data_6VXX # _model_server_result.job_id E8rt3VPNsJ5Rk0N6AEeWFQ _model_server_result.datetime_utc '2024-11-21 09:07:42' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6vxx # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"S","auth_seq_id":1301}' # _entry.id 6VXX # _exptl.entry_id 6VXX _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 3 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 33 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 S N N ? 3 T N N ? 3 U N N ? 3 V N N ? 3 W N N ? 3 X N N ? 3 Y N N ? 3 Z N N ? 3 AA N N ? 3 BA N N ? 3 CA N N ? 3 DA N N ? 3 EA N N ? 3 FA N N ? 3 GA N N ? 3 HA N N ? 3 IA N N ? 3 JA N N ? 3 KA N N ? 3 LA N N ? 3 MA N N ? 3 NA N N ? 3 OA N N ? 3 PA N N ? 3 QA N N ? 3 RA N N ? 3 SA N N ? 3 TA N N ? 3 UA N N ? 3 VA N N ? 3 WA N N ? 3 XA N N ? 3 YA N N # _pdbx_entity_branch.entity_id 2 _pdbx_entity_branch.type oligosaccharide # _pdbx_entity_branch_link.link_id 1 _pdbx_entity_branch_link.details ? _pdbx_entity_branch_link.entity_id 2 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 2 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 NAG _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 C1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 O1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 . _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 O4 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 HO4 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 . _pdbx_entity_branch_link.value_order sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 2 n D NAG 1 D 1 NAG A 1337 NAG 2 n D NAG 2 D 2 NAG A 1338 NAG 2 n E NAG 1 E 1 NAG A 1355 NAG 2 n E NAG 2 E 2 NAG A 1356 NAG 2 n F NAG 1 F 1 NAG A 1358 NAG 2 n F NAG 2 F 2 NAG A 1359 NAG 2 n G NAG 1 G 1 NAG A 1368 NAG 2 n G NAG 2 G 2 NAG A 1369 NAG 2 n H NAG 1 H 1 NAG A 1373 NAG 2 n H NAG 2 H 2 NAG A 1374 NAG 2 n I NAG 1 I 1 NAG B 1337 NAG 2 n I NAG 2 I 2 NAG B 1338 NAG 2 n J NAG 1 J 1 NAG B 1355 NAG 2 n J NAG 2 J 2 NAG B 1356 NAG 2 n K NAG 1 K 1 NAG B 1358 NAG 2 n K NAG 2 K 2 NAG B 1359 NAG 2 n L NAG 1 L 1 NAG B 1368 NAG 2 n L NAG 2 L 2 NAG B 1369 NAG 2 n M NAG 1 M 1 NAG B 1373 NAG 2 n M NAG 2 M 2 NAG B 1374 NAG 2 n N NAG 1 N 1 NAG C 1337 NAG 2 n N NAG 2 N 2 NAG C 1338 NAG 2 n O NAG 1 O 1 NAG C 1355 NAG 2 n O NAG 2 O 2 NAG C 1356 NAG 2 n P NAG 1 P 1 NAG C 1358 NAG 2 n P NAG 2 P 2 NAG C 1359 NAG 2 n Q NAG 1 Q 1 NAG C 1368 NAG 2 n Q NAG 2 Q 2 NAG C 1369 NAG 2 n R NAG 1 R 1 NAG C 1373 NAG 2 n R NAG 2 R 2 NAG C 1374 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 150 A CYS 131 1_555 A SG CYS 185 A CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 310 A CYS 291 1_555 A SG CYS 320 A CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 355 A CYS 336 1_555 A SG CYS 380 A CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 398 A CYS 379 1_555 A SG CYS 451 A CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.05 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 410 A CYS 391 1_555 A SG CYS 544 A CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.361 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 557 A CYS 538 1_555 A SG CYS 609 A CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 636 A CYS 617 1_555 A SG CYS 668 A CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 681 A CYS 662 1_555 A SG CYS 690 A CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.057 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 757 A CYS 738 1_555 A SG CYS 779 A CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 762 A CYS 743 1_555 A SG CYS 768 A CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 1051 A CYS 1032 1_555 A SG CYS 1062 A CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 1101 A CYS 1082 1_555 A SG CYS 1145 A CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf13 B SG CYS 150 B CYS 131 1_555 B SG CYS 185 B CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf14 B SG CYS 310 B CYS 291 1_555 B SG CYS 320 B CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf15 B SG CYS 355 B CYS 336 1_555 B SG CYS 380 B CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf16 B SG CYS 398 B CYS 379 1_555 B SG CYS 451 B CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? disulf ? disulf17 B SG CYS 410 B CYS 391 1_555 B SG CYS 544 B CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.361 ? disulf ? disulf18 B SG CYS 557 B CYS 538 1_555 B SG CYS 609 B CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? disulf ? disulf19 B SG CYS 636 B CYS 617 1_555 B SG CYS 668 B CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf20 B SG CYS 681 B CYS 662 1_555 B SG CYS 690 B CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.057 ? disulf ? disulf21 B SG CYS 757 B CYS 738 1_555 B SG CYS 779 B CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf22 B SG CYS 762 B CYS 743 1_555 B SG CYS 768 B CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf23 B SG CYS 1051 B CYS 1032 1_555 B SG CYS 1062 B CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf24 B SG CYS 1101 B CYS 1082 1_555 B SG CYS 1145 B CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf25 C SG CYS 150 C CYS 131 1_555 C SG CYS 185 C CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf26 C SG CYS 310 C CYS 291 1_555 C SG CYS 320 C CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf27 C SG CYS 355 C CYS 336 1_555 C SG CYS 380 C CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf28 C SG CYS 398 C CYS 379 1_555 C SG CYS 451 C CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.05 ? disulf ? disulf29 C SG CYS 410 C CYS 391 1_555 C SG CYS 544 C CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? disulf ? disulf30 C SG CYS 557 C CYS 538 1_555 C SG CYS 609 C CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? disulf ? disulf31 C SG CYS 636 C CYS 617 1_555 C SG CYS 668 C CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf32 C SG CYS 681 C CYS 662 1_555 C SG CYS 690 C CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? disulf ? disulf33 C SG CYS 757 C CYS 738 1_555 C SG CYS 779 C CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf34 C SG CYS 762 C CYS 743 1_555 C SG CYS 768 C CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf35 C SG CYS 1051 C CYS 1032 1_555 C SG CYS 1062 C CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf36 C SG CYS 1101 C CYS 1082 1_555 C SG CYS 1145 C CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 80 A ASN 61 1_555 S C1 NAG . A NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.507 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 141 A ASN 122 1_555 T C1 NAG . A NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 184 A ASN 165 1_555 CA C1 NAG . A NAG 1321 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.525 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 253 A ASN 234 1_555 D C1 NAG . D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 301 A ASN 282 1_555 U C1 NAG . A NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 350 A ASN 331 1_555 V C1 NAG . A NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.52 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 362 A ASN 343 1_555 W C1 NAG . A NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.508 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 622 A ASN 603 1_555 X C1 NAG . A NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.503 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 635 A ASN 616 1_555 Y C1 NAG . A NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 676 A ASN 657 1_555 Z C1 NAG . A NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 728 A ASN 709 1_555 AA C1 NAG . A NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.499 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 736 A ASN 717 1_555 E C1 NAG . E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.499 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 820 A ASN 801 1_555 F C1 NAG . F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ? covale ? covale14 A ND2 ASN 1093 A ASN 1074 1_555 BA C1 NAG . A NAG 1316 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale15 A ND2 ASN 1117 A ASN 1098 1_555 G C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale16 A ND2 ASN 1153 A ASN 1134 1_555 H C1 NAG . H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale17 B ND2 ASN 80 B ASN 61 1_555 DA C1 NAG . B NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.507 ? covale ? covale18 B ND2 ASN 141 B ASN 122 1_555 EA C1 NAG . B NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale19 B ND2 ASN 184 B ASN 165 1_555 NA C1 NAG . B NAG 1321 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.525 ? covale ? covale20 B ND2 ASN 253 B ASN 234 1_555 I C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale21 B ND2 ASN 301 B ASN 282 1_555 FA C1 NAG . B NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale22 B ND2 ASN 350 B ASN 331 1_555 GA C1 NAG . B NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? covale ? covale23 B ND2 ASN 362 B ASN 343 1_555 HA C1 NAG . B NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.508 ? covale ? covale24 B ND2 ASN 622 B ASN 603 1_555 IA C1 NAG . B NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.502 ? covale ? covale25 B ND2 ASN 635 B ASN 616 1_555 JA C1 NAG . B NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? covale ? covale26 B ND2 ASN 676 B ASN 657 1_555 KA C1 NAG . B NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale27 B ND2 ASN 728 B ASN 709 1_555 LA C1 NAG . B NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.499 ? covale ? covale28 B ND2 ASN 736 B ASN 717 1_555 J C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.498 ? covale ? covale29 B ND2 ASN 820 B ASN 801 1_555 K C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ? covale ? covale30 B ND2 ASN 1093 B ASN 1074 1_555 MA C1 NAG . B NAG 1316 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale31 B ND2 ASN 1117 B ASN 1098 1_555 L C1 NAG . L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale32 B ND2 ASN 1153 B ASN 1134 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale33 C ND2 ASN 80 C ASN 61 1_555 OA C1 NAG . C NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.507 ? covale ? covale34 C ND2 ASN 141 C ASN 122 1_555 PA C1 NAG . C NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale35 C ND2 ASN 184 C ASN 165 1_555 YA C1 NAG . C NAG 1321 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.526 ? covale ? covale36 C ND2 ASN 253 C ASN 234 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale37 C ND2 ASN 301 C ASN 282 1_555 QA C1 NAG . C NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale38 C ND2 ASN 350 C ASN 331 1_555 RA C1 NAG . C NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? covale ? covale39 C ND2 ASN 362 C ASN 343 1_555 SA C1 NAG . C NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.507 ? covale ? covale40 C ND2 ASN 622 C ASN 603 1_555 TA C1 NAG . C NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.503 ? covale ? covale41 C ND2 ASN 635 C ASN 616 1_555 UA C1 NAG . C NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? covale ? covale42 C ND2 ASN 676 C ASN 657 1_555 VA C1 NAG . C NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale43 C ND2 ASN 728 C ASN 709 1_555 WA C1 NAG . C NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.499 ? covale ? covale44 C ND2 ASN 736 C ASN 717 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.499 ? covale ? covale45 C ND2 ASN 820 C ASN 801 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.503 ? covale ? covale46 C ND2 ASN 1093 C ASN 1074 1_555 XA C1 NAG . C NAG 1316 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale47 C ND2 ASN 1117 C ASN 1098 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale48 C ND2 ASN 1153 C ASN 1134 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? covale ? covale49 D O4 NAG . D NAG 1 1_555 D C1 NAG . D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.508 ? covale ? covale50 E O4 NAG . E NAG 1 1_555 E C1 NAG . E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.5 ? covale ? covale51 F O4 NAG . F NAG 1 1_555 F C1 NAG . F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? covale ? covale52 G O4 NAG . G NAG 1 1_555 G C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.499 ? covale ? covale53 H O4 NAG . H NAG 1 1_555 H C1 NAG . H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.515 ? covale ? covale54 I O4 NAG . I NAG 1 1_555 I C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.507 ? covale ? covale55 J O4 NAG . J NAG 1 1_555 J C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.5 ? covale ? covale56 K O4 NAG . K NAG 1 1_555 K C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? covale ? covale57 L O4 NAG . L NAG 1 1_555 L C1 NAG . L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.499 ? covale ? covale58 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.515 ? covale ? covale59 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.508 ? covale ? covale60 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.5 ? covale ? covale61 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ? covale ? covale62 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.499 ? covale ? covale63 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.515 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 235 n n C1 O1 NAG sing 236 n n C1 O5 NAG sing 237 n n C1 H1 NAG sing 238 n n C2 C3 NAG sing 239 n n C2 N2 NAG sing 240 n n C2 H2 NAG sing 241 n n C3 C4 NAG sing 242 n n C3 O3 NAG sing 243 n n C3 H3 NAG sing 244 n n C4 C5 NAG sing 245 n n C4 O4 NAG sing 246 n n C4 H4 NAG sing 247 n n C5 C6 NAG sing 248 n n C5 O5 NAG sing 249 n n C5 H5 NAG sing 250 n n C6 O6 NAG sing 251 n n C6 H61 NAG sing 252 n n C6 H62 NAG sing 253 n n C7 C8 NAG sing 254 n n C7 N2 NAG sing 255 n n C7 O7 NAG doub 256 n n C8 H81 NAG sing 257 n n C8 H82 NAG sing 258 n n C8 H83 NAG sing 259 n n N2 HN2 NAG sing 260 n n O1 HO1 NAG sing 261 n n O3 HO3 NAG sing 262 n n O4 HO4 NAG sing 263 n n O6 HO6 NAG sing 264 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 6VXX _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code S 3 NAG A 1 1301 1329 NAG NAG . T 3 NAG A 1 1302 1334 NAG NAG . U 3 NAG A 1 1305 1339 NAG NAG . V 3 NAG A 1 1306 1342 NAG NAG . W 3 NAG A 1 1307 1343 NAG NAG . X 3 NAG A 1 1308 1346 NAG NAG . Y 3 NAG A 1 1309 1347 NAG NAG . Z 3 NAG A 1 1310 1348 NAG NAG . AA 3 NAG A 1 1311 1350 NAG NAG . BA 3 NAG A 1 1316 1363 NAG NAG . CA 3 NAG A 1 1321 1401 NAG NAG . DA 3 NAG B 1 1301 1329 NAG NAG . EA 3 NAG B 1 1302 1334 NAG NAG . FA 3 NAG B 1 1305 1339 NAG NAG . GA 3 NAG B 1 1306 1342 NAG NAG . HA 3 NAG B 1 1307 1343 NAG NAG . IA 3 NAG B 1 1308 1346 NAG NAG . JA 3 NAG B 1 1309 1347 NAG NAG . KA 3 NAG B 1 1310 1348 NAG NAG . LA 3 NAG B 1 1311 1350 NAG NAG . MA 3 NAG B 1 1316 1363 NAG NAG . NA 3 NAG B 1 1321 1401 NAG NAG . OA 3 NAG C 1 1301 1329 NAG NAG . PA 3 NAG C 1 1302 1334 NAG NAG . QA 3 NAG C 1 1305 1339 NAG NAG . RA 3 NAG C 1 1306 1342 NAG NAG . SA 3 NAG C 1 1307 1343 NAG NAG . TA 3 NAG C 1 1308 1346 NAG NAG . UA 3 NAG C 1 1309 1347 NAG NAG . VA 3 NAG C 1 1310 1348 NAG NAG . WA 3 NAG C 1 1311 1350 NAG NAG . XA 3 NAG C 1 1316 1363 NAG NAG . YA 3 NAG C 1 1321 1401 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . S 3 174.195 244.195 218.174 1 34.56 ? C1 NAG 1301 A 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . S 3 173.828 242.694 217.835 1 34.98 ? C2 NAG 1301 A 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . S 3 172.858 242.699 216.624 1 34.98 ? C3 NAG 1301 A 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . S 3 171.593 243.525 216.982 1 35.07 ? C4 NAG 1301 A 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . S 3 172.024 244.978 217.346 1 34.99 ? C5 NAG 1301 A 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . S 3 170.85 245.845 217.782 1 35.06 ? C6 NAG 1301 A 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . S 3 175.744 241.196 218.334 1 34.37 ? C7 NAG 1301 A 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . S 3 176.965 240.506 217.798 1 33.65 ? C8 NAG 1301 A 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . S 3 175.049 241.949 217.484 1 34.77 ? N2 NAG 1301 A 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . S 3 172.483 241.347 216.312 1 35.02 ? O3 NAG 1301 A 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . S 3 170.709 243.542 215.86 1 35.35 ? O4 NAG 1301 A 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . S 3 172.976 244.94 218.47 1 35.02 ? O5 NAG 1301 A 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . S 3 171.215 247.219 217.832 1 35.44 ? O6 NAG 1301 A 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . S 3 175.406 241.075 219.519 1 34.64 ? O7 NAG 1301 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 12 _model_server_stats.parse_time_ms 7 _model_server_stats.create_model_time_ms 17 _model_server_stats.query_time_ms 232 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 14 #