data_6X15 # _model_server_result.job_id sYkRRhUZ1D10Dz_zOIjyog _model_server_result.datetime_utc '2025-01-03 05:24:29' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6x15 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"AA","auth_seq_id":506}' # _entry.id 6X15 # _exptl.entry_id 6X15 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 200.59 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MERCURY (II) ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 3 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6X15 _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6X15 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 H N N ? 4 AA N N ? 4 SA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A C FME 1 A FME 1 1_555 A N GLY 2 A GLY 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale2 B C FME 1 B FME 1 1_555 B N GLY 2 B GLY 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale3 C C FME 1 C FME 1 1_555 C N GLY 2 C GLY 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? metalc ? metalc1 A O TYR 89 A TYR 89 1_555 F NA NA . A NA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.496 ? metalc ? metalc2 A OG1 THR 92 A THR 92 1_555 F NA NA . A NA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.608 ? metalc ? metalc3 A OG SER 93 A SER 93 1_555 F NA NA . A NA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.525 ? metalc ? metalc4 A O GLY 306 A GLY 306 1_555 D NA NA . A NA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.867 ? metalc ? metalc5 A O THR 308 A THR 308 1_555 E NA NA . A NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.54 ? metalc ? metalc6 A O ASN 310 A ASN 310 1_555 D NA NA . A NA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.485 ? metalc ? metalc7 A OD1 ASN 310 A ASN 310 1_555 F NA NA . A NA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.527 ? metalc ? metalc8 A OD2 ASP 312 A ASP 312 1_555 F NA NA . A NA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.512 ? metalc ? metalc9 A O SER 349 A SER 349 1_555 E NA NA . A NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.537 ? metalc ? metalc10 A O ILE 350 A ILE 350 1_555 E NA NA . A NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.077 ? metalc ? metalc11 A O THR 352 A THR 352 1_555 E NA NA . A NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.548 ? metalc ? metalc12 A SG CYS 364 A CYS 364 1_555 H HG HG . A HG 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.845 ? metalc ? metalc13 A OH TYR 383 A TYR 383 1_555 H HG HG . A HG 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.532 ? metalc ? metalc14 A O ASN 401 A ASN 401 1_555 D NA NA . A NA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.498 ? metalc ? metalc15 A OD1 ASP 405 A ASP 405 1_555 D NA NA . A NA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.063 ? metalc ? metalc16 A OD2 ASP 405 A ASP 405 1_555 D NA NA . A NA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.475 ? metalc ? metalc17 D NA NA . A NA 501 1_555 FB O HOH . A HOH 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.467 ? metalc ? metalc18 B O TYR 89 B TYR 89 1_555 Y NA NA . B NA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.495 ? metalc ? metalc19 B OG1 THR 92 B THR 92 1_555 Y NA NA . B NA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.608 ? metalc ? metalc20 B OG SER 93 B SER 93 1_555 Y NA NA . B NA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.525 ? metalc ? metalc21 B O GLY 306 B GLY 306 1_555 W NA NA . B NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.866 ? metalc ? metalc22 B O THR 308 B THR 308 1_555 X NA NA . B NA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.54 ? metalc ? metalc23 B O ASN 310 B ASN 310 1_555 W NA NA . B NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.485 ? metalc ? metalc24 B OD1 ASN 310 B ASN 310 1_555 Y NA NA . B NA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.528 ? metalc ? metalc25 B OD2 ASP 312 B ASP 312 1_555 Y NA NA . B NA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.512 ? metalc ? metalc26 B O SER 349 B SER 349 1_555 X NA NA . B NA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.537 ? metalc ? metalc27 B O ILE 350 B ILE 350 1_555 X NA NA . B NA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.077 ? metalc ? metalc28 B O THR 352 B THR 352 1_555 X NA NA . B NA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.547 ? metalc ? metalc29 B SG CYS 364 B CYS 364 1_555 AA HG HG . B HG 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.846 ? metalc ? metalc30 B OH TYR 383 B TYR 383 1_555 AA HG HG . B HG 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.531 ? metalc ? metalc31 B O ASN 401 B ASN 401 1_555 W NA NA . B NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.499 ? metalc ? metalc32 B OD1 ASP 405 B ASP 405 1_555 W NA NA . B NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.062 ? metalc ? metalc33 B OD2 ASP 405 B ASP 405 1_555 W NA NA . B NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.475 ? metalc ? metalc34 W NA NA . B NA 502 1_555 GB O HOH . B HOH 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.466 ? metalc ? metalc35 C O TYR 89 C TYR 89 1_555 QA NA NA . C NA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.496 ? metalc ? metalc36 C OG1 THR 92 C THR 92 1_555 QA NA NA . C NA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.607 ? metalc ? metalc37 C OG SER 93 C SER 93 1_555 QA NA NA . C NA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.525 ? metalc ? metalc38 C O GLY 306 C GLY 306 1_555 OA NA NA . C NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.867 ? metalc ? metalc39 C O THR 308 C THR 308 1_555 PA NA NA . C NA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.54 ? metalc ? metalc40 C O ASN 310 C ASN 310 1_555 OA NA NA . C NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.486 ? metalc ? metalc41 C OD1 ASN 310 C ASN 310 1_555 QA NA NA . C NA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.528 ? metalc ? metalc42 C OD2 ASP 312 C ASP 312 1_555 QA NA NA . C NA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.511 ? metalc ? metalc43 C O SER 349 C SER 349 1_555 PA NA NA . C NA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.537 ? metalc ? metalc44 C O ILE 350 C ILE 350 1_555 PA NA NA . C NA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.078 ? metalc ? metalc45 C O THR 352 C THR 352 1_555 PA NA NA . C NA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.548 ? metalc ? metalc46 C SG CYS 364 C CYS 364 1_555 SA HG HG . C HG 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.845 ? metalc ? metalc47 C OH TYR 383 C TYR 383 1_555 SA HG HG . C HG 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.532 ? metalc ? metalc48 C O ASN 401 C ASN 401 1_555 OA NA NA . C NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.499 ? metalc ? metalc49 C OD1 ASP 405 C ASP 405 1_555 OA NA NA . C NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.063 ? metalc ? metalc50 C OD2 ASP 405 C ASP 405 1_555 OA NA NA . C NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.475 ? metalc ? metalc51 OA NA NA . C NA 502 1_555 HB O HOH . C HOH 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.467 ? # _chem_comp.formula 'Hg 2' _chem_comp.formula_weight 200.59 _chem_comp.id HG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MERCURY (II) ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 6X15 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code D 2 NA A 1 501 453 NA NA . E 2 NA A 1 502 454 NA NA . F 2 NA A 1 503 455 NA NA . G 3 ASP A 1 504 500 ASP ASP . H 4 HG A 1 505 501 HG HG . I 5 6OU A 1 506 502 6OU 6OU . J 5 6OU A 1 507 503 6OU 6OU . K 5 6OU A 1 508 504 6OU 6OU . L 5 6OU A 1 509 506 6OU C14 . M 5 6OU A 1 510 507 6OU D12 . N 5 6OU A 1 511 508 6OU D12 . O 5 6OU A 1 512 509 6OU D10 . P 5 6OU A 1 513 510 6OU HEX . Q 5 6OU A 1 514 511 6OU HEX . R 5 6OU A 1 515 512 6OU OCT . S 5 6OU A 1 516 513 6OU HEX . T 5 6OU A 1 517 514 6OU HEX . U 5 6OU A 1 518 505 6OU R16 . V 5 6OU B 1 501 505 6OU R16 . W 2 NA B 1 502 453 NA NA . X 2 NA B 1 503 454 NA NA . Y 2 NA B 1 504 455 NA NA . Z 3 ASP B 1 505 500 ASP ASP . AA 4 HG B 1 506 501 HG HG . BA 5 6OU B 1 507 502 6OU 6OU . CA 5 6OU B 1 508 503 6OU 6OU . DA 5 6OU B 1 509 504 6OU 6OU . EA 5 6OU B 1 510 506 6OU C14 . FA 5 6OU B 1 511 507 6OU D12 . GA 5 6OU B 1 512 508 6OU D12 . HA 5 6OU B 1 513 509 6OU D10 . IA 5 6OU B 1 514 510 6OU HEX . JA 5 6OU B 1 515 511 6OU HEX . KA 5 6OU B 1 516 512 6OU OCT . LA 5 6OU B 1 517 513 6OU HEX . MA 5 6OU B 1 518 514 6OU HEX . NA 5 6OU C 1 501 505 6OU R16 . OA 2 NA C 1 502 453 NA NA . PA 2 NA C 1 503 454 NA NA . QA 2 NA C 1 504 455 NA NA . RA 3 ASP C 1 505 500 ASP ASP . SA 4 HG C 1 506 501 HG HG . TA 5 6OU C 1 507 502 6OU 6OU . UA 5 6OU C 1 508 503 6OU 6OU . VA 5 6OU C 1 509 504 6OU 6OU . WA 5 6OU C 1 510 506 6OU C14 . XA 5 6OU C 1 511 507 6OU D12 . YA 5 6OU C 1 512 508 6OU D12 . ZA 5 6OU C 1 513 509 6OU D10 . AB 5 6OU C 1 514 510 6OU HEX . BB 5 6OU C 1 515 511 6OU HEX . CB 5 6OU C 1 516 512 6OU OCT . DB 5 6OU C 1 517 513 6OU HEX . EB 5 6OU C 1 518 514 6OU HEX . FB 6 HOH A 1 601 456 HOH HOH . FB 6 HOH A 2 602 457 HOH HOH . FB 6 HOH A 3 603 458 HOH HOH . GB 6 HOH B 1 601 456 HOH HOH . GB 6 HOH B 2 602 457 HOH HOH . GB 6 HOH B 3 603 458 HOH HOH . HB 6 HOH C 1 601 456 HOH HOH . HB 6 HOH C 2 602 457 HOH HOH . HB 6 HOH C 3 603 458 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol HG _atom_site.label_atom_id HG _atom_site.label_comp_id HG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id AA _atom_site.label_entity_id 4 _atom_site.Cartn_x 143.378 _atom_site.Cartn_y 154.979 _atom_site.Cartn_z 130.616 _atom_site.occupancy 0.3 _atom_site.B_iso_or_equiv 54.41 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id HG _atom_site.auth_comp_id HG _atom_site.auth_seq_id 506 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 10 _model_server_stats.parse_time_ms 13 _model_server_stats.create_model_time_ms 19 _model_server_stats.query_time_ms 321 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 1 #