data_6W87 # _model_server_result.job_id jGnADg9z2ateIc9pJyQTRQ _model_server_result.datetime_utc '2024-11-05 10:59:24' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6w87 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"H","auth_seq_id":406}' # _entry.id 6W87 # _exptl.entry_id 6W87 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 39.098 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'POTASSIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 5 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6W87 _cell.length_a 66.944 _cell.length_b 119.48 _cell.length_c 128.393 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6W87 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 D N N ? 2 F N N ? 2 G N N ? 2 H N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 74 A CYS 93 1_555 B SG CYS 74 B CYS 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? metalc ? metalc1 A O THR 123 A THR 142 1_555 D K K . A K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.737 ? metalc ? metalc2 A O THR 123 A THR 142 1_555 G K K . A K 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.755 ? metalc ? metalc3 A OG1 THR 123 A THR 142 1_555 G K K . A K 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.417 ? metalc ? metalc4 A O ILE 124 A ILE 143 1_555 D K K . A K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.808 ? metalc ? metalc5 A O ILE 124 A ILE 143 1_555 F K K . A K 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.77 ? metalc ? metalc6 A O GLY 125 A GLY 144 1_555 C K K . A K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.197 ? metalc ? metalc7 A O GLY 125 A GLY 144 1_555 F K K . A K 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.166 ? metalc ? metalc8 A O PHE 126 A PHE 145 1_555 C K K . A K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.618 ? metalc ? metalc9 A O THR 232 A THR 251 1_555 D K K . A K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.71 ? metalc ? metalc10 A O THR 232 A THR 251 1_555 G K K . A K 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.734 ? metalc ? metalc11 A OG1 THR 232 A THR 251 1_555 G K K . A K 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.408 ? metalc ? metalc12 A O ILE 233 A ILE 252 1_555 D K K . A K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.777 ? metalc ? metalc13 A O ILE 233 A ILE 252 1_555 F K K . A K 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.78 ? metalc ? metalc14 A O GLY 234 A GLY 253 1_555 C K K . A K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.211 ? metalc ? metalc15 A O GLY 234 A GLY 253 1_555 F K K . A K 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.179 ? metalc ? metalc16 A O PHE 235 A PHE 254 1_555 C K K . A K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.62 ? metalc ? metalc17 A OE1 GLU 290 A GLU 309 1_555 P CD CD . B CD 402 2_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.548 ? metalc ? metalc18 C K K . A K 401 1_555 B O GLY 125 B GLY 144 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.209 ? metalc ? metalc19 C K K . A K 401 1_555 B O PHE 126 B PHE 145 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.616 ? metalc ? metalc20 C K K . A K 401 1_555 B O GLY 234 B GLY 253 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.219 ? metalc ? metalc21 C K K . A K 401 1_555 B O PHE 235 B PHE 254 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.624 ? metalc ? metalc22 D K K . A K 402 1_555 B O THR 123 B THR 142 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.745 ? metalc ? metalc23 D K K . A K 402 1_555 B O ILE 124 B ILE 143 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.799 ? metalc ? metalc24 D K K . A K 402 1_555 B O THR 232 B THR 251 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.728 ? metalc ? metalc25 D K K . A K 402 1_555 B O ILE 233 B ILE 252 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.791 ? metalc ? metalc26 F K K . A K 404 1_555 B O ILE 124 B ILE 143 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.794 ? metalc ? metalc27 F K K . A K 404 1_555 B O GLY 125 B GLY 144 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.149 ? metalc ? metalc28 F K K . A K 404 1_555 B O ILE 233 B ILE 252 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.762 ? metalc ? metalc29 F K K . A K 404 1_555 B O GLY 234 B GLY 253 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.162 ? metalc ? metalc30 G K K . A K 405 1_555 B O THR 123 B THR 142 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.735 ? metalc ? metalc31 G K K . A K 405 1_555 B OG1 THR 123 B THR 142 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.414 ? metalc ? metalc32 G K K . A K 405 1_555 B O THR 232 B THR 251 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.732 ? metalc ? metalc33 G K K . A K 405 1_555 B OG1 THR 232 B THR 251 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.414 ? metalc ? metalc34 B OD2 ASP 109 B ASP 128 1_555 Q CD CD . B CD 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.604 ? metalc ? metalc35 B OE1 GLU 290 B GLU 309 1_555 P CD CD . B CD 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.135 ? metalc ? metalc36 B OE2 GLU 290 B GLU 309 1_555 P CD CD . B CD 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? metalc ? metalc37 B NE2 HIS 294 B HIS 313 1_555 P CD CD . B CD 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.078 ? # _chem_comp.formula 'K 1' _chem_comp.formula_weight 39.098 _chem_comp.id K _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'POTASSIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 6W87 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.014938 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.00837 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.007789 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 K A 1 401 402 K K . D 2 K A 1 402 403 K K . E 3 Q6F A 1 403 406 Q6F Q6F . F 2 K A 1 404 401 K K . G 2 K A 1 405 402 K K . H 2 K A 1 406 1 K K . I 4 D12 A 1 407 3 D12 D12 . J 5 UND A 1 408 1 UND UND . K 6 D10 A 1 409 1 D10 D10 . L 7 OCT A 1 410 1 OCT OCT . M 7 OCT A 1 411 2 OCT OCT . N 8 CD A 1 412 1 CD CD . O 8 CD B 1 401 404 CD CD . P 8 CD B 1 402 405 CD CD . Q 8 CD B 1 403 406 CD CD . R 3 Q6F B 1 404 410 Q6F Q6F . S 4 D12 B 1 405 1 D12 D12 . T 4 D12 B 1 406 2 D12 D12 . U 4 D12 B 1 407 4 D12 D12 . V 9 R16 B 1 408 1 R16 R16 . W 9 R16 B 1 409 2 R16 R16 . X 9 R16 B 1 410 3 R16 R16 . Y 5 UND B 1 411 2 UND UND . Z 5 UND B 1 412 3 UND UND . AA 10 LNK B 1 413 1 LNK LNK . BA 10 LNK B 1 414 2 LNK LNK . CA 10 LNK B 1 415 3 LNK LNK . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol K _atom_site.label_atom_id K _atom_site.label_comp_id K _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id H _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 6.229 _atom_site.Cartn_y -16.998 _atom_site.Cartn_z -28.661 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 148.02 _atom_site.pdbx_formal_charge 1 _atom_site.auth_atom_id K _atom_site.auth_comp_id K _atom_site.auth_seq_id 406 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 17 _model_server_stats.parse_time_ms 15 _model_server_stats.create_model_time_ms 142 _model_server_stats.query_time_ms 414 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 1 #