data_7AQR
#
_model_server_result.job_id            CYqzD_SSj-rT6aRazWUgog 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-04 22:34:56' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
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_model_server_result.entry_id          7aqr 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"U","auth_seq_id":501}' 
#
_entry.id    7AQR 
#
_exptl.entry_id    7AQR 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              351.64 
_entity.id                          18 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'IRON/SULFUR CLUSTER' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    6 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
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_cell.entry_id            7AQR 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 7AQR 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    heptadecameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      17 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 18 R N N 
? 18 U N N 
? 18 W N N 
? 18 X N N 
? 18 Y N N 
? 18 Z N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 D SG CYS 174 E CYS 174 1_555 E SG CYS 300 F CYS 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf2 E SG CYS 148 F CYS 148 1_555 E SG CYS 300 F CYS 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? 
covale ? covale1 A SG CYS 93 B CYS 93 1_555 R S1 SF4 . B SF4 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.171 ? 
metalc ? metalc1 A SG CYS 93 B CYS 93 1_555 R FE4 SF4 . B SF4 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.248 ? 
metalc ? metalc2 A SG CYS 94 B CYS 94 1_555 R FE2 SF4 . B SF4 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.268 ? 
metalc ? metalc3 A SG CYS 158 B CYS 158 1_555 R FE1 SF4 . B SF4 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? 
metalc ? metalc4 A SG CYS 188 B CYS 188 1_555 R FE3 SF4 . B SF4 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.261 ? 
metalc ? metalc5 D SG CYS 135 E CYS 135 1_555 S FE2 FES . E FES 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.424 ? 
metalc ? metalc6 D SD MET 169 E MET 169 1_555 S FE1 FES . E FES 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.205 ? 
metalc ? metalc7 D SG CYS 171 E CYS 171 1_555 S FE1 FES . E FES 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? 
metalc ? metalc8 D SG CYS 175 E CYS 175 1_555 S FE2 FES . E FES 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? 
metalc ? metalc9 E SG CYS 402 F CYS 402 1_555 U FE3 SF4 . F SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.25 ? 
metalc ? metalc10 E SG CYS 405 F CYS 405 1_555 U FE1 SF4 . F SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.26 ? 
metalc ? metalc11 E SG CYS 408 F CYS 408 1_555 U FE2 SF4 . F SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? 
metalc ? metalc12 E SG CYS 448 F CYS 448 1_555 U FE4 SF4 . F SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.251 ? 
metalc ? metalc13 F SG CYS 106 G CYS 106 1_555 V FE1 FES . G FES 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.287 ? 
metalc ? metalc14 F SG CYS 117 G CYS 117 1_555 V FE1 FES . G FES 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? 
metalc ? metalc15 F SG CYS 120 G CYS 120 1_555 V FE2 FES . G FES 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? 
metalc ? metalc16 F SG CYS 134 G CYS 134 1_555 V FE2 FES . G FES 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.288 ? 
metalc ? metalc17 F NE2 HIS 166 G HIS 166 1_555 W FE2 SF4 . G SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? 
metalc ? metalc18 F SG CYS 170 G CYS 170 1_555 W FE3 SF4 . G SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? 
metalc ? metalc19 F SG CYS 173 G CYS 173 1_555 W FE4 SF4 . G SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.268 ? 
metalc ? metalc20 F SG CYS 179 G CYS 179 1_555 W FE1 SF4 . G SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? 
metalc ? metalc21 F SG CYS 218 G CYS 218 1_555 X FE2 SF4 . G SF4 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.258 ? 
metalc ? metalc22 F SG CYS 221 G CYS 221 1_555 X FE3 SF4 . G SF4 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.258 ? 
metalc ? metalc23 F SG CYS 224 G CYS 224 1_555 X FE1 SF4 . G SF4 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? 
metalc ? metalc24 F SG CYS 268 G CYS 268 1_555 X FE4 SF4 . G SF4 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? 
metalc ? metalc25 G SG CYS 123 I CYS 123 1_555 Z FE2 SF4 . I SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? 
metalc ? metalc26 G SG CYS 126 I CYS 126 1_555 Z FE4 SF4 . I SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.254 ? 
metalc ? metalc27 G SG CYS 129 I CYS 129 1_555 Z FE3 SF4 . I SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? 
metalc ? metalc28 G SG CYS 133 I CYS 133 1_555 Y FE4 SF4 . I SF4 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? 
metalc ? metalc29 G SG CYS 162 I CYS 162 1_555 Y FE2 SF4 . I SF4 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.259 ? 
metalc ? metalc30 G SG CYS 165 I CYS 165 1_555 Y FE3 SF4 . I SF4 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? 
metalc ? metalc31 G SG CYS 168 I CYS 168 1_555 Y FE1 SF4 . I SF4 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.269 ? 
metalc ? metalc32 G SG CYS 172 I CYS 172 1_555 Z FE1 SF4 . I SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? 
metalc ? metalc33 J SG CYS 72 R CYS 72 1_555 BA ZN ZN . R ZN 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? 
metalc ? metalc34 J NE2 HIS 82 R HIS 82 1_555 BA ZN ZN . R ZN 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? 
metalc ? metalc35 J SG CYS 97 R CYS 97 1_555 BA ZN ZN . R ZN 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? 
metalc ? metalc36 J SG CYS 100 R CYS 100 1_555 BA ZN ZN . R ZN 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.32 ? 
#
_chem_comp.formula           'Fe4 S4' 
_chem_comp.formula_weight    351.64 
_chem_comp.id                SF4 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'IRON/SULFUR CLUSTER' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     7AQR 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
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_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
R 18 SF4 B 1 500 500 SF4 SF4 . 
S 19 FES E 1 500 500 FES FES . 
T 20 FMN F 1 500 500 FMN FMN . 
U 18 SF4 F 1 501 501 SF4 SF4 . 
V 19 FES G 1 801 750 FES FES . 
W 18 SF4 G 1 802 751 SF4 SF4 . 
X 18 SF4 G 1 803 752 SF4 SF4 . 
Y 18 SF4 I 1 500 500 SF4 SF4 . 
Z 18 SF4 I 1 501 501 SF4 SF4 . 
AA 21 NDP P 1 500 500 NDP NDP . 
BA 22 ZN R 1 200 200 ZN ZN . 
CA 23 8Q1 W 1 200 200 8Q1 8Q1 . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 FE FE1 SF4 . . . U 18 185.092 161.607 279.278 1 27.81 ? FE1 SF4 501 F 1 
HETATM 2 FE FE2 SF4 . . . U 18 184.241 159.537 277.713 1 27.81 ? FE2 SF4 501 F 1 
HETATM 3 FE FE3 SF4 . . . U 18 182.464 160.86 279.314 1 27.81 ? FE3 SF4 501 F 1 
HETATM 4 FE FE4 SF4 . . . U 18 184.353 159.24 280.43 1 27.81 ? FE4 SF4 501 F 1 
HETATM 5 S S1 SF4 . . . U 18 182.653 158.604 279.053 1 27.81 ? S1 SF4 501 F 1 
HETATM 6 S S2 SF4 . . . U 18 183.774 161.335 281.116 1 27.81 ? S2 SF4 501 F 1 
HETATM 7 S S3 SF4 . . . U 18 186.105 159.582 279.018 1 27.81 ? S3 SF4 501 F 1 
HETATM 8 S S4 SF4 . . . U 18 183.615 161.722 277.547 1 27.81 ? S4 SF4 501 F 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              13 
_model_server_stats.parse_time_ms           25 
_model_server_stats.create_model_time_ms    26 
_model_server_stats.query_time_ms           241 
_model_server_stats.encode_time_ms          2 
_model_server_stats.element_count           8 
#