data_7BSG # _model_server_result.job_id K7qyAZGpEIaV7B9eiuAMUQ _model_server_result.datetime_utc '2024-11-25 06:02:56' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7bsg # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"K","auth_seq_id":109}' # _entry.id 7BSG # _exptl.entry_id 7BSG _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 107.868 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'SILVER ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 18 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7BSG _cell.length_a 29.882 _cell.length_b 33.677 _cell.length_c 76.75 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7BSG _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 20 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'C 2 2 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 D N N ? 2 E N N ? 2 F N N ? 2 G N N ? 2 H N N ? 2 I N N ? 2 J N N ? 2 K N N ? 2 L N N ? 2 M N N ? 2 N N N ? 2 O N N ? 2 P N N ? 2 Q N N ? 2 R N N ? 2 S N N ? 2 T N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A O2 DC 1 A DC 1 1_555 C AG AG . A AG 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.505 ? metalc ? metalc2 A N3 DC 1 A DC 1 1_555 G AG AG . A AG 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.542 ? metalc ? metalc3 A N1 DA 2 A DA 2 1_555 L AG AG . A AG 110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.53 ? metalc ? metalc4 A N3 DC 3 A DC 3 1_555 C AG AG . A AG 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.209 ? metalc ? metalc5 A O2 DC 3 A DC 3 1_555 M AG AG . A AG 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.542 ? metalc ? metalc6 A N3 DC 4 A DC 4 1_555 D AG AG . A AG 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.217 ? metalc ? metalc7 A O2 DC 4 A DC 4 1_555 M AG AG . A AG 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.364 ? metalc ? metalc8 A O2 DC 4 A DC 4 1_555 N AG AG . A AG 112 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.644 ? metalc ? metalc9 A OP1 DA 6 A DA 6 1_555 F AG AG . A AG 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.622 ? metalc ? metalc10 A N7 DA 6 A DA 6 1_555 J AG AG . A AG 108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.274 ? metalc ? metalc11 A OP2 DA 6 A DA 6 1_555 O AG AG . A AG 113 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.211 ? metalc ? metalc12 A N7 DG 7 A DG 7 1_555 F AG AG . A AG 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.512 ? metalc ? metalc13 A O6 DG 7 A DG 7 1_555 I AG AG . A AG 107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.418 ? metalc ? metalc14 A O6 DG 7 A DG 7 1_555 J AG AG . A AG 108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.314 ? metalc ? metalc15 A N3 DC 8 A DC 8 1_555 E AG AG . A AG 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.393 ? metalc ? metalc16 A O2 DC 8 A DC 8 1_555 I AG AG . A AG 107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.639 ? metalc ? metalc17 A O6 DG 9 A DG 9 1_555 D AG AG . A AG 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.349 ? metalc ? metalc18 A N1 DG 9 A DG 9 1_555 H AG AG . A AG 106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.335 ? metalc ? metalc19 G AG AG . A AG 105 1_555 B O2 DC 3 B DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.548 ? metalc ? metalc20 G AG AG . A AG 105 1_555 B O2 DC 4 B DC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.499 ? metalc ? metalc21 H AG AG . A AG 106 1_555 B O2 DC 4 B DC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.36 ? metalc ? metalc22 J AG AG . A AG 108 1_555 B OP2 DA 6 B DA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.378 ? metalc ? metalc23 L AG AG . A AG 110 1_555 B O2 DC 1 B DC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.489 ? metalc ? metalc24 L AG AG . A AG 110 1_555 B O2 DC 3 B DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.593 ? metalc ? metalc25 L AG AG . A AG 110 1_555 B N3 DC 3 B DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.241 ? metalc ? metalc26 M AG AG . A AG 111 1_555 B N3 DC 1 B DC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.405 ? metalc ? metalc27 N AG AG . A AG 112 1_555 B N1 DG 9 B DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.494 ? metalc ? metalc28 O AG AG . A AG 113 1_555 B O6 DG 7 B DG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.564 ? metalc ? metalc29 B N3 DC 4 B DC 4 1_555 P AG AG . B AG 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? metalc ? metalc30 B OP1 DA 6 B DA 6 1_555 R AG AG . B AG 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.488 ? metalc ? metalc31 B N7 DG 7 B DG 7 1_555 R AG AG . B AG 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.564 ? metalc ? metalc32 B N3 DC 8 B DC 8 1_555 Q AG AG . B AG 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.335 ? metalc ? metalc33 B O2 DC 8 B DC 8 1_555 S AG AG . B AG 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.519 ? metalc ? metalc34 B O6 DG 9 B DG 9 1_555 P AG AG . B AG 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.381 ? hydrog 'DC-DC MISPAIR' hydrog1 A O2 DC 1 A DC 1 1_555 A N4 DC 3 A DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DC MISPAIR' hydrog2 A N4 DC 1 A DC 1 1_555 B O2 DC 3 B DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DC MISPAIR' hydrog3 A N4 DC 1 A DC 1 1_555 B O2 DC 4 B DC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DA-DC MISPAIR' hydrog4 A N6 DA 2 A DA 2 1_555 B O2 DC 3 B DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DC MISPAIR' hydrog5 A O2 DC 3 A DC 3 1_555 B N4 DC 1 B DC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DG PAIR' hydrog6 A N4 DC 4 A DC 4 1_555 A O6 DG 9 A DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DC MISPAIR' hydrog7 A O2 DC 4 A DC 4 1_555 B N4 DC 1 B DC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DG PAIR' hydrog8 A O2 DC 4 A DC 4 1_555 B N1 DG 9 B DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_10_PAIR hydrog9 A N1 DA 6 A DA 6 1_555 B N2 DG 5 B DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_10_PAIR hydrog10 A N6 DA 6 A DA 6 1_555 B N3 DG 5 B DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DG MISPAIR' hydrog11 A N1 DG 7 A DG 7 1_555 B N3 DG 5 B DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DC PAIR' hydrog12 A N2 DG 9 A DG 9 1_555 B O2 DC 4 B DC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DC MISPAIR' hydrog13 B O2 DC 1 B DC 1 1_555 B N4 DC 3 B DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DG PAIR' hydrog14 B N4 DC 4 B DC 4 1_555 B O6 DG 9 B DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Ag 1' _chem_comp.formula_weight 107.868 _chem_comp.id AG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'SILVER ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 7BSG _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.033465 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.029694 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.013029 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 AG A 1 101 101 AG AG . D 2 AG A 1 102 102 AG AG . E 2 AG A 1 103 103 AG AG . F 2 AG A 1 104 104 AG AG . G 2 AG A 1 105 105 AG AG . H 2 AG A 1 106 106 AG AG . I 2 AG A 1 107 107 AG AG . J 2 AG A 1 108 108 AG AG . K 2 AG A 1 109 117 AG AG . L 2 AG A 1 110 109 AG AG . M 2 AG A 1 111 110 AG AG . N 2 AG A 1 112 111 AG AG . O 2 AG A 1 113 112 AG AG . P 2 AG B 1 101 113 AG AG . Q 2 AG B 1 102 114 AG AG . R 2 AG B 1 103 115 AG AG . S 2 AG B 1 104 116 AG AG . T 2 AG B 1 105 118 AG AG . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol AG _atom_site.label_atom_id AG _atom_site.label_comp_id AG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id K _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x -5.868 _atom_site.Cartn_y -6.819 _atom_site.Cartn_z -7.144 _atom_site.occupancy 0.41 _atom_site.B_iso_or_equiv 42.18 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id AG _atom_site.auth_comp_id AG _atom_site.auth_seq_id 109 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 8 _model_server_stats.parse_time_ms 38 _model_server_stats.create_model_time_ms 42 _model_server_stats.query_time_ms 493 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 1 #