data_6W8C # _model_server_result.job_id FI20gPMphvnkqJjgXhBD7A _model_server_result.datetime_utc '2024-11-05 09:19:01' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6w8c # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"CA","auth_seq_id":415}' # _entry.id 6W8C # _exptl.entry_id 6W8C _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 373.254 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description N-[(2,4-dichlorophenyl)methyl]-4-[(methylsulfonyl)amino]benzamide _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6W8C _cell.length_a 67.129 _cell.length_b 119.783 _cell.length_c 128.872 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6W8C _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 J N N ? 4 CA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 74 A CYS 93 1_555 B SG CYS 74 B CYS 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? metalc ? metalc1 A O THR 123 A THR 142 1_555 F K K . A K 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.936 ? metalc ? metalc2 A OG1 THR 123 A THR 142 1_555 N K K . A K 412 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.148 ? metalc ? metalc3 A O ILE 124 A ILE 143 1_555 E K K . A K 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.33 ? metalc ? metalc4 A O GLY 125 A GLY 144 1_555 D K K . A K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.395 ? metalc ? metalc5 A O GLY 125 A GLY 144 1_555 E K K . A K 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.275 ? metalc ? metalc6 A O PHE 126 A PHE 145 1_555 D K K . A K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.993 ? metalc ? metalc7 A O THR 232 A THR 251 1_555 F K K . A K 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.697 ? metalc ? metalc8 A O THR 232 A THR 251 1_555 N K K . A K 412 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.097 ? metalc ? metalc9 A OG1 THR 232 A THR 251 1_555 N K K . A K 412 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.897 ? metalc ? metalc10 A O ILE 233 A ILE 252 1_555 E K K . A K 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.042 ? metalc ? metalc11 A O ILE 233 A ILE 252 1_555 F K K . A K 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.983 ? metalc ? metalc12 A O GLY 234 A GLY 253 1_555 D K K . A K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.322 ? metalc ? metalc13 A O GLY 234 A GLY 253 1_555 E K K . A K 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.433 ? metalc ? metalc14 A O PHE 235 A PHE 254 1_555 D K K . A K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.981 ? metalc ? metalc15 A OE1 GLU 290 A GLU 309 1_555 Q CD CD . B CD 403 2_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.078 ? metalc ? metalc16 A NE2 HIS 294 A HIS 313 1_555 Q CD CD . B CD 403 2_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.075 ? metalc ? metalc17 D K K . A K 402 1_555 B O GLY 125 B GLY 144 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.399 ? metalc ? metalc18 D K K . A K 402 1_555 B O PHE 126 B PHE 145 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.947 ? metalc ? metalc19 D K K . A K 402 1_555 B O GLY 234 B GLY 253 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.326 ? metalc ? metalc20 D K K . A K 402 1_555 B O PHE 235 B PHE 254 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.005 ? metalc ? metalc21 E K K . A K 403 1_555 B O ILE 124 B ILE 143 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.029 ? metalc ? metalc22 E K K . A K 403 1_555 B O GLY 125 B GLY 144 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.212 ? metalc ? metalc23 E K K . A K 403 1_555 B O ILE 233 B ILE 252 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.824 ? metalc ? metalc24 E K K . A K 403 1_555 B O GLY 234 B GLY 253 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.144 ? metalc ? metalc25 F K K . A K 404 1_555 B O THR 123 B THR 142 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.847 ? metalc ? metalc26 F K K . A K 404 1_555 B O THR 232 B THR 251 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.834 ? metalc ? metalc27 F K K . A K 404 1_555 B O ILE 233 B ILE 252 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.127 ? metalc ? metalc28 N K K . A K 412 1_555 B O THR 123 B THR 142 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.39 ? metalc ? metalc29 N K K . A K 412 1_555 B OG1 THR 123 B THR 142 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.993 ? metalc ? metalc30 N K K . A K 412 1_555 B O THR 232 B THR 251 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.256 ? metalc ? metalc31 N K K . A K 412 1_555 B OG1 THR 232 B THR 251 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.096 ? metalc ? metalc32 B OD2 ASP 109 B ASP 128 1_555 R CD CD . B CD 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? metalc ? metalc33 B OE1 GLU 290 B GLU 309 1_555 Q CD CD . B CD 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.102 ? metalc ? metalc34 B NE2 HIS 294 B HIS 313 1_555 Q CD CD . B CD 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.27 ? # _chem_comp.formula 'C15 H14 Cl2 N2 O3 S' _chem_comp.formula_weight 373.254 _chem_comp.id Q6F _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name N-[(2,4-dichlorophenyl)methyl]-4-[(methylsulfonyl)amino]benzamide _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag O06 S03 Q6F doub 588 n n O05 S03 Q6F doub 589 n n C15 C17 Q6F doub 590 n y C15 C10 Q6F sing 591 n y C17 C11 Q6F sing 592 n y S03 C20 Q6F sing 593 n n S03 N08 Q6F sing 594 n n C22 C19 Q6F doub 595 n y C22 C23 Q6F sing 596 n y O04 C13 Q6F doub 597 n n CL2 C23 Q6F sing 598 n n C19 C12 Q6F sing 599 n y C23 C21 Q6F doub 600 n y C13 C10 Q6F sing 601 n n C13 N07 Q6F sing 602 n n C10 C14 Q6F doub 603 n y C11 N08 Q6F sing 604 n n C11 C16 Q6F doub 605 n y C12 C09 Q6F sing 606 n n C12 C18 Q6F doub 607 n y C21 C18 Q6F sing 608 n y C14 C16 Q6F sing 609 n y N07 C09 Q6F sing 610 n n C18 CL1 Q6F sing 611 n n C15 H1 Q6F sing 612 n n C17 H2 Q6F sing 613 n n C20 H3 Q6F sing 614 n n C20 H4 Q6F sing 615 n n C20 H5 Q6F sing 616 n n C21 H6 Q6F sing 617 n n C22 H7 Q6F sing 618 n n C09 H8 Q6F sing 619 n n C09 H9 Q6F sing 620 n n C14 H10 Q6F sing 621 n n C16 H11 Q6F sing 622 n n C19 H12 Q6F sing 623 n n N07 H13 Q6F sing 624 n n N08 H14 Q6F sing 625 n n # _atom_sites.entry_id 6W8C _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.014897 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.008348 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.00776 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 K A 1 401 2 K K . D 2 K A 1 402 3 K K . E 2 K A 1 403 4 K K . F 2 K A 1 404 5 K K . G 3 R16 A 1 405 2 R16 R16 . H 3 R16 A 1 406 3 R16 R16 . I 3 R16 A 1 407 5 R16 R16 . J 4 Q6F A 1 408 406 Q6F Q6F . K 5 B7G A 1 409 2 B7G B7G . L 6 IEP A 1 410 1 IEP IEP . M 7 11A A 1 411 1 11A 11A . N 2 K A 1 412 6 K K . O 2 K B 1 401 1 K K . P 8 CD B 1 402 1 CD CD . Q 8 CD B 1 403 2 CD CD . R 8 CD B 1 404 3 CD CD . S 9 OCT B 1 405 1 OCT OCT . T 9 OCT B 1 406 3 OCT OCT . U 10 D12 B 1 407 1 D12 D12 . V 10 D12 B 1 408 2 D12 D12 . W 5 B7G B 1 409 1 B7G B7G . X 5 B7G B 1 410 3 B7G B7G . Y 5 B7G B 1 411 4 B7G B7G . Z 11 UND B 1 412 1 UND UND . AA 6 IEP B 1 413 2 IEP IEP . BA 7 11A B 1 414 2 11A 11A . CA 4 Q6F B 1 415 410 Q6F Q6F . DA 12 LNK B 1 416 1 LNK LNK . EA 13 HOH A 1 501 1 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C10 Q6F . . . CA 4 9.757 -37.382 -22.881 1 92.49 ? C10 Q6F 415 B 1 HETATM 2 C C13 Q6F . . . CA 4 10.934 -36.638 -23.583 1 89.22 ? C13 Q6F 415 B 1 HETATM 3 C C15 Q6F . . . CA 4 8.49 -37.477 -23.411 1 94.9 ? C15 Q6F 415 B 1 HETATM 4 C C17 Q6F . . . CA 4 7.469 -38.071 -22.649 1 96.68 ? C17 Q6F 415 B 1 HETATM 5 C C20 Q6F . . . CA 4 4.978 -40.268 -22.725 1 108.04 ? C20 Q6F 415 B 1 HETATM 6 C C21 Q6F . . . CA 4 10.202 -32.014 -25.593 1 79.71 ? C21 Q6F 415 B 1 HETATM 7 C C22 Q6F . . . CA 4 11.849 -31.978 -23.851 1 80.08 ? C22 Q6F 415 B 1 HETATM 8 C C09 Q6F . . . CA 4 11.976 -35.401 -25.479 1 82.81 ? C09 Q6F 415 B 1 HETATM 9 C C11 Q6F . . . CA 4 7.774 -38.558 -21.384 1 97.35 ? C11 Q6F 415 B 1 HETATM 10 C C12 Q6F . . . CA 4 11.599 -33.96 -25.168 1 80.96 ? C12 Q6F 415 B 1 HETATM 11 C C14 Q6F . . . CA 4 10.025 -37.823 -21.599 1 94.01 ? C14 Q6F 415 B 1 HETATM 12 C C16 Q6F . . . CA 4 9.035 -38.42 -20.87 1 95.77 ? C16 Q6F 415 B 1 HETATM 13 C C18 Q6F . . . CA 4 10.564 -33.321 -25.877 1 79.7 ? C18 Q6F 415 B 1 HETATM 14 C C19 Q6F . . . CA 4 12.237 -33.284 -24.144 1 79.77 ? C19 Q6F 415 B 1 HETATM 15 C C23 Q6F . . . CA 4 10.836 -31.342 -24.571 1 79.2 ? C23 Q6F 415 B 1 HETATM 16 N N07 Q6F . . . CA 4 10.862 -36.172 -24.945 1 85.62 ? N07 Q6F 415 B 1 HETATM 17 N N08 Q6F . . . CA 4 6.704 -39.224 -20.622 1 101.66 ? N08 Q6F 415 B 1 HETATM 18 O O04 Q6F . . . CA 4 11.897 -36.422 -22.918 1 88.67 ? O04 Q6F 415 B 1 HETATM 19 O O05 Q6F . . . CA 4 4.552 -40.467 -20.155 1 106.18 ? O05 Q6F 415 B 1 HETATM 20 O O06 Q6F . . . CA 4 4.336 -38.358 -21.014 1 104.61 ? O06 Q6F 415 B 1 HETATM 21 S S03 Q6F . . . CA 4 5.143 -39.547 -21.101 1 103.2 ? S03 Q6F 415 B 1 HETATM 22 CL CL1 Q6F . . . CA 4 9.739 -34.136 -27.229 1 81.21 ? CL1 Q6F 415 B 1 HETATM 23 CL CL2 Q6F . . . CA 4 10.392 -29.678 -24.195 1 78.8 ? CL2 Q6F 415 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 60 _model_server_stats.parse_time_ms 14 _model_server_stats.create_model_time_ms 6 _model_server_stats.query_time_ms 354 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 23 #