data_7ARB # _model_server_result.job_id vV6bjCi7NF4NLi0LKX2klg _model_server_result.datetime_utc '2025-03-06 09:12:54' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7arb # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"LB","auth_seq_id":200}' # _entry.id 7ARB # _exptl.entry_id 7ARB _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 65.409 _entity.id 56 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ZINC ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7ARB _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7ARB _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 47-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 47 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 56 LB N N ? 56 SB N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 E SG CYS 174 E CYS 174 1_555 F SG CYS 300 F CYS 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf2 F SG CYS 148 F CYS 148 1_555 F SG CYS 300 F CYS 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf3 N SG CYS 336 N CYS 336 1_555 N SG CYS 420 N CYS 420 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf4 DA SG CYS 24 e CYS 24 1_555 DA SG CYS 34 e CYS 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf5 MA SG CYS 30 o CYS 30 1_555 MA SG CYS 61 o CYS 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf6 NA SG CYS 58 p CYS 58 1_555 NA SG CYS 70 p CYS 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? metalc ? metalc1 B SG CYS 93 B CYS 93 1_555 VA FE4 SF4 . B SF4 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.239 ? metalc ? metalc2 B SG CYS 94 B CYS 94 1_555 VA FE2 SF4 . B SF4 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? metalc ? metalc3 B SG CYS 158 B CYS 158 1_555 VA FE1 SF4 . B SF4 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? metalc ? metalc4 B SG CYS 188 B CYS 188 1_555 VA FE3 SF4 . B SF4 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.258 ? metalc ? metalc5 E SD MET 169 E MET 169 1_555 XA FE1 FES . E FES 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.252 ? metalc ? metalc6 E SG CYS 171 E CYS 171 1_555 XA FE1 FES . E FES 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? metalc ? metalc7 F SG CYS 402 F CYS 402 1_555 ZA FE3 SF4 . F SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.252 ? metalc ? metalc8 F SG CYS 405 F CYS 405 1_555 ZA FE1 SF4 . F SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.261 ? metalc ? metalc9 F SG CYS 408 F CYS 408 1_555 ZA FE2 SF4 . F SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? metalc ? metalc10 F SG CYS 448 F CYS 448 1_555 ZA FE4 SF4 . F SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.252 ? metalc ? metalc11 G SG CYS 106 G CYS 106 1_555 AB FE1 FES . G FES 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.289 ? metalc ? metalc12 G SG CYS 117 G CYS 117 1_555 AB FE1 FES . G FES 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.283 ? metalc ? metalc13 G SG CYS 120 G CYS 120 1_555 AB FE2 FES . G FES 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.281 ? metalc ? metalc14 G SG CYS 134 G CYS 134 1_555 AB FE2 FES . G FES 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.292 ? metalc ? metalc15 G NE2 HIS 166 G HIS 166 1_555 BB FE2 SF4 . G SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? metalc ? metalc16 G SG CYS 170 G CYS 170 1_555 BB FE3 SF4 . G SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.26 ? metalc ? metalc17 G SG CYS 173 G CYS 173 1_555 BB FE4 SF4 . G SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? metalc ? metalc18 G SG CYS 179 G CYS 179 1_555 BB FE1 SF4 . G SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? metalc ? metalc19 G SG CYS 218 G CYS 218 1_555 CB FE2 SF4 . G SF4 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? metalc ? metalc20 G SG CYS 221 G CYS 221 1_555 CB FE3 SF4 . G SF4 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? metalc ? metalc21 G SG CYS 224 G CYS 224 1_555 CB FE1 SF4 . G SF4 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.26 ? metalc ? metalc22 G SG CYS 268 G CYS 268 1_555 CB FE4 SF4 . G SF4 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.261 ? metalc ? metalc23 I SG CYS 123 I CYS 123 1_555 FB FE2 SF4 . I SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.261 ? metalc ? metalc24 I SG CYS 126 I CYS 126 1_555 FB FE4 SF4 . I SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.253 ? metalc ? metalc25 I SG CYS 129 I CYS 129 1_555 FB FE3 SF4 . I SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? metalc ? metalc26 I SG CYS 133 I CYS 133 1_555 EB FE4 SF4 . I SF4 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.26 ? metalc ? metalc27 I SG CYS 162 I CYS 162 1_555 EB FE2 SF4 . I SF4 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? metalc ? metalc28 I SG CYS 165 I CYS 165 1_555 EB FE3 SF4 . I SF4 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? metalc ? metalc29 I SG CYS 168 I CYS 168 1_555 EB FE1 SF4 . I SF4 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.267 ? metalc ? metalc30 I SG CYS 172 I CYS 172 1_555 FB FE1 SF4 . I SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.26 ? metalc ? metalc31 O NE2 HIS 83 O HIS 83 1_555 JB FE FE . O FE 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.111 ? metalc ? metalc32 O SG CYS 91 O CYS 91 1_555 JB FE FE . O FE 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.29 ? metalc ? metalc33 O SG CYS 95 O CYS 95 1_555 JB FE FE . O FE 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.357 ? metalc ? metalc34 O SG CYS 135 O CYS 135 1_555 JB FE FE . O FE 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? metalc ? metalc35 R SG CYS 72 R CYS 72 1_555 LB ZN ZN . R ZN 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? metalc ? metalc36 R NE2 HIS 82 R HIS 82 1_555 LB ZN ZN . R ZN 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.063 ? metalc ? metalc37 R SG CYS 97 R CYS 97 1_555 LB ZN ZN . R ZN 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? metalc ? metalc38 R SG CYS 100 R CYS 100 1_555 LB ZN ZN . R ZN 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.314 ? metalc ? metalc39 TA NE2 HIS 107 y HIS 107 1_555 SB ZN ZN . y ZN 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.665 ? metalc ? metalc40 TA NE2 HIS 135 y HIS 135 1_555 SB ZN ZN . y ZN 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.116 ? metalc ? metalc41 SB ZN ZN . y ZN 300 1_555 UA NE2 HIS 130 z HIS 130 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.286 ? # _chem_comp.formula 'Zn 2' _chem_comp.formula_weight 65.409 _chem_comp.id ZN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ZINC ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 7ARB _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code VA 48 SF4 B 1 500 500 SF4 SF4 . WA 49 PTY D 1 401 1 PTY PTY . XA 50 FES E 1 500 500 FES FES . YA 51 FMN F 1 500 500 FMN FMN . ZA 48 SF4 F 1 501 501 SF4 SF4 . AB 50 FES G 1 801 750 FES FES . BB 48 SF4 G 1 802 751 SF4 SF4 . CB 48 SF4 G 1 803 752 SF4 SF4 . DB 52 UQ9 H 1 500 500 UQ9 UQ9 . EB 48 SF4 I 1 500 500 SF4 SF4 . FB 48 SF4 I 1 501 501 SF4 SF4 . GB 49 PTY M 1 501 6 PTY PTY . HB 53 LMN M 1 502 7 LMN LMN . IB 49 PTY N 1 501 9 PTY PTY . JB 54 FE O 1 200 200 FE FE . KB 55 NDP P 1 500 500 NDP NDP . LB 56 ZN R 1 200 200 ZN ZN . MB 57 8Q1 W 1 200 200 8Q1 8Q1 . NB 58 PC7 c 1 101 3 PC7 PC7 . OB 59 PGT f 1 201 4 PGT PGT . PB 60 T7X f 1 202 8 T7X T7X . QB 57 8Q1 n 1 200 200 8Q1 8Q1 . RB 58 PC7 v 1 201 2 PC7 PC7 . SB 56 ZN y 1 300 300 ZN ZN . TB 61 PSF z 1 301 5 PSF PSF . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol ZN _atom_site.label_atom_id ZN _atom_site.label_comp_id ZN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id LB _atom_site.label_entity_id 56 _atom_site.Cartn_x 180.203 _atom_site.Cartn_y 176.862 _atom_site.Cartn_z 249.907 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 50.78 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id ZN _atom_site.auth_comp_id ZN _atom_site.auth_seq_id 200 _atom_site.auth_asym_id R _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 22 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 296 _model_server_stats.query_time_ms 250 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 1 #