data_7AR7 # _model_server_result.job_id h5fLMTTl8q5Alzcjew4hWw _model_server_result.datetime_utc '2025-03-06 09:37:19' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7ar7 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"CB","auth_seq_id":301}' # _entry.id 7AR7 # _exptl.entry_id 7AR7 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 351.64 _entity.id 47 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'IRON/SULFUR CLUSTER' _entity.pdbx_number_of_molecules 6 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7AR7 _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7AR7 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 46-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 46 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 47 UA N N ? 47 XA N N ? 47 ZA N N ? 47 AB N N ? 47 CB N N ? 47 DB N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 E SG CYS 145 E CYS 174 1_555 F SG CYS 98 F CYS 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf2 N SG CYS 325 N CYS 336 1_555 N SG CYS 409 N CYS 420 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf3 W SG CYS 62 X CYS 71 1_555 W SG CYS 94 X CYS 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf4 CA SG CYS 23 e CYS 24 1_555 CA SG CYS 33 e CYS 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf5 LA SG CYS 23 o CYS 30 1_555 LA SG CYS 54 o CYS 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? covale ? covale1 H CG LEU 17 H LEU 18 1_555 BB C25 UQ9 . H UQ9 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.491 ? covale ? covale2 H CD1 LEU 17 H LEU 18 1_555 BB C25 UQ9 . H UQ9 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.506 ? covale ? covale3 I CE1 PHE 19 I PHE 72 1_555 EB C37 PTY . I PTY 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? covale ? covale4 L CD1 LEU 10 L LEU 10 1_555 FB C23 PC7 . M PC7 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.491 ? covale ? covale5 M CA SER 364 M SER 372 1_555 FB C6 PC7 . M PC7 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.491 ? covale ? covale6 M CG2 THR 386 M THR 394 1_555 FB C48 PC7 . M PC7 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.49 ? covale ? covale7 M CD2 TYR 465 M TYR 473 1_555 GB O10 PTY . M PTY 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? covale ? covale8 N NH2 ARG 452 N ARG 463 1_555 IB O12 PTY . N PTY 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.297 ? covale ? covale9 O SG CYS 134 P CYS 185 1_555 JB C6N NDP . P NDP 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.766 ? covale ? covale10 O NZ LYS 149 P LYS 200 1_555 JB O2D NDP . P NDP 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.297 ? covale ? covale11 O CE MET 171 P MET 222 1_555 JB N7N NDP . P NDP 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale12 O NH2 ARG 177 P ARG 228 1_555 JB O2N NDP . P NDP 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.301 ? covale ? covale13 DA CD1 LEU 70 f LEU 70 1_555 MB C24 PC7 . f PC7 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.491 ? covale ? covale14 KA NE1 TRP 72 n TRP 78 1_555 NB C16 8Q1 . n 8Q1 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale15 TA NH1 ARG 23 z ARG 24 1_555 QB OT2 PSF . z PSF 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.297 ? covale ? covale16 TA NH2 ARG 27 z ARG 28 1_555 QB OT1 PSF . z PSF 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.297 ? metalc ? metalc1 B SG CYS 32 B CYS 93 1_555 UA FE4 SF4 . B SF4 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.239 ? metalc ? metalc2 B SG CYS 33 B CYS 94 1_555 UA FE2 SF4 . B SF4 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.258 ? metalc ? metalc3 B SG CYS 97 B CYS 158 1_555 UA FE1 SF4 . B SF4 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.254 ? metalc ? metalc4 B SG CYS 127 B CYS 188 1_555 UA FE3 SF4 . B SF4 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? metalc ? metalc5 E SG CYS 106 E CYS 135 1_555 VA FE1 FES . E FES 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? metalc ? metalc6 E SG CYS 142 E CYS 171 1_555 VA FE2 FES . E FES 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? metalc ? metalc7 E SG CYS 146 E CYS 175 1_555 VA FE2 FES . E FES 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? metalc ? metalc8 F SG CYS 352 F CYS 402 1_555 XA FE3 SF4 . F SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? metalc ? metalc9 F SG CYS 355 F CYS 405 1_555 XA FE1 SF4 . F SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.259 ? metalc ? metalc10 F SG CYS 358 F CYS 408 1_555 XA FE2 SF4 . F SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? metalc ? metalc11 F SG CYS 398 F CYS 448 1_555 XA FE4 SF4 . F SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.259 ? metalc ? metalc12 G SG CYS 50 G CYS 106 1_555 YA FE1 FES . G FES 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.293 ? metalc ? metalc13 G O ASN 60 G ASN 116 1_555 YA FE1 FES . G FES 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.661 ? metalc ? metalc14 G SG CYS 61 G CYS 117 1_555 YA FE1 FES . G FES 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? metalc ? metalc15 G SG CYS 64 G CYS 120 1_555 YA FE2 FES . G FES 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? metalc ? metalc16 G SG CYS 78 G CYS 134 1_555 YA FE2 FES . G FES 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? metalc ? metalc17 G NE2 HIS 110 G HIS 166 1_555 ZA FE2 SF4 . G SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? metalc ? metalc18 G SG CYS 114 G CYS 170 1_555 ZA FE3 SF4 . G SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? metalc ? metalc19 G SG CYS 117 G CYS 173 1_555 ZA FE4 SF4 . G SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? metalc ? metalc20 G SG CYS 123 G CYS 179 1_555 ZA FE1 SF4 . G SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? metalc ? metalc21 G SG CYS 162 G CYS 218 1_555 AB FE2 SF4 . G SF4 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.267 ? metalc ? metalc22 G SG CYS 165 G CYS 221 1_555 AB FE3 SF4 . G SF4 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.261 ? metalc ? metalc23 G SG CYS 168 G CYS 224 1_555 AB FE1 SF4 . G SF4 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? metalc ? metalc24 G SG CYS 212 G CYS 268 1_555 AB FE4 SF4 . G SF4 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? metalc ? metalc25 I SG CYS 70 I CYS 123 1_555 DB FE2 SF4 . I SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.261 ? metalc ? metalc26 I SG CYS 73 I CYS 126 1_555 DB FE4 SF4 . I SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.255 ? metalc ? metalc27 I SG CYS 76 I CYS 129 1_555 DB FE3 SF4 . I SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.26 ? metalc ? metalc28 I SG CYS 80 I CYS 133 1_555 CB FE4 SF4 . I SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.261 ? metalc ? metalc29 I SG CYS 109 I CYS 162 1_555 CB FE2 SF4 . I SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? metalc ? metalc30 I SG CYS 112 I CYS 165 1_555 CB FE3 SF4 . I SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.261 ? metalc ? metalc31 I SG CYS 115 I CYS 168 1_555 CB FE1 SF4 . I SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? metalc ? metalc32 I SG CYS 119 I CYS 172 1_555 DB FE1 SF4 . I SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.251 ? metalc ? metalc33 Q SG CYS 25 R CYS 72 1_555 KB ZN ZN . R ZN 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? metalc ? metalc34 Q NE2 HIS 35 R HIS 82 1_555 KB ZN ZN . R ZN 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.071 ? metalc ? metalc35 Q SG CYS 50 R CYS 97 1_555 KB ZN ZN . R ZN 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? metalc ? metalc36 Q SG CYS 53 R CYS 100 1_555 KB ZN ZN . R ZN 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.314 ? metalc ? metalc37 SA ND1 HIS 106 y HIS 107 1_555 OB ZN ZN . y ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.176 ? # _chem_comp.formula 'Fe4 S4' _chem_comp.formula_weight 351.64 _chem_comp.id SF4 _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'IRON/SULFUR CLUSTER' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 7AR7 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code UA 47 SF4 B 1 500 500 SF4 SF4 . VA 48 FES E 1 500 500 FES FES . WA 49 FMN F 1 500 500 FMN FMN . XA 47 SF4 F 1 501 501 SF4 SF4 . YA 48 FES G 1 801 750 FES FES . ZA 47 SF4 G 1 802 751 SF4 SF4 . AB 47 SF4 G 1 803 752 SF4 SF4 . BB 50 UQ9 H 1 500 500 UQ9 UQ9 . CB 47 SF4 I 1 301 500 SF4 SF4 . DB 47 SF4 I 1 302 501 SF4 SF4 . EB 51 PTY I 1 303 1 PTY PTY . FB 52 PC7 M 1 501 3 PC7 PC7 . GB 51 PTY M 1 502 6 PTY PTY . HB 53 LMN M 1 503 7 LMN LMN . IB 51 PTY N 1 501 9 PTY PTY . JB 54 NDP P 1 500 500 NDP NDP . KB 55 ZN R 1 200 200 ZN ZN . LB 56 8Q1 W 1 200 200 8Q1 8Q1 . MB 52 PC7 f 1 201 2 PC7 PC7 . NB 56 8Q1 n 1 200 200 8Q1 8Q1 . OB 55 ZN y 1 301 300 ZN ZN . PB 57 PGT y 1 302 4 PGT PGT . QB 58 PSF z 1 301 5 PSF PSF . RB 59 T7X z 1 302 8 T7X T7X . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 FE FE1 SF4 . . . CB 47 197.7 194.57 246.942 1 50.3 ? FE1 SF4 301 I 1 HETATM 2 FE FE2 SF4 . . . CB 47 198.572 197.083 246.32 1 50.3 ? FE2 SF4 301 I 1 HETATM 3 FE FE3 SF4 . . . CB 47 200.224 195.354 247.643 1 50.3 ? FE3 SF4 301 I 1 HETATM 4 FE FE4 SF4 . . . CB 47 198.059 196.423 248.921 1 50.3 ? FE4 SF4 301 I 1 HETATM 5 S S1 SF4 . . . CB 47 199.871 197.551 248.131 1 50.3 ? S1 SF4 301 I 1 HETATM 6 S S2 SF4 . . . CB 47 198.726 194.243 248.947 1 50.3 ? S2 SF4 301 I 1 HETATM 7 S S3 SF4 . . . CB 47 196.554 196.52 247.213 1 50.3 ? S3 SF4 301 I 1 HETATM 8 S S4 SF4 . . . CB 47 199.404 195.116 245.534 1 50.3 ? S4 SF4 301 I 1 # _model_server_stats.io_time_ms 104 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 59 _model_server_stats.query_time_ms 244 _model_server_stats.encode_time_ms 16 _model_server_stats.element_count 8 #