data_6YXR
#
_model_server_result.job_id            OqwnbhC2jsYVbl2QAG8EqQ 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-02-28 13:28:29' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          6yxr 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"GE","auth_seq_id":4003}' 
#
_entry.id    6YXR 
#
_exptl.entry_id    6YXR 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              536.873 
_entity.id                          14 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            BETA-CAROTENE 
_entity.pdbx_number_of_molecules    23 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            6YXR 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 6YXR 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    undecameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      11 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD,QD,RD,SD,TD,UD,VD,WD,XD,YD,ZD,AE,BE,CE,DE,EE,FE,GE,HE,IE,JE,KE,LE,ME,NE,OE,PE,QE,RE,SE,TE,UE,VE,WE,XE,YE,ZE,AF,BF,CF,DF,EF,FF,GF,HF,IF,JF,KF,LF,MF,NF,OF,PF,QF,RF,SF,TF,UF,VF,WF,XF,YF,ZF,AG,BG,CG,DG,EG,FG,GG,HG,IG,JG,KG,LG,MG,NG,OG,PG,QG,RG,SG,TG,UG,VG,WG 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 14 N N N 
? 14 FA N N 
? 14 AB N N 
? 14 BB N N 
? 14 CB N N 
? 14 VB N N 
? 14 FE N N 
? 14 GE N N 
? 14 HE N N 
? 14 IE N N 
? 14 JE N N 
? 14 KE N N 
? 14 LE N N 
? 14 FG N N 
? 14 GG N N 
? 14 HG N N 
? 14 IG N N 
? 14 JG N N 
? 14 KG N N 
? 14 SG N N 
? 14 TG N N 
? 14 VG N N 
? 14 WG N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 J SG CYS 8 F CYS 85 1_555 J SG CYS 63 F CYS 140 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
metalc ? metalc1 A OE2 GLU 44 1 GLU 75 1_555 R MG CLA . 1 CLA 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.948 ? 
metalc ? metalc2 A OE1 GLU 108 1 GLU 139 1_555 Z MG CLA . 1 CLA 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? 
metalc ? metalc3 A O SER 193 1 SER 224 1_555 BA MG CLA . 1 CLA 615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.973 ? 
metalc ? metalc4 U MG CLA . 1 CLA 607 1_555 CA O4 LHG . 1 LHG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.113 ? 
metalc ? metalc5 B O TRP 5 2 TRP 67 1_555 OA MG CHL . 2 CHL 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.899 ? 
metalc ? metalc6 B OE2 GLU 44 2 GLU 106 1_555 JA MG CLA . 2 CLA 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? 
metalc ? metalc7 B OE1 GLU 104 2 GLU 166 1_555 RA MG CLA . 2 CLA 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.418 ? 
metalc ? metalc8 B OE1 GLN 177 2 GLN 239 1_555 IA MG CLA . 2 CLA 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.897 ? 
metalc ? metalc9 B O SER 207 2 SER 269 1_555 TA MG CLA . 2 CLA 616 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.987 ? 
metalc ? metalc10 MA MG CLA . 2 CLA 607 1_555 UA O4 LHG . 2 LHG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.472 ? 
metalc ? metalc11 C OE1 GLN 106 3 GLN 178 1_555 QB MG CLA . 3 CLA 615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.979 ? 
metalc ? metalc12 C OE2 GLU 109 3 GLU 181 1_555 NB MG CLA . 3 CLA 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.876 ? 
metalc ? metalc13 C OE1 GLU 167 3 GLU 239 1_555 DB MG CLA . 3 CLA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.215 ? 
metalc ? metalc14 D O TRP 5 4 TRP 127 1_555 EC MG CLA . 4 CLA 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.913 ? 
metalc ? metalc15 D OE2 GLU 157 4 GLU 279 1_555 WB MG CLA . 4 CLA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.379 ? 
metalc ? metalc16 D O SER 204 4 SER 326 1_555 JC MG CLA . 4 CLA 616 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.402 ? 
metalc ? metalc17 E OE1 GLN 104 A GLN 116 1_555 TC MG CLA . A CLA 1106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.664 ? 
metalc ? metalc18 E OE1 GLN 112 A GLN 124 1_555 UC MG CLA . A CLA 1107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.553 ? 
metalc ? metalc19 E O THR 486 A THR 498 1_555 VD MG CLA . A CLA 1134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.253 ? 
metalc ? metalc20 E SG CYS 563 A CYS 575 1_555 EE FE1 SF4 . A SF4 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.31 ? 
metalc ? metalc21 E SG CYS 572 A CYS 584 1_555 EE FE4 SF4 . A SF4 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.495 ? 
metalc ? metalc22 CE MG CLA . A CLA 1141 1_555 ME O5 LHG . A LHG 5001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? 
metalc ? metalc23 EE FE2 SF4 . A SF4 3001 1_555 F SG CYS 555 B CYS 560 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.471 ? 
metalc ? metalc24 EE FE3 SF4 . A SF4 3001 1_555 F SG CYS 564 B CYS 569 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.477 ? 
metalc ? metalc25 F OE1 GLN 49 B GLN 54 1_555 TE MG CLA . B CLA 1203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.953 ? 
metalc ? metalc26 DG MG CLA . B CLA 1240 1_555 LG O4 LHG . B LHG 5001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.862 ? 
metalc ? metalc27 G SG CYS 10 C CYS 11 1_555 PG FE2 SF4 . C SF4 3003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.2 ? 
metalc ? metalc28 G SG CYS 13 C CYS 14 1_555 PG FE1 SF4 . C SF4 3003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.095 ? 
metalc ? metalc29 G SG CYS 16 C CYS 17 1_555 PG FE4 SF4 . C SF4 3003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.473 ? 
metalc ? metalc30 G SG CYS 47 C CYS 48 1_555 OG FE4 SF4 . C SF4 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.468 ? 
metalc ? metalc31 G SG CYS 50 C CYS 51 1_555 OG FE3 SF4 . C SF4 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.489 ? 
metalc ? metalc32 G SG CYS 53 C CYS 54 1_555 OG FE2 SF4 . C SF4 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.485 ? 
metalc ? metalc33 G OG SER 63 C SER 64 1_555 PG FE3 SF4 . C SF4 3003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.787 ? 
metalc ? metalc34 J OD1 ASP 74 F ASP 151 1_555 RG MG CLA . F CLA 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.345 ? 
#
_chem_comp.formula           'C40 H56' 
_chem_comp.formula_weight    536.873 
_chem_comp.id                BCR 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              BETA-CAROTENE 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 C2 BCR sing 194 n n 
C1 C6 BCR sing 195 n n 
C1 C31 BCR sing 196 n n 
C1 C32 BCR sing 197 n n 
C2 C3 BCR sing 198 n n 
C2 HC21 BCR sing 199 n n 
C2 HC22 BCR sing 200 n n 
C3 C4 BCR sing 201 n n 
C3 HC31 BCR sing 202 n n 
C3 HC32 BCR sing 203 n n 
C4 C5 BCR sing 204 n n 
C4 HC41 BCR sing 205 n n 
C4 HC42 BCR sing 206 n n 
C5 C6 BCR doub 207 n n 
C5 C33 BCR sing 208 n n 
C6 C7 BCR sing 209 n n 
C7 C8 BCR doub 210 e n 
C7 HC7 BCR sing 211 n n 
C8 C9 BCR sing 212 n n 
C8 HC8 BCR sing 213 n n 
C9 C10 BCR doub 214 e n 
C9 C34 BCR sing 215 n n 
C10 C11 BCR sing 216 n n 
C10 H10C BCR sing 217 n n 
C11 C12 BCR doub 218 e n 
C11 H11C BCR sing 219 n n 
C33 H331 BCR sing 220 n n 
C33 H332 BCR sing 221 n n 
C33 H333 BCR sing 222 n n 
C31 H311 BCR sing 223 n n 
C31 H312 BCR sing 224 n n 
C31 H313 BCR sing 225 n n 
C32 H321 BCR sing 226 n n 
C32 H322 BCR sing 227 n n 
C32 H323 BCR sing 228 n n 
C34 H341 BCR sing 229 n n 
C34 H342 BCR sing 230 n n 
C34 H343 BCR sing 231 n n 
C12 C13 BCR sing 232 n n 
C12 H12C BCR sing 233 n n 
C13 C14 BCR doub 234 e n 
C13 C35 BCR sing 235 n n 
C14 C15 BCR sing 236 n n 
C14 H14C BCR sing 237 n n 
C15 C16 BCR doub 238 e n 
C15 H15C BCR sing 239 n n 
C16 C17 BCR sing 240 n n 
C16 H16C BCR sing 241 n n 
C17 C18 BCR doub 242 e n 
C17 H17C BCR sing 243 n n 
C18 C19 BCR sing 244 n n 
C18 C36 BCR sing 245 n n 
C19 C20 BCR doub 246 e n 
C19 H19C BCR sing 247 n n 
C20 C21 BCR sing 248 n n 
C20 H20C BCR sing 249 n n 
C21 C22 BCR doub 250 e n 
C21 H21C BCR sing 251 n n 
C22 C23 BCR sing 252 n n 
C22 C37 BCR sing 253 n n 
C23 C24 BCR doub 254 e n 
C23 H23C BCR sing 255 n n 
C24 C25 BCR sing 256 n n 
C24 H24C BCR sing 257 n n 
C25 C26 BCR doub 258 n n 
C25 C30 BCR sing 259 n n 
C26 C27 BCR sing 260 n n 
C26 C38 BCR sing 261 n n 
C27 C28 BCR sing 262 n n 
C27 H271 BCR sing 263 n n 
C27 H272 BCR sing 264 n n 
C28 C29 BCR sing 265 n n 
C28 H281 BCR sing 266 n n 
C28 H282 BCR sing 267 n n 
C29 C30 BCR sing 268 n n 
C29 H291 BCR sing 269 n n 
C29 H292 BCR sing 270 n n 
C30 C39 BCR sing 271 n n 
C30 C40 BCR sing 272 n n 
C35 H351 BCR sing 273 n n 
C35 H352 BCR sing 274 n n 
C35 H353 BCR sing 275 n n 
C36 H361 BCR sing 276 n n 
C36 H362 BCR sing 277 n n 
C36 H363 BCR sing 278 n n 
C37 H371 BCR sing 279 n n 
C37 H372 BCR sing 280 n n 
C37 H373 BCR sing 281 n n 
C38 H381 BCR sing 282 n n 
C38 H382 BCR sing 283 n n 
C38 H383 BCR sing 284 n n 
C39 H391 BCR sing 285 n n 
C39 H392 BCR sing 286 n n 
C39 H393 BCR sing 287 n n 
C40 H401 BCR sing 288 n n 
C40 H402 BCR sing 289 n n 
C40 H403 BCR sing 290 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     6YXR 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
L 12 LUT 1 1 501 501 LUT LUT . 
M 13 XAT 1 1 502 502 XAT XAT . 
N 14 BCR 1 1 503 503 BCR BCR . 
O 15 CLA 1 1 601 601 CLA CLA . 
P 15 CLA 1 1 602 602 CLA CLA . 
Q 15 CLA 1 1 603 603 CLA CLA . 
R 15 CLA 1 1 604 604 CLA CLA . 
S 15 CLA 1 1 605 605 CLA CLA . 
T 15 CLA 1 1 606 606 CLA CLA . 
U 15 CLA 1 1 607 607 CLA CLA . 
V 15 CLA 1 1 608 608 CLA CLA . 
W 16 CHL 1 1 609 609 CHL CHL . 
X 16 CHL 1 1 610 610 CHL CHL . 
Y 15 CLA 1 1 611 611 CLA CLA . 
Z 15 CLA 1 1 612 612 CLA CLA . 
AA 15 CLA 1 1 613 613 CLA CLA . 
BA 15 CLA 1 1 615 615 CLA CLA . 
CA 17 LHG 1 1 801 801 LHG LHG . 
DA 12 LUT 2 1 501 501 LUT LUT . 
EA 13 XAT 2 1 502 502 XAT XAT . 
FA 14 BCR 2 1 503 503 BCR BCR . 
GA 15 CLA 2 1 601 601 CLA CLA . 
HA 15 CLA 2 1 602 602 CLA CLA . 
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JA 15 CLA 2 1 604 604 CLA CLA . 
KA 15 CLA 2 1 605 605 CLA CLA . 
LA 15 CLA 2 1 606 606 CLA CLA . 
MA 15 CLA 2 1 607 607 CLA CLA . 
NA 15 CLA 2 1 608 608 CLA CLA . 
OA 16 CHL 2 1 609 609 CHL CHL . 
PA 16 CHL 2 1 610 610 CHL CHL . 
QA 16 CHL 2 1 611 611 CHL CHL . 
RA 15 CLA 2 1 612 612 CLA CLA . 
SA 16 CHL 2 1 613 613 CHL CHL . 
TA 15 CLA 2 1 616 616 CLA CLA . 
UA 17 LHG 2 1 801 801 LHG LHG . 
VA 18 LMG 2 1 802 802 LMG LMG . 
WA 18 LMG 2 1 803 803 LMG LMG . 
XA 18 LMG 2 1 804 804 LMG LMG . 
YA 12 LUT 3 1 501 501 LUT LUT . 
ZA 13 XAT 3 1 502 502 XAT XAT . 
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OE 15 CLA B 1 1021 1021 CLA CLA . 
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