data_7DR1
#
_model_server_result.job_id            mXbUlQHD5nUQsjbVaeoYOA 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-03-09 06:10:53' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          7dr1 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"CB","auth_seq_id":845}' 
#
_entry.id    7DR1 
#
_exptl.entry_id    7DR1 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              351.64 
_entity.id                          14 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'IRON/SULFUR CLUSTER' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    3 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            7DR1 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 7DR1 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    decameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      10 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 14 CB N N 
? 14 XC N N 
? 14 YC N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 F SG CYS 33 F CYS 33 1_555 F SG CYS 88 F CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
metalc ? metalc1 A OE1 GLN 116 A GLN 116 1_555 R MG CLA . A CLA 808 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.212 ? 
metalc ? metalc2 A OE1 GLN 124 A GLN 124 1_555 S MG CLA . A CLA 809 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.175 ? 
metalc ? metalc3 A OD1 ASN 491 A ASN 491 1_555 SA MG CLA . A CLA 835 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.244 ? 
metalc ? metalc4 A O THR 498 A THR 498 1_555 TA MG CLA . A CLA 836 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.224 ? 
metalc ? metalc5 A SG CYS 575 A CYS 575 1_555 CB FE3 SF4 . A SF4 845 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.287 ? 
metalc ? metalc6 A SG CYS 584 A CYS 584 1_555 CB FE2 SF4 . A SF4 845 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? 
metalc ? metalc7 AB MG CLA . A CLA 843 1_555 KB O5 LHG . A LHG 853 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.189 ? 
metalc ? metalc8 CB FE4 SF4 . A SF4 845 1_555 B SG CYS 562 B CYS 562 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.278 ? 
metalc ? metalc9 CB FE1 SF4 . A SF4 845 1_555 B SG CYS 571 B CYS 571 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? 
metalc ? metalc10 B OD1 ASN 29 B ASN 29 1_555 QB MG CLA . B CLA 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? 
metalc ? metalc11 B OD2 ASP 93 B ASP 93 1_555 VB MG CLA . B CLA 810 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.194 ? 
metalc ? metalc12 C SG CYS 11 C CYS 11 1_555 YC FE4 SF4 . C SF4 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.272 ? 
metalc ? metalc13 C SG CYS 14 C CYS 14 1_555 YC FE3 SF4 . C SF4 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.303 ? 
metalc ? metalc14 C SG CYS 17 C CYS 17 1_555 YC FE2 SF4 . C SF4 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? 
metalc ? metalc15 C SG CYS 21 C CYS 21 1_555 XC FE2 SF4 . C SF4 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? 
metalc ? metalc16 C SG CYS 48 C CYS 48 1_555 XC FE4 SF4 . C SF4 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? 
metalc ? metalc17 C SG CYS 51 C CYS 51 1_555 XC FE1 SF4 . C SF4 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? 
metalc ? metalc18 C SG CYS 54 C CYS 54 1_555 XC FE3 SF4 . C SF4 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? 
metalc ? metalc19 C SG CYS 58 C CYS 58 1_555 YC FE1 SF4 . C SF4 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? 
metalc ? metalc20 F O ASP 99 F ASP 99 1_555 BD MG CLA . F CLA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.288 ? 
metalc ? metalc21 H OE2 GLU 27 J GLU 27 1_555 DD MG CLA . J CLA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.28 ? 
metalc ? metalc22 I OE2 GLU 50 L GLU 50 1_555 ID MG CLA . L CLA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.188 ? 
#
_chem_comp.formula           'Fe4 S4' 
_chem_comp.formula_weight    351.64 
_chem_comp.id                SF4 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'IRON/SULFUR CLUSTER' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
FE1 S2 SF4 sing 1019 n n 
FE1 S3 SF4 sing 1020 n n 
FE1 S4 SF4 sing 1021 n n 
FE2 S1 SF4 sing 1022 n n 
FE2 S3 SF4 sing 1023 n n 
FE2 S4 SF4 sing 1024 n n 
FE3 S1 SF4 sing 1025 n n 
FE3 S2 SF4 sing 1026 n n 
FE3 S4 SF4 sing 1027 n n 
FE4 S1 SF4 sing 1028 n n 
FE4 S2 SF4 sing 1029 n n 
FE4 S3 SF4 sing 1030 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     7DR1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
K 11 CL0 A 1 801 801 CL0 CL0 . 
L 12 CLA A 1 802 803 CLA CLA . 
M 12 CLA A 1 803 804 CLA CLA . 
N 12 CLA A 1 804 805 CLA CLA . 
O 12 CLA A 1 805 806 CLA CLA . 
P 12 CLA A 1 806 807 CLA CLA . 
Q 12 CLA A 1 807 808 CLA CLA . 
R 12 CLA A 1 808 809 CLA CLA . 
S 12 CLA A 1 809 810 CLA CLA . 
T 12 CLA A 1 810 811 CLA CLA . 
U 12 CLA A 1 811 812 CLA CLA . 
V 12 CLA A 1 812 813 CLA CLA . 
W 12 CLA A 1 813 814 CLA CLA . 
X 12 CLA A 1 814 815 CLA CLA . 
Y 12 CLA A 1 815 816 CLA CLA . 
Z 12 CLA A 1 816 817 CLA CLA . 
AA 12 CLA A 1 817 818 CLA CLA . 
BA 12 CLA A 1 818 819 CLA CLA . 
CA 12 CLA A 1 819 820 CLA CLA . 
DA 12 CLA A 1 820 821 CLA CLA . 
EA 12 CLA A 1 821 822 CLA CLA . 
FA 12 CLA A 1 822 823 CLA CLA . 
GA 12 CLA A 1 823 824 CLA CLA . 
HA 12 CLA A 1 824 825 CLA CLA . 
IA 12 CLA A 1 825 826 CLA CLA . 
JA 12 CLA A 1 826 827 CLA CLA . 
KA 12 CLA A 1 827 828 CLA CLA . 
LA 12 CLA A 1 828 829 CLA CLA . 
MA 12 CLA A 1 829 830 CLA CLA . 
NA 12 CLA A 1 830 831 CLA CLA . 
OA 12 CLA A 1 831 832 CLA CLA . 
PA 12 CLA A 1 832 833 CLA CLA . 
QA 12 CLA A 1 833 834 CLA CLA . 
RA 12 CLA A 1 834 835 CLA CLA . 
SA 12 CLA A 1 835 836 CLA CLA . 
TA 12 CLA A 1 836 837 CLA CLA . 
UA 12 CLA A 1 837 838 CLA CLA . 
VA 12 CLA A 1 838 839 CLA CLA . 
WA 12 CLA A 1 839 840 CLA CLA . 
XA 12 CLA A 1 840 841 CLA CLA . 
YA 12 CLA A 1 841 842 CLA CLA . 
ZA 12 CLA A 1 842 843 CLA CLA . 
AB 12 CLA A 1 843 846 CLA CLA . 
BB 13 PQN A 1 844 847 PQN PQN . 
CB 14 SF4 A 1 845 848 SF4 SF4 . 
DB 15 BCR A 1 846 849 BCR BCR . 
EB 15 BCR A 1 847 850 BCR BCR . 
FB 15 BCR A 1 848 851 BCR BCR . 
GB 15 BCR A 1 849 852 BCR BCR . 
HB 15 BCR A 1 850 853 BCR BCR . 
IB 15 BCR A 1 851 854 BCR BCR . 
JB 16 LHG A 1 852 855 LHG LHG . 
KB 16 LHG A 1 853 856 LHG LHG . 
LB 12 CLA A 1 854 802 CLA CLA . 
MB 12 CLA B 1 801 802 CLA CLA . 
NB 12 CLA B 1 802 844 CLA CLA . 
OB 12 CLA B 1 803 801 CLA CLA . 
PB 12 CLA B 1 804 803 CLA CLA . 
QB 12 CLA B 1 805 804 CLA CLA . 
RB 12 CLA B 1 806 805 CLA CLA . 
SB 12 CLA B 1 807 806 CLA CLA . 
TB 12 CLA B 1 808 807 CLA CLA . 
UB 12 CLA B 1 809 808 CLA CLA . 
VB 12 CLA B 1 810 809 CLA CLA . 
WB 12 CLA B 1 811 810 CLA CLA . 
XB 12 CLA B 1 812 811 CLA CLA . 
YB 12 CLA B 1 813 813 CLA CLA . 
ZB 12 CLA B 1 814 814 CLA CLA . 
AC 12 CLA B 1 815 815 CLA CLA . 
BC 12 CLA B 1 816 816 CLA CLA . 
CC 12 CLA B 1 817 817 CLA CLA . 
DC 12 CLA B 1 818 818 CLA CLA . 
EC 12 CLA B 1 819 825 CLA CLA . 
FC 12 CLA B 1 820 826 CLA CLA . 
GC 12 CLA B 1 821 827 CLA CLA . 
HC 12 CLA B 1 822 828 CLA CLA . 
IC 12 CLA B 1 823 829 CLA CLA . 
JC 12 CLA B 1 824 831 CLA CLA . 
KC 12 CLA B 1 825 832 CLA CLA . 
LC 12 CLA B 1 826 833 CLA CLA . 
MC 12 CLA B 1 827 834 CLA CLA . 
NC 12 CLA B 1 828 837 CLA CLA . 
OC 12 CLA B 1 829 838 CLA CLA . 
PC 12 CLA B 1 830 839 CLA CLA . 
QC 12 CLA B 1 831 840 CLA CLA . 
RC 12 CLA B 1 832 841 CLA CLA . 
SC 13 PQN B 1 833 842 PQN PQN . 
TC 15 BCR B 1 834 845 BCR BCR . 
UC 15 BCR B 1 835 847 BCR BCR . 
VC 15 BCR B 1 836 849 BCR BCR . 
WC 17 LMG B 1 837 850 LMG LMG . 
XC 14 SF4 C 1 101 101 SF4 SF4 . 
YC 14 SF4 C 1 102 102 SF4 SF4 . 
ZC 15 BCR F 1 201 848 BCR BCR . 
AD 15 BCR F 1 202 202 BCR BCR . 
BD 12 CLA F 1 203 203 CLA CLA . 
CD 15 BCR I 1 101 101 BCR BCR . 
DD 12 CLA J 1 101 101 CLA CLA . 
ED 15 BCR J 1 102 103 BCR BCR . 
FD 15 BCR J 1 103 104 BCR BCR . 
GD 15 BCR J 1 104 105 BCR BCR . 
HD 15 BCR L 1 201 102 BCR BCR . 
ID 12 CLA L 1 202 201 CLA CLA . 
JD 12 CLA L 1 203 202 CLA CLA . 
KD 12 CLA L 1 204 203 CLA CLA . 
LD 15 BCR L 1 205 204 BCR BCR . 
MD 15 BCR L 1 206 205 BCR BCR . 
ND 15 BCR M 1 101 101 BCR BCR . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 FE FE1 SF4 . . . CB 14 173.818 260.848 208.945 1 26.79 ? FE1 SF4 845 A 1 
HETATM 2 FE FE2 SF4 . . . CB 14 175.825 259.194 209.778 1 26.79 ? FE2 SF4 845 A 1 
HETATM 3 FE FE3 SF4 . . . CB 14 175.962 260.371 207.312 1 26.79 ? FE3 SF4 845 A 1 
HETATM 4 FE FE4 SF4 . . . CB 14 174.138 258.393 207.782 1 26.79 ? FE4 SF4 845 A 1 
HETATM 5 S S1 SF4 . . . CB 14 176.406 258.194 207.814 1 26.79 ? S1 SF4 845 A 1 
HETATM 6 S S2 SF4 . . . CB 14 173.764 260.371 206.718 1 26.79 ? S2 SF4 845 A 1 
HETATM 7 S S3 SF4 . . . CB 14 173.587 258.816 209.952 1 26.79 ? S3 SF4 845 A 1 
HETATM 8 S S4 SF4 . . . CB 14 175.985 261.419 209.331 1 26.79 ? S4 SF4 845 A 1 
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