data_7CYD # _model_server_result.job_id 9ASIrRlmUXMWTngaG-zJAA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-12 21:25:58' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7cyd # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"S","auth_seq_id":1210}' # _entry.id 7CYD # _exptl.entry_id 7CYD _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 42 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7CYD _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7CYD _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 J N N ? 4 K N N ? 4 L N N ? 4 M N N ? 4 N N N ? 4 O N N ? 4 P N N ? 4 Q N N ? 4 R N N ? 4 S N N ? 4 T N N ? 4 U N N ? 4 V N N ? 4 W N N ? 4 X N N ? 4 Y N N ? 4 Z N N ? 4 AA N N ? 4 BA N N ? 4 CA N N ? 4 DA N N ? 4 EA N N ? 4 FA N N ? 4 GA N N ? 4 HA N N ? 4 IA N N ? 4 JA N N ? 4 KA N N ? 4 LA N N ? 4 MA N N ? 4 NA N N ? 4 OA N N ? 4 PA N N ? 4 QA N N ? 4 RA N N ? 4 SA N N ? 4 TA N N ? 4 UA N N ? 4 VA N N ? 4 WA N N ? 4 XA N N ? 4 YA N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 2 oligosaccharide 3 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 2 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 2 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 2 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 4 ? 2 5 4 MAN MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 5 ? 2 6 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 6 ? 2 7 6 MAN MAN C1 O1 . O3 HO3 . sing 7 ? 3 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 8 ? 3 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 2 n D NAG 1 D 1 NAG A 1200 NAG 2 n D NAG 2 D 2 NAG A 1201 NAG 2 n D BMA 3 D 3 BMA A 1202 BMA 2 n D MAN 4 D 4 MAN A 1205 MAN 2 n D MAN 5 D 5 MAN A 1206 MAN 2 n D MAN 6 D 6 MAN A 1203 MAN 2 n D MAN 7 D 7 MAN A 1204 MAN 3 n E NAG 1 E 1 NAG A 1211 NAG 3 n E NAG 2 E 2 NAG A 1212 NAG 3 n E BMA 3 E 3 BMA A 1213 BMA 2 n F NAG 1 F 1 NAG B 1200 NAG 2 n F NAG 2 F 2 NAG B 1201 NAG 2 n F BMA 3 F 3 BMA B 1202 BMA 2 n F MAN 4 F 4 MAN B 1205 MAN 2 n F MAN 5 F 5 MAN B 1206 MAN 2 n F MAN 6 F 6 MAN B 1203 MAN 2 n F MAN 7 F 7 MAN B 1204 MAN 3 n G NAG 1 G 1 NAG B 1211 NAG 3 n G NAG 2 G 2 NAG B 1212 NAG 3 n G BMA 3 G 3 BMA B 1213 BMA 2 n H NAG 1 H 1 NAG C 1200 NAG 2 n H NAG 2 H 2 NAG C 1201 NAG 2 n H BMA 3 H 3 BMA C 1202 BMA 2 n H MAN 4 H 4 MAN C 1205 MAN 2 n H MAN 5 H 5 MAN C 1206 MAN 2 n H MAN 6 H 6 MAN C 1203 MAN 2 n H MAN 7 H 7 MAN C 1204 MAN 3 n I NAG 1 I 1 NAG C 1211 NAG 3 n I NAG 2 I 2 NAG C 1212 NAG 3 n I BMA 3 I 3 BMA C 1213 BMA # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 145 A CYS 145 1_555 A SG CYS 168 A CYS 168 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 317 A CYS 317 1_555 A SG CYS 320 A CYS 320 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 369 A CYS 369 1_555 A SG CYS 396 A CYS 396 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 608 A CYS 608 1_555 A SG CYS 630 A CYS 630 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 715 A CYS 715 1_555 A SG CYS 726 A CYS 726 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.015 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 917 A CYS 917 1_555 A SG CYS 928 A CYS 928 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf7 B SG CYS 145 B CYS 145 1_555 B SG CYS 168 B CYS 168 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf8 B SG CYS 317 B CYS 317 1_555 B SG CYS 320 B CYS 320 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf9 B SG CYS 369 B CYS 369 1_555 B SG CYS 396 B CYS 396 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf10 B SG CYS 608 B CYS 608 1_555 B SG CYS 630 B CYS 630 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf11 B SG CYS 715 B CYS 715 1_555 B SG CYS 726 B CYS 726 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.016 ? disulf ? disulf12 B SG CYS 917 B CYS 917 1_555 B SG CYS 928 B CYS 928 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf13 C SG CYS 145 C CYS 145 1_555 C SG CYS 168 C CYS 168 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf14 C SG CYS 317 C CYS 317 1_555 C SG CYS 320 C CYS 320 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf ? disulf15 C SG CYS 369 C CYS 369 1_555 C SG CYS 396 C CYS 396 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf16 C SG CYS 608 C CYS 608 1_555 C SG CYS 630 C CYS 630 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf17 C SG CYS 715 C CYS 715 1_555 C SG CYS 726 C CYS 726 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.017 ? disulf ? disulf18 C SG CYS 917 C CYS 917 1_555 C SG CYS 928 C CYS 928 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 62 A ASN 62 1_555 D C1 NAG . D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.545 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 98 A ASN 98 1_555 J C1 NAG . A NAG 1201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 122 A ASN 122 1_555 K C1 NAG . A NAG 1202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.56 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 171 A ASN 171 1_555 L C1 NAG . A NAG 1203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.423 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 220 A ASN 220 1_555 M C1 NAG . A NAG 1204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 243 A ASN 243 1_555 E C1 NAG . E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 326 A ASN 326 1_555 N C1 NAG . A NAG 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 440 A ASN 440 1_555 P C1 NAG . A NAG 1207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.719 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 518 A ASN 518 1_555 O C1 NAG . A NAG 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.725 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 542 A ASN 542 1_555 R C1 NAG . A NAG 1209 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.628 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 568 A ASN 568 1_555 S C1 NAG . A NAG 1210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.609 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 581 A ASN 581 1_555 T C1 NAG . A NAG 1211 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.591 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 587 A ASN 587 1_555 U C1 NAG . A NAG 1212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? covale ? covale14 A ND2 ASN 663 A ASN 663 1_555 Q C1 NAG . A NAG 1208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? covale ? covale15 A ND2 ASN 671 A ASN 671 1_555 V C1 NAG . A NAG 1213 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.409 ? covale ? covale16 A ND2 ASN 1015 A ASN 1015 1_555 W C1 NAG . A NAG 1214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.693 ? covale ? covale17 B ND2 ASN 62 B ASN 62 1_555 F C1 NAG . F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.471 ? covale ? covale18 B ND2 ASN 98 B ASN 98 1_555 X C1 NAG . B NAG 1201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.238 ? covale ? covale19 B ND2 ASN 122 B ASN 122 1_555 Y C1 NAG . B NAG 1202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.677 ? covale ? covale20 B ND2 ASN 171 B ASN 171 1_555 Z C1 NAG . B NAG 1203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.379 ? covale ? covale21 B ND2 ASN 220 B ASN 220 1_555 AA C1 NAG . B NAG 1204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? covale ? covale22 B ND2 ASN 243 B ASN 243 1_555 G C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.614 ? covale ? covale23 B ND2 ASN 326 B ASN 326 1_555 BA C1 NAG . B NAG 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.244 ? covale ? covale24 B ND2 ASN 440 B ASN 440 1_555 DA C1 NAG . B NAG 1207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.534 ? covale ? covale25 B ND2 ASN 518 B ASN 518 1_555 CA C1 NAG . B NAG 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.832 ? covale ? covale26 B ND2 ASN 542 B ASN 542 1_555 FA C1 NAG . B NAG 1209 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.619 ? covale ? covale27 B ND2 ASN 568 B ASN 568 1_555 GA C1 NAG . B NAG 1210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.712 ? covale ? covale28 B ND2 ASN 581 B ASN 581 1_555 HA C1 NAG . B NAG 1211 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.641 ? covale ? covale29 B ND2 ASN 587 B ASN 587 1_555 IA C1 NAG . B NAG 1212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.734 ? covale ? covale30 B ND2 ASN 663 B ASN 663 1_555 EA C1 NAG . B NAG 1208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.617 ? covale ? covale31 B ND2 ASN 671 B ASN 671 1_555 JA C1 NAG . B NAG 1213 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.63 ? covale ? covale32 B ND2 ASN 1015 B ASN 1015 1_555 KA C1 NAG . B NAG 1214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.362 ? covale ? covale33 C ND2 ASN 62 C ASN 62 1_555 H C1 NAG . H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale34 C ND2 ASN 98 C ASN 98 1_555 LA C1 NAG . C NAG 1201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? covale ? covale35 C ND2 ASN 122 C ASN 122 1_555 MA C1 NAG . C NAG 1202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale36 C ND2 ASN 171 C ASN 171 1_555 NA C1 NAG . C NAG 1203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale37 C ND2 ASN 220 C ASN 220 1_555 OA C1 NAG . C NAG 1204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.422 ? covale ? covale38 C ND2 ASN 243 C ASN 243 1_555 I C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale39 C ND2 ASN 326 C ASN 326 1_555 PA C1 NAG . C NAG 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale40 C ND2 ASN 440 C ASN 440 1_555 RA C1 NAG . C NAG 1207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.465 ? covale ? covale41 C ND2 ASN 518 C ASN 518 1_555 QA C1 NAG . C NAG 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale42 C ND2 ASN 542 C ASN 542 1_555 TA C1 NAG . C NAG 1209 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale43 C ND2 ASN 568 C ASN 568 1_555 UA C1 NAG . C NAG 1210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale44 C ND2 ASN 581 C ASN 581 1_555 VA C1 NAG . C NAG 1211 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale45 C ND2 ASN 587 C ASN 587 1_555 WA C1 NAG . C NAG 1212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale46 C ND2 ASN 663 C ASN 663 1_555 SA C1 NAG . C NAG 1208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale47 C ND2 ASN 671 C ASN 671 1_555 XA C1 NAG . C NAG 1213 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.484 ? covale ? covale48 C ND2 ASN 1015 C ASN 1015 1_555 YA C1 NAG . C NAG 1214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale49 D O4 NAG . D NAG 1 1_555 D C1 NAG . D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale50 D O4 NAG . D NAG 2 1_555 D C1 BMA . D BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale51 D O3 BMA . D BMA 3 1_555 D C1 MAN . D MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale52 D O6 BMA . D BMA 3 1_555 D C1 MAN . D MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale53 D O2 MAN . D MAN 4 1_555 D C1 MAN . D MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale54 D O3 MAN . D MAN 6 1_555 D C1 MAN . D MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale55 E O4 NAG . E NAG 1 1_555 E C1 NAG . E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale56 E O4 NAG . E NAG 2 1_555 E C1 BMA . E BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale57 F O4 NAG . F NAG 1 1_555 F C1 NAG . F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale58 F O4 NAG . F NAG 2 1_555 F C1 BMA . F BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale59 F O3 BMA . F BMA 3 1_555 F C1 MAN . F MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale60 F O6 BMA . F BMA 3 1_555 F C1 MAN . F MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale61 F O2 MAN . F MAN 4 1_555 F C1 MAN . F MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale62 F O3 MAN . F MAN 6 1_555 F C1 MAN . F MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale63 G O4 NAG . G NAG 1 1_555 G C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale64 G O4 NAG . G NAG 2 1_555 G C1 BMA . G BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale65 H O4 NAG . H NAG 1 1_555 H C1 NAG . H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale66 H O4 NAG . H NAG 2 1_555 H C1 BMA . H BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale67 H O3 BMA . H BMA 3 1_555 H C1 MAN . H MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale68 H O6 BMA . H BMA 3 1_555 H C1 MAN . H MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale69 H O2 MAN . H MAN 4 1_555 H C1 MAN . H MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale70 H O3 MAN . H MAN 6 1_555 H C1 MAN . H MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale71 I O4 NAG . I NAG 1 1_555 I C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale72 I O4 NAG . I NAG 2 1_555 I C1 BMA . I BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 283 n n C1 O1 NAG sing 284 n n C1 O5 NAG sing 285 n n C1 H1 NAG sing 286 n n C2 C3 NAG sing 287 n n C2 N2 NAG sing 288 n n C2 H2 NAG sing 289 n n C3 C4 NAG sing 290 n n C3 O3 NAG sing 291 n n C3 H3 NAG sing 292 n n C4 C5 NAG sing 293 n n C4 O4 NAG sing 294 n n C4 H4 NAG sing 295 n n C5 C6 NAG sing 296 n n C5 O5 NAG sing 297 n n C5 H5 NAG sing 298 n n C6 O6 NAG sing 299 n n C6 H61 NAG sing 300 n n C6 H62 NAG sing 301 n n C7 C8 NAG sing 302 n n C7 N2 NAG sing 303 n n C7 O7 NAG doub 304 n n C8 H81 NAG sing 305 n n C8 H82 NAG sing 306 n n C8 H83 NAG sing 307 n n N2 HN2 NAG sing 308 n n O1 HO1 NAG sing 309 n n O3 HO3 NAG sing 310 n n O4 HO4 NAG sing 311 n n O6 HO6 NAG sing 312 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 7CYD _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code J 4 NAG A 1 1201 1207 NAG NAG . K 4 NAG A 1 1202 1208 NAG NAG . L 4 NAG A 1 1203 1209 NAG NAG . M 4 NAG A 1 1204 1210 NAG NAG . N 4 NAG A 1 1205 1214 NAG NAG . O 4 NAG A 1 1206 1215 NAG NAG . P 4 NAG A 1 1207 1216 NAG NAG . Q 4 NAG A 1 1208 1217 NAG NAG . R 4 NAG A 1 1209 1218 NAG NAG . S 4 NAG A 1 1210 1219 NAG NAG . T 4 NAG A 1 1211 1220 NAG NAG . U 4 NAG A 1 1212 1221 NAG NAG . V 4 NAG A 1 1213 1222 NAG NAG . W 4 NAG A 1 1214 1223 NAG NAG . X 4 NAG B 1 1201 1207 NAG NAG . Y 4 NAG B 1 1202 1208 NAG NAG . Z 4 NAG B 1 1203 1209 NAG NAG . AA 4 NAG B 1 1204 1210 NAG NAG . BA 4 NAG B 1 1205 1214 NAG NAG . CA 4 NAG B 1 1206 1215 NAG NAG . DA 4 NAG B 1 1207 1216 NAG NAG . EA 4 NAG B 1 1208 1217 NAG NAG . FA 4 NAG B 1 1209 1218 NAG NAG . GA 4 NAG B 1 1210 1219 NAG NAG . HA 4 NAG B 1 1211 1220 NAG NAG . IA 4 NAG B 1 1212 1221 NAG NAG . JA 4 NAG B 1 1213 1222 NAG NAG . KA 4 NAG B 1 1214 1223 NAG NAG . LA 4 NAG C 1 1201 1207 NAG NAG . MA 4 NAG C 1 1202 1208 NAG NAG . NA 4 NAG C 1 1203 1209 NAG NAG . OA 4 NAG C 1 1204 1210 NAG NAG . PA 4 NAG C 1 1205 1214 NAG NAG . QA 4 NAG C 1 1206 1215 NAG NAG . RA 4 NAG C 1 1207 1216 NAG NAG . SA 4 NAG C 1 1208 1217 NAG NAG . TA 4 NAG C 1 1209 1218 NAG NAG . UA 4 NAG C 1 1210 1219 NAG NAG . VA 4 NAG C 1 1211 1220 NAG NAG . WA 4 NAG C 1 1212 1221 NAG NAG . XA 4 NAG C 1 1213 1222 NAG NAG . YA 4 NAG C 1 1214 1223 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . S 4 171.562 148.534 171.886 1 297.07 ? C1 NAG 1210 A 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . S 4 171.441 149.751 172.882 1 297.07 ? C2 NAG 1210 A 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . S 4 172.77 150.463 173.257 1 297.07 ? C3 NAG 1210 A 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . S 4 174.043 149.637 173.164 1 297.07 ? C4 NAG 1210 A 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . S 4 174.05 148.697 171.99 1 297.07 ? C5 NAG 1210 A 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . S 4 175.202 147.72 172.028 1 297.07 ? C6 NAG 1210 A 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . S 4 170.052 151.787 173.051 1 297.07 ? C7 NAG 1210 A 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . S 4 169.074 152.669 172.337 1 297.07 ? C8 NAG 1210 A 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . S 4 170.484 150.719 172.368 1 297.07 ? N2 NAG 1210 A 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . S 4 172.656 151.013 174.564 1 297.07 ? O3 NAG 1210 A 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . S 4 175.175 150.494 173.084 1 297.07 ? O4 NAG 1210 A 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . S 4 172.859 147.919 171.966 1 297.07 ? O5 NAG 1210 A 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . S 4 176.044 147.961 173.148 1 297.07 ? O6 NAG 1210 A 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . S 4 170.423 152.025 174.197 1 297.07 ? O7 NAG 1210 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 11 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 25 _model_server_stats.query_time_ms 213 _model_server_stats.encode_time_ms 22 _model_server_stats.element_count 14 #