data_7B5L # _model_server_result.job_id rkTTIsGNwYfM2WBZyFF5eg _model_server_result.datetime_utc '2024-12-21 12:28:42' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7b5l # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"R","auth_seq_id":606}' # _entry.id 7B5L # _exptl.entry_id 7B5L _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 65.409 _entity.id 13 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ZINC ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 9 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7B5L _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7B5L _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 13 M N N ? 13 N N N ? 13 O N N ? 13 P N N ? 13 Q N N ? 13 R N N ? 13 T N N ? 13 U N N ? 13 V N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 B SG CYS 357 H CYS 357 1_555 S C3 SY8 . U SY8 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.681 ? covale ? covale2 F C GLY 75 U GLY 75 1_555 S N SY8 . U SY8 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.311 ? covale ? covale3 S C SY8 . U SY8 101 1_555 I SG CYS 86 D CYS 86 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.709 ? covale ? covale4 J C TYR 159 L TYR 159 1_555 J N TPO 160 L TPO 160 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale5 J C TPO 160 L TPO 160 1_555 J N HIS 161 L HIS 161 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale6 L C GLN 186 P GLN 186 1_555 L N TPO 187 P TPO 187 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale7 L C TPO 187 P TPO 187 1_555 L N PRO 188 P PRO 188 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.34 ? metalc ? metalc1 B SG CYS 186 H CYS 186 1_555 Q ZN ZN . H ZN 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? metalc ? metalc2 B SG CYS 189 H CYS 189 1_555 Q ZN ZN . H ZN 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? metalc ? metalc3 B SG CYS 203 H CYS 203 1_555 R ZN ZN . H ZN 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? metalc ? metalc4 B ND1 HIS 205 H HIS 205 1_555 R ZN ZN . H ZN 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? metalc ? metalc5 B SG CYS 208 H CYS 208 1_555 Q ZN ZN . H ZN 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? metalc ? metalc6 B SG CYS 211 H CYS 211 1_555 Q ZN ZN . H ZN 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? metalc ? metalc7 B SG CYS 231 H CYS 231 1_555 R ZN ZN . H ZN 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? metalc ? metalc8 B SG CYS 236 H CYS 236 1_555 R ZN ZN . H ZN 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? metalc ? metalc9 B SG CYS 276 H CYS 276 1_555 O ZN ZN . H ZN 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? metalc ? metalc10 B SG CYS 281 H CYS 281 1_555 O ZN ZN . H ZN 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? metalc ? metalc11 B SG CYS 297 H CYS 297 1_555 O ZN ZN . H ZN 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? metalc ? metalc12 B SG CYS 299 H CYS 299 1_555 O ZN ZN . H ZN 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? metalc ? metalc13 B SG CYS 304 H CYS 304 1_555 P ZN ZN . H ZN 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? metalc ? metalc14 B SG CYS 307 H CYS 307 1_555 P ZN ZN . H ZN 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? metalc ? metalc15 B NE2 HIS 312 H HIS 312 1_555 P ZN ZN . H ZN 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? metalc ? metalc16 B SG CYS 317 H CYS 317 1_555 P ZN ZN . H ZN 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? metalc ? metalc17 B SG CYS 344 H CYS 344 1_555 M ZN ZN . H ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? metalc ? metalc18 B SG CYS 347 H CYS 347 1_555 M ZN ZN . H ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? metalc ? metalc19 B SG CYS 362 H CYS 362 1_555 M ZN ZN . H ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? metalc ? metalc20 B SG CYS 367 H CYS 367 1_555 M ZN ZN . H ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.31 ? metalc ? metalc21 B SG CYS 372 H CYS 372 1_555 N ZN ZN . H ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? metalc ? metalc22 B SG CYS 375 H CYS 375 1_555 N ZN ZN . H ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? metalc ? metalc23 B NE2 HIS 382 H HIS 382 1_555 N ZN ZN . H ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? metalc ? metalc24 B SG CYS 389 H CYS 389 1_555 N ZN ZN . H ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? metalc ? metalc25 H SG CYS 42 R CYS 42 1_555 T ZN ZN . R ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? metalc ? metalc26 H SG CYS 45 R CYS 45 1_555 T ZN ZN . R ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? metalc ? metalc27 H SG CYS 53 R CYS 53 1_555 V ZN ZN . R ZN 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.285 ? metalc ? metalc28 H SG CYS 56 R CYS 56 1_555 V ZN ZN . R ZN 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? metalc ? metalc29 H SG CYS 68 R CYS 68 1_555 V ZN ZN . R ZN 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? metalc ? metalc30 H SG CYS 75 R CYS 75 1_555 U ZN ZN . R ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.303 ? metalc ? metalc31 H ND1 HIS 77 R HIS 77 1_555 U ZN ZN . R ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? metalc ? metalc32 H ND1 HIS 80 R HIS 80 1_555 T ZN ZN . R ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.084 ? metalc ? metalc33 H ND1 HIS 82 R HIS 82 1_555 V ZN ZN . R ZN 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? metalc ? metalc34 H SG CYS 83 R CYS 83 1_555 T ZN ZN . R ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? metalc ? metalc35 H SG CYS 94 R CYS 94 1_555 U ZN ZN . R ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? metalc ? metalc36 H OD1 ASP 97 R ASP 97 1_555 U ZN ZN . R ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.681 ? metalc ? metalc37 H OD2 ASP 97 R ASP 97 1_555 U ZN ZN . R ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.993 ? # _chem_comp.formula 'Zn 2' _chem_comp.formula_weight 65.409 _chem_comp.id ZN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ZINC ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 7B5L _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code M 13 ZN H 1 601 601 ZN ZN . N 13 ZN H 1 602 602 ZN ZN . O 13 ZN H 1 603 603 ZN ZN . P 13 ZN H 1 604 604 ZN ZN . Q 13 ZN H 1 605 605 ZN ZN . R 13 ZN H 1 606 606 ZN ZN . S 14 SY8 U 1 101 101 SY8 sdf . T 13 ZN R 1 201 201 ZN ZN . U 13 ZN R 1 202 202 ZN ZN . V 13 ZN R 1 203 203 ZN ZN . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol ZN _atom_site.label_atom_id ZN _atom_site.label_comp_id ZN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id R _atom_site.label_entity_id 13 _atom_site.Cartn_x 177.809 _atom_site.Cartn_y 109.344 _atom_site.Cartn_z 135.972 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 204.36 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id ZN _atom_site.auth_comp_id ZN _atom_site.auth_seq_id 606 _atom_site.auth_asym_id H _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 16 _model_server_stats.parse_time_ms 16 _model_server_stats.create_model_time_ms 102 _model_server_stats.query_time_ms 565 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 1 #