data_6W4X # _model_server_result.job_id MWBODVEN3aA9hkzQZpYr7A _model_server_result.datetime_utc '2024-11-23 21:12:14' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6w4x # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"F","auth_seq_id":802}' # _entry.id 6W4X # _exptl.entry_id 6W4X _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6W4X _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6W4X _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 F N N ? 4 I N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 225 A CYS 225 1_555 A SG CYS 462 A CYS 462 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? covale ? covale1 C C SER 122 C SER 121 1_555 C N FY3 123 C FY3 122 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale2 C C FY3 123 C FY3 122 1_555 C N THR 124 C THR 123 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale3 D C SER 122 D SER 121 1_555 D N FY3 123 D FY3 122 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale4 D C FY3 123 D FY3 122 1_555 D N THR 124 D THR 123 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? metalc ? metalc1 E O2A TTP . A TTP 801 1_555 F MG MG . A MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.71 ? metalc ? metalc2 E O2B TTP . A TTP 801 1_555 F MG MG . A MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? metalc ? metalc3 E O3G TTP . A TTP 801 1_555 F MG MG . A MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.607 ? metalc ? metalc4 H O1A TTP . B TTP 802 1_555 I MG MG . B MG 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.203 ? metalc ? metalc5 H O3A TTP . B TTP 802 1_555 I MG MG . B MG 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.272 ? metalc ? metalc6 H O1B TTP . B TTP 802 1_555 I MG MG . B MG 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.496 ? metalc ? metalc7 H O3B TTP . B TTP 802 1_555 I MG MG . B MG 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.107 ? metalc ? metalc8 H O1G TTP . B TTP 802 1_555 I MG MG . B MG 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.103 ? metalc ? metalc9 H O5' TTP . B TTP 802 1_555 I MG MG . B MG 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.942 ? metalc ? metalc10 C OD2 ASP 85 C ASP 84 1_555 J FE2 FEO . C FEO 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.155 ? metalc ? metalc11 C OE1 GLU 116 C GLU 115 1_555 J FE2 FEO . C FEO 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.987 ? metalc ? metalc12 C ND1 HIS 119 C HIS 118 1_555 J FE2 FEO . C FEO 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.504 ? metalc ? metalc13 C OE1 GLU 205 C GLU 204 1_555 J FE1 FEO . C FEO 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.915 ? metalc ? metalc14 C OE1 GLU 239 C GLU 238 1_555 J FE1 FEO . C FEO 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.15 ? metalc ? metalc15 C ND1 HIS 242 C HIS 241 1_555 J FE1 FEO . C FEO 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.42 ? metalc ? metalc16 J FE1 FEO . C FEO 501 1_555 L O HOH . C HOH 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.564 ? metalc ? metalc17 J FE2 FEO . C FEO 501 1_555 L O HOH . C HOH 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.774 ? metalc ? metalc18 J FE2 FEO . C FEO 501 1_555 L O HOH . C HOH 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.666 ? metalc ? metalc19 D OD1 ASP 85 D ASP 84 1_555 K FE2 FEO . D FEO 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.379 ? metalc ? metalc20 D OD2 ASP 85 D ASP 84 1_555 K FE2 FEO . D FEO 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.451 ? metalc ? metalc21 D OE1 GLU 116 D GLU 115 1_555 K FE2 FEO . D FEO 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.059 ? metalc ? metalc22 D OE2 GLU 116 D GLU 115 1_555 K FE1 FEO . D FEO 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.869 ? metalc ? metalc23 D ND1 HIS 119 D HIS 118 1_555 K FE2 FEO . D FEO 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.086 ? metalc ? metalc24 D OE1 GLU 205 D GLU 204 1_555 K FE1 FEO . D FEO 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.173 ? metalc ? metalc25 D OE2 GLU 239 D GLU 238 1_555 K FE2 FEO . D FEO 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.694 ? metalc ? metalc26 D ND1 HIS 242 D HIS 241 1_555 K FE1 FEO . D FEO 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.408 ? metalc ? metalc27 K FE2 FEO . D FEO 501 1_555 M O HOH . D HOH 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.563 ? metalc ? metalc28 K FE1 FEO . D FEO 501 1_555 M O HOH . D HOH 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.556 ? metalc ? metalc29 K FE2 FEO . D FEO 501 1_555 M O HOH . D HOH 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.661 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 6W4X _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 3 TTP A 1 801 805 TTP TTP . F 4 MG A 1 802 806 MG MG . G 5 GDP B 1 801 801 GDP GDP . H 3 TTP B 1 802 805 TTP TTP . I 4 MG B 1 803 806 MG MG . J 6 FEO C 1 501 501 FEO FEO . K 6 FEO D 1 501 501 FEO FEO . L 7 HOH C 1 601 1 HOH HOH . L 7 HOH C 2 602 2 HOH HOH . M 7 HOH D 1 601 4 HOH HOH . M 7 HOH D 2 602 3 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id F _atom_site.label_entity_id 4 _atom_site.Cartn_x 115.681 _atom_site.Cartn_y 151.301 _atom_site.Cartn_z 144.049 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 49.09 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 802 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 14 _model_server_stats.parse_time_ms 12 _model_server_stats.create_model_time_ms 23 _model_server_stats.query_time_ms 390 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #