data_6Y35 # _model_server_result.job_id aBmJsjtw1XULwoZueM9ItA _model_server_result.datetime_utc '2024-12-28 05:18:20' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6y35 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"F","auth_seq_id":301}' # _entry.id 6Y35 # _exptl.entry_id 6Y35 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 80.063 _entity.id 6 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'SULFITE ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6Y35 _cell.length_a 51.57 _cell.length_b 75.51 _cell.length_c 142.94 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6Y35 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details pentameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 5 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 6 _struct_asym.id F _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order hydrog WATSON-CRICK hydrog1 D N3 DC 3 D DC 3 1_555 E N1 DG 25 E DG 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 D N4 DC 3 D DC 3 1_555 E O6 DG 25 E DG 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 D O2 DC 3 D DC 3 1_555 E N2 DG 25 E DG 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 D N1 DA 4 D DA 4 1_555 E N3 DT 24 E DT 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 D N6 DA 4 D DA 4 1_555 E O4 DT 24 E DT 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 D N3 DT 5 D DT 5 1_555 E N1 DA 23 E DA 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 D O4 DT 5 D DT 5 1_555 E N6 DA 23 E DA 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 D N3 DC 6 D DC 6 1_555 E N1 DG 22 E DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 D N4 DC 6 D DC 6 1_555 E O6 DG 22 E DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 D O2 DC 6 D DC 6 1_555 E N2 DG 22 E DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 D N1 DA 7 D DA 7 1_555 E N3 DT 21 E DT 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 D N6 DA 7 D DA 7 1_555 E O4 DT 21 E DT 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 D N3 DT 8 D DT 8 1_555 E N1 DA 20 E DA 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 D O4 DT 8 D DT 8 1_555 E N6 DA 20 E DA 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 D N1 DG 9 D DG 9 1_555 E N3 DC 19 E DC 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 D N2 DG 9 D DG 9 1_555 E O2 DC 19 E DC 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 D O6 DG 9 D DG 9 1_555 E N4 DC 19 E DC 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 D N3 DC 10 D DC 10 1_555 E N1 DG 18 E DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 D N4 DC 10 D DC 10 1_555 E O6 DG 18 E DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 D O2 DC 10 D DC 10 1_555 E N2 DG 18 E DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 D N1 DA 11 D DA 11 1_555 E N3 DT 17 E DT 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 D N6 DA 11 D DA 11 1_555 E O4 DT 17 E DT 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 D N3 DT 12 D DT 12 1_555 E N1 DA 16 E DA 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 D O4 DT 12 D DT 12 1_555 E N6 DA 16 E DA 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 D N3 DC 13 D DC 13 1_555 E N1 DG 15 E DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 D N4 DC 13 D DC 13 1_555 E O6 DG 15 E DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 D O2 DC 13 D DC 13 1_555 E N2 DG 15 E DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 D N3 DT 14 D DT 14 1_555 E N1 DA 14 E DA 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 D O4 DT 14 D DT 14 1_555 E N6 DA 14 E DA 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 D N1 DG 15 D DG 15 1_555 E N3 DC 13 E DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 D N2 DG 15 D DG 15 1_555 E O2 DC 13 E DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 D O6 DG 15 D DG 15 1_555 E N4 DC 13 E DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 D N1 DA 16 D DA 16 1_555 E N3 DT 12 E DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 D N6 DA 16 D DA 16 1_555 E O4 DT 12 E DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 D N3 DT 17 D DT 17 1_555 E N1 DA 11 E DA 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 D O4 DT 17 D DT 17 1_555 E N6 DA 11 E DA 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 D N3 DT 18 D DT 18 1_555 E N1 DA 10 E DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 D O4 DT 18 D DT 18 1_555 E N6 DA 10 E DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 D N1 DG 19 D DG 19 1_555 E N3 DC 9 E DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 D N2 DG 19 D DG 19 1_555 E O2 DC 9 E DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 D O6 DG 19 D DG 19 1_555 E N4 DC 9 E DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 D N1 DG 20 D DG 20 1_555 E N3 DC 8 E DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 D N2 DG 20 D DG 20 1_555 E O2 DC 8 E DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 D O6 DG 20 D DG 20 1_555 E N4 DC 8 E DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 D N3 DC 21 D DC 21 1_555 E N1 DG 7 E DG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 D N4 DC 21 D DC 21 1_555 E O6 DG 7 E DG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 D O2 DC 21 D DC 21 1_555 E N2 DG 7 E DG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 D N1 DG 22 D DG 22 1_555 E N3 DC 6 E DC 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 D N2 DG 22 D DG 22 1_555 E O2 DC 6 E DC 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 D O6 DG 22 D DG 22 1_555 E N4 DC 6 E DC 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 D N1 DG 23 D DG 23 1_555 E N3 DC 5 E DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 D N2 DG 23 D DG 23 1_555 E O2 DC 5 E DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 D O6 DG 23 D DG 23 1_555 E N4 DC 5 E DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 D N1 DG 24 D DG 24 1_555 E N3 DC 4 E DC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog55 D N2 DG 24 D DG 24 1_555 E O2 DC 4 E DC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog56 D O6 DG 24 D DG 24 1_555 E N4 DC 4 E DC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 D N3 DT 25 D DT 25 1_555 E N1 DA 3 E DA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog58 D O4 DT 25 D DT 25 1_555 E N6 DA 3 E DA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'O3 S -2' _chem_comp.formula_weight 80.063 _chem_comp.id SO3 _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'SULFITE ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag S O1 SO3 doub 439 n n S O2 SO3 sing 440 n n S O3 SO3 sing 441 n n # _atom_sites.entry_id 6Y35 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.019391 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.013243 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.006996 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code F 6 SO3 A 1 301 1 SO3 SO3 . G 7 HOH A 1 401 3 HOH HOH . G 7 HOH A 2 402 20 HOH HOH . G 7 HOH A 3 403 17 HOH HOH . G 7 HOH A 4 404 9 HOH HOH . G 7 HOH A 5 405 12 HOH HOH . G 7 HOH A 6 406 5 HOH HOH . H 7 HOH B 1 201 6 HOH HOH . H 7 HOH B 2 202 13 HOH HOH . H 7 HOH B 3 203 14 HOH HOH . H 7 HOH B 4 204 24 HOH HOH . H 7 HOH B 5 205 4 HOH HOH . H 7 HOH B 6 206 25 HOH HOH . I 7 HOH C 1 201 18 HOH HOH . I 7 HOH C 2 202 16 HOH HOH . I 7 HOH C 3 203 2 HOH HOH . I 7 HOH C 4 204 23 HOH HOH . I 7 HOH C 5 205 21 HOH HOH . I 7 HOH C 6 206 19 HOH HOH . I 7 HOH C 7 207 8 HOH HOH . I 7 HOH C 8 208 15 HOH HOH . J 7 HOH D 1 101 11 HOH HOH . J 7 HOH D 2 102 7 HOH HOH . J 7 HOH D 3 103 10 HOH HOH . K 7 HOH E 1 101 22 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 S S SO3 . . . F 6 -23.439 19.203 8.057 1 90.48 ? S SO3 301 A 1 HETATM 2 O O1 SO3 . . . F 6 -23.6 20.452 8.87 1 90.79 ? O1 SO3 301 A 1 HETATM 3 O O2 SO3 . . . F 6 -24.82 18.624 7.991 1 89.44 ? O2 SO3 301 A 1 HETATM 4 O O3 SO3 . . . F 6 -23.178 19.698 6.667 1 93.14 ? O3 SO3 301 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 72 _model_server_stats.parse_time_ms 12 _model_server_stats.create_model_time_ms 3 _model_server_stats.query_time_ms 320 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 4 #