data_6ZKP # _model_server_result.job_id k21uKACTW4v4ucgtCX6LTA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-23 20:14:09' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6zkp # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"BC","auth_seq_id":300}' # _entry.id 6ZKP # _exptl.entry_id 6ZKP _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 65.409 _entity.id 53 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ZINC ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6ZKP _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6ZKP _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 45-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 45 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 53 _struct_asym.id BC _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 O SG CYS 95 V CYS 94 1_555 O SG CYS 115 V CYS 114 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf2 S SG CYS 112 Z CYS 112 1_555 S SG CYS 124 Z CYS 124 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf3 EA SG CYS 33 l CYS 32 1_555 EA SG CYS 66 l CYS 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf4 EA SG CYS 43 l CYS 42 1_555 EA SG CYS 56 l CYS 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf5 LA SG CYS 69 s CYS 68 1_555 LA SG CYS 80 s CYS 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? covale ? covale1 D C HIS 117 4 HIS 84 1_555 D N 2MR 118 4 2MR 85 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? covale ? covale2 D C 2MR 118 4 2MR 85 1_555 D N GLY 119 4 GLY 86 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale3 K C FME 1 K FME 1 1_555 K N SER 2 K SER 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale4 L C FME 1 L FME 1 1_555 L N ASN 2 L ASN 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale5 M C FME 1 M FME 1 1_555 M N LEU 2 M LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? covale ? covale6 O C AYA 2 V AYA 1 1_555 O N LYS 3 V LYS 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale7 Q OG SER 113 X SER 44 1_555 AC P1 ZMP . X ZMP 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? covale ? covale8 AA C AYA 3 h AYA 1 1_555 AA N SER 4 h SER 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale9 DA C LYS 70 k LYS 35 1_555 DA N SEP 71 k SEP 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale10 DA C SEP 71 k SEP 36 1_555 DA N LYS 72 k LYS 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale11 LA CA GLY 2 s GLY 1 1_555 JC C1 MYR . s MYR 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? metalc ? metalc1 A SG CYS 385 1 CYS 365 1_555 TA FE1 SF4 . 1 SF4 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? metalc ? metalc2 B SG CYS 132 2 CYS 103 1_555 VA FE1 FES . 2 FES 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? metalc ? metalc3 B SG CYS 137 2 CYS 108 1_555 VA FE1 FES . 2 FES 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? metalc ? metalc4 B SG CYS 173 2 CYS 144 1_555 VA FE2 FES . 2 FES 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? metalc ? metalc5 B SG CYS 177 2 CYS 148 1_555 VA FE2 FES . 2 FES 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? metalc ? metalc6 C SG CYS 64 3 CYS 41 1_555 YA FE1 FES . 3 FES 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? metalc ? metalc7 C SG CYS 75 3 CYS 52 1_555 YA FE1 FES . 3 FES 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? metalc ? metalc8 C SG CYS 78 3 CYS 55 1_555 YA FE2 FES . 3 FES 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? metalc ? metalc9 C SG CYS 92 3 CYS 69 1_555 YA FE2 FES . 3 FES 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? metalc ? metalc10 C NE2 HIS 124 3 HIS 101 1_555 WA FE3 SF4 . 3 SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.913 ? metalc ? metalc11 C SG CYS 128 3 CYS 105 1_555 WA FE2 SF4 . 3 SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? metalc ? metalc12 C SG CYS 131 3 CYS 108 1_555 WA FE4 SF4 . 3 SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? metalc ? metalc13 C OE1 GLN 133 3 GLN 110 1_555 ZA K K . 3 K 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.839 ? metalc ? metalc14 C SG CYS 137 3 CYS 114 1_555 WA FE1 SF4 . 3 SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.32 ? metalc ? metalc15 C SG CYS 176 3 CYS 153 1_555 XA FE2 SF4 . 3 SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? metalc ? metalc16 C SG CYS 179 3 CYS 156 1_555 XA FE1 SF4 . 3 SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? metalc ? metalc17 C SG CYS 182 3 CYS 159 1_555 XA FE3 SF4 . 3 SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? metalc ? metalc18 C O ILE 223 3 ILE 200 1_555 ZA K K . 3 K 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.908 ? metalc ? metalc19 C SG CYS 226 3 CYS 203 1_555 XA FE4 SF4 . 3 SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? metalc ? metalc20 C O CYS 226 3 CYS 203 1_555 ZA K K . 3 K 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.874 ? metalc ? metalc21 C O VAL 228 3 VAL 205 1_555 ZA K K . 3 K 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.102 ? metalc ? metalc22 C O LEU 231 3 LEU 208 1_555 ZA K K . 3 K 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.877 ? metalc ? metalc23 F SG CYS 98 6 CYS 54 1_555 BB FE4 SF4 . 6 SF4 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? metalc ? metalc24 G SG CYS 118 9 CYS 77 1_555 GB FE3 SF4 . 9 SF4 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? metalc ? metalc25 G SG CYS 121 9 CYS 80 1_555 GB FE4 SF4 . 9 SF4 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? metalc ? metalc26 G SG CYS 124 9 CYS 83 1_555 GB FE2 SF4 . 9 SF4 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? metalc ? metalc27 G SG CYS 128 9 CYS 87 1_555 FB FE4 SF4 . 9 SF4 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? metalc ? metalc28 G SG CYS 157 9 CYS 116 1_555 FB FE2 SF4 . 9 SF4 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? metalc ? metalc29 G SG CYS 163 9 CYS 122 1_555 FB FE3 SF4 . 9 SF4 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? metalc ? metalc30 G SG CYS 167 9 CYS 126 1_555 GB FE1 SF4 . 9 SF4 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? metalc ? metalc31 U SG CYS 87 b CYS 59 1_555 BC ZN ZN . b ZN 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.29 ? metalc ? metalc32 U NE2 HIS 96 b HIS 68 1_555 BC ZN ZN . b ZN 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.999 ? metalc ? metalc33 U SG CYS 112 b CYS 84 1_555 BC ZN ZN . b ZN 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.29 ? metalc ? metalc34 U SG CYS 115 b CYS 87 1_555 BC ZN ZN . b ZN 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.288 ? # _chem_comp.formula 'Zn 2' _chem_comp.formula_weight 65.409 _chem_comp.id ZN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ZINC ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 6ZKP _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code TA 45 SF4 1 1 500 500 SF4 SF4 . UA 46 FMN 1 1 501 501 FMN FMN . VA 47 FES 2 1 300 300 FES FES . WA 45 SF4 3 1 801 801 SF4 SF4 . XA 45 SF4 3 1 802 802 SF4 SF4 . YA 47 FES 3 1 803 803 FES FES . ZA 48 K 3 1 804 901 K K . AB 49 3PE 4 1 501 903 3PE 3PE . BB 45 SF4 6 1 201 300 SF4 SF4 . CB 50 PC1 6 1 202 401 PC1 PC1 . DB 49 3PE 6 1 203 501 3PE 3PE . EB 50 PC1 9 1 401 401 PC1 PC1 . FB 45 SF4 9 1 402 502 SF4 SF4 . GB 45 SF4 9 1 403 503 SF4 SF4 . HB 50 PC1 A 1 201 201 PC1 PC1 . IB 49 3PE A 1 202 101 3PE 3PE . JB 49 3PE H 1 401 505 3PE 3PE . KB 49 3PE J 1 201 101 3PE 3PE . LB 49 3PE L 1 1001 1001 3PE 3PE . MB 50 PC1 L 1 1002 701 PC1 PC1 . NB 50 PC1 L 1 1003 801 PC1 PC1 . OB 51 CDL L 1 1004 501 CDL CDL . PB 49 3PE L 1 1005 202 3PE 3PE . QB 49 3PE M 1 501 702 3PE 3PE . RB 50 PC1 M 1 502 603 PC1 PC1 . SB 49 3PE N 1 401 401 3PE 3PE . TB 49 3PE N 1 402 501 3PE 3PE . UB 51 CDL N 1 403 502 CDL CDL . VB 49 3PE V 1 201 102 3PE 3PE . WB 49 3PE V 1 202 400 3PE 3PE . XB 51 CDL V 1 203 501 CDL CDL . YB 51 CDL V 1 204 502 CDL CDL . ZB 51 CDL W 1 201 502 CDL CDL . AC 52 ZMP X 1 101 101 ZMP ZMP . BC 53 ZN b 1 300 300 ZN ZN . CC 54 NDP d 1 401 401 NDP NDP . DC 52 ZMP g 1 201 101 ZMP ZMP . EC 51 CDL h 1 201 503 CDL CDL . FC 49 3PE i 1 201 502 3PE 3PE . GC 55 AMP k 1 501 501 AMP AMP . HC 51 CDL o 1 201 503 CDL CDL . IC 49 3PE p 1 201 201 3PE 3PE . JC 56 MYR s 1 201 201 MYR MYR . KC 51 CDL y 1 201 201 CDL CDL . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol ZN _atom_site.label_atom_id ZN _atom_site.label_comp_id ZN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id BC _atom_site.label_entity_id 53 _atom_site.Cartn_x 94.174 _atom_site.Cartn_y 83.114 _atom_site.Cartn_z 238.437 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 26.1 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id ZN _atom_site.auth_comp_id ZN _atom_site.auth_seq_id 300 _atom_site.auth_asym_id b _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 43 _model_server_stats.parse_time_ms 16 _model_server_stats.create_model_time_ms 122 _model_server_stats.query_time_ms 374 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 1 #