data_6WPS # _model_server_result.job_id 3HrWEyjO1hQ-lC06fkFy0w _model_server_result.datetime_utc '2024-11-21 09:03:47' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6wps # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"LA","auth_seq_id":1303}' # _entry.id 6WPS # _exptl.entry_id 6WPS _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 6 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 33 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details nonameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 9 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 6 Y N N ? 6 Z N N ? 6 AA N N ? 6 BA N N ? 6 CA N N ? 6 DA N N ? 6 EA N N ? 6 FA N N ? 6 GA N N ? 6 HA N N ? 6 IA N N ? 6 JA N N ? 6 KA N N ? 6 LA N N ? 6 MA N N ? 6 NA N N ? 6 OA N N ? 6 PA N N ? 6 QA N N ? 6 RA N N ? 6 SA N N ? 6 TA N N ? 6 UA N N ? 6 VA N N ? 6 WA N N ? 6 XA N N ? 6 YA N N ? 6 ZA N N ? 6 AB N N ? 6 BB N N ? 6 CB N N ? 6 DB N N ? 6 EB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 4 oligosaccharide 5 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 4 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 5 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 4 ? 5 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 5 ? 5 5 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 6 ? 5 6 1 FUC NAG C1 O1 . O6 HO6 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 4 n J NAG 1 I 1 NAG A 1310 NAG 4 n J NAG 2 I 2 NAG A 1311 NAG 4 n K NAG 1 J 1 NAG A 1312 NAG 4 n K NAG 2 J 2 NAG A 1313 NAG 4 n L NAG 1 K 1 NAG A 1315 NAG 4 n L NAG 2 K 2 NAG A 1316 NAG 4 n M NAG 1 M 1 NAG A 1317 NAG 4 n M NAG 2 M 2 NAG A 1318 NAG 5 n N NAG 1 N 1 NAG A 1321 NAG 5 n N NAG 2 N 2 NAG A 1322 NAG 5 n N BMA 3 N 3 BMA A 1323 BMA 5 n N MAN 4 N 4 MAN A 1325 MAN 5 n N MAN 5 N 5 MAN A 1324 MAN 5 n N FUC 6 N 6 FUC A 1320 FUC 4 n O NAG 1 O 1 NAG B 1310 NAG 4 n O NAG 2 O 2 NAG B 1311 NAG 4 n P NAG 1 P 1 NAG B 1312 NAG 4 n P NAG 2 P 2 NAG B 1313 NAG 4 n Q NAG 1 Q 1 NAG B 1315 NAG 4 n Q NAG 2 Q 2 NAG B 1316 NAG 4 n R NAG 1 R 1 NAG B 1317 NAG 4 n R NAG 2 R 2 NAG B 1318 NAG 5 n S NAG 1 S 1 NAG B 1321 NAG 5 n S NAG 2 S 2 NAG B 1322 NAG 5 n S BMA 3 S 3 BMA B 1323 BMA 5 n S MAN 4 S 4 MAN B 1325 MAN 5 n S MAN 5 S 5 MAN B 1324 MAN 5 n S FUC 6 S 6 FUC B 1320 FUC 4 n T NAG 1 T 1 NAG E 1310 NAG 4 n T NAG 2 T 2 NAG E 1311 NAG 4 n U NAG 1 U 1 NAG E 1312 NAG 4 n U NAG 2 U 2 NAG E 1313 NAG 4 n V NAG 1 V 1 NAG E 1315 NAG 4 n V NAG 2 V 2 NAG E 1316 NAG 4 n W NAG 1 W 1 NAG E 1317 NAG 4 n W NAG 2 W 2 NAG E 1318 NAG 5 n X NAG 1 X 1 NAG E 1321 NAG 5 n X NAG 2 X 2 NAG E 1322 NAG 5 n X BMA 3 X 3 BMA E 1323 BMA 5 n X MAN 4 X 4 MAN E 1325 MAN 5 n X MAN 5 X 5 MAN E 1324 MAN 5 n X FUC 6 X 6 FUC E 1320 FUC # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 150 A CYS 131 1_555 A SG CYS 185 A CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 310 A CYS 291 1_555 A SG CYS 320 A CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 355 A CYS 336 1_555 A SG CYS 380 A CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 398 A CYS 379 1_555 A SG CYS 451 A CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.095 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 410 A CYS 391 1_555 A SG CYS 544 A CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.233 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 557 A CYS 538 1_555 A SG CYS 609 A CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 636 A CYS 617 1_555 A SG CYS 668 A CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 681 A CYS 662 1_555 A SG CYS 690 A CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 757 A CYS 738 1_555 A SG CYS 779 A CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 762 A CYS 743 1_555 A SG CYS 768 A CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 1051 A CYS 1032 1_555 A SG CYS 1062 A CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 1101 A CYS 1082 1_555 A SG CYS 1145 A CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf13 B SG CYS 22 H CYS 22 1_555 B SG CYS 96 H CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf14 C SG CYS 23 L CYS 23 1_555 C SG CYS 89 L CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf15 D SG CYS 150 B CYS 131 1_555 D SG CYS 185 B CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf16 D SG CYS 310 B CYS 291 1_555 D SG CYS 320 B CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf17 D SG CYS 355 B CYS 336 1_555 D SG CYS 380 B CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf18 D SG CYS 398 B CYS 379 1_555 D SG CYS 451 B CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.095 ? disulf ? disulf19 D SG CYS 410 B CYS 391 1_555 D SG CYS 544 B CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.233 ? disulf ? disulf20 D SG CYS 557 B CYS 538 1_555 D SG CYS 609 B CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf21 D SG CYS 636 B CYS 617 1_555 D SG CYS 668 B CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf22 D SG CYS 681 B CYS 662 1_555 D SG CYS 690 B CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf23 D SG CYS 757 B CYS 738 1_555 D SG CYS 779 B CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf24 D SG CYS 762 B CYS 743 1_555 D SG CYS 768 B CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf25 D SG CYS 1051 B CYS 1032 1_555 D SG CYS 1062 B CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf26 D SG CYS 1101 B CYS 1082 1_555 D SG CYS 1145 B CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf27 E SG CYS 22 C CYS 22 1_555 E SG CYS 96 C CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf28 F SG CYS 23 D CYS 23 1_555 F SG CYS 89 D CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf29 G SG CYS 150 E CYS 131 1_555 G SG CYS 185 E CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf30 G SG CYS 310 E CYS 291 1_555 G SG CYS 320 E CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf31 G SG CYS 355 E CYS 336 1_555 G SG CYS 380 E CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf32 G SG CYS 398 E CYS 379 1_555 G SG CYS 451 E CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.095 ? disulf ? disulf33 G SG CYS 410 E CYS 391 1_555 G SG CYS 544 E CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.233 ? disulf ? disulf34 G SG CYS 557 E CYS 538 1_555 G SG CYS 609 E CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf35 G SG CYS 636 E CYS 617 1_555 G SG CYS 668 E CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf36 G SG CYS 681 E CYS 662 1_555 G SG CYS 690 E CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf37 G SG CYS 757 E CYS 738 1_555 G SG CYS 779 E CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf38 G SG CYS 762 E CYS 743 1_555 G SG CYS 768 E CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf39 G SG CYS 1051 E CYS 1032 1_555 G SG CYS 1062 E CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf40 G SG CYS 1101 E CYS 1082 1_555 G SG CYS 1145 E CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf41 H SG CYS 22 F CYS 22 1_555 H SG CYS 96 F CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf42 I SG CYS 23 G CYS 23 1_555 I SG CYS 89 G CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 80 A ASN 61 1_555 Y C1 NAG . A NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 141 A ASN 122 1_555 Z C1 NAG . A NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 184 A ASN 165 1_555 IA C1 NAG . A NAG 1319 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 253 A ASN 234 1_555 AA C1 NAG . A NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 301 A ASN 282 1_555 BA C1 NAG . A NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 350 A ASN 331 1_555 CA C1 NAG . A NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 362 A ASN 343 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 622 A ASN 603 1_555 DA C1 NAG . A NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 635 A ASN 616 1_555 EA C1 NAG . A NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 676 A ASN 657 1_555 FA C1 NAG . A NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 728 A ASN 709 1_555 GA C1 NAG . A NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 736 A ASN 717 1_555 J C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 820 A ASN 801 1_555 K C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale14 A ND2 ASN 1093 A ASN 1074 1_555 HA C1 NAG . A NAG 1314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? covale ? covale15 A ND2 ASN 1117 A ASN 1098 1_555 L C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.491 ? covale ? covale16 A ND2 ASN 1153 A ASN 1134 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? covale ? covale17 D ND2 ASN 80 B ASN 61 1_555 JA C1 NAG . B NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? covale ? covale18 D ND2 ASN 141 B ASN 122 1_555 KA C1 NAG . B NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? covale ? covale19 D ND2 ASN 184 B ASN 165 1_555 TA C1 NAG . B NAG 1319 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale ? covale20 D ND2 ASN 253 B ASN 234 1_555 LA C1 NAG . B NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? covale ? covale21 D ND2 ASN 301 B ASN 282 1_555 MA C1 NAG . B NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale22 D ND2 ASN 350 B ASN 331 1_555 NA C1 NAG . B NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ? covale ? covale23 D ND2 ASN 362 B ASN 343 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale ? covale24 D ND2 ASN 622 B ASN 603 1_555 OA C1 NAG . B NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.491 ? covale ? covale25 D ND2 ASN 635 B ASN 616 1_555 PA C1 NAG . B NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? covale ? covale26 D ND2 ASN 676 B ASN 657 1_555 QA C1 NAG . B NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale27 D ND2 ASN 728 B ASN 709 1_555 RA C1 NAG . B NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? covale ? covale28 D ND2 ASN 736 B ASN 717 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? covale ? covale29 D ND2 ASN 820 B ASN 801 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale30 D ND2 ASN 1093 B ASN 1074 1_555 SA C1 NAG . B NAG 1314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? covale ? covale31 D ND2 ASN 1117 B ASN 1098 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.491 ? covale ? covale32 D ND2 ASN 1153 B ASN 1134 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? covale ? covale33 G ND2 ASN 80 E ASN 61 1_555 UA C1 NAG . E NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? covale ? covale34 G ND2 ASN 141 E ASN 122 1_555 VA C1 NAG . E NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? covale ? covale35 G ND2 ASN 184 E ASN 165 1_555 EB C1 NAG . E NAG 1319 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale ? covale36 G ND2 ASN 253 E ASN 234 1_555 WA C1 NAG . E NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale37 G ND2 ASN 301 E ASN 282 1_555 XA C1 NAG . E NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale38 G ND2 ASN 350 E ASN 331 1_555 YA C1 NAG . E NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ? covale ? covale39 G ND2 ASN 362 E ASN 343 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale ? covale40 G ND2 ASN 622 E ASN 603 1_555 ZA C1 NAG . E NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale ? covale41 G ND2 ASN 635 E ASN 616 1_555 AB C1 NAG . E NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale42 G ND2 ASN 676 E ASN 657 1_555 BB C1 NAG . E NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? covale ? covale43 G ND2 ASN 728 E ASN 709 1_555 CB C1 NAG . E NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? covale ? covale44 G ND2 ASN 736 E ASN 717 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? covale ? covale45 G ND2 ASN 820 E ASN 801 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale46 G ND2 ASN 1093 E ASN 1074 1_555 DB C1 NAG . E NAG 1314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? covale ? covale47 G ND2 ASN 1117 E ASN 1098 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.491 ? covale ? covale48 G ND2 ASN 1153 E ASN 1134 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? covale ? covale49 J O4 NAG . I NAG 1 1_555 J C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? covale ? covale50 K O4 NAG . J NAG 1 1_555 K C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? covale ? covale51 L O4 NAG . K NAG 1 1_555 L C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.489 ? covale ? covale52 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.5 ? covale ? covale53 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? covale ? covale54 N O6 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 FUC . N FUC 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.481 ? covale ? covale55 N O4 NAG . N NAG 2 1_555 N C1 BMA . N BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? covale ? covale56 N O3 BMA . N BMA 3 1_555 N C1 MAN . N MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? covale ? covale57 N O6 BMA . N BMA 3 1_555 N C1 MAN . N MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.486 ? covale ? covale58 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? covale ? covale59 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? covale ? covale60 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.489 ? covale ? covale61 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.5 ? covale ? covale62 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? covale ? covale63 S O6 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 FUC . S FUC 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.482 ? covale ? covale64 S O4 NAG . S NAG 2 1_555 S C1 BMA . S BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? covale ? covale65 S O3 BMA . S BMA 3 1_555 S C1 MAN . S MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? covale ? covale66 S O6 BMA . S BMA 3 1_555 S C1 MAN . S MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.487 ? covale ? covale67 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? covale ? covale68 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? covale ? covale69 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.49 ? covale ? covale70 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.5 ? covale ? covale71 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? covale ? covale72 X O6 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 FUC . X FUC 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.481 ? covale ? covale73 X O4 NAG . X NAG 2 1_555 X C1 BMA . X BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? covale ? covale74 X O3 BMA . X BMA 3 1_555 X C1 MAN . X MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? covale ? covale75 X O6 BMA . X BMA 3 1_555 X C1 MAN . X MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.487 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 306 n n C1 O1 NAG sing 307 n n C1 O5 NAG sing 308 n n C1 H1 NAG sing 309 n n C2 C3 NAG sing 310 n n C2 N2 NAG sing 311 n n C2 H2 NAG sing 312 n n C3 C4 NAG sing 313 n n C3 O3 NAG sing 314 n n C3 H3 NAG sing 315 n n C4 C5 NAG sing 316 n n C4 O4 NAG sing 317 n n C4 H4 NAG sing 318 n n C5 C6 NAG sing 319 n n C5 O5 NAG sing 320 n n C5 H5 NAG sing 321 n n C6 O6 NAG sing 322 n n C6 H61 NAG sing 323 n n C6 H62 NAG sing 324 n n C7 C8 NAG sing 325 n n C7 N2 NAG sing 326 n n C7 O7 NAG doub 327 n n C8 H81 NAG sing 328 n n C8 H82 NAG sing 329 n n C8 H83 NAG sing 330 n n N2 HN2 NAG sing 331 n n O1 HO1 NAG sing 332 n n O3 HO3 NAG sing 333 n n O4 HO4 NAG sing 334 n n O6 HO6 NAG sing 335 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 6WPS _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code Y 6 NAG A 1 1301 1301 NAG NAG . Z 6 NAG A 1 1302 1302 NAG NAG . AA 6 NAG A 1 1303 1303 NAG NAG . BA 6 NAG A 1 1304 1304 NAG NAG . CA 6 NAG A 1 1305 1305 NAG NAG . DA 6 NAG A 1 1306 1306 NAG NAG . EA 6 NAG A 1 1307 1307 NAG NAG . FA 6 NAG A 1 1308 1308 NAG NAG . GA 6 NAG A 1 1309 1309 NAG NAG . HA 6 NAG A 1 1314 1314 NAG NAG . IA 6 NAG A 1 1319 1319 NAG NAG . JA 6 NAG B 1 1301 1301 NAG NAG . KA 6 NAG B 1 1302 1302 NAG NAG . LA 6 NAG B 1 1303 1303 NAG NAG . MA 6 NAG B 1 1304 1304 NAG NAG . NA 6 NAG B 1 1305 1305 NAG NAG . OA 6 NAG B 1 1306 1306 NAG NAG . PA 6 NAG B 1 1307 1307 NAG NAG . QA 6 NAG B 1 1308 1308 NAG NAG . RA 6 NAG B 1 1309 1309 NAG NAG . SA 6 NAG B 1 1314 1314 NAG NAG . TA 6 NAG B 1 1319 1319 NAG NAG . UA 6 NAG E 1 1301 1301 NAG NAG . VA 6 NAG E 1 1302 1302 NAG NAG . WA 6 NAG E 1 1303 1303 NAG NAG . XA 6 NAG E 1 1304 1304 NAG NAG . YA 6 NAG E 1 1305 1305 NAG NAG . ZA 6 NAG E 1 1306 1306 NAG NAG . AB 6 NAG E 1 1307 1307 NAG NAG . BB 6 NAG E 1 1308 1308 NAG NAG . CB 6 NAG E 1 1309 1309 NAG NAG . DB 6 NAG E 1 1314 1314 NAG NAG . EB 6 NAG E 1 1319 1319 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . LA 6 246.328 215.033 183.708 1 51.79 ? C1 NAG 1303 B 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . LA 6 245.205 213.989 183.387 1 52.6 ? C2 NAG 1303 B 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . LA 6 245.581 212.645 184.05 1 52.06 ? C3 NAG 1303 B 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . LA 6 246.941 212.184 183.488 1 52.86 ? C4 NAG 1303 B 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . LA 6 248 213.265 183.803 1 52.05 ? C5 NAG 1303 B 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . LA 6 249.359 212.896 183.236 1 53.89 ? C6 NAG 1303 B 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . LA 6 242.821 214.579 183.22 1 51.99 ? C7 NAG 1303 B 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . LA 6 241.604 215.127 183.901 1 51.57 ? C8 NAG 1303 B 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . LA 6 243.939 214.493 183.925 1 52.48 ? N2 NAG 1303 B 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . LA 6 244.577 211.663 183.759 1 52.82 ? O3 NAG 1303 B 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . LA 6 247.305 210.95 184.098 1 54.32 ? O4 NAG 1303 B 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . LA 6 247.595 214.543 183.207 1 51.97 ? O5 NAG 1303 B 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . LA 6 250.36 213.806 183.674 1 53.24 ? O6 NAG 1303 B 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . LA 6 242.785 214.215 182.039 1 51.72 ? O7 NAG 1303 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 14 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 40 _model_server_stats.query_time_ms 244 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 14 #