data_6ZTQ # _model_server_result.job_id H3DHTwVKCP0hjPEKVqfdOw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-04 23:01:25' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6ztq # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"YA","auth_seq_id":301}' # _entry.id 6ZTQ # _exptl.entry_id 6ZTQ _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 175.82 _entity.id 49 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6ZTQ _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6ZTQ _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 45-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 45 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 49 YA N N ? 49 DB N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 X SG CYS 36 X CYS 35 1_555 X SG CYS 66 X CYS 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf2 X SG CYS 46 X CYS 45 1_555 X SG CYS 56 X CYS 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? disulf ? disulf3 X SG CYS 78 X CYS 77 1_555 X SG CYS 110 X CYS 109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf4 X SG CYS 88 X CYS 87 1_555 X SG CYS 100 X CYS 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf5 Y SG CYS 97 Y CYS 96 1_555 Y SG CYS 117 Y CYS 116 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf6 EA SG CYS 33 e CYS 32 1_555 EA SG CYS 66 e CYS 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf7 EA SG CYS 43 e CYS 42 1_555 EA SG CYS 56 e CYS 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf8 OA SG CYS 69 o CYS 68 1_555 OA SG CYS 80 o CYS 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf9 PA SG CYS 77 p CYS 76 1_555 PA SG CYS 84 p CYS 83 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf10 PA SG CYS 113 p CYS 112 1_555 PA SG CYS 125 p CYS 124 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? covale ? covale1 A C FME 1 A FME 1 1_555 A N ASN 2 A ASN 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale2 D C HIS 117 D HIS 84 1_555 D N 2MR 118 D 2MR 85 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? covale ? covale3 D C 2MR 118 D 2MR 85 1_555 D N GLY 119 D GLY 86 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale4 H C FME 1 H FME 1 1_555 H N PHE 2 H PHE 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale5 J C FME 1 J FME 1 1_555 J N ASN 2 J ASN 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale6 K C FME 1 K FME 1 1_555 K N PRO 2 K PRO 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.347 ? covale ? covale7 L C FME 1 L FME 1 1_555 L N ASN 2 L ASN 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale8 M C FME 1 M FME 1 1_555 M N LEU 2 M LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? covale ? covale9 N C FME 1 N FME 1 1_555 N N ASN 2 N ASN 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale10 T OG SER 112 T SER 44 1_555 RB P1 EHZ . T EHZ 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.608 ? covale ? covale11 U OG SER 112 U SER 44 1_555 SB P1 EHZ . U EHZ 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.592 ? covale ? covale12 IA C SAC 2 i SAC 1 1_555 IA N GLY 3 i GLY 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.34 ? covale ? covale13 QA C AME 1 q AME 1 1_555 QA N GLU 2 q GLU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale14 RA C AYA 2 r AYA 1 1_555 RA N SER 3 r SER 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? metalc ? metalc1 B SG CYS 99 B CYS 64 1_555 TA FE3 SF4 . B SF4 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? metalc ? metalc2 B SG CYS 100 B CYS 65 1_555 TA FE2 SF4 . B SF4 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? metalc ? metalc3 B SG CYS 164 B CYS 129 1_555 TA FE1 SF4 . B SF4 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.277 ? metalc ? metalc4 B SG CYS 194 B CYS 159 1_555 TA FE4 SF4 . B SF4 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.24 ? metalc ? metalc5 E SG CYS 134 E CYS 103 1_555 YA FE1 FES . E FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.283 ? metalc ? metalc6 E SG CYS 139 E CYS 108 1_555 YA FE1 FES . E FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.268 ? metalc ? metalc7 E SG CYS 175 E CYS 144 1_555 YA FE2 FES . E FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.247 ? metalc ? metalc8 E SG CYS 179 E CYS 148 1_555 YA FE2 FES . E FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.247 ? metalc ? metalc9 F SG CYS 379 F CYS 359 1_555 AB FE4 SF4 . F SF4 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.252 ? metalc ? metalc10 F SG CYS 382 F CYS 362 1_555 AB FE1 SF4 . F SF4 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.242 ? metalc ? metalc11 F SG CYS 385 F CYS 365 1_555 AB FE2 SF4 . F SF4 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.217 ? metalc ? metalc12 F SG CYS 425 F CYS 405 1_555 AB FE3 SF4 . F SF4 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.269 ? metalc ? metalc13 G SG CYS 64 G CYS 41 1_555 DB FE1 FES . G FES 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.237 ? metalc ? metalc14 G SG CYS 75 G CYS 52 1_555 DB FE1 FES . G FES 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.229 ? metalc ? metalc15 G SG CYS 78 G CYS 55 1_555 DB FE2 FES . G FES 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.226 ? metalc ? metalc16 G SG CYS 92 G CYS 69 1_555 DB FE2 FES . G FES 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.26 ? metalc ? metalc17 G NE2 HIS 124 G HIS 101 1_555 BB FE3 SF4 . G SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? metalc ? metalc18 G SG CYS 128 G CYS 105 1_555 BB FE2 SF4 . G SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.303 ? metalc ? metalc19 G SG CYS 131 G CYS 108 1_555 BB FE4 SF4 . G SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? metalc ? metalc20 G SG CYS 137 G CYS 114 1_555 BB FE1 SF4 . G SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.226 ? metalc ? metalc21 G SG CYS 176 G CYS 153 1_555 CB FE2 SF4 . G SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.277 ? metalc ? metalc22 G SG CYS 179 G CYS 156 1_555 CB FE1 SF4 . G SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.249 ? metalc ? metalc23 G SG CYS 182 G CYS 159 1_555 CB FE3 SF4 . G SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.277 ? metalc ? metalc24 G SG CYS 226 G CYS 203 1_555 CB FE4 SF4 . G SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.251 ? metalc ? metalc25 I SG CYS 113 I CYS 79 1_555 GB FE3 SF4 . I SF4 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.255 ? metalc ? metalc26 I SG CYS 116 I CYS 82 1_555 GB FE4 SF4 . I SF4 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.222 ? metalc ? metalc27 I SG CYS 119 I CYS 85 1_555 GB FE2 SF4 . I SF4 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.275 ? metalc ? metalc28 I SG CYS 123 I CYS 89 1_555 FB FE4 SF4 . I SF4 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.292 ? metalc ? metalc29 I SG CYS 152 I CYS 118 1_555 FB FE2 SF4 . I SF4 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.259 ? metalc ? metalc30 I SG CYS 155 I CYS 121 1_555 FB FE1 SF4 . I SF4 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.252 ? metalc ? metalc31 I SG CYS 158 I CYS 124 1_555 FB FE3 SF4 . I SF4 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? metalc ? metalc32 I SG CYS 162 I CYS 128 1_555 GB FE1 SF4 . I SF4 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.246 ? metalc ? metalc33 R SG CYS 79 R CYS 59 1_555 QB ZN ZN . R ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.371 ? metalc ? metalc34 R NE2 HIS 88 R HIS 68 1_555 QB ZN ZN . R ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? metalc ? metalc35 R SG CYS 104 R CYS 84 1_555 QB ZN ZN . R ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.258 ? metalc ? metalc36 R SG CYS 107 R CYS 87 1_555 QB ZN ZN . R ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.283 ? # _chem_comp.formula 'Fe2 S2' _chem_comp.formula_weight 175.82 _chem_comp.id FES _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 6ZTQ _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code TA 45 SF4 B 1 201 201 SF4 SF4 . UA 46 PC1 B 1 202 202 PC1 PC1 . VA 46 PC1 B 1 203 203 PC1 PC1 . WA 47 HQH D 1 501 501 HQH HQH . XA 48 3PE D 1 502 502 3PE 3PE . YA 49 FES E 1 301 301 FES FES . ZA 50 FMN F 1 501 501 FMN FMN . AB 45 SF4 F 1 502 502 SF4 SF4 . BB 45 SF4 G 1 801 801 SF4 SF4 . CB 45 SF4 G 1 802 802 SF4 SF4 . DB 49 FES G 1 803 803 FES FES . EB 48 3PE H 1 401 401 3PE 3PE . FB 45 SF4 I 1 201 201 SF4 SF4 . GB 45 SF4 I 1 202 202 SF4 SF4 . HB 46 PC1 J 1 201 201 PC1 PC1 . IB 48 3PE K 1 201 201 3PE 3PE . JB 51 CDL L 1 701 701 CDL CDL . KB 48 3PE L 1 702 702 3PE 3PE . LB 48 3PE M 1 501 501 3PE 3PE . MB 51 CDL N 1 401 401 CDL CDL . NB 51 CDL N 1 402 402 CDL CDL . OB 52 ATP O 1 401 401 ATP ATP . PB 53 NDP P 1 501 501 NDP NAP . QB 54 ZN R 1 201 201 ZN ZN . RB 55 EHZ T 1 201 201 EHZ EHZ . SB 55 EHZ U 1 201 201 EHZ EHZ . TB 48 3PE Y 1 401 401 3PE 3PE . UB 46 PC1 Z 1 201 201 PC1 PC1 . VB 51 CDL d 1 201 201 CDL CDL . WB 51 CDL d 1 202 202 CDL CDL . XB 51 CDL h 1 201 201 CDL CDL . YB 48 3PE h 1 202 202 3PE 3PE . ZB 48 3PE i 1 201 201 3PE 3PE . AC 48 3PE l 1 701 701 3PE 3PE . BC 51 CDL q 1 201 201 CDL CDL . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 FE FE1 FES . . . YA 49 257.409 174.429 347.712 1 50.17 ? FE1 FES 301 E 1 HETATM 2 FE FE2 FES . . . YA 49 259.122 173.149 346.044 1 50.17 ? FE2 FES 301 E 1 HETATM 3 S S1 FES . . . YA 49 259.458 173.669 348.186 1 50.17 ? S1 FES 301 E 1 HETATM 4 S S2 FES . . . YA 49 257.053 173.822 345.596 1 50.17 ? S2 FES 301 E 1 # _model_server_stats.io_time_ms 0 _model_server_stats.parse_time_ms 13 _model_server_stats.create_model_time_ms 94 _model_server_stats.query_time_ms 263 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 4 #