data_6VRW # _model_server_result.job_id jVp6Ghu2z4Kevo4nc7RgwA _model_server_result.datetime_utc '2024-10-10 06:30:56' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6vrw # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"PB","auth_seq_id":1611}' # _entry.id 6VRW # _exptl.entry_id 6VRW _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 5 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 39 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6VRW _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6VRW _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 6 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 5 EA N N ? 5 FA N N ? 5 GA N N ? 5 HA N N ? 5 IA N N ? 5 JA N N ? 5 KA N N ? 5 LA N N ? 5 MA N N ? 5 NA N N ? 5 OA N N ? 5 PA N N ? 5 QA N N ? 5 RA N N ? 5 SA N N ? 5 TA N N ? 5 UA N N ? 5 VA N N ? 5 WA N N ? 5 XA N N ? 5 YA N N ? 5 ZA N N ? 5 AB N N ? 5 BB N N ? 5 CB N N ? 5 DB N N ? 5 EB N N ? 5 FB N N ? 5 GB N N ? 5 HB N N ? 5 IB N N ? 5 JB N N ? 5 KB N N ? 5 LB N N ? 5 MB N N ? 5 NB N N ? 5 OB N N ? 5 PB N N ? 5 QB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 3 oligosaccharide 4 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 3 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 4 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 4 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 4 ? 4 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 5 ? 4 5 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 3 n G NAG 1 F 1 NAG G 1160 NAG 3 n G NAG 2 F 2 NAG G 1161 NAG 3 n H NAG 1 H 1 NAG G 1130 NAG 3 n H NAG 2 H 2 NAG G 1131 NAG 3 n I NAG 1 I 1 NAG G 1197 NAG 3 n I NAG 2 I 2 NAG G 1198 NAG 3 n J NAG 1 J 1 NAG G 1230 NAG 3 n J NAG 2 J 2 NAG G 1231 NAG 3 n K NAG 1 K 1 NAG G 1241 NAG 3 n K NAG 2 K 2 NAG G 1242 NAG 3 n L NAG 1 L 1 NAG G 1332 NAG 3 n L NAG 2 L 2 NAG G 1333 NAG 4 n M NAG 1 M 1 NAG G 1262 NAG 4 n M NAG 2 M 2 NAG G 1263 NAG 4 n M BMA 3 M 3 BMA G 1264 BMA 4 n M MAN 4 M 4 MAN G 1266 MAN 4 n M MAN 5 M 5 MAN G 1265 MAN 3 n N NAG 1 N 1 NAG G 1289 NAG 3 n N NAG 2 N 2 NAG G 1290 NAG 3 n O NAG 1 O 1 NAG A 1160 NAG 3 n O NAG 2 O 2 NAG A 1161 NAG 3 n P NAG 1 P 1 NAG A 1130 NAG 3 n P NAG 2 P 2 NAG A 1131 NAG 3 n Q NAG 1 Q 1 NAG A 1197 NAG 3 n Q NAG 2 Q 2 NAG A 1198 NAG 3 n R NAG 1 R 1 NAG A 1230 NAG 3 n R NAG 2 R 2 NAG A 1231 NAG 3 n S NAG 1 S 1 NAG A 1241 NAG 3 n S NAG 2 S 2 NAG A 1242 NAG 3 n T NAG 1 T 1 NAG A 1332 NAG 3 n T NAG 2 T 2 NAG A 1333 NAG 4 n U NAG 1 U 1 NAG A 1262 NAG 4 n U NAG 2 U 2 NAG A 1263 NAG 4 n U BMA 3 U 3 BMA A 1264 BMA 4 n U MAN 4 U 4 MAN A 1266 MAN 4 n U MAN 5 U 5 MAN A 1265 MAN 3 n V NAG 1 V 1 NAG A 1289 NAG 3 n V NAG 2 V 2 NAG A 1290 NAG 3 n W NAG 1 W 1 NAG D 1160 NAG 3 n W NAG 2 W 2 NAG D 1161 NAG 3 n X NAG 1 X 1 NAG D 1130 NAG 3 n X NAG 2 X 2 NAG D 1131 NAG 3 n Y NAG 1 Y 1 NAG D 1197 NAG 3 n Y NAG 2 Y 2 NAG D 1198 NAG 3 n Z NAG 1 Z 1 NAG D 1230 NAG 3 n Z NAG 2 Z 2 NAG D 1231 NAG 3 n AA NAG 1 a 1 NAG D 1241 NAG 3 n AA NAG 2 a 2 NAG D 1242 NAG 3 n BA NAG 1 b 1 NAG D 1332 NAG 3 n BA NAG 2 b 2 NAG D 1333 NAG 4 n CA NAG 1 c 1 NAG D 1262 NAG 4 n CA NAG 2 c 2 NAG D 1263 NAG 4 n CA BMA 3 c 3 BMA D 1264 BMA 4 n CA MAN 4 c 4 MAN D 1266 MAN 4 n CA MAN 5 c 5 MAN D 1265 MAN 3 n DA NAG 1 d 1 NAG D 1289 NAG 3 n DA NAG 2 d 2 NAG D 1290 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 22 G CYS 54 1_555 A SG CYS 42 G CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 87 G CYS 119 1_555 A SG CYS 169 G CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 94 G CYS 126 1_555 A SG CYS 160 G CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 99 G CYS 131 1_555 A SG CYS 118 G CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 182 G CYS 218 1_555 A SG CYS 211 G CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 192 G CYS 228 1_555 A SG CYS 203 G CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 260 G CYS 296 1_555 A SG CYS 294 G CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 339 G CYS 378 1_555 A SG CYS 403 G CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 346 G CYS 385 1_555 A SG CYS 376 G CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 459 G CYS 501 1_555 B SG CYS 95 B CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf11 B SG CYS 88 B CYS 598 1_555 B SG CYS 94 B CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf12 C SG CYS 22 A CYS 54 1_555 C SG CYS 42 A CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf13 C SG CYS 87 A CYS 119 1_555 C SG CYS 169 A CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf14 C SG CYS 94 A CYS 126 1_555 C SG CYS 160 A CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf15 C SG CYS 99 A CYS 131 1_555 C SG CYS 118 A CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf16 C SG CYS 182 A CYS 218 1_555 C SG CYS 211 A CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? disulf ? disulf17 C SG CYS 192 A CYS 228 1_555 C SG CYS 203 A CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf18 C SG CYS 260 A CYS 296 1_555 C SG CYS 294 A CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf19 C SG CYS 339 A CYS 378 1_555 C SG CYS 403 A CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf20 C SG CYS 346 A CYS 385 1_555 C SG CYS 376 A CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf21 C SG CYS 459 A CYS 501 1_555 D SG CYS 95 C CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.984 ? disulf ? disulf22 D SG CYS 88 C CYS 598 1_555 D SG CYS 94 C CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf23 E SG CYS 22 D CYS 54 1_555 E SG CYS 42 D CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf24 E SG CYS 87 D CYS 119 1_555 E SG CYS 169 D CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf25 E SG CYS 94 D CYS 126 1_555 E SG CYS 160 D CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf26 E SG CYS 99 D CYS 131 1_555 E SG CYS 118 D CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf27 E SG CYS 182 D CYS 218 1_555 E SG CYS 211 D CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? disulf ? disulf28 E SG CYS 192 D CYS 228 1_555 E SG CYS 203 D CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf29 E SG CYS 260 D CYS 296 1_555 E SG CYS 294 D CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf30 E SG CYS 339 D CYS 378 1_555 E SG CYS 403 D CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf31 E SG CYS 346 D CYS 385 1_555 E SG CYS 376 D CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf32 E SG CYS 459 D CYS 501 1_555 F SG CYS 95 E CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? disulf ? disulf33 F SG CYS 88 E CYS 598 1_555 F SG CYS 94 E CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 56 G ASN 88 1_555 MA C1 NAG . G NAG 1088 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 98 G ASN 130 1_555 H C1 NAG . H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 117 G ASN 156 1_555 EA C1 NAG . G NAG 1156 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 121 G ASN 160 1_555 G C1 NAG . F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 161 G ASN 197 1_555 I C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 194 G ASN 230 1_555 J C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 198 G ASN 234 1_555 FA C1 NAG . G NAG 1234 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 205 G ASN 241 1_555 K C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 226 G ASN 262 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 240 G ASN 276 1_555 GA C1 NAG . G NAG 1276 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 253 G ASN 289 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 265 G ASN 301 1_555 OA C1 NAG . G NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 295 G ASN 332 1_555 L C1 NAG . L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale14 A ND2 ASN 317 G ASN 356 1_555 HA C1 NAG . G NAG 1356 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.462 ? covale ? covale15 A ND2 ASN 323 G ASN 362 1_555 IA C1 NAG . G NAG 1362 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale16 A ND2 ASN 347 G ASN 386 1_555 JA C1 NAG . G NAG 1386 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale17 A ND2 ASN 400 G ASN 442 1_555 NA C1 NAG . G NAG 1442 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale18 A ND2 ASN 406 G ASN 448 1_555 KA C1 NAG . G NAG 1448 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale19 A ND2 ASN 460 G ASN 502 1_555 LA C1 NAG . G NAG 1502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale20 B ND2 ASN 101 B ASN 611 1_555 PA C1 NAG . B NAG 1611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale21 B ND2 ASN 127 B ASN 637 1_555 QA C1 NAG . B NAG 1637 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? covale ? covale22 C ND2 ASN 56 A ASN 88 1_555 ZA C1 NAG . A NAG 1088 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale23 C ND2 ASN 98 A ASN 130 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale24 C ND2 ASN 117 A ASN 156 1_555 RA C1 NAG . A NAG 1156 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale25 C ND2 ASN 121 A ASN 160 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale26 C ND2 ASN 161 A ASN 197 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale27 C ND2 ASN 194 A ASN 230 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale28 C ND2 ASN 198 A ASN 234 1_555 SA C1 NAG . A NAG 1234 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale29 C ND2 ASN 205 A ASN 241 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale30 C ND2 ASN 226 A ASN 262 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale31 C ND2 ASN 240 A ASN 276 1_555 TA C1 NAG . A NAG 1276 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale32 C ND2 ASN 253 A ASN 289 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale33 C ND2 ASN 265 A ASN 301 1_555 BB C1 NAG . A NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale34 C ND2 ASN 295 A ASN 332 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale35 C ND2 ASN 317 A ASN 356 1_555 UA C1 NAG . A NAG 1356 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.462 ? covale ? covale36 C ND2 ASN 323 A ASN 362 1_555 VA C1 NAG . A NAG 1362 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale37 C ND2 ASN 347 A ASN 386 1_555 WA C1 NAG . A NAG 1386 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale38 C ND2 ASN 400 A ASN 442 1_555 AB C1 NAG . A NAG 1442 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale39 C ND2 ASN 406 A ASN 448 1_555 XA C1 NAG . A NAG 1448 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale40 C ND2 ASN 460 A ASN 502 1_555 YA C1 NAG . A NAG 1502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale41 D ND2 ASN 101 C ASN 611 1_555 CB C1 NAG . C NAG 1611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale42 D ND2 ASN 127 C ASN 637 1_555 DB C1 NAG . C NAG 1637 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? covale ? covale43 E ND2 ASN 56 D ASN 88 1_555 MB C1 NAG . D NAG 1088 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale44 E ND2 ASN 98 D ASN 130 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale45 E ND2 ASN 117 D ASN 156 1_555 EB C1 NAG . D NAG 1156 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale46 E ND2 ASN 121 D ASN 160 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? covale ? covale47 E ND2 ASN 161 D ASN 197 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale48 E ND2 ASN 194 D ASN 230 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale49 E ND2 ASN 198 D ASN 234 1_555 FB C1 NAG . D NAG 1234 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale50 E ND2 ASN 205 D ASN 241 1_555 AA C1 NAG . a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale51 E ND2 ASN 226 D ASN 262 1_555 CA C1 NAG . c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale52 E ND2 ASN 240 D ASN 276 1_555 GB C1 NAG . D NAG 1276 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale53 E ND2 ASN 253 D ASN 289 1_555 DA C1 NAG . d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale54 E ND2 ASN 265 D ASN 301 1_555 OB C1 NAG . D NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale55 E ND2 ASN 295 D ASN 332 1_555 BA C1 NAG . b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale56 E ND2 ASN 317 D ASN 356 1_555 HB C1 NAG . D NAG 1356 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.463 ? covale ? covale57 E ND2 ASN 323 D ASN 362 1_555 IB C1 NAG . D NAG 1362 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale58 E ND2 ASN 347 D ASN 386 1_555 JB C1 NAG . D NAG 1386 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale59 E ND2 ASN 400 D ASN 442 1_555 NB C1 NAG . D NAG 1442 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale60 E ND2 ASN 406 D ASN 448 1_555 KB C1 NAG . D NAG 1448 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale61 E ND2 ASN 460 D ASN 502 1_555 LB C1 NAG . D NAG 1502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale62 F ND2 ASN 101 E ASN 611 1_555 PB C1 NAG . E NAG 1611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale63 F ND2 ASN 127 E ASN 637 1_555 QB C1 NAG . E NAG 1637 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? covale ? covale64 G O4 NAG . F NAG 1 1_555 G C1 NAG . F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale65 H O4 NAG . H NAG 1 1_555 H C1 NAG . H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale66 I O4 NAG . I NAG 1 1_555 I C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale67 J O4 NAG . J NAG 1 1_555 J C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale68 K O4 NAG . K NAG 1 1_555 K C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale69 L O4 NAG . L NAG 1 1_555 L C1 NAG . L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale70 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale71 M O4 NAG . M NAG 2 1_555 M C1 BMA . M BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale72 M O3 BMA . M BMA 3 1_555 M C1 MAN . M MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale73 M O6 BMA . M BMA 3 1_555 M C1 MAN . M MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale74 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale75 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale76 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale77 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale78 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale79 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale80 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale81 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale82 U O4 NAG . U NAG 2 1_555 U C1 BMA . U BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale83 U O3 BMA . U BMA 3 1_555 U C1 MAN . U MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale84 U O6 BMA . U BMA 3 1_555 U C1 MAN . U MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale85 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale86 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale87 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale88 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale89 Z O4 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale90 AA O4 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 NAG . a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale91 BA O4 NAG . b NAG 1 1_555 BA C1 NAG . b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale92 CA O4 NAG . c NAG 1 1_555 CA C1 NAG . c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale93 CA O4 NAG . c NAG 2 1_555 CA C1 BMA . c BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale94 CA O3 BMA . c BMA 3 1_555 CA C1 MAN . c MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale95 CA O6 BMA . c BMA 3 1_555 CA C1 MAN . c MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale96 DA O4 NAG . d NAG 1 1_555 DA C1 NAG . d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 283 n n C1 O1 NAG sing 284 n n C1 O5 NAG sing 285 n n C1 H1 NAG sing 286 n n C2 C3 NAG sing 287 n n C2 N2 NAG sing 288 n n C2 H2 NAG sing 289 n n C3 C4 NAG sing 290 n n C3 O3 NAG sing 291 n n C3 H3 NAG sing 292 n n C4 C5 NAG sing 293 n n C4 O4 NAG sing 294 n n C4 H4 NAG sing 295 n n C5 C6 NAG sing 296 n n C5 O5 NAG sing 297 n n C5 H5 NAG sing 298 n n C6 O6 NAG sing 299 n n C6 H61 NAG sing 300 n n C6 H62 NAG sing 301 n n C7 C8 NAG sing 302 n n C7 N2 NAG sing 303 n n C7 O7 NAG doub 304 n n C8 H81 NAG sing 305 n n C8 H82 NAG sing 306 n n C8 H83 NAG sing 307 n n N2 HN2 NAG sing 308 n n O1 HO1 NAG sing 309 n n O3 HO3 NAG sing 310 n n O4 HO4 NAG sing 311 n n O6 HO6 NAG sing 312 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 6VRW _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code EA 5 NAG G 1 1156 1156 NAG NAG . FA 5 NAG G 1 1234 1234 NAG NAG . GA 5 NAG G 1 1276 1276 NAG NAG . HA 5 NAG G 1 1356 1356 NAG NAG . IA 5 NAG G 1 1362 1362 NAG NAG . JA 5 NAG G 1 1386 1386 NAG NAG . KA 5 NAG G 1 1448 1448 NAG NAG . LA 5 NAG G 1 1502 1502 NAG NAG . MA 5 NAG G 1 1088 1088 NAG NAG . NA 5 NAG G 1 1442 1442 NAG NAG . OA 5 NAG G 1 1301 1301 NAG NAG . PA 5 NAG B 1 1611 1611 NAG NAG . QA 5 NAG B 1 1637 1637 NAG NAG . RA 5 NAG A 1 1156 1156 NAG NAG . SA 5 NAG A 1 1234 1234 NAG NAG . TA 5 NAG A 1 1276 1276 NAG NAG . UA 5 NAG A 1 1356 1356 NAG NAG . VA 5 NAG A 1 1362 1362 NAG NAG . WA 5 NAG A 1 1386 1386 NAG NAG . XA 5 NAG A 1 1448 1448 NAG NAG . YA 5 NAG A 1 1502 1502 NAG NAG . ZA 5 NAG A 1 1088 1088 NAG NAG . AB 5 NAG A 1 1442 1442 NAG NAG . BB 5 NAG A 1 1301 1301 NAG NAG . CB 5 NAG C 1 1611 1611 NAG NAG . DB 5 NAG C 1 1637 1637 NAG NAG . EB 5 NAG D 1 1156 1156 NAG NAG . FB 5 NAG D 1 1234 1234 NAG NAG . GB 5 NAG D 1 1276 1276 NAG NAG . HB 5 NAG D 1 1356 1356 NAG NAG . IB 5 NAG D 1 1362 1362 NAG NAG . JB 5 NAG D 1 1386 1386 NAG NAG . KB 5 NAG D 1 1448 1448 NAG NAG . LB 5 NAG D 1 1502 1502 NAG NAG . MB 5 NAG D 1 1088 1088 NAG NAG . NB 5 NAG D 1 1442 1442 NAG NAG . OB 5 NAG D 1 1301 1301 NAG NAG . PB 5 NAG E 1 1611 1611 NAG NAG . QB 5 NAG E 1 1637 1637 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . PB 5 200.334 171.953 127.794 1 152.08 ? C1 NAG 1611 E 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . PB 5 200.214 173.339 127.155 1 152.08 ? C2 NAG 1611 E 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . PB 5 201.48 174.16 127.419 1 152.08 ? C3 NAG 1611 E 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . PB 5 201.81 174.191 128.906 1 152.08 ? C4 NAG 1611 E 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . PB 5 201.891 172.771 129.455 1 152.08 ? C5 NAG 1611 E 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . PB 5 202.108 172.726 130.948 1 152.08 ? C6 NAG 1611 E 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . PB 5 199.267 174.119 125.029 1 152.08 ? C7 NAG 1611 E 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . PB 5 199.12 173.841 123.565 1 152.08 ? C8 NAG 1611 E 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . PB 5 199.972 173.224 125.727 1 152.08 ? N2 NAG 1611 E 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . PB 5 201.297 175.488 126.946 1 152.08 ? O3 NAG 1611 E 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . PB 5 203.056 174.844 129.117 1 152.08 ? O4 NAG 1611 E 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . PB 5 200.656 172.088 129.194 1 152.08 ? O5 NAG 1611 E 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . PB 5 203.077 173.681 131.36 1 152.08 ? O6 NAG 1611 E 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . PB 5 198.775 175.111 125.556 1 152.08 ? O7 NAG 1611 E 1 # _model_server_stats.io_time_ms 11 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 27 _model_server_stats.query_time_ms 261 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 14 #