data_7B9A
#
_model_server_result.job_id            vOxz7eauyq3AiOxJidZYjg 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-08 06:06:17' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          7b9a 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"CB","auth_seq_id":701}' 
#
_entry.id    7B9A 
#
_exptl.entry_id    7B9A 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              351.64 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'IRON/SULFUR CLUSTER' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    4 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          101.52 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            7B9A 
_cell.length_a            69.41 
_cell.length_b            230.05 
_cell.length_c            82.74 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 7B9A 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? dimeric 2 author_defined_assembly 1 
? dimeric 2 author_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB 1 1 
C,D,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 E N N 
? 2 DA N N 
? 2 CB N N 
? 2 FC N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 A SG CYS 521 A CYS 521 1_555 BA S H2S . A H2S 724 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.011 ? 
covale ? covale2 C SG CYS 521 C CYS 521 1_555 YB S H2S . C H2S 723 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.011 ? 
covale ? covale3 D SG CYS 521 D CYS 521 1_555 WC S H2S . D H2S 1024 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.01 ? 
metalc ? metalc1 A SG CYS 38 A CYS 38 1_555 CA FE2 FES . B FES 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? 
metalc ? metalc2 A SG CYS 41 A CYS 41 1_555 CA FE2 FES . B FES 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.276 ? 
metalc ? metalc3 A OE2 GLU 556 A GLU 556 1_555 X FE2 T2N . A T2N 720 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.541 ? 
metalc ? metalc4 X FE1 T2N . A T2N 720 1_555 BA S H2S . A H2S 724 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.13 ? 
metalc ? metalc5 B SG CYS 38 B CYS 38 1_555 CA FE1 FES . B FES 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.254 ? 
metalc ? metalc6 B SG CYS 41 B CYS 41 1_555 CA FE1 FES . B FES 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? 
metalc ? metalc7 B OE2 GLU 556 B GLU 556 1_555 AB FE2 T2N . B T2N 1025 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.554 ? 
metalc ? metalc8 C SG CYS 38 C CYS 38 1_555 ZB FE2 FES . D FES 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? 
metalc ? metalc9 C SG CYS 41 C CYS 41 1_555 ZB FE2 FES . D FES 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.288 ? 
metalc ? metalc10 C OE1 GLU 556 C GLU 556 1_555 RB FE2 T2N . C T2N 716 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.633 ? 
metalc ? metalc11 C OE2 GLU 556 C GLU 556 1_555 RB FE2 T2N . C T2N 716 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.668 ? 
metalc ? metalc12 D SG CYS 38 D CYS 38 1_555 ZB FE1 FES . D FES 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.303 ? 
metalc ? metalc13 D SG CYS 41 D CYS 41 1_555 ZB FE1 FES . D FES 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.282 ? 
metalc ? metalc14 VC FE1 T2N . D T2N 1023 1_555 WC S H2S . D H2S 1024 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.28 ? 
#
_chem_comp.formula           'Fe4 S4' 
_chem_comp.formula_weight    351.64 
_chem_comp.id                SF4 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'IRON/SULFUR CLUSTER' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
FE1 S2 SF4 sing 294 n n 
FE1 S3 SF4 sing 295 n n 
FE1 S4 SF4 sing 296 n n 
FE2 S1 SF4 sing 297 n n 
FE2 S3 SF4 sing 298 n n 
FE2 S4 SF4 sing 299 n n 
FE3 S1 SF4 sing 300 n n 
FE3 S2 SF4 sing 301 n n 
FE3 S4 SF4 sing 302 n n 
FE4 S1 SF4 sing 303 n n 
FE4 S2 SF4 sing 304 n n 
FE4 S3 SF4 sing 305 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     7B9A 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.014407 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.002937 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.004347 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.012335 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 2 SF4 A 1 701 1002 SF4 FS4 . 
F 3 XE A 1 702 633 XE XE . 
G 3 XE A 1 703 634 XE XE . 
H 3 XE A 1 704 635 XE XE . 
I 3 XE A 1 705 636 XE XE . 
J 3 XE A 1 706 637 XE XE . 
K 3 XE A 1 707 638 XE XE . 
L 3 XE A 1 708 639 XE XE . 
M 3 XE A 1 709 640 XE XE . 
N 3 XE A 1 710 642 XE XE . 
O 3 XE A 1 711 643 XE XE . 
P 3 XE A 1 712 646 XE XE . 
Q 3 XE A 1 713 647 XE XE . 
R 3 XE A 1 714 648 XE XE . 
S 3 XE A 1 715 650 XE XE . 
T 3 XE A 1 716 651 XE XE . 
U 4 BR A 1 717 653 BR BR . 
V 4 BR A 1 718 654 BR BR . 
W 4 BR A 1 719 655 BR BR . 
X 5 T2N A 1 720 656 T2N HPX . 
Y 3 XE A 1 721 657 XE XE . 
Z 3 XE A 1 722 658 XE XE . 
AA 3 XE A 1 723 651 XE XE . 
BA 6 H2S A 1 724 1 H2S S . 
CA 7 FES B 1 1001 1001 FES FES . 
DA 2 SF4 B 1 1002 1002 SF4 FS4 . 
EA 3 XE B 1 1003 632 XE XE . 
FA 3 XE B 1 1004 633 XE XE . 
GA 3 XE B 1 1005 634 XE XE . 
HA 3 XE B 1 1006 636 XE XE . 
IA 3 XE B 1 1007 638 XE XE . 
JA 3 XE B 1 1008 639 XE XE . 
KA 3 XE B 1 1009 640 XE XE . 
LA 3 XE B 1 1010 641 XE XE . 
MA 3 XE B 1 1011 644 XE XE . 
NA 3 XE B 1 1012 645 XE XE . 
OA 3 XE B 1 1013 646 XE XE . 
PA 3 XE B 1 1014 649 XE XE . 
QA 3 XE B 1 1015 650 XE XE . 
RA 4 BR B 1 1016 653 BR BR . 
SA 4 BR B 1 1017 654 BR BR . 
TA 4 BR B 1 1018 655 BR BR . 
UA 4 BR B 1 1019 656 BR BR . 
VA 4 BR B 1 1020 658 BR BR . 
WA 4 BR B 1 1021 659 BR BR . 
XA 4 BR B 1 1022 660 BR BR . 
YA 4 BR B 1 1023 661 BR BR . 
ZA 4 BR B 1 1024 662 BR BR . 
AB 5 T2N B 1 1025 663 T2N HPX . 
BB 3 XE B 1 1026 664 XE XE . 
CB 2 SF4 C 1 701 1002 SF4 FS4 . 
DB 3 XE C 1 702 632 XE XE . 
EB 3 XE C 1 703 633 XE XE . 
FB 3 XE C 1 704 634 XE XE . 
GB 3 XE C 1 705 635 XE XE . 
HB 3 XE C 1 706 636 XE XE . 
IB 3 XE C 1 707 637 XE XE . 
JB 3 XE C 1 708 638 XE XE . 
KB 3 XE C 1 709 640 XE XE . 
LB 3 XE C 1 710 644 XE XE . 
MB 3 XE C 1 711 647 XE XE . 
NB 3 XE C 1 712 648 XE XE . 
OB 3 XE C 1 713 649 XE XE . 
PB 3 XE C 1 714 650 XE XE . 
QB 3 XE C 1 715 651 XE XE . 
RB 5 T2N C 1 716 657 T2N HPX . 
SB 4 BR C 1 717 652 BR BR . 
TB 4 BR C 1 718 653 BR BR . 
UB 4 BR C 1 719 654 BR BR . 
VB 4 BR C 1 720 655 BR BR . 
WB 4 BR C 1 721 656 BR BR . 
XB 4 BR C 1 722 657 BR BR . 
YB 6 H2S C 1 723 3 H2S S . 
ZB 7 FES D 1 1001 1001 FES FES . 
AC 4 BR D 1 1002 652 BR BR . 
BC 4 BR D 1 1003 653 BR BR . 
CC 4 BR D 1 1004 654 BR BR . 
DC 4 BR D 1 1005 655 BR BR . 
EC 4 BR D 1 1006 656 BR BR . 
FC 2 SF4 D 1 1007 1002 SF4 FS4 . 
GC 3 XE D 1 1008 633 XE XE . 
HC 3 XE D 1 1009 634 XE XE . 
IC 3 XE D 1 1010 635 XE XE . 
JC 3 XE D 1 1011 636 XE XE . 
KC 3 XE D 1 1012 637 XE XE . 
LC 3 XE D 1 1013 638 XE XE . 
MC 3 XE D 1 1014 639 XE XE . 
NC 3 XE D 1 1015 640 XE XE . 
OC 3 XE D 1 1016 641 XE XE . 
PC 3 XE D 1 1017 643 XE XE . 
QC 3 XE D 1 1018 645 XE XE . 
RC 3 XE D 1 1019 646 XE XE . 
SC 3 XE D 1 1020 648 XE XE . 
TC 3 XE D 1 1021 649 XE XE . 
UC 3 XE D 1 1022 650 XE XE . 
VC 5 T2N D 1 1023 658 T2N HPX . 
WC 6 H2S D 1 1024 2 H2S S . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 FE FE1 SF4 . . . CB 2 46.529 105.836 71.798 1 34.4 ? FE1 SF4 701 C 1 
HETATM 2 FE FE2 SF4 . . . CB 2 46.974 103.162 71.689 1 35.92 ? FE2 SF4 701 C 1 
HETATM 3 FE FE3 SF4 . . . CB 2 49.063 104.891 71.498 1 25.92 ? FE3 SF4 701 C 1 
HETATM 4 FE FE4 SF4 . . . CB 2 47.282 104.663 69.467 1 31.58 ? FE4 SF4 701 C 1 
HETATM 5 S S1 SF4 . . . CB 2 48.721 103.023 70.2 1 18.96 ? S1 SF4 701 C 1 
HETATM 6 S S2 SF4 . . . CB 2 48.112 106.63 70.33 1 28.61 ? S2 SF4 701 C 1 
HETATM 7 S S3 SF4 . . . CB 2 45.308 104.306 70.594 1 20.9 ? S3 SF4 701 C 1 
HETATM 8 S S4 SF4 . . . CB 2 47.711 104.594 73.336 1 20.83 ? S4 SF4 701 C 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              16 
_model_server_stats.parse_time_ms           31 
_model_server_stats.create_model_time_ms    48 
_model_server_stats.query_time_ms           357 
_model_server_stats.encode_time_ms          4 
_model_server_stats.element_count           8 
#