data_6X4C
#
_model_server_result.job_id            ZTGVzBmp5hZ13dSbs7TpsQ 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-12-26 18:48:53' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          6x4c 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":601}' 
#
_entry.id    6X4C 
#
_exptl.entry_id    6X4C 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              445.442 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            7-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]-4-fluorophenoxy}-5,8-dimethylnaphthalene-2-carbonitrile 
_entity.pdbx_number_of_molecules    1 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          100.13 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            6X4C 
_cell.length_a            162.186 
_cell.length_b            74.11 
_cell.length_c            108.357 
_cell.Z_PDB               4 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 6X4C 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        5 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'C 1 2 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    dimeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      2 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
_struct_asym.details                        ? 
_struct_asym.entity_id                      3 
_struct_asym.id                             C 
_struct_asym.pdbx_modified                  N 
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag    N 
#
_chem_comp.formula           'C25 H20 F N3 O4' 
_chem_comp.formula_weight    445.442 
_chem_comp.id                UNS 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              7-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]-4-fluorophenoxy}-5,8-dimethylnaphthalene-2-carbonitrile 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
O0Q C0K UNS doub 356 n n 
C0E C0D UNS sing 357 n n 
C0E N0H UNS sing 358 n n 
C0D O0B UNS sing 359 n n 
C0K N0H UNS sing 360 n n 
C0K N0M UNS sing 361 n n 
N0H C0P UNS sing 362 n n 
N0M C0N UNS sing 363 n n 
O0B C05 UNS sing 364 n n 
C0P C0O UNS doub 365 n n 
C00 C05 UNS doub 366 n y 
C00 C01 UNS sing 367 n y 
F33 C01 UNS sing 368 n n 
C0N C0O UNS sing 369 n n 
C0N O0S UNS doub 370 n n 
C05 C04 UNS sing 371 n y 
C01 C02 UNS doub 372 n y 
C04 O0A UNS sing 373 n n 
C04 C03 UNS doub 374 n y 
C02 C03 UNS sing 375 n y 
O0A CAL UNS sing 376 n n 
CAM CAL UNS doub 377 n y 
CAM CAH UNS sing 378 n y 
CAL CAK UNS sing 379 n y 
C32 CAH UNS sing 380 n n 
CAH CAI UNS doub 381 n y 
CAK C31 UNS sing 382 n n 
CAK CAJ UNS doub 383 n y 
CAI CAJ UNS sing 384 n y 
CAI CAY UNS sing 385 n y 
CAJ CBB UNS sing 386 n y 
CAY CAZ UNS doub 387 n y 
CBB CBA UNS doub 388 n y 
CAZ CBA UNS sing 389 n y 
CBA CBC UNS sing 390 n n 
CBC NBD UNS trip 391 n n 
CAM H1 UNS sing 392 n n 
CAY H2 UNS sing 393 n n 
CAZ H3 UNS sing 394 n n 
CBB H4 UNS sing 395 n n 
C0P H5 UNS sing 396 n n 
C00 H6 UNS sing 397 n n 
C0D H7 UNS sing 398 n n 
C0D H8 UNS sing 399 n n 
C0E H9 UNS sing 400 n n 
C0E H10 UNS sing 401 n n 
C0O H11 UNS sing 402 n n 
N0M H12 UNS sing 403 n n 
C02 H13 UNS sing 404 n n 
C03 H14 UNS sing 405 n n 
C31 H15 UNS sing 406 n n 
C31 H16 UNS sing 407 n n 
C31 H17 UNS sing 408 n n 
C32 H18 UNS sing 409 n n 
C32 H19 UNS sing 410 n n 
C32 H20 UNS sing 411 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     6X4C 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.006166 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.001101 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.013493 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.009375 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id          C 
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id        3 
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id           UNS 
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id    A 
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num      1 
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_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num     1 
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id       UNS 
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id      658 
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code     . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C CAH UNS . . . C 3 517.067 -31.313 144.302 1 75.21 ? CAH UNS 601 A 1 
HETATM 2 C CAI UNS . . . C 3 516.397 -32.092 145.288 1 67.65 ? CAI UNS 601 A 1 
HETATM 3 C CAJ UNS . . . C 3 516.839 -33.381 145.502 1 68.39 ? CAJ UNS 601 A 1 
HETATM 4 C CAK UNS . . . C 3 517.925 -33.902 144.755 1 70.92 ? CAK UNS 601 A 1 
HETATM 5 C CAL UNS . . . C 3 518.584 -33.127 143.785 1 68.77 ? CAL UNS 601 A 1 
HETATM 6 C CAM UNS . . . C 3 518.144 -31.827 143.562 1 70.42 ? CAM UNS 601 A 1 
HETATM 7 C CAY UNS . . . C 3 515.274 -31.571 146.063 1 75.9 ? CAY UNS 601 A 1 
HETATM 8 C CAZ UNS . . . C 3 514.663 -32.36 147.003 1 78.61 ? CAZ UNS 601 A 1 
HETATM 9 C CBA UNS . . . C 3 515.133 -33.706 147.222 1 76.01 ? CBA UNS 601 A 1 
HETATM 10 C CBB UNS . . . C 3 516.199 -34.207 146.487 1 70.26 ? CBB UNS 601 A 1 
HETATM 11 C CBC UNS . . . C 3 514.477 -34.602 148.254 1 74.64 ? CBC UNS 601 A 1 
HETATM 12 N NBD UNS . . . C 3 513.993 -35.305 149.035 1 79.86 ? NBD UNS 601 A 1 
HETATM 13 C C0P UNS . . . C 3 517.177 -35.7 140.415 1 72.31 ? C0P UNS 601 A 1 
HETATM 14 C C00 UNS . . . C 3 521.754 -32.019 140.433 1 62.49 ? C00 UNS 601 A 1 
HETATM 15 C C0D UNS . . . C 3 519.513 -33.542 138.94 1 67.3 ? C0D UNS 601 A 1 
HETATM 16 C C0E UNS . . . C 3 518.222 -34.358 138.67 1 72.14 ? C0E UNS 601 A 1 
HETATM 17 C C0K UNS . . . C 3 518.945 -36.751 139.09 1 70.95 ? C0K UNS 601 A 1 
HETATM 18 C C0N UNS . . . C 3 517.835 -38.005 140.856 1 73.71 ? C0N UNS 601 A 1 
HETATM 19 C C0O UNS . . . C 3 517.004 -36.834 141.148 1 75.47 ? C0O UNS 601 A 1 
HETATM 20 N N0H UNS . . . C 3 518.153 -35.656 139.379 1 69.35 ? N0H UNS 601 A 1 
HETATM 21 N N0M UNS . . . C 3 518.732 -37.854 139.851 1 69.24 ? N0M UNS 601 A 1 
HETATM 22 O O0A UNS . . . C 3 519.692 -33.673 143.021 1 63.64 ? O0A UNS 601 A 1 
HETATM 23 O O0B UNS . . . C 3 519.711 -33.495 140.353 1 62.06 ? O0B UNS 601 A 1 
HETATM 24 O O0Q UNS . . . C 3 519.802 -36.775 138.211 1 76.85 ? O0Q UNS 601 A 1 
HETATM 25 O O0S UNS . . . C 3 517.747 -39.062 141.463 1 71.45 ? O0S UNS 601 A 1 
HETATM 26 C C01 UNS . . . C 3 522.709 -31.376 141.253 1 71.37 ? C01 UNS 601 A 1 
HETATM 27 C C02 UNS . . . C 3 522.661 -31.494 142.659 1 69.89 ? C02 UNS 601 A 1 
HETATM 28 C C03 UNS . . . C 3 521.642 -32.27 143.255 1 66.6 ? C03 UNS 601 A 1 
HETATM 29 C C04 UNS . . . C 3 520.675 -32.915 142.436 1 62.65 ? C04 UNS 601 A 1 
HETATM 30 C C05 UNS . . . C 3 520.717 -32.807 141.019 1 61.67 ? C05 UNS 601 A 1 
HETATM 31 C C31 UNS . . . C 3 518.342 -35.323 145.055 1 69.46 ? C31 UNS 601 A 1 
HETATM 32 C C32 UNS . . . C 3 516.627 -29.893 144.021 1 71.6 ? C32 UNS 601 A 1 
HETATM 33 F F33 UNS . . . C 3 523.665 -30.645 140.675 1 88.57 ? F33 UNS 601 A 1 
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