data_7CWT
#
_model_server_result.job_id            '_cBMov43xsrohPeWxB72Yw' 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-21 09:24:36' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          7cwt 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"X","auth_seq_id":1201}' 
#
_entry.id    7CWT 
#
_exptl.entry_id    7CWT 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              221.208 
_entity.id                          6 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose 
_entity.pdbx_number_of_molecules    14 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    pentadecameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      15 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 6 P N N 
? 6 Q N N 
? 6 R N N 
? 6 S N N 
? 6 T N N 
? 6 U N N 
? 6 V N N 
? 6 W N N 
? 6 X N N 
? 6 Y N N 
? 6 Z N N 
? 6 AA N N 
? 6 BA N N 
? 6 CA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 2 A CYS 15 1_555 A SG CYS 123 A CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf2 A SG CYS 118 A CYS 131 1_555 A SG CYS 153 A CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? 
disulf ? disulf3 A SG CYS 278 A CYS 291 1_555 A SG CYS 288 A CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? 
disulf ? disulf4 A SG CYS 323 A CYS 336 1_555 A SG CYS 348 A CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? 
disulf ? disulf5 A SG CYS 366 A CYS 379 1_555 A SG CYS 419 A CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? 
disulf ? disulf6 A SG CYS 467 A CYS 480 1_555 A SG CYS 475 A CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
disulf ? disulf7 A SG CYS 604 A CYS 617 1_555 A SG CYS 636 A CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? 
disulf ? disulf8 A SG CYS 649 A CYS 662 1_555 A SG CYS 658 A CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf9 A SG CYS 725 A CYS 738 1_555 A SG CYS 747 A CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? 
disulf ? disulf10 A SG CYS 730 A CYS 743 1_555 A SG CYS 736 A CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? 
disulf ? disulf11 A SG CYS 1019 A CYS 1032 1_555 A SG CYS 1030 A CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? 
disulf ? disulf12 A SG CYS 1069 A CYS 1082 1_555 A SG CYS 1113 A CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? 
disulf ? disulf13 B SG CYS 2 B CYS 15 1_555 B SG CYS 123 B CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? 
disulf ? disulf14 B SG CYS 118 B CYS 131 1_555 B SG CYS 153 B CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? 
disulf ? disulf15 B SG CYS 278 B CYS 291 1_555 B SG CYS 288 B CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? 
disulf ? disulf16 B SG CYS 323 B CYS 336 1_555 B SG CYS 348 B CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? 
disulf ? disulf17 B SG CYS 366 B CYS 379 1_555 B SG CYS 419 B CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? 
disulf ? disulf18 B SG CYS 467 B CYS 480 1_555 B SG CYS 475 B CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
disulf ? disulf19 B SG CYS 604 B CYS 617 1_555 B SG CYS 636 B CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? 
disulf ? disulf20 B SG CYS 649 B CYS 662 1_555 B SG CYS 658 B CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf21 B SG CYS 725 B CYS 738 1_555 B SG CYS 747 B CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? 
disulf ? disulf22 B SG CYS 730 B CYS 743 1_555 B SG CYS 736 B CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? 
disulf ? disulf23 B SG CYS 1019 B CYS 1032 1_555 B SG CYS 1030 B CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? 
disulf ? disulf24 B SG CYS 1069 B CYS 1082 1_555 B SG CYS 1113 B CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? 
disulf ? disulf25 C SG CYS 2 C CYS 15 1_555 C SG CYS 123 C CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
disulf ? disulf26 C SG CYS 118 C CYS 131 1_555 C SG CYS 153 C CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? 
disulf ? disulf27 C SG CYS 278 C CYS 291 1_555 C SG CYS 288 C CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.094 ? 
disulf ? disulf28 C SG CYS 323 C CYS 336 1_555 C SG CYS 348 C CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? 
disulf ? disulf29 C SG CYS 366 C CYS 379 1_555 C SG CYS 419 C CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? 
disulf ? disulf30 C SG CYS 467 C CYS 480 1_555 C SG CYS 475 C CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? 
disulf ? disulf31 C SG CYS 604 C CYS 617 1_555 C SG CYS 636 C CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.054 ? 
disulf ? disulf32 C SG CYS 649 C CYS 662 1_555 C SG CYS 658 C CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf33 C SG CYS 725 C CYS 738 1_555 C SG CYS 747 C CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? 
disulf ? disulf34 C SG CYS 730 C CYS 743 1_555 C SG CYS 736 C CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? 
disulf ? disulf35 C SG CYS 1019 C CYS 1032 1_555 C SG CYS 1030 C CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? 
disulf ? disulf36 C SG CYS 1069 C CYS 1082 1_555 C SG CYS 1113 C CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? 
disulf ? disulf37 D SG CYS 21 D CYS 22 1_555 D SG CYS 90 D CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? 
disulf ? disulf38 E SG CYS 21 E CYS 22 1_555 E SG CYS 95 E CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.016 ? 
disulf ? disulf39 F SG CYS 21 F CYS 22 1_555 F SG CYS 90 F CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? 
disulf ? disulf40 G SG CYS 21 G CYS 22 1_555 G SG CYS 95 G CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.016 ? 
disulf ? disulf41 H SG CYS 21 H CYS 22 1_555 H SG CYS 88 H CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? 
disulf ? disulf42 I SG CYS 21 I CYS 22 1_555 I SG CYS 95 I CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.421 ? 
disulf ? disulf43 J SG CYS 21 J CYS 22 1_555 J SG CYS 90 J CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? 
disulf ? disulf44 K SG CYS 21 K CYS 22 1_555 K SG CYS 88 K CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
disulf ? disulf45 L SG CYS 23 L CYS 23 1_555 L SG CYS 97 L CYS 97 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? 
disulf ? disulf46 M SG CYS 21 M CYS 22 1_555 M SG CYS 88 M CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf47 N SG CYS 23 N CYS 23 1_555 N SG CYS 97 N CYS 97 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? 
disulf ? disulf48 O SG CYS 23 P CYS 23 1_555 O SG CYS 97 P CYS 97 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? 
covale ? covale1 A ND2 ASN 603 A ASN 616 1_555 P C1 NAG . A NAG 1201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.462 ? 
covale ? covale2 A ND2 ASN 704 A ASN 717 1_555 T C1 NAG . A NAG 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? 
covale ? covale3 A ND2 ASN 788 A ASN 801 1_555 R C1 NAG . A NAG 1203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? 
covale ? covale4 A ND2 ASN 1061 A ASN 1074 1_555 Q C1 NAG . A NAG 1202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.46 ? 
covale ? covale5 A ND2 ASN 1085 A ASN 1098 1_555 S C1 NAG . A NAG 1204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.462 ? 
covale ? covale6 B ND2 ASN 603 B ASN 616 1_555 U C1 NAG . B NAG 1201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? 
covale ? covale7 B ND2 ASN 788 B ASN 801 1_555 V C1 NAG . B NAG 1202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.488 ? 
covale ? covale8 B ND2 ASN 1085 B ASN 1098 1_555 W C1 NAG . B NAG 1203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? 
covale ? covale9 C ND2 ASN 330 C ASN 343 1_555 AA C1 NAG . C NAG 1204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.463 ? 
covale ? covale10 C ND2 ASN 603 C ASN 616 1_555 CA C1 NAG . C NAG 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.531 ? 
covale ? covale11 C ND2 ASN 645 C ASN 658 1_555 BA C1 NAG . C NAG 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.472 ? 
covale ? covale12 C ND2 ASN 704 C ASN 717 1_555 X C1 NAG . C NAG 1201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? 
covale ? covale13 C ND2 ASN 788 C ASN 801 1_555 Y C1 NAG . C NAG 1202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? 
covale ? covale14 C ND2 ASN 1061 C ASN 1074 1_555 Z C1 NAG . C NAG 1203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? 
#
_chem_comp.formula           'C8 H15 N O6' 
_chem_comp.formula_weight    221.208 
_chem_comp.id                NAG 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose 
_chem_comp.type              'd-saccharide, beta linking' 
_chem_comp.pdbx_synonyms     N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 C2 NAG sing 235 n n 
C1 O1 NAG sing 236 n n 
C1 O5 NAG sing 237 n n 
C1 H1 NAG sing 238 n n 
C2 C3 NAG sing 239 n n 
C2 N2 NAG sing 240 n n 
C2 H2 NAG sing 241 n n 
C3 C4 NAG sing 242 n n 
C3 O3 NAG sing 243 n n 
C3 H3 NAG sing 244 n n 
C4 C5 NAG sing 245 n n 
C4 O4 NAG sing 246 n n 
C4 H4 NAG sing 247 n n 
C5 C6 NAG sing 248 n n 
C5 O5 NAG sing 249 n n 
C5 H5 NAG sing 250 n n 
C6 O6 NAG sing 251 n n 
C6 H61 NAG sing 252 n n 
C6 H62 NAG sing 253 n n 
C7 C8 NAG sing 254 n n 
C7 N2 NAG sing 255 n n 
C7 O7 NAG doub 256 n n 
C8 H81 NAG sing 257 n n 
C8 H82 NAG sing 258 n n 
C8 H83 NAG sing 259 n n 
N2 HN2 NAG sing 260 n n 
O1 HO1 NAG sing 261 n n 
O3 HO3 NAG sing 262 n n 
O4 HO4 NAG sing 263 n n 
O6 HO6 NAG sing 264 n n 
#
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier
_pdbx_chem_comp_identifier.type
_pdbx_chem_comp_identifier.program
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version
NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 
NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 
NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 
NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 
#
_atom_sites.entry_id                     7CWT 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
P 6 NAG A 1 1201 1309 NAG NAG . 
Q 6 NAG A 1 1202 1310 NAG NAG . 
R 6 NAG A 1 1203 1311 NAG NAG . 
S 6 NAG A 1 1204 1312 NAG NAG . 
T 6 NAG A 1 1205 1313 NAG NAG . 
U 6 NAG B 1 1201 1306 NAG NAG . 
V 6 NAG B 1 1202 1307 NAG NAG . 
W 6 NAG B 1 1203 1308 NAG NAG . 
X 6 NAG C 1 1201 1309 NAG NAG . 
Y 6 NAG C 1 1202 1310 NAG NAG . 
Z 6 NAG C 1 1203 1311 NAG NAG . 
AA 6 NAG C 1 1204 1312 NAG NAG . 
BA 6 NAG C 1 1205 1313 NAG NAG . 
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