data_7AKD # _model_server_result.job_id 9llhGpSCI7jiXP6OvBBfFQ _model_server_result.datetime_utc '2024-11-14 06:27:51' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7akd # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"YA","auth_seq_id":1304}' # _entry.id 7AKD # _exptl.entry_id 7AKD _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 10 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 28 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details heptameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 7 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 10 Y N N ? 10 Z N N ? 10 AA N N ? 10 BA N N ? 10 CA N N ? 10 DA N N ? 10 EA N N ? 10 FA N N ? 10 GA N N ? 10 IA N N ? 10 JA N N ? 10 KA N N ? 10 LA N N ? 10 MA N N ? 10 OA N N ? 10 PA N N ? 10 QA N N ? 10 RA N N ? 10 SA N N ? 10 TA N N ? 10 UA N N ? 10 VA N N ? 10 WA N N ? 10 XA N N ? 10 YA N N ? 10 ZA N N ? 10 AB N N ? 10 BB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 4 oligosaccharide 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide 7 oligosaccharide 8 oligosaccharide 9 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 4 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 5 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 4 ? 6 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 5 ? 6 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 6 ? 6 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 7 ? 6 5 3 MAN BMA C3 H3 . O6 HO6 . sing 8 ? 7 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 9 ? 7 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 10 ? 7 4 1 FUC NAG C1 O1 . O6 HO6 . sing 11 ? 8 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 12 ? 8 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 13 ? 8 4 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 14 ? 8 5 4 MAN MAN C1 O1 . O3 HO3 . sing 15 ? 8 6 1 FUC NAG C1 O1 . O6 HO6 . sing 16 ? 9 2 1 MAN MAN C1 O1 . O6 HO6 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 4 n H NAG 1 F 1 NAG A 1304 NAG 4 n H NAG 2 F 2 NAG A 1305 NAG 5 n I NAG 1 G 1 NAG A 1306 NAG 5 n I NAG 2 G 2 NAG A 1307 NAG 5 n I BMA 3 G 3 BMA A 1308 BMA 5 n J NAG 1 I 1 NAG A 1310 NAG 5 n J NAG 2 I 2 NAG A 1311 NAG 5 n J BMA 3 I 3 BMA A 1312 BMA 4 n K NAG 1 J 1 NAG A 1313 NAG 4 n K NAG 2 J 2 NAG A 1314 NAG 4 n L NAG 1 K 1 NAG A 1327 NAG 4 n L NAG 2 K 2 NAG A 1328 NAG 4 n M NAG 1 M 1 NAG A 1332 NAG 4 n M NAG 2 M 2 NAG A 1333 NAG 5 n N NAG 1 N 1 NAG B 1306 NAG 5 n N NAG 2 N 2 NAG B 1307 NAG 5 n N BMA 3 N 3 BMA B 1308 BMA 6 n O NAG 1 O 1 NAG B 1313 NAG 6 n O NAG 2 O 2 NAG B 1314 NAG 6 n O BMA 3 O 3 BMA B 1315 BMA 6 n O MAN 4 O 4 MAN B 1316 MAN 6 n O MAN 5 O 5 MAN B 1317 MAN 4 n P NAG 1 P 1 NAG B 1329 NAG 4 n P NAG 2 P 2 NAG B 1330 NAG 4 n Q NAG 1 Q 1 NAG B 1332 NAG 4 n Q NAG 2 Q 2 NAG B 1333 NAG 4 n R NAG 1 R 1 NAG C 1304 NAG 4 n R NAG 2 R 2 NAG C 1305 NAG 7 n S NAG 1 S 1 NAG C 1306 NAG 7 n S NAG 2 S 2 NAG C 1307 NAG 7 n S BMA 3 S 3 BMA C 1308 BMA 7 n S FUC 4 S 4 FUC C 1309 FUC 8 n T NAG 1 T 1 NAG C 1313 NAG 8 n T NAG 2 T 2 NAG C 1314 NAG 8 n T BMA 3 T 3 BMA C 1315 BMA 8 n T MAN 4 T 4 MAN C 1317 MAN 8 n T MAN 5 T 5 MAN C 1319 MAN 8 n T FUC 6 T 6 FUC C 1321 FUC 9 n U MAN 1 U 1 MAN C 1316 MAN 9 n U MAN 2 U 2 MAN C 1320 MAN 4 n V NAG 1 V 1 NAG C 1325 NAG 4 n V NAG 2 V 2 NAG C 1326 NAG 4 n W NAG 1 W 1 NAG C 1329 NAG 4 n W NAG 2 W 2 NAG C 1330 NAG 4 n X NAG 1 X 1 NAG C 1332 NAG 4 n X NAG 2 X 2 NAG C 1333 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 131 A CYS 131 1_555 A SG CYS 166 A CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 291 A CYS 291 1_555 A SG CYS 301 A CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 336 A CYS 336 1_555 A SG CYS 361 A CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 379 A CYS 379 1_555 A SG CYS 432 A CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 391 A CYS 391 1_555 A SG CYS 525 A CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 538 A CYS 538 1_555 A SG CYS 590 A CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 617 A CYS 617 1_555 A SG CYS 649 A CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 662 A CYS 662 1_555 A SG CYS 671 A CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 738 A CYS 738 1_555 A SG CYS 760 A CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 743 A CYS 743 1_555 A SG CYS 749 A CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 1032 A CYS 1032 1_555 A SG CYS 1043 A CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 1082 A CYS 1082 1_555 A SG CYS 1126 A CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf13 B SG CYS 131 B CYS 131 1_555 B SG CYS 166 B CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf14 B SG CYS 336 B CYS 336 1_555 B SG CYS 361 B CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf15 B SG CYS 379 B CYS 379 1_555 B SG CYS 432 B CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf16 B SG CYS 391 B CYS 391 1_555 B SG CYS 525 B CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf17 B SG CYS 480 B CYS 480 1_555 B SG CYS 488 B CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf18 B SG CYS 538 B CYS 538 1_555 B SG CYS 590 B CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf19 B SG CYS 617 B CYS 617 1_555 B SG CYS 649 B CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf20 B SG CYS 662 B CYS 662 1_555 B SG CYS 671 B CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf21 B SG CYS 738 B CYS 738 1_555 B SG CYS 760 B CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf22 B SG CYS 743 B CYS 743 1_555 B SG CYS 749 B CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf23 B SG CYS 1032 B CYS 1032 1_555 B SG CYS 1043 B CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf24 B SG CYS 1082 B CYS 1082 1_555 B SG CYS 1126 B CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf25 C SG CYS 131 C CYS 131 1_555 C SG CYS 166 C CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf26 C SG CYS 336 C CYS 336 1_555 C SG CYS 361 C CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf27 C SG CYS 379 C CYS 379 1_555 C SG CYS 432 C CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf28 C SG CYS 391 C CYS 391 1_555 C SG CYS 525 C CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf29 C SG CYS 480 C CYS 480 1_555 C SG CYS 488 C CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf30 C SG CYS 538 C CYS 538 1_555 C SG CYS 590 C CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf31 C SG CYS 617 C CYS 617 1_555 C SG CYS 649 C CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf32 C SG CYS 662 C CYS 662 1_555 C SG CYS 671 C CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf33 C SG CYS 738 C CYS 738 1_555 C SG CYS 760 C CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf34 C SG CYS 743 C CYS 743 1_555 C SG CYS 749 C CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf35 C SG CYS 1032 C CYS 1032 1_555 C SG CYS 1043 C CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf36 D SG CYS 22 D CYS 22 1_555 D SG CYS 95 D CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf37 E SG CYS 23 E CYS 23 1_555 E SG CYS 88 E CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf38 F SG CYS 22 H CYS 22 1_555 F SG CYS 95 H CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf39 G SG CYS 23 L CYS 23 1_555 G SG CYS 88 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 61 A ASN 61 1_555 Y C1 NAG . A NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 122 A ASN 122 1_555 Z C1 NAG . A NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 165 A ASN 165 1_555 AA C1 NAG . A NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 234 A ASN 234 1_555 H C1 NAG . F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 282 A ASN 282 1_555 I C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 331 A ASN 331 1_555 J C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 343 A ASN 343 1_555 K C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 616 A ASN 616 1_555 BA C1 NAG . A NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 657 A ASN 657 1_555 CA C1 NAG . A NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 709 A ASN 709 1_555 DA C1 NAG . A NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 717 A ASN 717 1_555 EA C1 NAG . A NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 1074 A ASN 1074 1_555 GA C1 NAG . A NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 1098 A ASN 1098 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale14 B ND2 ASN 61 B ASN 61 1_555 IA C1 NAG . B NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? covale ? covale15 B ND2 ASN 234 B ASN 234 1_555 LA C1 NAG . B NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? covale ? covale16 B ND2 ASN 282 B ASN 282 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale17 B ND2 ASN 343 B ASN 343 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? covale ? covale18 B ND2 ASN 616 B ASN 616 1_555 OA C1 NAG . B NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale19 B ND2 ASN 657 B ASN 657 1_555 PA C1 NAG . B NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale20 B ND2 ASN 717 B ASN 717 1_555 RA C1 NAG . B NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale21 B ND2 ASN 1098 B ASN 1098 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale22 C ND2 ASN 282 C ASN 282 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale23 C ND2 ASN 331 C ASN 331 1_555 XA C1 NAG . C NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale24 C ND2 ASN 343 C ASN 343 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale25 C ND2 ASN 616 C ASN 616 1_555 YA C1 NAG . C NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale26 C ND2 ASN 801 C ASN 801 1_555 BB C1 NAG . C NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale27 C ND2 ASN 1074 C ASN 1074 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale28 H O4 NAG . F NAG 1 1_555 H C1 NAG . F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale29 I O4 NAG . G NAG 1 1_555 I C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale30 I O4 NAG . G NAG 2 1_555 I C1 BMA . G BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale31 J O4 NAG . I NAG 1 1_555 J C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale32 J O4 NAG . I NAG 2 1_555 J C1 BMA . I BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale33 K O4 NAG . J NAG 1 1_555 K C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale34 L O4 NAG . K NAG 1 1_555 L C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? covale ? covale35 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale36 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale37 N O4 NAG . N NAG 2 1_555 N C1 BMA . N BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale38 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? covale ? covale39 O O4 NAG . O NAG 2 1_555 O C1 BMA . O BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? covale ? covale40 O O3 BMA . O BMA 3 1_555 O C1 MAN . O MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale41 O O6 BMA . O BMA 3 1_555 O C3 MAN . O MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? covale ? covale42 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale43 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale44 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale45 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? covale ? covale46 S O6 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 FUC . S FUC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale47 S O4 NAG . S NAG 2 1_555 S C1 BMA . S BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale48 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale49 T O6 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 FUC . T FUC 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.483 ? covale ? covale50 T O4 NAG . T NAG 2 1_555 T C1 BMA . T BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale51 T O6 BMA . T BMA 3 1_555 T C1 MAN . T MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale52 T O3 MAN . T MAN 4 1_555 T C1 MAN . T MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale53 U O6 MAN . U MAN 1 1_555 U C1 MAN . U MAN 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale54 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale55 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale56 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 306 n n C1 O1 NAG sing 307 n n C1 O5 NAG sing 308 n n C1 H1 NAG sing 309 n n C2 C3 NAG sing 310 n n C2 N2 NAG sing 311 n n C2 H2 NAG sing 312 n n C3 C4 NAG sing 313 n n C3 O3 NAG sing 314 n n C3 H3 NAG sing 315 n n C4 C5 NAG sing 316 n n C4 O4 NAG sing 317 n n C4 H4 NAG sing 318 n n C5 C6 NAG sing 319 n n C5 O5 NAG sing 320 n n C5 H5 NAG sing 321 n n C6 O6 NAG sing 322 n n C6 H61 NAG sing 323 n n C6 H62 NAG sing 324 n n C7 C8 NAG sing 325 n n C7 N2 NAG sing 326 n n C7 O7 NAG doub 327 n n C8 H81 NAG sing 328 n n C8 H82 NAG sing 329 n n C8 H83 NAG sing 330 n n N2 HN2 NAG sing 331 n n O1 HO1 NAG sing 332 n n O3 HO3 NAG sing 333 n n O4 HO4 NAG sing 334 n n O6 HO6 NAG sing 335 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 7AKD _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code Y 10 NAG A 1 1301 1301 NAG NAG . Z 10 NAG A 1 1302 1302 NAG NAG . AA 10 NAG A 1 1303 1303 NAG NAG . BA 10 NAG A 1 1304 1322 NAG NAG . CA 10 NAG A 1 1305 1323 NAG NAG . DA 10 NAG A 1 1306 1324 NAG NAG . EA 10 NAG A 1 1307 1325 NAG NAG . FA 10 NAG A 1 1308 1326 NAG NAG . GA 10 NAG A 1 1309 1329 NAG NAG . HA 11 FUC A 1 1310 1331 FUC FUC . IA 10 NAG B 1 1301 1301 NAG NAG . JA 10 NAG B 1 1302 1302 NAG NAG . KA 10 NAG B 1 1303 1303 NAG NAG . LA 10 NAG B 1 1304 1304 NAG NAG . MA 10 NAG B 1 1305 1310 NAG NAG . NA 11 FUC B 1 1306 1319 FUC FUC . OA 10 NAG B 1 1307 1322 NAG NAG . PA 10 NAG B 1 1308 1323 NAG NAG . QA 10 NAG B 1 1309 1324 NAG NAG . RA 10 NAG B 1 1310 1325 NAG NAG . SA 10 NAG B 1 1311 1326 NAG NAG . TA 10 NAG B 1 1312 1327 NAG NAG . UA 10 NAG B 1 1313 1328 NAG NAG . VA 10 NAG C 1 1301 1301 NAG NAG . WA 10 NAG C 1 1302 1302 NAG NAG . XA 10 NAG C 1 1303 1310 NAG NAG . YA 10 NAG C 1 1304 1322 NAG NAG . ZA 10 NAG C 1 1305 1323 NAG NAG . AB 10 NAG C 1 1306 1324 NAG NAG . BB 10 NAG C 1 1307 1327 NAG NAG . CB 11 FUC C 1 1308 1331 FUC FUC . DB 12 MAN D 1 201 1318 MAN MAN . EB 12 MAN H 1 201 1318 MAN MAN . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . YA 10 200.076 254.412 211.205 1 67.62 ? C1 NAG 1304 C 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . YA 10 199.515 255.81 211.464 1 67.62 ? C2 NAG 1304 C 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . YA 10 198.434 256.132 210.441 1 67.62 ? C3 NAG 1304 C 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . YA 10 198.995 255.985 209.034 1 67.62 ? C4 NAG 1304 C 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . YA 10 199.577 254.585 208.851 1 67.62 ? C5 NAG 1304 C 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . YA 10 200.245 254.392 207.509 1 67.62 ? C6 NAG 1304 C 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . YA 10 199.289 256.933 213.639 1 67.62 ? C7 NAG 1304 C 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . YA 10 200.216 257.977 213.092 1 67.62 ? C8 NAG 1304 C 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . YA 10 198.99 255.922 212.816 1 67.62 ? N2 NAG 1304 C 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . YA 10 197.968 257.461 210.643 1 67.62 ? O3 NAG 1304 C 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . YA 10 197.965 256.195 208.074 1 67.62 ? O4 NAG 1304 C 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . YA 10 200.576 254.333 209.853 1 67.62 ? O5 NAG 1304 C 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . YA 10 199.298 254.061 206.503 1 67.62 ? O6 NAG 1304 C 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . YA 10 198.831 257.001 214.776 1 67.62 ? O7 NAG 1304 C 1 # _model_server_stats.io_time_ms 13 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 26 _model_server_stats.query_time_ms 229 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 14 #