data_6ZJM # _model_server_result.job_id ROAZibNxHWG-pjfMZdE6bQ _model_server_result.datetime_utc '2024-11-23 20:58:59' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6zjm # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"V","auth_seq_id":1101}' # _entry.id 6ZJM # _exptl.entry_id 6ZJM _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 4 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 6 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 8 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 R N N ? 4 S N N ? 4 T N N ? 4 U N N ? 4 V N N ? 4 W N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 2 oligosaccharide 3 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 2 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 2 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 2 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 4 ? 3 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 2 n I NAG 1 N 1 NAG E 1404 NAG 2 n I NAG 2 N 2 NAG E 1405 NAG 2 n I BMA 3 N 3 BMA E 1406 BMA 2 n I MAN 4 N 4 MAN E 1407 MAN 2 n J NAG 1 V 1 NAG E 2408 NAG 2 n J NAG 2 V 2 NAG E 2409 NAG 2 n J BMA 3 V 3 BMA E 2410 BMA 2 n J MAN 4 V 4 MAN E 2411 MAN 2 n K NAG 1 K 1 NAG G 1404 NAG 2 n K NAG 2 K 2 NAG G 1405 NAG 2 n K BMA 3 K 3 BMA G 1406 BMA 2 n K MAN 4 K 4 MAN G 1407 MAN 2 n L NAG 1 R 1 NAG G 2408 NAG 2 n L NAG 2 R 2 NAG G 2409 NAG 2 n L BMA 3 R 3 BMA G 2410 BMA 2 n L MAN 4 R 4 MAN G 2411 MAN 2 n M NAG 1 J 1 NAG C 1404 NAG 2 n M NAG 2 J 2 NAG C 1405 NAG 2 n M BMA 3 J 3 BMA C 1406 BMA 2 n M MAN 4 J 4 MAN C 1407 MAN 2 n N NAG 1 O 1 NAG C 2408 NAG 2 n N NAG 2 O 2 NAG C 2409 NAG 2 n N BMA 3 O 3 BMA C 2410 BMA 2 n N MAN 4 O 4 MAN C 2411 MAN 3 n O NAG 1 T 1 NAG C 4481 NAG 3 n O NAG 2 T 2 NAG C 4482 NAG 2 n P NAG 1 I 1 NAG A 1404 NAG 2 n P NAG 2 I 2 NAG A 1405 NAG 2 n P BMA 3 I 3 BMA A 1406 BMA 2 n P MAN 4 I 4 MAN A 1407 MAN 2 n Q NAG 1 M 1 NAG A 2408 NAG 2 n Q NAG 2 M 2 NAG A 2409 NAG 2 n Q BMA 3 M 3 BMA A 2410 BMA 2 n Q MAN 4 M 4 MAN A 2411 MAN # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 10 A CYS 30 1_555 A SG CYS 135 A CYS 155 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 44 A CYS 64 1_555 A SG CYS 141 A CYS 161 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 93 A CYS 113 1_555 A SG CYS 112 A CYS 132 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 117 A CYS 137 1_555 A SG CYS 122 A CYS 142 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 159 A CYS 179 1_555 A SG CYS 169 A CYS 189 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 194 A CYS 214 1_555 A SG CYS 230 A CYS 250 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 219 A CYS 239 1_555 A SG CYS 334 A CYS 354 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 898 A CYS 918 1_555 A SG CYS 957 A CYS 977 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 902 A CYS 922 1_555 A SG CYS 911 A CYS 931 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 927 A CYS 947 1_555 A SG CYS 946 A CYS 966 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.054 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 974 A CYS 994 1_555 A SG CYS 997 A CYS 1017 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf12 B SG CYS 485 B CYS 738 1_555 B SG CYS 520 B CYS 773 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.012 ? disulf ? disulf13 B SG CYS 489 B CYS 742 1_555 B SG CYS 527 B CYS 780 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? disulf ? disulf14 B SG CYS 501 B CYS 754 1_555 B SG CYS 634 B CYS 887 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf15 B SG CYS 515 B CYS 768 1_555 B SG CYS 645 B CYS 898 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf16 B SG CYS 530 B CYS 783 1_555 B SG CYS 653 B CYS 906 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf17 B SG CYS 556 B CYS 809 1_555 B SG CYS 565 B CYS 818 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf18 B SG CYS 573 B CYS 826 1_555 B SG CYS 582 B CYS 835 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf19 B SG CYS 613 B CYS 866 1_555 B SG CYS 617 B CYS 870 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf20 B SG CYS 719 B CYS 972 1_555 B SG CYS 749 B CYS 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf21 B SG CYS 742 B CYS 995 1_555 B SG CYS 794 B CYS 1047 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? disulf ? disulf22 B SG CYS 759 B CYS 1012 1_555 B SG CYS 764 B CYS 1017 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.004 ? disulf ? disulf23 B SG CYS 795 B CYS 1048 1_555 B SG CYS 800 B CYS 1053 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf24 B SG CYS 834 B CYS 1087 1_555 B SG CYS 838 B CYS 1091 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf25 C SG CYS 10 C CYS 30 1_555 C SG CYS 135 C CYS 155 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf26 C SG CYS 44 C CYS 64 1_555 C SG CYS 141 C CYS 161 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf27 C SG CYS 93 C CYS 113 1_555 C SG CYS 112 C CYS 132 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf28 C SG CYS 117 C CYS 137 1_555 C SG CYS 122 C CYS 142 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf29 C SG CYS 159 C CYS 179 1_555 C SG CYS 169 C CYS 189 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf30 C SG CYS 194 C CYS 214 1_555 C SG CYS 230 C CYS 250 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? disulf ? disulf31 C SG CYS 219 C CYS 239 1_555 C SG CYS 334 C CYS 354 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf32 C SG CYS 898 C CYS 918 1_555 C SG CYS 957 C CYS 977 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf33 C SG CYS 902 C CYS 922 1_555 C SG CYS 911 C CYS 931 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf34 C SG CYS 927 C CYS 947 1_555 C SG CYS 946 C CYS 966 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf35 C SG CYS 974 C CYS 994 1_555 C SG CYS 997 C CYS 1017 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf ? disulf36 D SG CYS 485 D CYS 738 1_555 D SG CYS 520 D CYS 773 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.012 ? disulf ? disulf37 D SG CYS 489 D CYS 742 1_555 D SG CYS 527 D CYS 780 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? disulf ? disulf38 D SG CYS 501 D CYS 754 1_555 D SG CYS 634 D CYS 887 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf39 D SG CYS 515 D CYS 768 1_555 D SG CYS 645 D CYS 898 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf40 D SG CYS 530 D CYS 783 1_555 D SG CYS 653 D CYS 906 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf41 D SG CYS 556 D CYS 809 1_555 D SG CYS 565 D CYS 818 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf42 D SG CYS 573 D CYS 826 1_555 D SG CYS 582 D CYS 835 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf43 D SG CYS 613 D CYS 866 1_555 D SG CYS 617 D CYS 870 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf44 D SG CYS 719 D CYS 972 1_555 D SG CYS 749 D CYS 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf45 D SG CYS 742 D CYS 995 1_555 D SG CYS 794 D CYS 1047 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? disulf ? disulf46 D SG CYS 759 D CYS 1012 1_555 D SG CYS 764 D CYS 1017 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.004 ? disulf ? disulf47 D SG CYS 795 D CYS 1048 1_555 D SG CYS 800 D CYS 1053 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf48 D SG CYS 834 D CYS 1087 1_555 D SG CYS 838 D CYS 1091 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf49 E SG CYS 10 E CYS 30 1_555 E SG CYS 135 E CYS 155 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf50 E SG CYS 44 E CYS 64 1_555 E SG CYS 141 E CYS 161 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf51 E SG CYS 93 E CYS 113 1_555 E SG CYS 112 E CYS 132 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf52 E SG CYS 117 E CYS 137 1_555 E SG CYS 122 E CYS 142 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf53 E SG CYS 159 E CYS 179 1_555 E SG CYS 169 E CYS 189 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf54 E SG CYS 194 E CYS 214 1_555 E SG CYS 230 E CYS 250 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? disulf ? disulf55 E SG CYS 219 E CYS 239 1_555 E SG CYS 334 E CYS 354 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf56 E SG CYS 898 E CYS 918 1_555 E SG CYS 957 E CYS 977 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf57 E SG CYS 902 E CYS 922 1_555 E SG CYS 911 E CYS 931 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf ? disulf58 E SG CYS 927 E CYS 947 1_555 E SG CYS 946 E CYS 966 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf59 E SG CYS 974 E CYS 994 1_555 E SG CYS 997 E CYS 1017 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? disulf ? disulf60 F SG CYS 485 F CYS 738 1_555 F SG CYS 520 F CYS 773 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.012 ? disulf ? disulf61 F SG CYS 489 F CYS 742 1_555 F SG CYS 527 F CYS 780 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? disulf ? disulf62 F SG CYS 501 F CYS 754 1_555 F SG CYS 634 F CYS 887 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf63 F SG CYS 515 F CYS 768 1_555 F SG CYS 645 F CYS 898 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf64 F SG CYS 530 F CYS 783 1_555 F SG CYS 653 F CYS 906 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf65 F SG CYS 556 F CYS 809 1_555 F SG CYS 565 F CYS 818 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf66 F SG CYS 573 F CYS 826 1_555 F SG CYS 582 F CYS 835 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf67 F SG CYS 613 F CYS 866 1_555 F SG CYS 617 F CYS 870 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf68 F SG CYS 719 F CYS 972 1_555 F SG CYS 749 F CYS 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf69 F SG CYS 742 F CYS 995 1_555 F SG CYS 794 F CYS 1047 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? disulf ? disulf70 F SG CYS 759 F CYS 1012 1_555 F SG CYS 764 F CYS 1017 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.004 ? disulf ? disulf71 F SG CYS 795 F CYS 1048 1_555 F SG CYS 800 F CYS 1053 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf72 F SG CYS 834 F CYS 1087 1_555 F SG CYS 838 F CYS 1091 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf73 G SG CYS 10 G CYS 30 1_555 G SG CYS 135 G CYS 155 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf74 G SG CYS 44 G CYS 64 1_555 G SG CYS 141 G CYS 161 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf75 G SG CYS 93 G CYS 113 1_555 G SG CYS 112 G CYS 132 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf76 G SG CYS 117 G CYS 137 1_555 G SG CYS 122 G CYS 142 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf77 G SG CYS 159 G CYS 179 1_555 G SG CYS 169 G CYS 189 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf78 G SG CYS 194 G CYS 214 1_555 G SG CYS 230 G CYS 250 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? disulf ? disulf79 G SG CYS 219 G CYS 239 1_555 G SG CYS 334 G CYS 354 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf80 G SG CYS 898 G CYS 918 1_555 G SG CYS 957 G CYS 977 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf81 G SG CYS 902 G CYS 922 1_555 G SG CYS 911 G CYS 931 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.05 ? disulf ? disulf82 G SG CYS 927 G CYS 947 1_555 G SG CYS 946 G CYS 966 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf83 G SG CYS 974 G CYS 994 1_555 G SG CYS 997 G CYS 1017 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf84 H SG CYS 485 H CYS 738 1_555 H SG CYS 520 H CYS 773 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.012 ? disulf ? disulf85 H SG CYS 489 H CYS 742 1_555 H SG CYS 527 H CYS 780 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? disulf ? disulf86 H SG CYS 501 H CYS 754 1_555 H SG CYS 634 H CYS 887 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf87 H SG CYS 515 H CYS 768 1_555 H SG CYS 645 H CYS 898 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf88 H SG CYS 530 H CYS 783 1_555 H SG CYS 653 H CYS 906 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf89 H SG CYS 556 H CYS 809 1_555 H SG CYS 565 H CYS 818 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf90 H SG CYS 573 H CYS 826 1_555 H SG CYS 582 H CYS 835 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf91 H SG CYS 613 H CYS 866 1_555 H SG CYS 617 H CYS 870 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf92 H SG CYS 719 H CYS 972 1_555 H SG CYS 749 H CYS 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf93 H SG CYS 742 H CYS 995 1_555 H SG CYS 794 H CYS 1047 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? disulf ? disulf94 H SG CYS 759 H CYS 1012 1_555 H SG CYS 764 H CYS 1017 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.004 ? disulf ? disulf95 H SG CYS 795 H CYS 1048 1_555 H SG CYS 800 H CYS 1053 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf96 H SG CYS 834 H CYS 1087 1_555 H SG CYS 838 H CYS 1091 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 118 A ASN 138 1_555 P C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 330 A ASN 350 1_555 Q C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 921 A ASN 941 1_555 R C1 NAG . A NAG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale4 C ND2 ASN 118 C ASN 138 1_555 M C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale5 C ND2 ASN 330 C ASN 350 1_555 N C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? covale ? covale6 C ND2 ASN 921 C ASN 941 1_555 O C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale7 E ND2 ASN 118 E ASN 138 1_555 I C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale8 E ND2 ASN 330 E ASN 350 1_555 J C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? covale ? covale9 G ND2 ASN 118 G ASN 138 1_555 K C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale10 G ND2 ASN 330 G ASN 350 1_555 L C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? covale ? covale11 G ND2 ASN 921 G ASN 941 1_555 V C1 NAG . G NAG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale12 I O4 NAG . N NAG 1 1_555 I C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.481 ? covale ? covale13 I O4 NAG . N NAG 2 1_555 I C1 BMA . N BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale14 I O3 BMA . N BMA 3 1_555 I C1 MAN . N MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? covale ? covale15 J O4 NAG . V NAG 1 1_555 J C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale16 J O4 NAG . V NAG 2 1_555 J C1 BMA . V BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale17 J O3 BMA . V BMA 3 1_555 J C1 MAN . V MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale18 K O4 NAG . K NAG 1 1_555 K C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.481 ? covale ? covale19 K O4 NAG . K NAG 2 1_555 K C1 BMA . K BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale20 K O3 BMA . K BMA 3 1_555 K C1 MAN . K MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? covale ? covale21 L O4 NAG . R NAG 1 1_555 L C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale22 L O4 NAG . R NAG 2 1_555 L C1 BMA . R BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale23 L O3 BMA . R BMA 3 1_555 L C1 MAN . R MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale24 M O4 NAG . J NAG 1 1_555 M C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.481 ? covale ? covale25 M O4 NAG . J NAG 2 1_555 M C1 BMA . J BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale26 M O3 BMA . J BMA 3 1_555 M C1 MAN . J MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? covale ? covale27 N O4 NAG . O NAG 1 1_555 N C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale28 N O4 NAG . O NAG 2 1_555 N C1 BMA . O BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale29 N O3 BMA . O BMA 3 1_555 N C1 MAN . O MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale30 O O4 NAG . T NAG 1 1_555 O C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale31 P O4 NAG . I NAG 1 1_555 P C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.481 ? covale ? covale32 P O4 NAG . I NAG 2 1_555 P C1 BMA . I BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale33 P O3 BMA . I BMA 3 1_555 P C1 MAN . I MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? covale ? covale34 Q O4 NAG . M NAG 1 1_555 Q C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale35 Q O4 NAG . M NAG 2 1_555 Q C1 BMA . M BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale36 Q O3 BMA . M BMA 3 1_555 Q C1 MAN . M MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 283 n n C1 O1 NAG sing 284 n n C1 O5 NAG sing 285 n n C1 H1 NAG sing 286 n n C2 C3 NAG sing 287 n n C2 N2 NAG sing 288 n n C2 H2 NAG sing 289 n n C3 C4 NAG sing 290 n n C3 O3 NAG sing 291 n n C3 H3 NAG sing 292 n n C4 C5 NAG sing 293 n n C4 O4 NAG sing 294 n n C4 H4 NAG sing 295 n n C5 C6 NAG sing 296 n n C5 O5 NAG sing 297 n n C5 H5 NAG sing 298 n n C6 O6 NAG sing 299 n n C6 H61 NAG sing 300 n n C6 H62 NAG sing 301 n n C7 C8 NAG sing 302 n n C7 N2 NAG sing 303 n n C7 O7 NAG doub 304 n n C8 H81 NAG sing 305 n n C8 H82 NAG sing 306 n n C8 H83 NAG sing 307 n n N2 HN2 NAG sing 308 n n O1 HO1 NAG sing 309 n n O3 HO3 NAG sing 310 n n O4 HO4 NAG sing 311 n n O6 HO6 NAG sing 312 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 6ZJM _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code R 4 NAG A 1 1101 3481 NAG NAG . S 4 NAG B 1 1301 2172 NAG NAG . T 4 NAG D 1 1301 1172 NAG NAG . U 4 NAG F 1 1301 1172 NAG NAG . V 4 NAG G 1 1101 3484 NAG NAG . W 4 NAG H 1 1301 1172 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . V 4 231.525 200.282 216.425 1 78.59 ? C1 NAG 1101 G 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . V 4 231.243 198.852 216.887 1 92.85 ? C2 NAG 1101 G 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . V 4 231.745 198.652 218.316 1 98.28 ? C3 NAG 1101 G 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . V 4 233.22 199.031 218.414 1 102.03 ? C4 NAG 1101 G 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . V 4 233.433 200.448 217.885 1 97.01 ? C5 NAG 1101 G 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . V 4 234.889 200.859 217.845 1 99.49 ? C6 NAG 1101 G 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . V 4 229.291 197.925 215.719 1 100.98 ? C7 NAG 1101 G 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . V 4 227.814 197.67 215.778 1 100.07 ? C8 NAG 1101 G 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . V 4 229.827 198.53 216.787 1 97.27 ? N2 NAG 1101 G 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . V 4 231.539 197.295 218.693 1 96.98 ? O3 NAG 1101 G 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . V 4 233.65 199.03 219.771 1 111.18 ? O4 NAG 1101 G 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . V 4 232.926 200.562 216.547 1 88.88 ? O5 NAG 1101 G 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . V 4 235.423 200.824 216.527 1 102.67 ? O6 NAG 1101 G 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . V 4 229.969 197.6 214.747 1 100.7 ? O7 NAG 1101 G 1 # _model_server_stats.io_time_ms 23 _model_server_stats.parse_time_ms 11 _model_server_stats.create_model_time_ms 35 _model_server_stats.query_time_ms 283 _model_server_stats.encode_time_ms 21 _model_server_stats.element_count 14 #