data_6W8F # _model_server_result.job_id sbCYcUlfKRAhnT2SeDiDPQ _model_server_result.datetime_utc '2024-11-23 00:31:40' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6w8f # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"U","auth_seq_id":409}' # _entry.id 6W8F # _exptl.entry_id 6W8F _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 373.254 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description N-[(2,4-dichlorophenyl)methyl]-4-[(methylsulfonyl)amino]benzamide _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6W8F _cell.length_a 66.671 _cell.length_b 119.963 _cell.length_c 128.941 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6W8F _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 D N N ? 3 U N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 74 A CYS 93 1_555 B SG CYS 74 B CYS 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? metalc ? metalc1 A O THR 123 A THR 142 1_555 C K K . A K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.814 ? metalc ? metalc2 A O THR 123 A THR 142 1_555 J K K . A K 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.02 ? metalc ? metalc3 A OG1 THR 123 A THR 142 1_555 J K K . A K 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.319 ? metalc ? metalc4 A O ILE 124 A ILE 143 1_555 C K K . A K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.798 ? metalc ? metalc5 A O ILE 124 A ILE 143 1_555 I K K . A K 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.84 ? metalc ? metalc6 A O GLY 125 A GLY 144 1_555 I K K . A K 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.772 ? metalc ? metalc7 A O GLY 125 A GLY 144 1_555 M K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.957 ? metalc ? metalc8 A O PHE 126 A PHE 145 1_555 M K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.842 ? metalc ? metalc9 A O THR 232 A THR 251 1_555 C K K . A K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.748 ? metalc ? metalc10 A O THR 232 A THR 251 1_555 J K K . A K 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.913 ? metalc ? metalc11 A OG1 THR 232 A THR 251 1_555 J K K . A K 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.199 ? metalc ? metalc12 A O ILE 233 A ILE 252 1_555 C K K . A K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.885 ? metalc ? metalc13 A O ILE 233 A ILE 252 1_555 I K K . A K 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.864 ? metalc ? metalc14 A O GLY 234 A GLY 253 1_555 I K K . A K 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.739 ? metalc ? metalc15 A O GLY 234 A GLY 253 1_555 M K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.007 ? metalc ? metalc16 A O PHE 235 A PHE 254 1_555 M K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.918 ? metalc ? metalc17 C K K . A K 401 1_555 B O THR 123 B THR 142 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.847 ? metalc ? metalc18 C K K . A K 401 1_555 B O ILE 124 B ILE 143 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.876 ? metalc ? metalc19 C K K . A K 401 1_555 B O THR 232 B THR 251 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.729 ? metalc ? metalc20 C K K . A K 401 1_555 B O ILE 233 B ILE 252 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.89 ? metalc ? metalc21 I K K . A K 407 1_555 B O ILE 124 B ILE 143 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.812 ? metalc ? metalc22 I K K . A K 407 1_555 B O GLY 125 B GLY 144 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.741 ? metalc ? metalc23 I K K . A K 407 1_555 B O ILE 233 B ILE 252 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.839 ? metalc ? metalc24 I K K . A K 407 1_555 B O GLY 234 B GLY 253 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.735 ? metalc ? metalc25 J K K . A K 408 1_555 B O THR 123 B THR 142 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.008 ? metalc ? metalc26 J K K . A K 408 1_555 B OG1 THR 123 B THR 142 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.234 ? metalc ? metalc27 J K K . A K 408 1_555 B O THR 232 B THR 251 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.808 ? metalc ? metalc28 J K K . A K 408 1_555 B OG1 THR 232 B THR 251 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.042 ? metalc ? metalc29 B O GLY 125 B GLY 144 1_555 M K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.835 ? metalc ? metalc30 B O PHE 126 B PHE 145 1_555 M K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.82 ? metalc ? metalc31 B O GLY 234 B GLY 253 1_555 M K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.87 ? metalc ? metalc32 B O PHE 235 B PHE 254 1_555 M K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.862 ? # _chem_comp.formula 'C15 H14 Cl2 N2 O3 S' _chem_comp.formula_weight 373.254 _chem_comp.id Q6F _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name N-[(2,4-dichlorophenyl)methyl]-4-[(methylsulfonyl)amino]benzamide _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag O06 S03 Q6F doub 432 n n O05 S03 Q6F doub 433 n n C15 C17 Q6F doub 434 n y C15 C10 Q6F sing 435 n y C17 C11 Q6F sing 436 n y S03 C20 Q6F sing 437 n n S03 N08 Q6F sing 438 n n C22 C19 Q6F doub 439 n y C22 C23 Q6F sing 440 n y O04 C13 Q6F doub 441 n n CL2 C23 Q6F sing 442 n n C19 C12 Q6F sing 443 n y C23 C21 Q6F doub 444 n y C13 C10 Q6F sing 445 n n C13 N07 Q6F sing 446 n n C10 C14 Q6F doub 447 n y C11 N08 Q6F sing 448 n n C11 C16 Q6F doub 449 n y C12 C09 Q6F sing 450 n n C12 C18 Q6F doub 451 n y C21 C18 Q6F sing 452 n y C14 C16 Q6F sing 453 n y N07 C09 Q6F sing 454 n n C18 CL1 Q6F sing 455 n n C15 H1 Q6F sing 456 n n C17 H2 Q6F sing 457 n n C20 H3 Q6F sing 458 n n C20 H4 Q6F sing 459 n n C20 H5 Q6F sing 460 n n C21 H6 Q6F sing 461 n n C22 H7 Q6F sing 462 n n C09 H8 Q6F sing 463 n n C09 H9 Q6F sing 464 n n C14 H10 Q6F sing 465 n n C16 H11 Q6F sing 466 n n C19 H12 Q6F sing 467 n n N07 H13 Q6F sing 468 n n N08 H14 Q6F sing 469 n n # _atom_sites.entry_id 6W8F _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.014999 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.008336 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.007755 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 K A 1 401 403 K K . D 3 Q6F A 1 402 406 Q6F Q6F . E 4 16C A 1 403 407 16C 16C . F 5 R16 A 1 404 408 R16 R16 . G 5 R16 A 1 405 409 R16 R16 . H 5 R16 A 1 406 410 R16 R16 . I 2 K A 1 407 401 K K . J 2 K A 1 408 402 K K . K 6 CD A 1 409 1 CD CD . L 7 LNK A 1 410 1 LNK LNK . M 2 K B 1 401 402 K K . N 5 R16 B 1 402 404 R16 R16 . O 6 CD B 1 403 404 CD CD . P 6 CD B 1 404 405 CD CD . Q 6 CD B 1 405 406 CD CD . R 5 R16 B 1 406 407 R16 R16 . S 5 R16 B 1 407 408 R16 R16 . T 5 R16 B 1 408 409 R16 R16 . U 3 Q6F B 1 409 410 Q6F Q6F . V 5 R16 B 1 410 411 R16 R16 . W 5 R16 B 1 411 412 R16 R16 . X 8 D12 B 1 412 1 D12 D12 . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C10 Q6F . . . U 3 9.685 -37.179 -22.724 1 147.99 ? C10 Q6F 409 B 1 HETATM 2 C C13 Q6F . . . U 3 10.756 -36.217 -23.351 1 143.68 ? C13 Q6F 409 B 1 HETATM 3 C C15 Q6F . . . U 3 8.407 -37.223 -23.237 1 150.58 ? C15 Q6F 409 B 1 HETATM 4 C C17 Q6F . . . U 3 7.455 -38.08 -22.674 1 153.88 ? C17 Q6F 409 B 1 HETATM 5 C C20 Q6F . . . U 3 4.117 -39.45 -22.591 1 167.03 ? C20 Q6F 409 B 1 HETATM 6 C C21 Q6F . . . U 3 9.632 -31.698 -25.231 1 133.78 ? C21 Q6F 409 B 1 HETATM 7 C C22 Q6F . . . U 3 11.439 -31.504 -23.653 1 134.56 ? C22 Q6F 409 B 1 HETATM 8 C C09 Q6F . . . U 3 11.635 -34.895 -25.283 1 139.19 ? C09 Q6F 409 B 1 HETATM 9 C C11 Q6F . . . U 3 7.789 -38.882 -21.603 1 155.77 ? C11 Q6F 409 B 1 HETATM 10 C C12 Q6F . . . U 3 11.181 -33.499 -24.928 1 136.27 ? C12 Q6F 409 B 1 HETATM 11 C C14 Q6F . . . U 3 10.025 -37.991 -21.641 1 149.64 ? C14 Q6F 409 B 1 HETATM 12 C C16 Q6F . . . U 3 9.078 -38.839 -21.088 1 152.96 ? C16 Q6F 409 B 1 HETATM 13 C C18 Q6F . . . U 3 10.062 -32.964 -25.556 1 134.5 ? C18 Q6F 409 B 1 HETATM 14 C C19 Q6F . . . U 3 11.867 -32.779 -23.979 1 135.46 ? C19 Q6F 409 B 1 HETATM 15 C C23 Q6F . . . U 3 10.322 -30.971 -24.284 1 133.95 ? C23 Q6F 409 B 1 HETATM 16 N N07 Q6F . . . U 3 10.637 -35.797 -24.725 1 141.86 ? N07 Q6F 409 B 1 HETATM 17 N N08 Q6F . . . U 3 6.616 -39.689 -21.2 1 159.66 ? N08 Q6F 409 B 1 HETATM 18 O O04 Q6F . . . U 3 11.677 -35.837 -22.694 1 142.88 ? O04 Q6F 409 B 1 HETATM 19 O O05 Q6F . . . U 3 4.37 -39.531 -19.917 1 162.62 ? O05 Q6F 409 B 1 HETATM 20 O O06 Q6F . . . U 3 5.052 -37.62 -20.846 1 164.37 ? O06 Q6F 409 B 1 HETATM 21 S S03 Q6F . . . U 3 5.059 -39.047 -21.101 1 164.36 ? S03 Q6F 409 B 1 HETATM 22 CL CL1 Q6F . . . U 3 9.187 -33.917 -26.777 1 133.95 ? CL1 Q6F 409 B 1 HETATM 23 CL CL2 Q6F . . . U 3 9.79 -29.346 -23.861 1 133.72 ? CL2 Q6F 409 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 22 _model_server_stats.parse_time_ms 12 _model_server_stats.create_model_time_ms 5 _model_server_stats.query_time_ms 313 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 23 #