data_6ZGF # _model_server_result.job_id mGg4wqkum9TZmAiFGzAP6Q _model_server_result.datetime_utc '2024-11-01 22:34:44' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6zgf # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"OA","auth_seq_id":1328}' # _entry.id 6ZGF # _exptl.entry_id 6ZGF _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 6 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 27 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6ZGF _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6ZGF _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 6 HA N N ? 6 IA N N ? 6 JA N N ? 6 KA N N ? 6 LA N N ? 6 MA N N ? 6 NA N N ? 6 OA N N ? 6 PA N N ? 6 QA N N ? 6 RA N N ? 6 SA N N ? 6 TA N N ? 6 UA N N ? 6 VA N N ? 6 WA N N ? 6 XA N N ? 6 YA N N ? 6 ZA N N ? 6 AB N N ? 6 BB N N ? 6 CB N N ? 6 DB N N ? 6 EB N N ? 6 FB N N ? 6 GB N N ? 6 HB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 2 oligosaccharide 3 oligosaccharide 4 oligosaccharide 5 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 2 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 3 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 3 3 1 FUC NAG C1 O1 . O6 HO6 . sing 4 ? 4 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 5 ? 4 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 6 ? 5 2 1 FUC NAG C1 O1 . O6 HO6 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 2 n D NAG 1 D 1 NAG A 1142 NAG 2 n D NAG 2 D 2 NAG A 1166 NAG 2 n E NAG 1 E 1 NAG A 1144 NAG 2 n E NAG 2 E 2 NAG A 1167 NAG 2 n F NAG 1 F 1 NAG A 1145 NAG 2 n F NAG 2 F 2 NAG A 1168 NAG 2 n G NAG 1 G 1 NAG A 1146 NAG 2 n G NAG 2 G 2 NAG A 1169 NAG 3 n H NAG 1 H 1 NAG A 1148 NAG 3 n H NAG 2 H 2 NAG A 1171 NAG 3 n H FUC 3 H 3 FUC A 1170 FUC 4 n I NAG 1 I 1 NAG A 1156 NAG 4 n I NAG 2 I 2 NAG A 1164 NAG 4 n I BMA 3 I 3 BMA A 1165 BMA 2 n J NAG 1 J 1 NAG A 1158 NAG 2 n J NAG 2 J 2 NAG A 1173 NAG 2 n K NAG 1 K 1 NAG A 1159 NAG 2 n K NAG 2 K 2 NAG A 1174 NAG 2 n L NAG 1 L 1 NAG A 1160 NAG 2 n L NAG 2 L 2 NAG A 1172 NAG 5 n M NAG 1 M 1 NAG A 1162 NAG 5 n M FUC 2 M 2 FUC A 1163 FUC 2 n N NAG 1 N 1 NAG B 1142 NAG 2 n N NAG 2 N 2 NAG B 1166 NAG 2 n O NAG 1 O 1 NAG B 1144 NAG 2 n O NAG 2 O 2 NAG B 1167 NAG 2 n P NAG 1 P 1 NAG B 1145 NAG 2 n P NAG 2 P 2 NAG B 1168 NAG 2 n Q NAG 1 Q 1 NAG B 1146 NAG 2 n Q NAG 2 Q 2 NAG B 1169 NAG 3 n R NAG 1 R 1 NAG B 1148 NAG 3 n R NAG 2 R 2 NAG B 1171 NAG 3 n R FUC 3 R 3 FUC B 1170 FUC 4 n S NAG 1 S 1 NAG B 1156 NAG 4 n S NAG 2 S 2 NAG B 1164 NAG 4 n S BMA 3 S 3 BMA B 1165 BMA 2 n T NAG 1 T 1 NAG B 1158 NAG 2 n T NAG 2 T 2 NAG B 1173 NAG 2 n U NAG 1 U 1 NAG B 1159 NAG 2 n U NAG 2 U 2 NAG B 1174 NAG 2 n V NAG 1 V 1 NAG B 1160 NAG 2 n V NAG 2 V 2 NAG B 1172 NAG 5 n W NAG 1 W 1 NAG B 1162 NAG 5 n W FUC 2 W 2 FUC B 1163 FUC 2 n X NAG 1 X 1 NAG C 1142 NAG 2 n X NAG 2 X 2 NAG C 1166 NAG 2 n Y NAG 1 Y 1 NAG C 1144 NAG 2 n Y NAG 2 Y 2 NAG C 1167 NAG 2 n Z NAG 1 Z 1 NAG C 1145 NAG 2 n Z NAG 2 Z 2 NAG C 1168 NAG 2 n AA NAG 1 a 1 NAG C 1146 NAG 2 n AA NAG 2 a 2 NAG C 1169 NAG 3 n BA NAG 1 b 1 NAG C 1148 NAG 3 n BA NAG 2 b 2 NAG C 1171 NAG 3 n BA FUC 3 b 3 FUC C 1170 FUC 4 n CA NAG 1 c 1 NAG C 1156 NAG 4 n CA NAG 2 c 2 NAG C 1164 NAG 4 n CA BMA 3 c 3 BMA C 1165 BMA 2 n DA NAG 1 d 1 NAG C 1158 NAG 2 n DA NAG 2 d 2 NAG C 1173 NAG 2 n EA NAG 1 e 1 NAG C 1159 NAG 2 n EA NAG 2 e 2 NAG C 1174 NAG 2 n FA NAG 1 f 1 NAG C 1160 NAG 2 n FA NAG 2 f 2 NAG C 1172 NAG 5 n GA NAG 1 g 1 NAG C 1162 NAG 5 n GA FUC 2 g 2 FUC C 1163 FUC # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 46 A CYS 15 1_555 A SG CYS 167 A CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 162 A CYS 131 1_555 A SG CYS 197 A CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 322 A CYS 291 1_555 A SG CYS 332 A CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 367 A CYS 336 1_555 A SG CYS 392 A CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 410 A CYS 379 1_555 A SG CYS 463 A CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 422 A CYS 391 1_555 A SG CYS 556 A CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 511 A CYS 480 1_555 A SG CYS 519 A CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 569 A CYS 538 1_555 A SG CYS 621 A CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 648 A CYS 617 1_555 A SG CYS 680 A CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 693 A CYS 662 1_555 A SG CYS 702 A CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 765 A CYS 734 1_555 A SG CYS 787 A CYS 756 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 770 A CYS 739 1_555 A SG CYS 776 A CYS 745 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf13 A SG CYS 867 A CYS 836 1_555 A SG CYS 878 A CYS 847 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf14 A SG CYS 1059 A CYS 1028 1_555 A SG CYS 1070 A CYS 1039 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf15 A SG CYS 1109 A CYS 1078 1_555 A SG CYS 1153 A CYS 1122 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf16 B SG CYS 46 B CYS 15 1_555 B SG CYS 167 B CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf17 B SG CYS 162 B CYS 131 1_555 B SG CYS 197 B CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf18 B SG CYS 322 B CYS 291 1_555 B SG CYS 332 B CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? disulf ? disulf19 B SG CYS 367 B CYS 336 1_555 B SG CYS 392 B CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf20 B SG CYS 410 B CYS 379 1_555 B SG CYS 463 B CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf21 B SG CYS 422 B CYS 391 1_555 B SG CYS 556 B CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf22 B SG CYS 511 B CYS 480 1_555 B SG CYS 519 B CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf23 B SG CYS 569 B CYS 538 1_555 B SG CYS 621 B CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf24 B SG CYS 648 B CYS 617 1_555 B SG CYS 680 B CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf25 B SG CYS 693 B CYS 662 1_555 B SG CYS 702 B CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf26 B SG CYS 765 B CYS 734 1_555 B SG CYS 787 B CYS 756 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf27 B SG CYS 770 B CYS 739 1_555 B SG CYS 776 B CYS 745 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf28 B SG CYS 867 B CYS 836 1_555 B SG CYS 878 B CYS 847 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf29 B SG CYS 1059 B CYS 1028 1_555 B SG CYS 1070 B CYS 1039 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf30 B SG CYS 1109 B CYS 1078 1_555 B SG CYS 1153 B CYS 1122 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf31 C SG CYS 46 C CYS 15 1_555 C SG CYS 167 C CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf32 C SG CYS 162 C CYS 131 1_555 C SG CYS 197 C CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf33 C SG CYS 322 C CYS 291 1_555 C SG CYS 332 C CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? disulf ? disulf34 C SG CYS 367 C CYS 336 1_555 C SG CYS 392 C CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf35 C SG CYS 410 C CYS 379 1_555 C SG CYS 463 C CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf36 C SG CYS 422 C CYS 391 1_555 C SG CYS 556 C CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf37 C SG CYS 511 C CYS 480 1_555 C SG CYS 519 C CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf38 C SG CYS 569 C CYS 538 1_555 C SG CYS 621 C CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf39 C SG CYS 648 C CYS 617 1_555 C SG CYS 680 C CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf40 C SG CYS 693 C CYS 662 1_555 C SG CYS 702 C CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf41 C SG CYS 765 C CYS 734 1_555 C SG CYS 787 C CYS 756 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf42 C SG CYS 770 C CYS 739 1_555 C SG CYS 776 C CYS 745 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf43 C SG CYS 867 C CYS 836 1_555 C SG CYS 878 C CYS 847 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf44 C SG CYS 1059 C CYS 1028 1_555 C SG CYS 1070 C CYS 1039 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf45 C SG CYS 1109 C CYS 1078 1_555 C SG CYS 1153 C CYS 1122 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 48 A ASN 17 1_555 HA C1 NAG . A NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 61 A ASN 30 1_555 D C1 NAG . D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.419 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 92 A ASN 61 1_555 IA C1 NAG . A NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 153 A ASN 122 1_555 E C1 NAG . E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 196 A ASN 165 1_555 F C1 NAG . F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.423 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 265 A ASN 234 1_555 G C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 313 A ASN 282 1_555 JA C1 NAG . A NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 362 A ASN 331 1_555 H C1 NAG . H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 374 A ASN 343 1_555 KA C1 NAG . A NAG 1315 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 401 A ASN 370 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 634 A ASN 603 1_555 OA C1 NAG . A NAG 1328 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 647 A ASN 616 1_555 LA C1 NAG . A NAG 1316 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 688 A ASN 657 1_555 PA C1 NAG . A NAG 1331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale14 A ND2 ASN 736 A ASN 705 1_555 MA C1 NAG . A NAG 1317 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale15 A ND2 ASN 744 A ASN 713 1_555 I C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.419 ? covale ? covale16 A ND2 ASN 828 A ASN 797 1_555 L C1 NAG . L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.427 ? covale ? covale17 A ND2 ASN 1101 A ASN 1070 1_555 NA C1 NAG . A NAG 1321 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale18 A ND2 ASN 1125 A ASN 1094 1_555 J C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.424 ? covale ? covale19 A ND2 ASN 1161 A ASN 1130 1_555 K C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? covale ? covale20 B ND2 ASN 48 B ASN 17 1_555 QA C1 NAG . B NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale21 B ND2 ASN 61 B ASN 30 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.419 ? covale ? covale22 B ND2 ASN 92 B ASN 61 1_555 RA C1 NAG . B NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale23 B ND2 ASN 153 B ASN 122 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale24 B ND2 ASN 196 B ASN 165 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.423 ? covale ? covale25 B ND2 ASN 265 B ASN 234 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? covale ? covale26 B ND2 ASN 313 B ASN 282 1_555 SA C1 NAG . B NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale27 B ND2 ASN 362 B ASN 331 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? covale ? covale28 B ND2 ASN 374 B ASN 343 1_555 TA C1 NAG . B NAG 1315 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale29 B ND2 ASN 401 B ASN 370 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? covale ? covale30 B ND2 ASN 634 B ASN 603 1_555 XA C1 NAG . B NAG 1328 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale31 B ND2 ASN 647 B ASN 616 1_555 UA C1 NAG . B NAG 1316 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale32 B ND2 ASN 688 B ASN 657 1_555 YA C1 NAG . B NAG 1331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale33 B ND2 ASN 736 B ASN 705 1_555 VA C1 NAG . B NAG 1317 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale34 B ND2 ASN 744 B ASN 713 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.419 ? covale ? covale35 B ND2 ASN 828 B ASN 797 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.426 ? covale ? covale36 B ND2 ASN 1101 B ASN 1070 1_555 WA C1 NAG . B NAG 1321 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale37 B ND2 ASN 1125 B ASN 1094 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.424 ? covale ? covale38 B ND2 ASN 1161 B ASN 1130 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? covale ? covale39 C ND2 ASN 48 C ASN 17 1_555 ZA C1 NAG . C NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale40 C ND2 ASN 61 C ASN 30 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.419 ? covale ? covale41 C ND2 ASN 92 C ASN 61 1_555 AB C1 NAG . C NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale42 C ND2 ASN 153 C ASN 122 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale43 C ND2 ASN 196 C ASN 165 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.422 ? covale ? covale44 C ND2 ASN 265 C ASN 234 1_555 AA C1 NAG . a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? covale ? covale45 C ND2 ASN 313 C ASN 282 1_555 BB C1 NAG . C NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale46 C ND2 ASN 362 C ASN 331 1_555 BA C1 NAG . b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale47 C ND2 ASN 374 C ASN 343 1_555 CB C1 NAG . C NAG 1315 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale48 C ND2 ASN 401 C ASN 370 1_555 GA C1 NAG . g NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? covale ? covale49 C ND2 ASN 634 C ASN 603 1_555 GB C1 NAG . C NAG 1328 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale50 C ND2 ASN 647 C ASN 616 1_555 DB C1 NAG . C NAG 1316 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale51 C ND2 ASN 688 C ASN 657 1_555 HB C1 NAG . C NAG 1331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale52 C ND2 ASN 736 C ASN 705 1_555 EB C1 NAG . C NAG 1317 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale53 C ND2 ASN 744 C ASN 713 1_555 CA C1 NAG . c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.419 ? covale ? covale54 C ND2 ASN 828 C ASN 797 1_555 FA C1 NAG . f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.426 ? covale ? covale55 C ND2 ASN 1101 C ASN 1070 1_555 FB C1 NAG . C NAG 1321 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale56 C ND2 ASN 1125 C ASN 1094 1_555 DA C1 NAG . d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? covale ? covale57 C ND2 ASN 1161 C ASN 1130 1_555 EA C1 NAG . e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? covale ? covale58 D O4 NAG . D NAG 1 1_555 D C1 NAG . D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale59 E O4 NAG . E NAG 1 1_555 E C1 NAG . E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale60 F O4 NAG . F NAG 1 1_555 F C1 NAG . F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? covale ? covale61 G O4 NAG . G NAG 1 1_555 G C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.475 ? covale ? covale62 H O4 NAG . H NAG 1 1_555 H C1 NAG . H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale63 H O6 NAG . H NAG 1 1_555 H C1 FUC . H FUC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale64 I O4 NAG . I NAG 1 1_555 I C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale65 I O4 NAG . I NAG 2 1_555 I C1 BMA . I BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale66 J O4 NAG . J NAG 1 1_555 J C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale67 K O4 NAG . K NAG 1 1_555 K C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.472 ? covale ? covale68 L O4 NAG . L NAG 1 1_555 L C1 NAG . L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale69 M O6 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 FUC . M FUC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale70 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale71 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale72 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? covale ? covale73 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.475 ? covale ? covale74 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale75 R O6 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 FUC . R FUC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale76 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale77 S O4 NAG . S NAG 2 1_555 S C1 BMA . S BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale78 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale79 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.473 ? covale ? covale80 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale81 W O6 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 FUC . W FUC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale82 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale83 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale84 Z O4 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? covale ? covale85 AA O4 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 NAG . a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.475 ? covale ? covale86 BA O4 NAG . b NAG 1 1_555 BA C1 NAG . b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale87 BA O6 NAG . b NAG 1 1_555 BA C1 FUC . b FUC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale88 CA O4 NAG . c NAG 1 1_555 CA C1 NAG . c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale89 CA O4 NAG . c NAG 2 1_555 CA C1 BMA . c BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale90 DA O4 NAG . d NAG 1 1_555 DA C1 NAG . d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale91 EA O4 NAG . e NAG 1 1_555 EA C1 NAG . e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.473 ? covale ? covale92 FA O4 NAG . f NAG 1 1_555 FA C1 NAG . f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale93 GA O6 NAG . g NAG 1 1_555 GA C1 FUC . g FUC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 6ZGF _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code HA 6 NAG A 1 1301 1141 NAG NAG . IA 6 NAG A 1 1304 1143 NAG NAG . JA 6 NAG A 1 1311 1147 NAG NAG . KA 6 NAG A 1 1315 1149 NAG NAG . LA 6 NAG A 1 1316 1153 NAG NAG . MA 6 NAG A 1 1317 1155 NAG NAG . NA 6 NAG A 1 1321 1157 NAG NAG . OA 6 NAG A 1 1328 1161 NAG NAG . PA 6 NAG A 1 1331 1175 NAG NAG . QA 6 NAG B 1 1301 1141 NAG NAG . RA 6 NAG B 1 1304 1143 NAG NAG . SA 6 NAG B 1 1311 1147 NAG NAG . TA 6 NAG B 1 1315 1149 NAG NAG . UA 6 NAG B 1 1316 1153 NAG NAG . VA 6 NAG B 1 1317 1155 NAG NAG . WA 6 NAG B 1 1321 1157 NAG NAG . XA 6 NAG B 1 1328 1161 NAG NAG . YA 6 NAG B 1 1331 1175 NAG NAG . ZA 6 NAG C 1 1301 1141 NAG NAG . AB 6 NAG C 1 1304 1143 NAG NAG . BB 6 NAG C 1 1311 1147 NAG NAG . CB 6 NAG C 1 1315 1149 NAG NAG . DB 6 NAG C 1 1316 1153 NAG NAG . EB 6 NAG C 1 1317 1155 NAG NAG . FB 6 NAG C 1 1321 1157 NAG NAG . GB 6 NAG C 1 1328 1161 NAG NAG . HB 6 NAG C 1 1331 1175 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . OA 6 192.947 247.535 202.191 1 30 ? C1 NAG 1328 A 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . OA 6 193.963 247.496 201.047 1 30 ? C2 NAG 1328 A 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . OA 6 194.285 248.912 200.558 1 30 ? C3 NAG 1328 A 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . OA 6 193.011 249.711 200.296 1 30 ? C4 NAG 1328 A 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . OA 6 192.111 249.621 201.518 1 30 ? C5 NAG 1328 A 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . OA 6 190.834 250.42 201.333 1 30 ? C6 NAG 1328 A 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . OA 6 195.412 245.527 201.281 1 30 ? C7 NAG 1328 A 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . OA 6 196.657 244.971 201.912 1 30 ? C8 NAG 1328 A 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . OA 6 195.188 246.834 201.461 1 30 ? N2 NAG 1328 A 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . OA 6 195.099 248.821 199.382 1 30 ? O3 NAG 1328 A 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . OA 6 193.282 251.11 200.147 1 30 ? O4 NAG 1328 A 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . OA 6 191.796 248.26 201.787 1 30 ? O5 NAG 1328 A 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . OA 6 190.087 249.799 200.297 1 30 ? O6 NAG 1328 A 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . OA 6 194.652 244.813 200.639 1 30 ? O7 NAG 1328 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 14 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 36 _model_server_stats.query_time_ms 298 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 14 #