data_7CGD
#
_model_server_result.job_id            APaEWp4iDdp6vNiS0Ssgdg 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-10 04:20:20' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          7cgd 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"CA","auth_seq_id":404}' 
#
_entry.id    7CGD 
#
_exptl.entry_id    7CGD 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
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_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'SILVER ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    27 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
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_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            7CGD 
_cell.length_a            57.641 
_cell.length_b            124.681 
_cell.length_c            85.148 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 7CGD 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 2 
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 3 
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 4 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,E,F,G,H,I,J,K,FA 1 1 
B,L,M,N,O,P,Q,R,S,GA 2 1 
C,T,U,V,W,X,Y,HA 3 1 
D,Z,AA,BA,CA,DA,EA,IA 4 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 E N N 
? 2 F N N 
? 2 G N N 
? 2 H N N 
? 2 I N N 
? 2 J N N 
? 2 K N N 
? 2 L N N 
? 2 M N N 
? 2 N N N 
? 2 O N N 
? 2 P N N 
? 2 Q N N 
? 2 R N N 
? 2 S N N 
? 2 T N N 
? 2 U N N 
? 2 V N N 
? 2 W N N 
? 2 X N N 
? 2 Y N N 
? 2 Z N N 
? 2 AA N N 
? 2 BA N N 
? 2 CA N N 
? 2 DA N N 
? 2 EA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A SG CYS 109 A CYS 109 1_555 E AG AG . A AG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.456 ? 
metalc ? metalc2 A SG CYS 109 A CYS 109 1_555 F AG AG . A AG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.418 ? 
metalc ? metalc3 A NZ LYS 111 A LYS 111 1_555 G AG AG . A AG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.605 ? 
metalc ? metalc4 A SG CYS 113 A CYS 113 1_555 G AG AG . A AG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.924 ? 
metalc ? metalc5 A SG CYS 113 A CYS 113 1_555 H AG AG . A AG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.469 ? 
metalc ? metalc6 A NZ LYS 142 A LYS 142 1_555 H AG AG . A AG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.482 ? 
metalc ? metalc7 A N VAL 173 A VAL 173 1_555 I AG AG . A AG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.214 ? 
metalc ? metalc8 A O VAL 173 A VAL 173 1_555 I AG AG . A AG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.486 ? 
metalc ? metalc9 A NE2 HIS 177 A HIS 177 1_555 K AG AG . A AG 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.469 ? 
metalc ? metalc10 A SD MET 227 A MET 227 1_555 K AG AG . A AG 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.661 ? 
metalc ? metalc11 A SG CYS 251 A CYS 251 1_555 I AG AG . A AG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.335 ? 
metalc ? metalc12 A SG CYS 251 A CYS 251 1_555 J AG AG . A AG 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.363 ? 
metalc ? metalc13 B O ALA 70 B ALA 70 1_555 L AG AG . B AG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.557 ? 
metalc ? metalc14 B SG CYS 109 B CYS 109 1_555 L AG AG . B AG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.432 ? 
metalc ? metalc15 B SG CYS 109 B CYS 109 1_555 M AG AG . B AG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.401 ? 
metalc ? metalc16 B SG CYS 113 B CYS 113 1_555 O AG AG . B AG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.478 ? 
metalc ? metalc17 B SG CYS 113 B CYS 113 1_555 P AG AG . B AG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.351 ? 
metalc ? metalc18 B NZ LYS 142 B LYS 142 1_555 O AG AG . B AG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.238 ? 
metalc ? metalc19 B N VAL 173 B VAL 173 1_555 R AG AG . B AG 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.274 ? 
metalc ? metalc20 B O VAL 173 B VAL 173 1_555 R AG AG . B AG 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.455 ? 
metalc ? metalc21 B NE2 HIS 177 B HIS 177 1_555 S AG AG . B AG 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.577 ? 
metalc ? metalc22 B SD MET 227 B MET 227 1_555 S AG AG . B AG 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.551 ? 
metalc ? metalc23 B SG CYS 251 B CYS 251 1_555 Q AG AG . B AG 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.413 ? 
metalc ? metalc24 B SG CYS 251 B CYS 251 1_555 R AG AG . B AG 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.28 ? 
metalc ? metalc25 C SG CYS 113 C CYS 113 1_555 T AG AG . C AG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.414 ? 
metalc ? metalc26 C SG CYS 113 C CYS 113 1_555 U AG AG . C AG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.792 ? 
metalc ? metalc27 C SG CYS 113 C CYS 113 1_555 V AG AG . C AG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.388 ? 
metalc ? metalc28 C NZ LYS 142 C LYS 142 1_555 T AG AG . C AG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.573 ? 
metalc ? metalc29 C N VAL 173 C VAL 173 1_555 W AG AG . C AG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.215 ? 
metalc ? metalc30 C O VAL 173 C VAL 173 1_555 W AG AG . C AG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.681 ? 
metalc ? metalc31 C NE2 HIS 177 C HIS 177 1_555 Y AG AG . C AG 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.376 ? 
metalc ? metalc32 C SD MET 227 C MET 227 1_555 Y AG AG . C AG 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.608 ? 
metalc ? metalc33 C SG CYS 251 C CYS 251 1_555 W AG AG . C AG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.244 ? 
metalc ? metalc34 C SG CYS 251 C CYS 251 1_555 X AG AG . C AG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? 
metalc ? metalc35 D SG CYS 109 D CYS 109 1_555 Z AG AG . D AG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.41 ? 
metalc ? metalc36 D SG CYS 109 D CYS 109 1_555 AA AG AG . D AG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.514 ? 
metalc ? metalc37 D SG CYS 113 D CYS 113 1_555 BA AG AG . D AG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.39 ? 
metalc ? metalc38 D SG CYS 113 D CYS 113 1_555 CA AG AG . D AG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.381 ? 
metalc ? metalc39 D N VAL 173 D VAL 173 1_555 EA AG AG . D AG 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.217 ? 
metalc ? metalc40 D SG CYS 251 D CYS 251 1_555 DA AG AG . D AG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? 
metalc ? metalc41 D SG CYS 251 D CYS 251 1_555 EA AG AG . D AG 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.252 ? 
#
_chem_comp.formula           'Ag 1' 
_chem_comp.formula_weight    107.868 
_chem_comp.id                AG 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'SILVER ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     7CGD 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.017349 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.005301 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.00802 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.01228 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 2 AG A 1 401 401 AG AG . 
F 2 AG A 1 402 402 AG AG . 
G 2 AG A 1 403 403 AG AG . 
H 2 AG A 1 404 404 AG AG . 
I 2 AG A 1 405 405 AG AG . 
J 2 AG A 1 406 406 AG AG . 
K 2 AG A 1 407 407 AG AG . 
L 2 AG B 1 401 401 AG AG . 
M 2 AG B 1 402 402 AG AG . 
N 2 AG B 1 403 403 AG AG . 
O 2 AG B 1 404 404 AG AG . 
P 2 AG B 1 405 405 AG AG . 
Q 2 AG B 1 406 406 AG AG . 
R 2 AG B 1 407 407 AG AG . 
S 2 AG B 1 408 408 AG AG . 
T 2 AG C 1 401 401 AG AG . 
U 2 AG C 1 402 402 AG AG . 
V 2 AG C 1 403 403 AG AG . 
W 2 AG C 1 404 404 AG AG . 
X 2 AG C 1 405 405 AG AG . 
Y 2 AG C 1 406 406 AG AG . 
Z 2 AG D 1 401 401 AG AG . 
AA 2 AG D 1 402 402 AG AG . 
BA 2 AG D 1 403 403 AG AG . 
CA 2 AG D 1 404 404 AG AG . 
DA 2 AG D 1 405 405 AG AG . 
EA 2 AG D 1 406 406 AG AG . 
FA 3 HOH A 1 501 501 HOH HOH . 
FA 3 HOH A 2 502 502 HOH HOH . 
FA 3 HOH A 3 503 503 HOH HOH . 
FA 3 HOH A 4 504 504 HOH HOH . 
FA 3 HOH A 5 505 505 HOH HOH . 
FA 3 HOH A 6 506 506 HOH HOH . 
FA 3 HOH A 7 507 507 HOH HOH . 
FA 3 HOH A 8 508 508 HOH HOH . 
FA 3 HOH A 9 509 509 HOH HOH . 
FA 3 HOH A 10 510 510 HOH HOH . 
FA 3 HOH A 11 511 511 HOH HOH . 
FA 3 HOH A 12 512 512 HOH HOH . 
FA 3 HOH A 13 513 513 HOH HOH . 
GA 3 HOH B 1 501 501 HOH HOH . 
GA 3 HOH B 2 502 502 HOH HOH . 
GA 3 HOH B 3 503 503 HOH HOH . 
GA 3 HOH B 4 504 504 HOH HOH . 
GA 3 HOH B 5 505 505 HOH HOH . 
GA 3 HOH B 6 506 506 HOH HOH . 
GA 3 HOH B 7 507 507 HOH HOH . 
GA 3 HOH B 8 508 508 HOH HOH . 
GA 3 HOH B 9 509 509 HOH HOH . 
GA 3 HOH B 10 510 510 HOH HOH . 
GA 3 HOH B 11 511 511 HOH HOH . 
GA 3 HOH B 12 512 512 HOH HOH . 
GA 3 HOH B 13 513 513 HOH HOH . 
HA 3 HOH C 1 501 501 HOH HOH . 
HA 3 HOH C 2 502 502 HOH HOH . 
HA 3 HOH C 3 503 503 HOH HOH . 
HA 3 HOH C 4 504 504 HOH HOH . 
HA 3 HOH C 5 505 505 HOH HOH . 
HA 3 HOH C 6 506 506 HOH HOH . 
HA 3 HOH C 7 507 507 HOH HOH . 
HA 3 HOH C 8 508 508 HOH HOH . 
HA 3 HOH C 9 509 509 HOH HOH . 
HA 3 HOH C 10 510 510 HOH HOH . 
IA 3 HOH D 1 501 501 HOH HOH . 
IA 3 HOH D 2 502 502 HOH HOH . 
IA 3 HOH D 3 503 503 HOH HOH . 
IA 3 HOH D 4 504 504 HOH HOH . 
IA 3 HOH D 5 505 505 HOH HOH . 
IA 3 HOH D 6 506 506 HOH HOH . 
IA 3 HOH D 7 507 507 HOH HOH . 
IA 3 HOH D 8 508 508 HOH HOH . 
IA 3 HOH D 9 509 509 HOH HOH . 
IA 3 HOH D 10 510 510 HOH HOH . 
IA 3 HOH D 11 511 511 HOH HOH . 
IA 3 HOH D 12 512 512 HOH HOH . 
IA 3 HOH D 13 513 513 HOH HOH . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           AG 
_atom_site.label_atom_id         AG 
_atom_site.label_comp_id         AG 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         CA 
_atom_site.label_entity_id       2 
_atom_site.Cartn_x               29.822 
_atom_site.Cartn_y               0.848 
_atom_site.Cartn_z               19.092 
_atom_site.occupancy             0.73 
_atom_site.B_iso_or_equiv        29.95 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          AG 
_atom_site.auth_comp_id          AG 
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