data_6XAV # _model_server_result.job_id yJI2eNyQ24prtKLJ6I-4Lg _model_server_result.datetime_utc '2024-10-20 19:41:25' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6xav # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"Q","auth_seq_id":1501}' # _entry.id 6XAV # _exptl.entry_id 6XAV _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 11 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexadecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 16 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 11 _struct_asym.id Q _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 D O3' A 18 R A 18 1_555 Q MG MG . J MG 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.132 ? metalc ? metalc2 D O2' A 18 R A 18 1_555 Q MG MG . J MG 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.853 ? metalc ? metalc3 I O LEU 71 J LEU 71 1_555 R ZN ZN . J ZN 1502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.684 ? metalc ? metalc4 I SG CYS 85 J CYS 85 1_555 R ZN ZN . J ZN 1502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.928 ? metalc ? metalc5 I SG CYS 88 J CYS 88 1_555 R ZN ZN . J ZN 1502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.547 ? metalc ? metalc6 I OD1 ASP 460 J ASP 460 1_555 Q MG MG . J MG 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.136 ? metalc ? metalc7 I OD1 ASP 464 J ASP 464 1_555 Q MG MG . J MG 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.137 ? metalc ? metalc8 I OD2 ASP 464 J ASP 464 1_555 Q MG MG . J MG 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.241 ? metalc ? metalc9 I SG CYS 814 J CYS 814 1_555 S ZN ZN . J ZN 1503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.45 ? metalc ? metalc10 I SG CYS 888 J CYS 888 1_555 S ZN ZN . J ZN 1503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.384 ? metalc ? metalc11 I SG CYS 895 J CYS 895 1_555 S ZN ZN . J ZN 1503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.423 ? metalc ? metalc12 I SG CYS 898 J CYS 898 1_555 S ZN ZN . J ZN 1503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.413 ? hydrog 'DG-DC PAIR' hydrog1 B N1 DG 1 N DG 1 1_555 C O2 DC 29 T DC 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 B N1 DG 2 N DG 2 1_555 C N3 DC 28 T DC 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 B N2 DG 2 N DG 2 1_555 C O2 DC 28 T DC 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 B O6 DG 2 N DG 2 1_555 C N4 DC 28 T DC 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 B N1 DG 3 N DG 3 1_555 C N3 DC 27 T DC 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 B N2 DG 3 N DG 3 1_555 C O2 DC 27 T DC 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 B O6 DG 3 N DG 3 1_555 C N4 DC 27 T DC 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog8 B N3 DT 5 N DT 5 1_555 C O6 DG 26 T DG 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog9 B O2 DT 5 N DT 5 1_555 C N1 DG 26 T DG 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DA-DT PAIR' hydrog10 B N6 DA 19 N DA 17 1_555 C O4 DT 13 T DT 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DG PAIR' hydrog11 B O2 DC 20 N DC 18 1_555 C N1 DG 12 T DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DC PAIR' hydrog12 B N1 DG 21 N DG 19 1_555 C O2 DC 11 T DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 B N1 DG 22 N DG 20 1_555 C N3 DC 10 T DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 B N2 DG 22 N DG 20 1_555 C O2 DC 10 T DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 B O6 DG 22 N DG 20 1_555 C N4 DC 10 T DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 B N1 DA 25 N DA 23 1_555 C N3 DT 7 T DT 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 B N6 DA 25 N DA 23 1_555 C O4 DT 7 T DT 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 B N1 DA 26 N DA 24 1_555 C N3 DT 6 T DT 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 B N6 DA 26 N DA 24 1_555 C O4 DT 6 T DT 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 B N3 DC 29 N DC 27 1_555 C N1 DG 3 T DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 B N4 DC 29 N DC 27 1_555 C O6 DG 3 T DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 B O2 DC 29 N DC 27 1_555 C N2 DG 3 T DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 B N3 DC 30 N DC 28 1_555 C N1 DG 2 T DG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 B N4 DC 30 N DC 28 1_555 C O6 DG 2 T DG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 B O2 DC 30 N DC 28 1_555 C N2 DG 2 T DG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 B N3 DC 31 N DC 29 1_555 C N1 DG 1 T DG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 B N4 DC 31 N DC 29 1_555 C O6 DG 1 T DG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 B O2 DC 31 N DC 29 1_555 C N2 DG 1 T DG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 C N3 DT 15 T DT 15 1_555 D N1 A 18 R A 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 C O4 DT 15 T DT 15 1_555 D N6 A 18 R A 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 C N1 DA 16 T DA 16 1_555 D N3 U 17 R U 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 C N6 DA 16 T DA 16 1_555 D O4 U 17 R U 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-G PAIR' hydrog33 C O2 DC 17 T DC 17 1_555 D N2 G 16 R G 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 C N3 DC 18 T DC 18 1_555 D N1 G 15 R G 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 C N4 DC 18 T DC 18 1_555 D O6 G 15 R G 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 C O2 DC 18 T DC 18 1_555 D N2 G 15 R G 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 C N3 DT 19 T DT 19 1_555 D N1 A 14 R A 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 C O4 DT 19 T DT 19 1_555 D N6 A 14 R A 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 C N3 DC 20 T DC 20 1_555 D N1 G 13 R G 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 C N4 DC 20 T DC 20 1_555 D O6 G 13 R G 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 C O2 DC 20 T DC 20 1_555 D N2 G 13 R G 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 C N3 DT 21 T DT 21 1_555 D N1 A 12 R A 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 C O4 DT 21 T DT 21 1_555 D N6 A 12 R A 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 C N3 DC 22 T DC 22 1_555 D N1 G 11 R G 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 C N4 DC 22 T DC 22 1_555 D O6 G 11 R G 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 C O2 DC 22 T DC 22 1_555 D N2 G 11 R G 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 C N3 DC 23 T DC 23 1_555 D N1 G 10 R G 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 C N4 DC 23 T DC 23 1_555 D O6 G 10 R G 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 C O2 DC 23 T DC 23 1_555 D N2 G 10 R G 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 6XAV _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code Q 11 MG J 1 1501 1501 MG MG . R 12 ZN J 1 1502 1501 ZN ZN . S 12 ZN J 1 1503 1502 ZN ZN . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id Q _atom_site.label_entity_id 11 _atom_site.Cartn_x 202.566 _atom_site.Cartn_y 192.178 _atom_site.Cartn_z 225.056 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 65.51 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 1501 _atom_site.auth_asym_id J _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 24 _model_server_stats.parse_time_ms 11 _model_server_stats.create_model_time_ms 58 _model_server_stats.query_time_ms 259 _model_server_stats.encode_time_ms 6 _model_server_stats.element_count 1 #