data_7AXL
#
_model_server_result.job_id            mjM_MvXW11pEuXwX1p00yA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-12 07:28:01' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          7axl 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"B","auth_seq_id":501}' 
#
_entry.id    7AXL 
#
_exptl.entry_id    7AXL 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              272.382 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            ESTRADIOL 
_entity.pdbx_number_of_molecules    1 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            7AXL 
_cell.length_a            91.177 
_cell.length_b            91.177 
_cell.length_c            85.396 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 7AXL 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        96 
_symmetry.space_group_name_Hall    'P 4nw 2abw' 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 43 21 2' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
'gel filtration' monomeric 1 author_defined_assembly 1 
PISA dimeric 2 software_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,C,D,E 1 1 
A,B,C,D,E 2 1,2 
#
loop_
_pdbx_struct_oper_list.id
_pdbx_struct_oper_list.type
_pdbx_struct_oper_list.name
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]
1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 
2 'crystal symmetry operation' 8_664 -y+1,-x+1,-z-1/2 0 -1 0 -1 0 0 0 0 -1 91.177 91.177 -42.698 
#
_struct_asym.details                        ? 
_struct_asym.entity_id                      2 
_struct_asym.id                             B 
_struct_asym.pdbx_modified                  N 
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag    N 
#
_chem_comp.formula           'C18 H24 O2' 
_chem_comp.formula_weight    272.382 
_chem_comp.id                EST 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              ESTRADIOL 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 C2 EST doub 83 n y 
C1 C10 EST sing 84 n y 
C1 H1 EST sing 85 n n 
C2 C3 EST sing 86 n y 
C2 H2 EST sing 87 n n 
C3 O3 EST sing 88 n n 
C3 C4 EST doub 89 n y 
O3 HO3 EST sing 90 n n 
C4 C5 EST sing 91 n y 
C4 H4 EST sing 92 n n 
C5 C6 EST sing 93 n n 
C5 C10 EST doub 94 n y 
C6 C7 EST sing 95 n n 
C6 H61 EST sing 96 n n 
C6 H62 EST sing 97 n n 
C7 C8 EST sing 98 n n 
C7 H71 EST sing 99 n n 
C7 H72 EST sing 100 n n 
C8 C9 EST sing 101 n n 
C8 C14 EST sing 102 n n 
C8 H8 EST sing 103 n n 
C9 C10 EST sing 104 n n 
C9 C11 EST sing 105 n n 
C9 H9 EST sing 106 n n 
C11 C12 EST sing 107 n n 
C11 H111 EST sing 108 n n 
C11 H112 EST sing 109 n n 
C12 C13 EST sing 110 n n 
C12 H121 EST sing 111 n n 
C12 H122 EST sing 112 n n 
C13 C14 EST sing 113 n n 
C13 C17 EST sing 114 n n 
C13 C18 EST sing 115 n n 
C14 C15 EST sing 116 n n 
C14 H14 EST sing 117 n n 
C15 C16 EST sing 118 n n 
C15 H151 EST sing 119 n n 
C15 H152 EST sing 120 n n 
C16 C17 EST sing 121 n n 
C16 H161 EST sing 122 n n 
C16 H162 EST sing 123 n n 
C17 O17 EST sing 124 n n 
C17 H17 EST sing 125 n n 
O17 HO7 EST sing 126 n n 
C18 H181 EST sing 127 n n 
C18 H182 EST sing 128 n n 
C18 H183 EST sing 129 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     7AXL 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.010968 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.010968 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.01171 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
B 2 EST A 1 501 1 EST EST . 
C 3 S65 A 1 502 1 S65 HEP . 
D 4 MPD A 1 503 1 MPD MPD . 
E 5 HOH A 1 601 72 HOH HOH . 
E 5 HOH A 2 602 139 HOH HOH . 
E 5 HOH A 3 603 73 HOH HOH . 
E 5 HOH A 4 604 20 HOH HOH . 
E 5 HOH A 5 605 116 HOH HOH . 
E 5 HOH A 6 606 88 HOH HOH . 
E 5 HOH A 7 607 5 HOH HOH . 
E 5 HOH A 8 608 91 HOH HOH . 
E 5 HOH A 9 609 27 HOH HOH . 
E 5 HOH A 10 610 110 HOH HOH . 
E 5 HOH A 11 611 57 HOH HOH . 
E 5 HOH A 12 612 30 HOH HOH . 
E 5 HOH A 13 613 11 HOH HOH . 
E 5 HOH A 14 614 75 HOH HOH . 
E 5 HOH A 15 615 36 HOH HOH . 
E 5 HOH A 16 616 22 HOH HOH . 
E 5 HOH A 17 617 8 HOH HOH . 
E 5 HOH A 18 618 33 HOH HOH . 
E 5 HOH A 19 619 34 HOH HOH . 
E 5 HOH A 20 620 144 HOH HOH . 
E 5 HOH A 21 621 3 HOH HOH . 
E 5 HOH A 22 622 31 HOH HOH . 
E 5 HOH A 23 623 67 HOH HOH . 
E 5 HOH A 24 624 12 HOH HOH . 
E 5 HOH A 25 625 94 HOH HOH . 
E 5 HOH A 26 626 4 HOH HOH . 
E 5 HOH A 27 627 68 HOH HOH . 
E 5 HOH A 28 628 19 HOH HOH . 
E 5 HOH A 29 629 96 HOH HOH . 
E 5 HOH A 30 630 109 HOH HOH . 
E 5 HOH A 31 631 78 HOH HOH . 
E 5 HOH A 32 632 108 HOH HOH . 
E 5 HOH A 33 633 82 HOH HOH . 
E 5 HOH A 34 634 47 HOH HOH . 
E 5 HOH A 35 635 42 HOH HOH . 
E 5 HOH A 36 636 102 HOH HOH . 
E 5 HOH A 37 637 105 HOH HOH . 
E 5 HOH A 38 638 77 HOH HOH . 
E 5 HOH A 39 639 152 HOH HOH . 
E 5 HOH A 40 640 56 HOH HOH . 
E 5 HOH A 41 641 150 HOH HOH . 
E 5 HOH A 42 642 79 HOH HOH . 
E 5 HOH A 43 643 99 HOH HOH . 
E 5 HOH A 44 644 86 HOH HOH . 
E 5 HOH A 45 645 90 HOH HOH . 
E 5 HOH A 46 646 23 HOH HOH . 
E 5 HOH A 47 647 58 HOH HOH . 
E 5 HOH A 48 648 18 HOH HOH . 
E 5 HOH A 49 649 16 HOH HOH . 
E 5 HOH A 50 650 117 HOH HOH . 
E 5 HOH A 51 651 24 HOH HOH . 
E 5 HOH A 52 652 21 HOH HOH . 
E 5 HOH A 53 653 148 HOH HOH . 
E 5 HOH A 54 654 118 HOH HOH . 
E 5 HOH A 55 655 89 HOH HOH . 
E 5 HOH A 56 656 54 HOH HOH . 
E 5 HOH A 57 657 93 HOH HOH . 
E 5 HOH A 58 658 15 HOH HOH . 
E 5 HOH A 59 659 141 HOH HOH . 
E 5 HOH A 60 660 130 HOH HOH . 
E 5 HOH A 61 661 129 HOH HOH . 
E 5 HOH A 62 662 40 HOH HOH . 
E 5 HOH A 63 663 25 HOH HOH . 
E 5 HOH A 64 664 143 HOH HOH . 
E 5 HOH A 65 665 133 HOH HOH . 
E 5 HOH A 66 666 115 HOH HOH . 
E 5 HOH A 67 667 124 HOH HOH . 
E 5 HOH A 68 668 112 HOH HOH . 
E 5 HOH A 69 669 123 HOH HOH . 
E 5 HOH A 70 670 146 HOH HOH . 
E 5 HOH A 71 671 85 HOH HOH . 
E 5 HOH A 72 672 134 HOH HOH . 
E 5 HOH A 73 673 113 HOH HOH . 
E 5 HOH A 74 674 147 HOH HOH . 
E 5 HOH A 75 675 153 HOH HOH . 
E 5 HOH A 76 676 125 HOH HOH . 
E 5 HOH A 77 677 138 HOH HOH . 
E 5 HOH A 78 678 71 HOH HOH . 
E 5 HOH A 79 679 149 HOH HOH . 
E 5 HOH A 80 680 60 HOH HOH . 
E 5 HOH A 81 681 142 HOH HOH . 
E 5 HOH A 82 682 158 HOH HOH . 
E 5 HOH A 83 683 132 HOH HOH . 
E 5 HOH A 84 684 62 HOH HOH . 
E 5 HOH A 85 685 127 HOH HOH . 
E 5 HOH A 86 686 119 HOH HOH . 
E 5 HOH A 87 687 120 HOH HOH . 
E 5 HOH A 88 688 61 HOH HOH . 
E 5 HOH A 89 689 145 HOH HOH . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C C1 EST . . . B 2 8.641 79.094 1.911 1 55.05 ? C1 EST 501 A 1 
HETATM 2 C C2 EST . . . B 2 7.276 78.856 1.793 1 51.82 ? C2 EST 501 A 1 
HETATM 3 C C3 EST . . . B 2 6.656 78.813 0.545 1 52.13 ? C3 EST 501 A 1 
HETATM 4 O O3 EST . . . B 2 5.317 78.578 0.467 1 52.33 ? O3 EST 501 A 1 
HETATM 5 C C4 EST . . . B 2 7.383 79.006 -0.627 1 53.41 ? C4 EST 501 A 1 
HETATM 6 C C5 EST . . . B 2 8.749 79.246 -0.563 1 54.24 ? C5 EST 501 A 1 
HETATM 7 C C6 EST . . . B 2 9.531 79.455 -1.841 1 53.6 ? C6 EST 501 A 1 
HETATM 8 C C7 EST . . . B 2 10.905 80.021 -1.51 1 58.5 ? C7 EST 501 A 1 
HETATM 9 C C8 EST . . . B 2 11.55 79.187 -0.417 1 58.35 ? C8 EST 501 A 1 
HETATM 10 C C9 EST . . . B 2 10.864 79.553 0.892 1 55.46 ? C9 EST 501 A 1 
HETATM 11 C C10 EST . . . B 2 9.41 79.289 0.771 1 54.09 ? C10 EST 501 A 1 
HETATM 12 C C11 EST . . . B 2 11.49 78.842 2.097 1 56.54 ? C11 EST 501 A 1 
HETATM 13 C C12 EST . . . B 2 13 79.086 2.174 1 57.57 ? C12 EST 501 A 1 
HETATM 14 C C13 EST . . . B 2 13.647 78.662 0.864 1 59.22 ? C13 EST 501 A 1 
HETATM 15 C C14 EST . . . B 2 13.04 79.463 -0.269 1 60.13 ? C14 EST 501 A 1 
HETATM 16 C C15 EST . . . B 2 13.96 79.204 -1.456 1 59.29 ? C15 EST 501 A 1 
HETATM 17 C C16 EST . . . B 2 15.336 78.99 -0.819 1 61.4 ? C16 EST 501 A 1 
HETATM 18 C C17 EST . . . B 2 15.122 78.976 0.697 1 61.89 ? C17 EST 501 A 1 
HETATM 19 O O17 EST . . . B 2 15.942 77.985 1.321 1 63.59 ? O17 EST 501 A 1 
HETATM 20 C C18 EST . . . B 2 13.441 77.166 0.633 1 58.85 ? C18 EST 501 A 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              50 
_model_server_stats.parse_time_ms           19 
_model_server_stats.create_model_time_ms    9 
_model_server_stats.query_time_ms           321 
_model_server_stats.encode_time_ms          2 
_model_server_stats.element_count           20 
#