data_6Z8O
#
_model_server_result.job_id            rQx4SZzdb0KWyRoWOddf-w 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-01-11 16:54:04' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          6z8o 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"X","auth_seq_id":510}' 
#
_entry.id    6Z8O 
#
_exptl.entry_id    6Z8O 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              83.798 
_entity.id                          5 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            KRYPTON 
_entity.pdbx_number_of_molecules    20 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          104.656 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            6Z8O 
_cell.length_a            63.716 
_cell.length_b            97.022 
_cell.length_c            121.318 
_cell.Z_PDB               4 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 6Z8O 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    'P 2yb' 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,QA,RA 1 1 
C,D,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,SA,TA 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 5 I N N 
? 5 J N N 
? 5 K N N 
? 5 L N N 
? 5 M N N 
? 5 N N N 
? 5 T N N 
? 5 U N N 
? 5 V N N 
? 5 W N N 
? 5 X N N 
? 5 CA N N 
? 5 DA N N 
? 5 EA N N 
? 5 FA N N 
? 5 GA N N 
? 5 HA N N 
? 5 NA N N 
? 5 OA N N 
? 5 PA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 A SG CYS 21 A CYS 21 1_555 H S1 6ML . A 6ML 304 1_555 ? B ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.08 ? 
covale ? covale2 B SE SEC 478 B SEC 489 1_555 R S H2S . B H2S 504 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.101 ? 
covale ? covale3 B SE SEC 478 B SEC 489 1_555 R S H2S . B H2S 504 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.093 ? 
covale ? covale4 C SG CYS 21 C CYS 21 1_555 BA S1 6ML . C 6ML 304 1_555 ? B ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.07 ? 
covale ? covale5 D SE SEC 478 D SEC 489 1_555 LA S H2S . D H2S 504 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.112 ? 
covale ? covale6 D SE SEC 478 D SEC 489 1_555 LA S H2S . D H2S 504 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.095 ? 
metalc ? metalc1 A SG CYS 18 A CYS 18 1_555 G FE1 SF4 . A SF4 303 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? 
metalc ? metalc2 A SG CYS 18 A CYS 18 1_555 H FE1 6ML . A 6ML 304 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.274 ? 
metalc ? metalc3 A SG CYS 21 A CYS 21 1_555 G FE4 SF4 . A SF4 303 1_555 ? A ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? 
metalc ? metalc4 A SG CYS 121 A CYS 121 1_555 G FE2 SF4 . A SF4 303 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? 
metalc ? metalc5 A SG CYS 121 A CYS 121 1_555 H FE4 6ML . A 6ML 304 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? 
metalc ? metalc6 A SG CYS 159 A CYS 159 1_555 G FE3 SF4 . A SF4 303 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? 
metalc ? metalc7 A SG CYS 159 A CYS 159 1_555 H FE3 6ML . A 6ML 304 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? 
metalc ? metalc8 A ND1 HIS 208 A HIS 208 1_555 E FE2 SF4 . A SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.162 ? 
metalc ? metalc9 A SG CYS 211 A CYS 211 1_555 E FE4 SF4 . A SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.29 ? 
metalc ? metalc10 A SG CYS 232 A CYS 232 1_555 E FE3 SF4 . A SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? 
metalc ? metalc11 A SG CYS 238 A CYS 238 1_555 E FE1 SF4 . A SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? 
metalc ? metalc12 A SG CYS 247 A CYS 247 1_555 F FE4 SF4 . A SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.31 ? 
metalc ? metalc13 A SG CYS 259 A CYS 259 1_555 F FE3 SF4 . A SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? 
metalc ? metalc14 A SG CYS 265 A CYS 265 1_555 F FE2 SF4 . A SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.283 ? 
metalc ? metalc15 A SG CYS 268 A CYS 268 1_555 F FE1 SF4 . A SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? 
metalc ? metalc16 B OE2 GLU 45 B GLU 56 1_555 Q FE FE2 . B FE2 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.147 ? 
metalc ? metalc17 B SG CYS 64 B CYS 75 1_555 P NI NI . B NI 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? 
metalc ? metalc18 B SG CYS 67 B CYS 78 1_555 O FE FCO . B FCO 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? 
metalc ? metalc19 B SG CYS 67 B CYS 78 1_555 P NI NI . B NI 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? 
metalc ? metalc20 B O ILE 430 B ILE 441 1_555 Q FE FE2 . B FE2 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? 
metalc ? metalc21 B SG CYS 481 B CYS 492 1_555 O FE FCO . B FCO 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.261 ? 
metalc ? metalc22 B SG CYS 481 B CYS 492 1_555 P NI NI . B NI 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? 
metalc ? metalc23 B NE2 HIS 484 B HIS 495 1_555 Q FE FE2 . B FE2 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? 
metalc ? metalc24 P NI NI . B NI 502 1_555 R S H2S . B H2S 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.095 ? 
metalc ? metalc25 Q FE FE2 . B FE2 503 1_555 RA O HOH . B HOH 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.194 ? 
metalc ? metalc26 Q FE FE2 . B FE2 503 1_555 RA O HOH . B HOH 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.226 ? 
metalc ? metalc27 C SG CYS 18 C CYS 18 1_555 AA FE1 SF4 . C SF4 303 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? 
metalc ? metalc28 C SG CYS 18 C CYS 18 1_555 BA FE1 6ML . C 6ML 304 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.267 ? 
metalc ? metalc29 C SG CYS 21 C CYS 21 1_555 AA FE4 SF4 . C SF4 303 1_555 ? A ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? 
metalc ? metalc30 C SG CYS 121 C CYS 121 1_555 AA FE2 SF4 . C SF4 303 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.31 ? 
metalc ? metalc31 C SG CYS 121 C CYS 121 1_555 BA FE4 6ML . C 6ML 304 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.285 ? 
metalc ? metalc32 C SG CYS 159 C CYS 159 1_555 AA FE3 SF4 . C SF4 303 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? 
metalc ? metalc33 C SG CYS 159 C CYS 159 1_555 BA FE3 6ML . C 6ML 304 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? 
metalc ? metalc34 C ND1 HIS 208 C HIS 208 1_555 Y FE2 SF4 . C SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.176 ? 
metalc ? metalc35 C SG CYS 211 C CYS 211 1_555 Y FE4 SF4 . C SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? 
metalc ? metalc36 C SG CYS 232 C CYS 232 1_555 Y FE3 SF4 . C SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? 
metalc ? metalc37 C SG CYS 238 C CYS 238 1_555 Y FE1 SF4 . C SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.301 ? 
metalc ? metalc38 C SG CYS 247 C CYS 247 1_555 Z FE4 SF4 . C SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.303 ? 
metalc ? metalc39 C SG CYS 259 C CYS 259 1_555 Z FE3 SF4 . C SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? 
metalc ? metalc40 C SG CYS 265 C CYS 265 1_555 Z FE2 SF4 . C SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.285 ? 
metalc ? metalc41 C SG CYS 268 C CYS 268 1_555 Z FE1 SF4 . C SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.303 ? 
metalc ? metalc42 D OE2 GLU 45 D GLU 56 1_555 KA FE FE2 . D FE2 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.157 ? 
metalc ? metalc43 D SG CYS 64 D CYS 75 1_555 JA NI NI . D NI 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? 
metalc ? metalc44 D SG CYS 67 D CYS 78 1_555 IA FE FCO . D FCO 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? 
metalc ? metalc45 D SG CYS 67 D CYS 78 1_555 JA NI NI . D NI 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? 
metalc ? metalc46 D O ILE 430 D ILE 441 1_555 KA FE FE2 . D FE2 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.247 ? 
metalc ? metalc47 D SG CYS 481 D CYS 492 1_555 IA FE FCO . D FCO 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.289 ? 
metalc ? metalc48 D SG CYS 481 D CYS 492 1_555 JA NI NI . D NI 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? 
metalc ? metalc49 D NE2 HIS 484 D HIS 495 1_555 KA FE FE2 . D FE2 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? 
metalc ? metalc50 JA NI NI . D NI 502 1_555 LA S H2S . D H2S 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.103 ? 
metalc ? metalc51 KA FE FE2 . D FE2 503 1_555 TA O HOH . D HOH 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.277 ? 
#
_chem_comp.formula           Kr 
_chem_comp.formula_weight    83.798 
_chem_comp.id                KR 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              KRYPTON 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     6Z8O 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.015695 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.004105 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.010307 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.00852 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 3 SF4 A 1 301 284 SF4 FS4 . 
F 3 SF4 A 1 302 285 SF4 FS4 . 
G 3 SF4 A 1 303 286 SF4 FS4 . 
H 4 6ML A 1 304 287 6ML FSK . 
I 5 KR A 1 305 1 KR KR . 
J 5 KR A 1 306 2 KR KR . 
K 5 KR A 1 307 4 KR KR . 
L 5 KR A 1 308 5 KR KR . 
M 5 KR A 1 309 6 KR KR . 
N 5 KR A 1 310 7 KR KR . 
O 6 FCO B 1 501 500 FCO FCO . 
P 7 NI B 1 502 501 NI NI . 
Q 8 FE2 B 1 503 502 FE2 FE2 . 
R 9 H2S B 1 504 503 H2S H2S . 
S 10 CL B 1 505 504 CL CL . 
T 5 KR B 1 506 3 KR KR . 
U 5 KR B 1 507 8 KR KR . 
V 5 KR B 1 508 9 KR KR . 
W 5 KR B 1 509 110 KR KR . 
X 5 KR B 1 510 111 KR KR . 
Y 3 SF4 C 1 301 284 SF4 FS4 . 
Z 3 SF4 C 1 302 285 SF4 FS4 . 
AA 3 SF4 C 1 303 286 SF4 FS4 . 
BA 4 6ML C 1 304 287 6ML FSK . 
CA 5 KR C 1 305 102 KR KR . 
DA 5 KR C 1 306 103 KR KR . 
EA 5 KR C 1 307 104 KR KR . 
FA 5 KR C 1 308 107 KR KR . 
GA 5 KR C 1 309 108 KR KR . 
HA 5 KR C 1 310 109 KR KR . 
IA 6 FCO D 1 501 500 FCO FCO . 
JA 7 NI D 1 502 501 NI NI . 
KA 8 FE2 D 1 503 502 FE2 FE2 . 
LA 9 H2S D 1 504 503 H2S H2S . 
MA 10 CL D 1 505 504 CL CL . 
NA 5 KR D 1 506 101 KR KR . 
OA 5 KR D 1 507 105 KR KR . 
PA 5 KR D 1 508 106 KR KR . 
QA 11 HOH A 1 401 15 HOH HOH . 
QA 11 HOH A 2 402 1 HOH HOH . 
QA 11 HOH A 3 403 6 HOH HOH . 
QA 11 HOH A 4 404 31 HOH HOH . 
QA 11 HOH A 5 405 4 HOH HOH . 
QA 11 HOH A 6 406 2 HOH HOH . 
RA 11 HOH B 1 601 3 HOH HOH . 
RA 11 HOH B 2 602 25 HOH HOH . 
RA 11 HOH B 3 603 38 HOH HOH . 
RA 11 HOH B 4 604 20 HOH HOH . 
RA 11 HOH B 5 605 17 HOH HOH . 
RA 11 HOH B 6 606 16 HOH HOH . 
RA 11 HOH B 7 607 35 HOH HOH . 
RA 11 HOH B 8 608 23 HOH HOH . 
RA 11 HOH B 9 609 5 HOH HOH . 
SA 11 HOH C 1 401 36 HOH HOH . 
SA 11 HOH C 2 402 8 HOH HOH . 
SA 11 HOH C 3 403 26 HOH HOH . 
SA 11 HOH C 4 404 34 HOH HOH . 
SA 11 HOH C 5 405 30 HOH HOH . 
SA 11 HOH C 6 406 11 HOH HOH . 
SA 11 HOH C 7 407 19 HOH HOH . 
SA 11 HOH C 8 408 10 HOH HOH . 
SA 11 HOH C 9 409 7 HOH HOH . 
SA 11 HOH C 10 410 9 HOH HOH . 
SA 11 HOH C 11 411 28 HOH HOH . 
TA 11 HOH D 1 601 24 HOH HOH . 
TA 11 HOH D 2 602 33 HOH HOH . 
TA 11 HOH D 3 603 22 HOH HOH . 
TA 11 HOH D 4 604 37 HOH HOH . 
TA 11 HOH D 5 605 27 HOH HOH . 
TA 11 HOH D 6 606 18 HOH HOH . 
TA 11 HOH D 7 607 14 HOH HOH . 
TA 11 HOH D 8 608 21 HOH HOH . 
TA 11 HOH D 9 609 29 HOH HOH . 
TA 11 HOH D 10 610 32 HOH HOH . 
TA 11 HOH D 11 611 12 HOH HOH . 
TA 11 HOH D 12 612 13 HOH HOH . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           KR 
_atom_site.label_atom_id         KR 
_atom_site.label_comp_id         KR 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         X 
_atom_site.label_entity_id       5 
_atom_site.Cartn_x               1.787 
_atom_site.Cartn_y               17.489 
_atom_site.Cartn_z               -46.853 
_atom_site.occupancy             0.98 
_atom_site.B_iso_or_equiv        93.64 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          KR 
_atom_site.auth_comp_id          KR 
_atom_site.auth_seq_id           510 
_atom_site.auth_asym_id          B 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              33 
_model_server_stats.parse_time_ms           22 
_model_server_stats.create_model_time_ms    28 
_model_server_stats.query_time_ms           330 
_model_server_stats.encode_time_ms          2 
_model_server_stats.element_count           1 
#