data_6X3P # _model_server_result.job_id QStyLJfaA_jTkpQ4VM1Wog _model_server_result.datetime_utc '2024-10-19 20:22:31' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6x3p # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":703}' # _entry.id 6X3P # _exptl.entry_id 6X3P _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 62.068 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 1,2-ETHANEDIOL _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6X3P _cell.length_a 72.01 _cell.length_b 104.64 _cell.length_c 38 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6X3P _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 18 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 3 _struct_asym.id D _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # _chem_comp.formula 'C2 H6 O2' _chem_comp.formula_weight 62.068 _chem_comp.id EDO _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 1,2-ETHANEDIOL _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms 'ETHYLENE GLYCOL' # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 O1 EDO sing 115 n n C1 C2 EDO sing 116 n n C1 H11 EDO sing 117 n n C1 H12 EDO sing 118 n n O1 HO1 EDO sing 119 n n C2 O2 EDO sing 120 n n C2 H21 EDO sing 121 n n C2 H22 EDO sing 122 n n O2 HO2 EDO sing 123 n n # _atom_sites.entry_id 6X3P _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.013887 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.009557 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.026316 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 UM4 A 1 701 1 UM4 SCH . C 2 UM4 A 1 702 2 UM4 SCH . D 3 EDO A 1 703 3 EDO EDO . E 4 BTB A 1 704 4 BTB BTB . F 5 HOH A 1 801 190 HOH WAT . F 5 HOH A 2 802 187 HOH WAT . F 5 HOH A 3 803 139 HOH WAT . F 5 HOH A 4 804 71 HOH WAT . F 5 HOH A 5 805 61 HOH WAT . F 5 HOH A 6 806 154 HOH WAT . F 5 HOH A 7 807 104 HOH WAT . F 5 HOH A 8 808 185 HOH WAT . F 5 HOH A 9 809 13 HOH WAT . F 5 HOH A 10 810 138 HOH WAT . F 5 HOH A 11 811 65 HOH WAT . F 5 HOH A 12 812 163 HOH WAT . F 5 HOH A 13 813 192 HOH WAT . F 5 HOH A 14 814 90 HOH WAT . F 5 HOH A 15 815 115 HOH WAT . F 5 HOH A 16 816 148 HOH WAT . F 5 HOH A 17 817 176 HOH WAT . F 5 HOH A 18 818 68 HOH WAT . F 5 HOH A 19 819 103 HOH WAT . F 5 HOH A 20 820 136 HOH WAT . F 5 HOH A 21 821 143 HOH WAT . F 5 HOH A 22 822 66 HOH WAT . F 5 HOH A 23 823 121 HOH WAT . F 5 HOH A 24 824 40 HOH WAT . F 5 HOH A 25 825 75 HOH WAT . F 5 HOH A 26 826 101 HOH WAT . F 5 HOH A 27 827 141 HOH WAT . F 5 HOH A 28 828 31 HOH WAT . F 5 HOH A 29 829 177 HOH WAT . F 5 HOH A 30 830 189 HOH WAT . F 5 HOH A 31 831 199 HOH WAT . F 5 HOH A 32 832 3 HOH WAT . F 5 HOH A 33 833 168 HOH WAT . F 5 HOH A 34 834 153 HOH WAT . F 5 HOH A 35 835 93 HOH WAT . F 5 HOH A 36 836 39 HOH WAT . F 5 HOH A 37 837 45 HOH WAT . F 5 HOH A 38 838 183 HOH WAT . F 5 HOH A 39 839 165 HOH WAT . F 5 HOH A 40 840 7 HOH WAT . F 5 HOH A 41 841 12 HOH WAT . F 5 HOH A 42 842 144 HOH WAT . F 5 HOH A 43 843 26 HOH WAT . F 5 HOH A 44 844 63 HOH WAT . F 5 HOH A 45 845 127 HOH WAT . F 5 HOH A 46 846 69 HOH WAT . F 5 HOH A 47 847 73 HOH WAT . F 5 HOH A 48 848 84 HOH WAT . F 5 HOH A 49 849 81 HOH WAT . F 5 HOH A 50 850 18 HOH WAT . F 5 HOH A 51 851 37 HOH WAT . F 5 HOH A 52 852 170 HOH WAT . F 5 HOH A 53 853 17 HOH WAT . F 5 HOH A 54 854 2 HOH WAT . F 5 HOH A 55 855 108 HOH WAT . F 5 HOH A 56 856 188 HOH WAT . F 5 HOH A 57 857 150 HOH WAT . F 5 HOH A 58 858 152 HOH WAT . F 5 HOH A 59 859 132 HOH WAT . F 5 HOH A 60 860 58 HOH WAT . F 5 HOH A 61 861 162 HOH WAT . F 5 HOH A 62 862 147 HOH WAT . F 5 HOH A 63 863 8 HOH WAT . F 5 HOH A 64 864 164 HOH WAT . F 5 HOH A 65 865 19 HOH WAT . F 5 HOH A 66 866 46 HOH WAT . F 5 HOH A 67 867 1 HOH WAT . F 5 HOH A 68 868 91 HOH WAT . F 5 HOH A 69 869 158 HOH WAT . F 5 HOH A 70 870 54 HOH WAT . F 5 HOH A 71 871 178 HOH WAT . F 5 HOH A 72 872 125 HOH WAT . F 5 HOH A 73 873 87 HOH WAT . F 5 HOH A 74 874 74 HOH WAT . F 5 HOH A 75 875 44 HOH WAT . F 5 HOH A 76 876 111 HOH WAT . F 5 HOH A 77 877 171 HOH WAT . F 5 HOH A 78 878 11 HOH WAT . F 5 HOH A 79 879 43 HOH WAT . F 5 HOH A 80 880 16 HOH WAT . F 5 HOH A 81 881 133 HOH WAT . F 5 HOH A 82 882 60 HOH WAT . F 5 HOH A 83 883 166 HOH WAT . F 5 HOH A 84 884 191 HOH WAT . F 5 HOH A 85 885 200 HOH WAT . F 5 HOH A 86 886 134 HOH WAT . F 5 HOH A 87 887 28 HOH WAT . F 5 HOH A 88 888 159 HOH WAT . F 5 HOH A 89 889 182 HOH WAT . F 5 HOH A 90 890 48 HOH WAT . F 5 HOH A 91 891 47 HOH WAT . F 5 HOH A 92 892 157 HOH WAT . F 5 HOH A 93 893 146 HOH WAT . F 5 HOH A 94 894 27 HOH WAT . F 5 HOH A 95 895 42 HOH WAT . F 5 HOH A 96 896 30 HOH WAT . F 5 HOH A 97 897 82 HOH WAT . F 5 HOH A 98 898 137 HOH WAT . F 5 HOH A 99 899 32 HOH WAT . F 5 HOH A 100 900 23 HOH WAT . F 5 HOH A 101 901 21 HOH WAT . F 5 HOH A 102 902 184 HOH WAT . F 5 HOH A 103 903 24 HOH WAT . F 5 HOH A 104 904 62 HOH WAT . F 5 HOH A 105 905 77 HOH WAT . F 5 HOH A 106 906 107 HOH WAT . F 5 HOH A 107 907 34 HOH WAT . F 5 HOH A 108 908 67 HOH WAT . F 5 HOH A 109 909 151 HOH WAT . F 5 HOH A 110 910 95 HOH WAT . F 5 HOH A 111 911 36 HOH WAT . F 5 HOH A 112 912 72 HOH WAT . F 5 HOH A 113 913 55 HOH WAT . F 5 HOH A 114 914 5 HOH WAT . F 5 HOH A 115 915 105 HOH WAT . F 5 HOH A 116 916 106 HOH WAT . F 5 HOH A 117 917 79 HOH WAT . F 5 HOH A 118 918 56 HOH WAT . F 5 HOH A 119 919 135 HOH WAT . F 5 HOH A 120 920 142 HOH WAT . F 5 HOH A 121 921 86 HOH WAT . F 5 HOH A 122 922 155 HOH WAT . F 5 HOH A 123 923 83 HOH WAT . F 5 HOH A 124 924 130 HOH WAT . F 5 HOH A 125 925 53 HOH WAT . F 5 HOH A 126 926 64 HOH WAT . F 5 HOH A 127 927 4 HOH WAT . F 5 HOH A 128 928 160 HOH WAT . F 5 HOH A 129 929 194 HOH WAT . F 5 HOH A 130 930 186 HOH WAT . F 5 HOH A 131 931 181 HOH WAT . F 5 HOH A 132 932 197 HOH WAT . F 5 HOH A 133 933 92 HOH WAT . F 5 HOH A 134 934 20 HOH WAT . F 5 HOH A 135 935 174 HOH WAT . F 5 HOH A 136 936 25 HOH WAT . F 5 HOH A 137 937 172 HOH WAT . F 5 HOH A 138 938 6 HOH WAT . F 5 HOH A 139 939 10 HOH WAT . F 5 HOH A 140 940 173 HOH WAT . F 5 HOH A 141 941 169 HOH WAT . F 5 HOH A 142 942 52 HOH WAT . F 5 HOH A 143 943 145 HOH WAT . F 5 HOH A 144 944 78 HOH WAT . F 5 HOH A 145 945 140 HOH WAT . F 5 HOH A 146 946 175 HOH WAT . F 5 HOH A 147 947 76 HOH WAT . F 5 HOH A 148 948 109 HOH WAT . F 5 HOH A 149 949 118 HOH WAT . F 5 HOH A 150 950 57 HOH WAT . F 5 HOH A 151 951 124 HOH WAT . F 5 HOH A 152 952 113 HOH WAT . F 5 HOH A 153 953 195 HOH WAT . F 5 HOH A 154 954 59 HOH WAT . F 5 HOH A 155 955 51 HOH WAT . F 5 HOH A 156 956 179 HOH WAT . F 5 HOH A 157 957 99 HOH WAT . F 5 HOH A 158 958 167 HOH WAT . F 5 HOH A 159 959 50 HOH WAT . F 5 HOH A 160 960 38 HOH WAT . F 5 HOH A 161 961 70 HOH WAT . F 5 HOH A 162 962 180 HOH WAT . F 5 HOH A 163 963 94 HOH WAT . F 5 HOH A 164 964 193 HOH WAT . F 5 HOH A 165 965 117 HOH WAT . F 5 HOH A 166 966 80 HOH WAT . F 5 HOH A 167 967 161 HOH WAT . F 5 HOH A 168 968 149 HOH WAT . F 5 HOH A 169 969 97 HOH WAT . F 5 HOH A 170 970 131 HOH WAT . F 5 HOH A 171 971 33 HOH WAT . F 5 HOH A 172 972 122 HOH WAT . F 5 HOH A 173 973 35 HOH WAT . F 5 HOH A 174 974 22 HOH WAT . F 5 HOH A 175 975 129 HOH WAT . F 5 HOH A 176 976 114 HOH WAT . F 5 HOH A 177 977 15 HOH WAT . F 5 HOH A 178 978 202 HOH WAT . F 5 HOH A 179 979 96 HOH WAT . F 5 HOH A 180 980 89 HOH WAT . F 5 HOH A 181 981 198 HOH WAT . F 5 HOH A 182 982 102 HOH WAT . F 5 HOH A 183 983 116 HOH WAT . F 5 HOH A 184 984 9 HOH WAT . F 5 HOH A 185 985 126 HOH WAT . F 5 HOH A 186 986 88 HOH WAT . F 5 HOH A 187 987 100 HOH WAT . F 5 HOH A 188 988 85 HOH WAT . F 5 HOH A 189 989 123 HOH WAT . F 5 HOH A 190 990 119 HOH WAT . F 5 HOH A 191 991 156 HOH WAT . F 5 HOH A 192 992 14 HOH WAT . F 5 HOH A 193 993 98 HOH WAT . F 5 HOH A 194 994 128 HOH WAT . F 5 HOH A 195 995 41 HOH WAT . F 5 HOH A 196 996 49 HOH WAT . F 5 HOH A 197 997 196 HOH WAT . F 5 HOH A 198 998 120 HOH WAT . F 5 HOH A 199 999 29 HOH WAT . F 5 HOH A 200 1000 112 HOH WAT . F 5 HOH A 201 1001 201 HOH WAT . F 5 HOH A 202 1002 110 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 EDO . . . D 3 -13.738 13.256 -6.037 1 23.38 ? C1 EDO 703 A 1 HETATM 2 O O1 EDO . . . D 3 -13.992 14.65 -6.165 1 23.39 ? O1 EDO 703 A 1 HETATM 3 C C2 EDO . . . D 3 -14.582 12.427 -7.036 1 24.31 ? C2 EDO 703 A 1 HETATM 4 O O2 EDO . . . D 3 -14.942 13.155 -8.226 1 22.94 ? O2 EDO 703 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 28 _model_server_stats.parse_time_ms 22 _model_server_stats.create_model_time_ms 3 _model_server_stats.query_time_ms 305 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 4 #