C5 NAG 612 C 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . SA 7 201.634 169.28 176.7 1 73.91 ? C6 NAG 612 C 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . SA 7 196.08 166.863 174.016 1 52.38 ? C7 NAG 612 C 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . SA 7 194.617 166.679 173.837 1 50.38 ? C8 NAG 612 C 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . SA 7 196.521 167.381 175.135 1 51.32 ? N2 NAG 612 C 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . SA 7 198.074 165.743 176.682 1 61.81 ? O3 NAG 612 C 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . SA 7 200.37 166.931 177.921 1 71.78 ? O4 NAG 612 C 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . SA 7 199.714 169.413 175.338 1 58.65 ? O5 NAG 612 C 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . SA 7 202.293 168.469 177.661 1 80 ? O6 NAG 612 C 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . SA 7 196.879 166.536 173.142 1 55.24 ? O7 NAG 612 C 1 # _model_server_stats.io_time_ms 14 _model_server_stats.parse_time_ms 25 _model_server_stats.create_model_time_ms 55 _model_server_stats.query_time_ms 418 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 14 #