data_7CH3
#
_model_server_result.job_id            -JqOmOYrbcDo4yNZn8Kh7g 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-10 10:22:48' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          7ch3 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"T","auth_seq_id":502}' 
#
_entry.id    7CH3 
#
_exptl.entry_id    7CH3 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              54.938 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'MANGANESE (II) ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    18 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         81.08 
_cell.angle_beta          81.15 
_cell.angle_gamma         88.89 
_cell.entry_id            7CH3 
_cell.length_a            87.424 
_cell.length_b            113.913 
_cell.length_c            160.833 
_cell.Z_PDB               12 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 7CH3 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA hexameric 6 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA hexameric 6 author_and_software_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,C,D,F,H,M,N,O,P,Q,R,U,V,X,EA,FA,GA,HA,JA,LA 1 1 
E,G,I,J,K,L,S,T,W,Y,Z,AA,BA,CA,DA,IA,KA,MA,NA 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 M N N 
? 2 N N N 
? 2 O N N 
? 2 P N N 
? 2 Q N N 
? 2 R N N 
? 2 S N N 
? 2 T N N 
? 2 U N N 
? 2 V N N 
? 2 W N N 
? 2 X N N 
? 2 Y N N 
? 2 Z N N 
? 2 AA N N 
? 2 BA N N 
? 2 CA N N 
? 2 DA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OE2 GLU 302 A GLU 302 1_555 M MN MN . A MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.706 ? 
metalc ? metalc2 A OE1 GLU 329 A GLU 329 1_555 M MN MN . A MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.832 ? 
metalc ? metalc3 A OE2 GLU 329 A GLU 329 1_555 M MN MN . A MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.862 ? 
metalc ? metalc4 A O GLY 395 A GLY 395 1_555 N MN MN . A MN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.186 ? 
metalc ? metalc5 N MN MN . A MN 502 1_555 H O GLY 395 H GLY 395 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.425 ? 
metalc ? metalc6 B OE2 GLU 302 B GLU 302 1_555 O MN MN . B MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.735 ? 
metalc ? metalc7 B OE1 GLU 329 B GLU 329 1_555 O MN MN . B MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.938 ? 
metalc ? metalc8 B OE2 GLU 329 B GLU 329 1_555 O MN MN . B MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.638 ? 
metalc ? metalc9 B O GLY 395 B GLY 395 1_555 V MN MN . F MN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.369 ? 
metalc ? metalc10 C OE2 GLU 302 C GLU 302 1_555 P MN MN . C MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.875 ? 
metalc ? metalc11 C OE2 GLU 329 C GLU 329 1_555 P MN MN . C MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? 
metalc ? metalc12 C O GLY 395 C GLY 395 1_555 Q MN MN . C MN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.31 ? 
metalc ? metalc13 Q MN MN . C MN 502 1_555 D OE1 GLU 197 D GLU 197 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.381 ? 
metalc ? metalc14 Q MN MN . C MN 502 1_555 D O GLY 395 D GLY 395 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.348 ? 
metalc ? metalc15 D OE1 GLU 302 D GLU 302 1_555 R MN MN . D MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.586 ? 
metalc ? metalc16 D OE2 GLU 302 D GLU 302 1_555 R MN MN . D MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.744 ? 
metalc ? metalc17 D OE1 GLU 329 D GLU 329 1_555 R MN MN . D MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.485 ? 
metalc ? metalc18 D OE2 GLU 329 D GLU 329 1_555 R MN MN . D MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.711 ? 
metalc ? metalc19 D NE2 HIS 445 D HIS 445 1_555 R MN MN . D MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.753 ? 
metalc ? metalc20 E OE1 GLU 302 E GLU 302 1_555 S MN MN . E MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.458 ? 
metalc ? metalc21 E OE2 GLU 302 E GLU 302 1_555 S MN MN . E MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.756 ? 
metalc ? metalc22 E OE1 GLU 329 E GLU 329 1_555 S MN MN . E MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.612 ? 
metalc ? metalc23 E OE2 GLU 329 E GLU 329 1_555 S MN MN . E MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.665 ? 
metalc ? metalc24 E O GLY 395 E GLY 395 1_555 T MN MN . E MN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? 
metalc ? metalc25 T MN MN . E MN 502 1_555 I O GLY 395 I GLY 395 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.099 ? 
metalc ? metalc26 F OE2 GLU 302 F GLU 302 1_555 U MN MN . F MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.13 ? 
metalc ? metalc27 F OE1 GLU 329 F GLU 329 1_555 U MN MN . F MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.68 ? 
metalc ? metalc28 F OE2 GLU 329 F GLU 329 1_555 U MN MN . F MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? 
metalc ? metalc29 F O GLY 395 F GLY 395 1_555 V MN MN . F MN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.206 ? 
metalc ? metalc30 G OE1 GLU 302 G GLU 302 1_555 W MN MN . G MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.789 ? 
metalc ? metalc31 G OE2 GLU 302 G GLU 302 1_555 W MN MN . G MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.946 ? 
metalc ? metalc32 G O GLY 395 G GLY 395 1_555 DA MN MN . L MN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.519 ? 
metalc ? metalc33 H OE2 GLU 302 H GLU 302 1_555 X MN MN . H MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.792 ? 
metalc ? metalc34 H OE1 GLU 329 H GLU 329 1_555 X MN MN . H MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.241 ? 
metalc ? metalc35 I OE2 GLU 302 I GLU 302 1_555 Y MN MN . I MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.115 ? 
metalc ? metalc36 I OE1 GLU 329 I GLU 329 1_555 Y MN MN . I MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? 
metalc ? metalc37 I OE2 GLU 329 I GLU 329 1_555 Y MN MN . I MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.563 ? 
metalc ? metalc38 J OE2 GLU 302 J GLU 302 1_555 Z MN MN . J MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.848 ? 
metalc ? metalc39 J O GLY 395 J GLY 395 1_555 AA MN MN . J MN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.432 ? 
metalc ? metalc40 AA MN MN . J MN 502 1_555 K O GLY 395 K GLY 395 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.799 ? 
metalc ? metalc41 K OE2 GLU 302 K GLU 302 1_555 BA MN MN . K MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.918 ? 
metalc ? metalc42 K OE1 GLU 329 K GLU 329 1_555 BA MN MN . K MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.125 ? 
metalc ? metalc43 K OE2 GLU 329 K GLU 329 1_555 BA MN MN . K MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.484 ? 
metalc ? metalc44 K NE2 HIS 445 K HIS 445 1_555 BA MN MN . K MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.715 ? 
metalc ? metalc45 L OE2 GLU 302 L GLU 302 1_555 CA MN MN . L MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.79 ? 
metalc ? metalc46 L OE1 GLU 329 L GLU 329 1_555 CA MN MN . L MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.986 ? 
metalc ? metalc47 L OE2 GLU 329 L GLU 329 1_555 CA MN MN . L MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.602 ? 
metalc ? metalc48 L O GLY 395 L GLY 395 1_555 DA MN MN . L MN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? 
metalc ? metalc49 L NE2 HIS 445 L HIS 445 1_555 CA MN MN . L MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.786 ? 
#
_chem_comp.formula           'Mn 2' 
_chem_comp.formula_weight    54.938 
_chem_comp.id                MN 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'MANGANESE (II) ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     7CH3 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.011439 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    -0.000223 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    -0.001767 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.00878 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    -0.001367 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.006368 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
M 2 MN A 1 501 1 MN MN . 
N 2 MN A 1 502 13 MN MN . 
O 2 MN B 1 501 2 MN MN . 
P 2 MN C 1 501 3 MN MN . 
Q 2 MN C 1 502 15 MN MN . 
R 2 MN D 1 501 4 MN MN . 
S 2 MN E 1 501 5 MN MN . 
T 2 MN E 1 502 16 MN MN . 
U 2 MN F 1 501 6 MN MN . 
V 2 MN F 1 502 14 MN MN . 
W 2 MN G 1 501 7 MN MN . 
X 2 MN H 1 501 8 MN MN . 
Y 2 MN I 1 501 9 MN MN . 
Z 2 MN J 1 501 10 MN MN . 
AA 2 MN J 1 502 18 MN MN . 
BA 2 MN K 1 501 11 MN MN . 
CA 2 MN L 1 501 12 MN MN . 
DA 2 MN L 1 502 17 MN MN . 
EA 3 HOH A 1 601 18 HOH HOH . 
EA 3 HOH A 2 602 17 HOH HOH . 
EA 3 HOH A 3 603 19 HOH HOH . 
FA 3 HOH B 1 601 6 HOH HOH . 
FA 3 HOH B 2 602 10 HOH HOH . 
FA 3 HOH B 3 603 3 HOH HOH . 
GA 3 HOH C 1 601 11 HOH HOH . 
GA 3 HOH C 2 602 5 HOH HOH . 
HA 3 HOH D 1 601 4 HOH HOH . 
HA 3 HOH D 2 602 2 HOH HOH . 
HA 3 HOH D 3 603 12 HOH HOH . 
IA 3 HOH E 1 601 7 HOH HOH . 
JA 3 HOH F 1 601 13 HOH HOH . 
KA 3 HOH G 1 601 1 HOH HOH . 
KA 3 HOH G 2 602 9 HOH HOH . 
LA 3 HOH H 1 601 14 HOH HOH . 
MA 3 HOH I 1 601 15 HOH HOH . 
NA 3 HOH K 1 601 8 HOH HOH . 
NA 3 HOH K 2 602 16 HOH HOH . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           MN 
_atom_site.label_atom_id         MN 
_atom_site.label_comp_id         MN 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         T 
_atom_site.label_entity_id       2 
_atom_site.Cartn_x               -49.11 
_atom_site.Cartn_y               23.381 
_atom_site.Cartn_z               -44.56 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        51.11 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          MN 
_atom_site.auth_comp_id          MN 
_atom_site.auth_seq_id           502 
_atom_site.auth_asym_id          E 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              91 
_model_server_stats.parse_time_ms           34 
_model_server_stats.create_model_time_ms    308 
_model_server_stats.query_time_ms           335 
_model_server_stats.encode_time_ms          3 
_model_server_stats.element_count           1 
#