data_7AQR # _model_server_result.job_id wUSfpSUmknEcIhQtr2mj4g _model_server_result.datetime_utc '2024-11-04 22:34:03' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7aqr # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"X","auth_seq_id":803}' # _entry.id 7AQR # _exptl.entry_id 7AQR _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 351.64 _entity.id 18 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'IRON/SULFUR CLUSTER' _entity.pdbx_number_of_molecules 6 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7AQR _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7AQR _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details heptadecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 17 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 18 R N N ? 18 U N N ? 18 W N N ? 18 X N N ? 18 Y N N ? 18 Z N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 D SG CYS 174 E CYS 174 1_555 E SG CYS 300 F CYS 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf2 E SG CYS 148 F CYS 148 1_555 E SG CYS 300 F CYS 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? covale ? covale1 A SG CYS 93 B CYS 93 1_555 R S1 SF4 . B SF4 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.171 ? metalc ? metalc1 A SG CYS 93 B CYS 93 1_555 R FE4 SF4 . B SF4 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.248 ? metalc ? metalc2 A SG CYS 94 B CYS 94 1_555 R FE2 SF4 . B SF4 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.268 ? metalc ? metalc3 A SG CYS 158 B CYS 158 1_555 R FE1 SF4 . B SF4 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? metalc ? metalc4 A SG CYS 188 B CYS 188 1_555 R FE3 SF4 . B SF4 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.261 ? metalc ? metalc5 D SG CYS 135 E CYS 135 1_555 S FE2 FES . E FES 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.424 ? metalc ? metalc6 D SD MET 169 E MET 169 1_555 S FE1 FES . E FES 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.205 ? metalc ? metalc7 D SG CYS 171 E CYS 171 1_555 S FE1 FES . E FES 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? metalc ? metalc8 D SG CYS 175 E CYS 175 1_555 S FE2 FES . E FES 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? metalc ? metalc9 E SG CYS 402 F CYS 402 1_555 U FE3 SF4 . F SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.25 ? metalc ? metalc10 E SG CYS 405 F CYS 405 1_555 U FE1 SF4 . F SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.26 ? metalc ? metalc11 E SG CYS 408 F CYS 408 1_555 U FE2 SF4 . F SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? metalc ? metalc12 E SG CYS 448 F CYS 448 1_555 U FE4 SF4 . F SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.251 ? metalc ? metalc13 F SG CYS 106 G CYS 106 1_555 V FE1 FES . G FES 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.287 ? metalc ? metalc14 F SG CYS 117 G CYS 117 1_555 V FE1 FES . G FES 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? metalc ? metalc15 F SG CYS 120 G CYS 120 1_555 V FE2 FES . G FES 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? metalc ? metalc16 F SG CYS 134 G CYS 134 1_555 V FE2 FES . G FES 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.288 ? metalc ? metalc17 F NE2 HIS 166 G HIS 166 1_555 W FE2 SF4 . G SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? metalc ? metalc18 F SG CYS 170 G CYS 170 1_555 W FE3 SF4 . G SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? metalc ? metalc19 F SG CYS 173 G CYS 173 1_555 W FE4 SF4 . G SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.268 ? metalc ? metalc20 F SG CYS 179 G CYS 179 1_555 W FE1 SF4 . G SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? metalc ? metalc21 F SG CYS 218 G CYS 218 1_555 X FE2 SF4 . G SF4 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.258 ? metalc ? metalc22 F SG CYS 221 G CYS 221 1_555 X FE3 SF4 . G SF4 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.258 ? metalc ? metalc23 F SG CYS 224 G CYS 224 1_555 X FE1 SF4 . G SF4 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? metalc ? metalc24 F SG CYS 268 G CYS 268 1_555 X FE4 SF4 . G SF4 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? metalc ? metalc25 G SG CYS 123 I CYS 123 1_555 Z FE2 SF4 . I SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? metalc ? metalc26 G SG CYS 126 I CYS 126 1_555 Z FE4 SF4 . I SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.254 ? metalc ? metalc27 G SG CYS 129 I CYS 129 1_555 Z FE3 SF4 . I SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? metalc ? metalc28 G SG CYS 133 I CYS 133 1_555 Y FE4 SF4 . I SF4 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? metalc ? metalc29 G SG CYS 162 I CYS 162 1_555 Y FE2 SF4 . I SF4 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.259 ? metalc ? metalc30 G SG CYS 165 I CYS 165 1_555 Y FE3 SF4 . I SF4 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? metalc ? metalc31 G SG CYS 168 I CYS 168 1_555 Y FE1 SF4 . I SF4 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.269 ? metalc ? metalc32 G SG CYS 172 I CYS 172 1_555 Z FE1 SF4 . I SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? metalc ? metalc33 J SG CYS 72 R CYS 72 1_555 BA ZN ZN . R ZN 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? metalc ? metalc34 J NE2 HIS 82 R HIS 82 1_555 BA ZN ZN . R ZN 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? metalc ? metalc35 J SG CYS 97 R CYS 97 1_555 BA ZN ZN . R ZN 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? metalc ? metalc36 J SG CYS 100 R CYS 100 1_555 BA ZN ZN . R ZN 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.32 ? # _chem_comp.formula 'Fe4 S4' _chem_comp.formula_weight 351.64 _chem_comp.id SF4 _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'IRON/SULFUR CLUSTER' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 7AQR _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code R 18 SF4 B 1 500 500 SF4 SF4 . S 19 FES E 1 500 500 FES FES . T 20 FMN F 1 500 500 FMN FMN . U 18 SF4 F 1 501 501 SF4 SF4 . V 19 FES G 1 801 750 FES FES . W 18 SF4 G 1 802 751 SF4 SF4 . X 18 SF4 G 1 803 752 SF4 SF4 . Y 18 SF4 I 1 500 500 SF4 SF4 . Z 18 SF4 I 1 501 501 SF4 SF4 . AA 21 NDP P 1 500 500 NDP NDP . BA 22 ZN R 1 200 200 ZN ZN . CA 23 8Q1 W 1 200 200 8Q1 8Q1 . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 FE FE1 SF4 . . . X 18 178.228 177.293 275.674 1 26.43 ? FE1 SF4 803 G 1 HETATM 2 FE FE2 SF4 . . . X 18 179.41 175.912 273.633 1 26.43 ? FE2 SF4 803 G 1 HETATM 3 FE FE3 SF4 . . . X 18 180.893 176.692 275.793 1 26.43 ? FE3 SF4 803 G 1 HETATM 4 FE FE4 SF4 . . . X 18 179.995 178.556 274.01 1 26.43 ? FE4 SF4 803 G 1 HETATM 5 S S1 SF4 . . . X 18 181.475 176.874 273.599 1 26.43 ? S1 SF4 803 G 1 HETATM 6 S S2 SF4 . . . X 18 179.92 178.693 276.283 1 26.43 ? S2 SF4 803 G 1 HETATM 7 S S3 SF4 . . . X 18 177.973 177.671 273.44 1 26.43 ? S3 SF4 803 G 1 HETATM 8 S S4 SF4 . . . X 18 179.157 175.215 275.787 1 26.43 ? S4 SF4 803 G 1 # _model_server_stats.io_time_ms 16 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 44 _model_server_stats.query_time_ms 287 _model_server_stats.encode_time_ms 8 _model_server_stats.element_count 8 #