data_7C52 # _model_server_result.job_id Hho2oF2BrUobxddKXGSOkA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-24 03:00:31' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7c52 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"ZA","auth_seq_id":307}' # _entry.id 7C52 # _exptl.entry_id 7C52 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 749.007 _entity.id 12 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description '(1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE' _entity.pdbx_number_of_molecules 10 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 112.584 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7C52 _cell.length_a 96.435 _cell.length_b 183.335 _cell.length_c 123.857 _cell.Z_PDB 32 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7C52 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall 'P 2yb' _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 37-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 37 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD,QD,RD,SD,TD,UD,VD,WD,XD,YD,ZD,AE,BE,CE,DE,EE,FE,GE,HE,IE,JE,KE,LE,ME,NE,OE,PE,QE,RE,SE,TE,UE,VE,WE,XE,YE,ZE,AF _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 12 SA N N ? 12 ZA N N ? 12 AB N N ? 12 NB N N ? 12 OB N N ? 12 UB N N ? 12 HC N N ? 12 EE N N ? 12 LE N N ? 12 YE N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A N CYS 1 C CYS 23 1_555 RA C23 LHG . C LHG 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale2 A SG CYS 1 C CYS 23 1_555 SA C03 PGV . C PGV 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.766 ? covale ? covale3 A SG CYS 85 C CYS 107 1_555 LA CAB HEM . C HEM 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.71 ? covale ? covale4 A SG CYS 88 C CYS 110 1_555 LA CAC HEM . C HEM 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.818 ? covale ? covale5 A SG CYS 130 C CYS 152 1_555 MA CAB HEM . C HEM 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.72 ? covale ? covale6 A SG CYS 133 C CYS 155 1_555 MA CAC HEM . C HEM 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.804 ? covale ? covale7 A SG CYS 225 C CYS 247 1_555 NA CAB HEM . C HEM 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.714 ? covale ? covale8 A SG CYS 228 C CYS 250 1_555 NA CAC HEM . C HEM 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.809 ? covale ? covale9 A SG CYS 285 C CYS 307 1_555 OA CAB HEM . C HEM 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.711 ? covale ? covale10 A SG CYS 288 C CYS 310 1_555 OA CAC HEM . C HEM 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.818 ? covale ? covale11 C NZ LYS 42 M LYS 42 1_555 PB OB4 CDL . M CDL 412 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.297 ? metalc ? metalc1 A SD MET 72 C MET 94 1_555 LA FE HEM . C HEM 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.288 ? metalc ? metalc2 A NE2 HIS 89 C HIS 111 1_555 LA FE HEM . C HEM 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.061 ? metalc ? metalc3 A SD MET 108 C MET 130 1_555 MA FE HEM . C HEM 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? metalc ? metalc4 A NE2 HIS 122 C HIS 144 1_555 OA FE HEM . C HEM 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? metalc ? metalc5 A NE2 HIS 134 C HIS 156 1_555 MA FE HEM . C HEM 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? metalc ? metalc6 A OE1 GLN 161 C GLN 183 1_555 PA CA CA . C CA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.551 ? metalc ? metalc7 A OE1 GLU 208 C GLU 230 1_555 PA CA CA . C CA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.729 ? metalc ? metalc8 A SD MET 214 C MET 236 1_555 NA FE HEM . C HEM 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? metalc ? metalc9 A NE2 HIS 229 C HIS 251 1_555 NA FE HEM . C HEM 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? metalc ? metalc10 A NE2 HIS 289 C HIS 311 1_555 OA FE HEM . C HEM 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? metalc ? metalc11 B NE2 HIS 199 L HIS 199 1_555 GB FE FE . M FE 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.144 ? metalc ? metalc12 B NE2 HIS 239 L HIS 239 1_555 GB FE FE . M FE 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.158 ? metalc ? metalc13 C NE2 HIS 219 M HIS 219 1_555 GB FE FE . M FE 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.15 ? metalc ? metalc14 C OE1 GLU 234 M GLU 234 1_555 GB FE FE . M FE 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.205 ? metalc ? metalc15 C OE2 GLU 234 M GLU 234 1_555 GB FE FE . M FE 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.191 ? metalc ? metalc16 C NE2 HIS 266 M HIS 266 1_555 GB FE FE . M FE 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.156 ? metalc ? metalc17 E O TRP 46 A TRP 46 1_555 YB CA CA . A CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.34 ? metalc ? metalc18 E OD1 ASP 49 A ASP 49 1_555 YB CA CA . A CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.381 ? metalc ? metalc19 E O ILE 51 A ILE 51 1_555 YB CA CA . A CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.348 ? metalc ? metalc20 YB CA CA . A CA 102 1_555 JA O TRP 46 0 TRP 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.522 ? metalc ? metalc21 F O TRP 46 B TRP 45 1_555 DC CA CA . D CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.444 ? metalc ? metalc22 G O TRP 46 D TRP 46 1_555 DC CA CA . D CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.413 ? metalc ? metalc23 G OD1 ASP 49 D ASP 49 1_555 DC CA CA . D CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.358 ? metalc ? metalc24 G O ILE 51 D ILE 51 1_555 DC CA CA . D CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.475 ? metalc ? metalc25 H O TRP 46 E TRP 45 1_555 JC CA CA . F CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.547 ? metalc ? metalc26 I O TRP 46 F TRP 46 1_555 JC CA CA . F CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.358 ? metalc ? metalc27 I OD1 ASP 49 F ASP 49 1_555 JC CA CA . F CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? metalc ? metalc28 I OD2 ASP 49 F ASP 49 1_555 JC CA CA . F CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.907 ? metalc ? metalc29 I O ILE 51 F ILE 51 1_555 JC CA CA . F CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.439 ? metalc ? metalc30 J O TRP 46 G TRP 45 1_555 NC CA CA . I CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.511 ? metalc ? metalc31 K O TRP 46 I TRP 46 1_555 NC CA CA . I CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? metalc ? metalc32 K OD1 ASP 49 I ASP 49 1_555 NC CA CA . I CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.45 ? metalc ? metalc33 K O ILE 51 I ILE 51 1_555 NC CA CA . I CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.41 ? metalc ? metalc34 L O TRP 46 J TRP 45 1_555 SC CA CA . K CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.505 ? metalc ? metalc35 M O TRP 46 K TRP 46 1_555 SC CA CA . K CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.359 ? metalc ? metalc36 M OD1 ASP 49 K ASP 49 1_555 SC CA CA . K CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.364 ? metalc ? metalc37 M OD2 ASP 49 K ASP 49 1_555 SC CA CA . K CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.919 ? metalc ? metalc38 M O ILE 51 K ILE 51 1_555 SC CA CA . K CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.519 ? metalc ? metalc39 N O TRP 46 N TRP 45 1_555 XC CA CA . O CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.567 ? metalc ? metalc40 O O TRP 46 O TRP 46 1_555 XC CA CA . O CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.389 ? metalc ? metalc41 O OD1 ASP 49 O ASP 49 1_555 XC CA CA . O CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.361 ? metalc ? metalc42 O OD2 ASP 49 O ASP 49 1_555 XC CA CA . O CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.964 ? metalc ? metalc43 O O ILE 51 O ILE 51 1_555 XC CA CA . O CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.507 ? metalc ? metalc44 P O TRP 46 P TRP 45 1_555 DD CA CA . Q CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.403 ? metalc ? metalc45 Q O TRP 46 Q TRP 46 1_555 DD CA CA . Q CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.24 ? metalc ? metalc46 Q OD1 ASP 49 Q ASP 49 1_555 DD CA CA . Q CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.357 ? metalc ? metalc47 Q OD2 ASP 49 Q ASP 49 1_555 DD CA CA . Q CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.893 ? metalc ? metalc48 Q O ILE 51 Q ILE 51 1_555 DD CA CA . Q CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.391 ? metalc ? metalc49 R O TRP 46 R TRP 45 1_555 GD CA CA . S CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.459 ? metalc ? metalc50 S O TRP 46 S TRP 46 1_555 GD CA CA . S CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.467 ? metalc ? metalc51 S OD1 ASP 49 S ASP 49 1_555 GD CA CA . S CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.391 ? metalc ? metalc52 S OD2 ASP 49 S ASP 49 1_555 GD CA CA . S CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.87 ? metalc ? metalc53 S O ILE 51 S ILE 51 1_555 GD CA CA . S CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.539 ? metalc ? metalc54 T O TRP 46 T TRP 45 1_555 LD CA CA . U CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.513 ? metalc ? metalc55 U O TRP 46 U TRP 46 1_555 LD CA CA . U CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.387 ? metalc ? metalc56 U OD1 ASP 49 U ASP 49 1_555 LD CA CA . U CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? metalc ? metalc57 U O ILE 51 U ILE 51 1_555 LD CA CA . U CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.405 ? metalc ? metalc58 V O TRP 46 V TRP 45 1_555 RD CA CA . W CA 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.365 ? metalc ? metalc59 W O TRP 46 W TRP 46 1_555 RD CA CA . W CA 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.26 ? metalc ? metalc60 W OD1 ASP 49 W ASP 49 1_555 RD CA CA . W CA 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.403 ? metalc ? metalc61 W OD2 ASP 49 W ASP 49 1_555 RD CA CA . W CA 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.093 ? metalc ? metalc62 W O ILE 51 W ILE 51 1_555 RD CA CA . W CA 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.384 ? metalc ? metalc63 X O TRP 46 X TRP 45 1_555 WD CA CA . Y CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.394 ? metalc ? metalc64 Y O TRP 46 Y TRP 46 1_555 WD CA CA . Y CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.384 ? metalc ? metalc65 Y OD1 ASP 49 Y ASP 49 1_555 WD CA CA . Y CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.488 ? metalc ? metalc66 Y OD2 ASP 49 Y ASP 49 1_555 WD CA CA . Y CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.028 ? metalc ? metalc67 Y O ILE 51 Y ILE 51 1_555 WD CA CA . Y CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.451 ? metalc ? metalc68 Z O TRP 46 Z TRP 45 1_555 BE CA CA . 1 CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.447 ? metalc ? metalc69 AA O TRP 46 1 TRP 46 1_555 BE CA CA . 1 CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.403 ? metalc ? metalc70 AA OD1 ASP 49 1 ASP 49 1_555 BE CA CA . 1 CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.482 ? metalc ? metalc71 AA O ILE 51 1 ILE 51 1_555 BE CA CA . 1 CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.427 ? metalc ? metalc72 BA O TRP 46 2 TRP 45 1_555 IE CA CA . 3 CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? metalc ? metalc73 CA O TRP 46 3 TRP 46 1_555 IE CA CA . 3 CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.383 ? metalc ? metalc74 CA OD1 ASP 49 3 ASP 49 1_555 IE CA CA . 3 CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.289 ? metalc ? metalc75 CA OD2 ASP 49 3 ASP 49 1_555 IE CA CA . 3 CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.894 ? metalc ? metalc76 CA O ILE 51 3 ILE 51 1_555 IE CA CA . 3 CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.345 ? metalc ? metalc77 DA O TRP 46 4 TRP 45 1_555 PE CA CA . 5 CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.373 ? metalc ? metalc78 EA O TRP 46 5 TRP 46 1_555 PE CA CA . 5 CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.352 ? metalc ? metalc79 EA OD1 ASP 49 5 ASP 49 1_555 PE CA CA . 5 CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? metalc ? metalc80 EA O ILE 51 5 ILE 51 1_555 PE CA CA . 5 CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.449 ? metalc ? metalc81 FA O TRP 46 6 TRP 45 1_555 SE CA CA . 7 CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.509 ? metalc ? metalc82 GA O TRP 46 7 TRP 46 1_555 SE CA CA . 7 CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? metalc ? metalc83 GA OD1 ASP 49 7 ASP 49 1_555 SE CA CA . 7 CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.564 ? metalc ? metalc84 GA OD2 ASP 49 7 ASP 49 1_555 SE CA CA . 7 CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.91 ? metalc ? metalc85 GA O ILE 51 7 ILE 51 1_555 SE CA CA . 7 CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.572 ? metalc ? metalc86 HA O TRP 46 8 TRP 45 1_555 WE CA CA . 9 CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.45 ? metalc ? metalc87 IA O TRP 46 9 TRP 46 1_555 WE CA CA . 9 CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.45 ? metalc ? metalc88 IA OD1 ASP 49 9 ASP 49 1_555 WE CA CA . 9 CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? metalc ? metalc89 IA O ILE 51 9 ILE 51 1_555 WE CA CA . 9 CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? metalc ? metalc90 KA SG CYS 75 b CYS 75 1_555 AF FE4 SF4 . b SF4 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.687 ? # _chem_comp.formula 'C40 H77 O10 P' _chem_comp.formula_weight 749.007 _chem_comp.id PGV _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name '(1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms PHOSPHATIDYLGLYCEROL;2-VACCENOYL-1-PALMITOYL-SN-GLYCEROL-3-PHOSPHOGLYCEROL # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag P O11 PGV sing 1433 n n P O12 PGV sing 1434 n n P O13 PGV doub 1435 n n P O14 PGV sing 1436 n n C01 C02 PGV sing 1437 n n C01 O03 PGV sing 1438 n n C01 H011 PGV sing 1439 n n C01 H012 PGV sing 1440 n n C02 C03 PGV sing 1441 n n C02 O01 PGV sing 1442 n n C02 H02 PGV sing 1443 n n C03 O11 PGV sing 1444 n n C03 H031 PGV sing 1445 n n C03 H032 PGV sing 1446 n n C04 C05 PGV sing 1447 n n C04 O12 PGV sing 1448 n n C04 H041 PGV sing 1449 n n C04 H042 PGV sing 1450 n n C05 C06 PGV sing 1451 n n C05 O05 PGV sing 1452 n n C05 H05 PGV sing 1453 n n C06 O06 PGV sing 1454 n n C06 H061 PGV sing 1455 n n C06 H062 PGV sing 1456 n n O01 C1 PGV sing 1457 n n O02 C1 PGV doub 1458 n n O03 C19 PGV sing 1459 n n O04 C19 PGV doub 1460 n n O05 H1 PGV sing 1461 n n O06 H06 PGV sing 1462 n n O14 H14 PGV sing 1463 n n C1 C2 PGV sing 1464 n n C2 C3 PGV sing 1465 n n C2 H21 PGV sing 1466 n n C2 H22 PGV sing 1467 n n C3 C4 PGV sing 1468 n n C3 H31 PGV sing 1469 n n C3 H32 PGV sing 1470 n n C4 C5 PGV sing 1471 n n C4 H41 PGV sing 1472 n n C4 H42 PGV sing 1473 n n C5 C6 PGV sing 1474 n n C5 H51 PGV sing 1475 n n C5 H52 PGV sing 1476 n n C6 C7 PGV sing 1477 n n C6 H61 PGV sing 1478 n n C6 H62 PGV sing 1479 n n C7 C8 PGV sing 1480 n n C7 H71 PGV sing 1481 n n C7 H72 PGV sing 1482 n n C8 C9 PGV sing 1483 n n C8 H81 PGV sing 1484 n n C8 H82 PGV sing 1485 n n C9 C10 PGV sing 1486 n n C9 H91 PGV sing 1487 n n C9 H92 PGV sing 1488 n n C10 C11 PGV sing 1489 n n C10 H101 PGV sing 1490 n n C10 H102 PGV sing 1491 n n C11 C12 PGV doub 1492 z n C11 H11 PGV sing 1493 n n C12 C13 PGV sing 1494 n n C12 H12 PGV sing 1495 n n C13 C14 PGV sing 1496 n n C13 H131 PGV sing 1497 n n C13 H132 PGV sing 1498 n n C14 C15 PGV sing 1499 n n C14 H141 PGV sing 1500 n n C14 H142 PGV sing 1501 n n C15 C16 PGV sing 1502 n n C15 H151 PGV sing 1503 n n C15 H152 PGV sing 1504 n n C16 C17 PGV sing 1505 n n C16 H161 PGV sing 1506 n n C16 H162 PGV sing 1507 n n C17 C18 PGV sing 1508 n n C17 H171 PGV sing 1509 n n C17 H172 PGV sing 1510 n n C18 H181 PGV sing 1511 n n C18 H182 PGV sing 1512 n n C18 H183 PGV sing 1513 n n C19 C20 PGV sing 1514 n n C20 C21 PGV sing 1515 n n C20 H201 PGV sing 1516 n n C20 H202 PGV sing 1517 n n C21 C22 PGV sing 1518 n n C21 H211 PGV sing 1519 n n C21 H212 PGV sing 1520 n n C22 C23 PGV sing 1521 n n C22 H221 PGV sing 1522 n n C22 H222 PGV sing 1523 n n C23 C24 PGV sing 1524 n n C23 H231 PGV sing 1525 n n C23 H232 PGV sing 1526 n n C24 C25 PGV sing 1527 n n C24 H241 PGV sing 1528 n n C24 H242 PGV sing 1529 n n C25 C26 PGV sing 1530 n n C25 H251 PGV sing 1531 n n C25 H252 PGV sing 1532 n n C26 C27 PGV sing 1533 n n C26 H261 PGV sing 1534 n n C26 H262 PGV sing 1535 n n C27 C28 PGV sing 1536 n n C27 H271 PGV sing 1537 n n C27 H272 PGV sing 1538 n n C28 C29 PGV sing 1539 n n C28 H281 PGV sing 1540 n n C28 H282 PGV sing 1541 n n C29 C30 PGV sing 1542 n n C29 H291 PGV sing 1543 n n C29 H292 PGV sing 1544 n n C30 C31 PGV sing 1545 n n C30 H301 PGV sing 1546 n n C30 H302 PGV sing 1547 n n C31 C32 PGV sing 1548 n n C31 H311 PGV sing 1549 n n C31 H312 PGV sing 1550 n n C32 C33 PGV sing 1551 n n C32 H321 PGV sing 1552 n n C32 H322 PGV sing 1553 n n C33 C34 PGV sing 1554 n n C33 H331 PGV sing 1555 n n C33 H332 PGV sing 1556 n n C34 H341 PGV sing 1557 n n C34 H342 PGV sing 1558 n n C34 H343 PGV sing 1559 n n # _atom_sites.entry_id 7C52 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.01037 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.004313 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.005454 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.008744 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code LA 8 HEM C 1 501 501 HEM HEM . MA 8 HEM C 1 502 502 HEM HEM . NA 8 HEM C 1 503 503 HEM HEM . OA 8 HEM C 1 504 504 HEM HEM . PA 9 CA C 1 505 505 CA CA . QA 10 GOL C 1 506 1 GOL GOL . RA 11 LHG C 1 507 21 LHG LHG . SA 12 PGV C 1 508 35 PGV PGV . TA 13 BCL L 1 301 301 BCL BCL . UA 13 BCL L 1 302 302 BCL BCL . VA 14 BPH L 1 303 303 BPH BPH . WA 15 UQ8 L 1 304 304 UQ8 UQ8 . XA 13 BCL L 1 305 401 BCL BCL . YA 16 SO4 L 1 306 18 SO4 SO4 . ZA 12 PGV L 1 307 31 PGV PGV . AB 12 PGV L 1 308 38 PGV PGV . BB 15 UQ8 L 1 309 101 UQ8 UQ8 . CB 15 UQ8 L 1 310 103 UQ8 UQ8 . DB 15 UQ8 L 1 311 104 UQ8 UQ8 . EB 13 BCL M 1 401 402 BCL BCL . FB 14 BPH M 1 402 403 BPH BPH . GB 17 FE M 1 403 404 FE FE . HB 18 MQ8 M 1 404 405 MQ8 MQ8 . IB 19 CRT M 1 405 406 CRT CRT . JB 20 CDL M 1 406 501 CDL CDL . KB 21 PEF M 1 407 4 PEF PEF . LB 21 PEF M 1 408 10 PEF PEF . MB 21 PEF M 1 409 12 PEF PEF . NB 12 PGV M 1 410 37 PGV PGV . OB 12 PGV M 1 411 41 PGV PGV . PB 20 CDL M 1 412 69 CDL CDL . QB 15 UQ8 M 1 413 102 UQ8 UQ8 . RB 22 LMT M 1 414 302 LMT LMT . SB 10 GOL H 1 301 2 GOL GOL . TB 21 PEF H 1 302 3 PEF PEF . UB 12 PGV H 1 303 32 PGV PGV . VB 22 LMT H 1 304 51 LMT LMT . WB 20 CDL H 1 305 303 CDL CDL . XB 13 BCL A 1 101 101 BCL BCL . YB 9 CA A 1 102 103 CA CA . ZB 13 BCL A 1 103 101 BCL BCL . AC 19 CRT A 1 104 102 CRT CRT . BC 19 CRT B 1 101 102 CRT CRT . CC 13 BCL D 1 101 101 BCL BCL . DC 9 CA D 1 102 103 CA CA . EC 13 BCL D 1 103 101 BCL BCL . FC 20 CDL D 1 104 25 CDL CDL . GC 20 CDL D 1 105 30 CDL CDL . HC 12 PGV D 1 106 36 PGV PGV . IC 13 BCL F 1 101 101 BCL BCL . JC 9 CA F 1 102 103 CA CA . KC 13 BCL F 1 103 101 BCL BCL . LC 19 CRT G 1 101 102 CRT CRT . MC 13 BCL I 1 101 101 BCL BCL . NC 9 CA I 1 102 103 CA CA . OC 21 PEF I 1 103 8 PEF PEF . PC 19 CRT J 1 101 102 CRT CRT . QC 13 BCL J 1 102 101 BCL BCL . RC 13 BCL K 1 101 101 BCL BCL . SC 9 CA K 1 102 103 CA CA . TC 13 BCL K 1 103 101 BCL BCL . UC 21 PEF K 1 104 304 PEF PEF . VC 19 CRT N 1 101 102 CRT CRT . WC 13 BCL O 1 101 101 BCL BCL . XC 9 CA O 1 102 103 CA CA . YC 19 CRT O 1 103 102 CRT CRT . ZC 20 CDL O 1 104 27 CDL CDL . AD 19 CRT P 1 101 102 CRT CRT . BD 13 BCL P 1 102 101 BCL BCL . CD 13 BCL Q 1 101 101 BCL BCL . DD 9 CA Q 1 102 103 CA CA . ED 13 BCL Q 1 103 101 BCL BCL . FD 13 BCL S 1 101 101 BCL BCL . GD 9 CA S 1 102 103 CA CA . HD 13 BCL S 1 103 101 BCL BCL . ID 20 CDL S 1 104 28 CDL CDL . JD 19 CRT T 1 101 102 CRT CRT . KD 13 BCL U 1 101 101 BCL BCL . LD 9 CA U 1 102 103 CA CA . MD 13 BCL U 1 103 101 BCL BCL . ND 20 CDL U 1 104 29 CDL CDL . OD 19 CRT V 1 101 102 CRT CRT . PD 13 BCL W 1 101 101 BCL BCL . QD 19 CRT W 1 102 102 CRT CRT . RD 9 CA W 1 103 103 CA CA . SD 13 BCL W 1 104 101 BCL BCL . TD 21 PEF W 1 105 5 PEF PEF . UD 21 PEF W 1 106 14 PEF PEF . VD 13 BCL Y 1 101 101 BCL BCL . WD 9 CA Y 1 102 103 CA CA . XD 13 BCL Y 1 103 101 BCL BCL . YD 20 CDL Y 1 104 24 CDL CDL . ZD 19 CRT Z 1 101 102 CRT CRT . AE 13 BCL 1 1 101 101 BCL BCL . BE 9 CA 1 1 102 103 CA CA . CE 21 PEF 1 1 103 6 PEF PEF . DE 20 CDL 1 1 104 26 CDL CDL . EE 12 PGV 1 1 105 34 PGV PGV . FE 19 CRT 2 1 101 102 CRT CRT . GE 13 BCL 2 1 102 101 BCL BCL . HE 13 BCL 3 1 101 101 BCL BCL . IE 9 CA 3 1 102 103 CA CA . JE 19 CRT 3 1 103 102 CRT CRT . KE 21 PEF 3 1 104 13 PEF PEF . LE 12 PGV 3 1 105 39 PGV PGV . ME 19 CRT 4 1 101 102 CRT CRT . NE 13 BCL 4 1 102 101 BCL BCL . OE 13 BCL 5 1 101 101 BCL BCL . PE 9 CA 5 1 102 103 CA CA . QE 13 BCL 5 1 103 101 BCL BCL . RE 13 BCL 7 1 101 101 BCL BCL . SE 9 CA 7 1 102 103 CA CA . TE 13 BCL 7 1 103 101 BCL BCL . UE 19 CRT 8 1 101 102 CRT CRT . VE 13 BCL 9 1 101 101 BCL BCL . WE 9 CA 9 1 102 103 CA CA . XE 13 BCL 9 1 103 101 BCL BCL . YE 12 PGV 9 1 104 40 PGV PGV . ZE 19 CRT 0 1 101 102 CRT CRT . AF 23 SF4 b 1 101 84 SF4 SF4 . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 P P PGV . . . ZA 12 10.53 38.224 116.356 1 175.27 ? P PGV 307 L 1 HETATM 2 C C01 PGV . . . ZA 12 7.398 40.731 115.014 1 159.96 ? C01 PGV 307 L 1 HETATM 3 C C02 PGV . . . ZA 12 6.881 39.429 115.603 1 160.44 ? C02 PGV 307 L 1 HETATM 4 C C03 PGV . . . ZA 12 8.001 38.395 115.582 1 166.41 ? C03 PGV 307 L 1 HETATM 5 C C04 PGV . . . ZA 12 12.787 38.788 117.575 1 173.78 ? C04 PGV 307 L 1 HETATM 6 C C05 PGV . . . ZA 12 12.959 38.165 118.954 1 169.53 ? C05 PGV 307 L 1 HETATM 7 C C06 PGV . . . ZA 12 14.421 37.848 119.245 1 168.72 ? C06 PGV 307 L 1 HETATM 8 O O01 PGV . . . ZA 12 5.72 39.02 114.877 1 157.25 ? O01 PGV 307 L 1 HETATM 9 O O02 PGV . . . ZA 12 4.908 37.829 116.672 1 154.68 ? O02 PGV 307 L 1 HETATM 10 O O03 PGV . . . ZA 12 6.421 41.713 115.326 1 156.97 ? O03 PGV 307 L 1 HETATM 11 O O04 PGV . . . ZA 12 7.844 42.799 116.775 1 156.03 ? O04 PGV 307 L 1 HETATM 12 O O05 PGV . . . ZA 12 12.2 36.951 119.025 1 166.83 ? O05 PGV 307 L 1 HETATM 13 O O06 PGV . . . ZA 12 14.491 37.058 120.439 1 164.52 ? O06 PGV 307 L 1 HETATM 14 O O11 PGV . . . ZA 12 9.078 38.922 116.36 1 171.34 ? O11 PGV 307 L 1 HETATM 15 O O12 PGV . . . ZA 12 11.404 39.092 117.394 1 174.33 ? O12 PGV 307 L 1 HETATM 16 O O13 PGV . . . ZA 12 11.127 38.397 114.98 1 178.46 ? O13 PGV 307 L 1 HETATM 17 O O14 PGV . . . ZA 12 10.384 36.841 116.943 1 173.76 ? O14 PGV 307 L 1 HETATM 18 C C1 PGV . . . ZA 12 4.653 38.626 115.785 1 154.05 ? C1 PGV 307 L 1 HETATM 19 C C2 PGV . . . ZA 12 3.253 39.183 115.642 1 150.6 ? C2 PGV 307 L 1 HETATM 20 C C3 PGV . . . ZA 12 3.041 40.275 116.684 1 149.26 ? C3 PGV 307 L 1 HETATM 21 C C4 PGV . . . ZA 12 1.609 40.8 116.693 1 148.19 ? C4 PGV 307 L 1 HETATM 22 C C5 PGV . . . ZA 12 1.531 42.078 117.523 1 148.05 ? C5 PGV 307 L 1 HETATM 23 C C6 PGV . . . ZA 12 0.16 42.74 117.449 1 147.01 ? C6 PGV 307 L 1 HETATM 24 C C7 PGV . . . ZA 12 0.203 44.132 118.074 1 149.04 ? C7 PGV 307 L 1 HETATM 25 C C8 PGV . . . ZA 12 0.66 45.188 117.072 1 152.73 ? C8 PGV 307 L 1 HETATM 26 C C9 PGV . . . ZA 12 1.131 46.449 117.789 1 153.53 ? C9 PGV 307 L 1 HETATM 27 C C10 PGV . . . ZA 12 0.731 47.709 117.029 1 154.68 ? C10 PGV 307 L 1 HETATM 28 C C19 PGV . . . ZA 12 6.688 42.584 116.452 1 153.78 ? C19 PGV 307 L 1 HETATM 29 C C20 PGV . . . ZA 12 5.554 43.185 117.238 1 147.71 ? C20 PGV 307 L 1 HETATM 30 C C21 PGV . . . ZA 12 6.18 44.053 118.317 1 145.65 ? C21 PGV 307 L 1 HETATM 31 C C22 PGV . . . ZA 12 5.344 44.021 119.584 1 140.15 ? C22 PGV 307 L 1 HETATM 32 C C23 PGV . . . ZA 12 3.978 44.641 119.333 1 136.68 ? C23 PGV 307 L 1 HETATM 33 C C24 PGV . . . ZA 12 3.206 44.729 120.639 1 132.56 ? C24 PGV 307 L 1 HETATM 34 C C25 PGV . . . ZA 12 3.172 43.363 121.309 1 128.43 ? C25 PGV 307 L 1 HETATM 35 C C26 PGV . . . ZA 12 3.698 43.452 122.735 1 126.82 ? C26 PGV 307 L 1 HETATM 36 C C27 PGV . . . ZA 12 2.677 42.882 123.707 1 122.49 ? C27 PGV 307 L 1 HETATM 37 C C28 PGV . . . ZA 12 1.294 43.449 123.417 1 117.73 ? C28 PGV 307 L 1 HETATM 38 C C29 PGV . . . ZA 12 0.289 42.318 123.279 1 113.61 ? C29 PGV 307 L 1 HETATM 39 C C30 PGV . . . ZA 12 0.406 41.368 124.462 1 109.87 ? C30 PGV 307 L 1 HETATM 40 C C31 PGV . . . ZA 12 -0.935 40.696 124.713 1 105.86 ? C31 PGV 307 L 1 HETATM 41 C C32 PGV . . . ZA 12 -1.349 40.866 126.167 1 101.85 ? C32 PGV 307 L 1 HETATM 42 C C33 PGV . . . ZA 12 -0.657 39.828 127.037 1 99.15 ? C33 PGV 307 L 1 HETATM 43 C C34 PGV . . . ZA 12 -0.918 40.104 128.498 1 98.52 ? C34 PGV 307 L 1 # _model_server_stats.io_time_ms 80 _model_server_stats.parse_time_ms 20 _model_server_stats.create_model_time_ms 27 _model_server_stats.query_time_ms 273 _model_server_stats.encode_time_ms 26 _model_server_stats.element_count 43 #