data_7E8O # _model_server_result.job_id PRzjCYqhk_POWbKmc3c5tg _model_server_result.datetime_utc '2025-02-05 04:54:27' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7e8o # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"H","auth_seq_id":302}' # _entry.id 7E8O # _exptl.entry_id 7E8O _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 5 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7E8O _cell.length_a 146.277 _cell.length_b 146.277 _cell.length_c 143.369 _cell.Z_PDB 32 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7E8O _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 92 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 41 21 2' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 1 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,E,F,G,H,K,L 1 1 C,D,I,J 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 F N N ? 3 G N N ? 3 H N N ? 3 I N N ? 3 J N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A O ARG 151 A ARG 146 1_555 F CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.189 ? metalc ? metalc2 A O ILE 154 A ILE 149 1_555 F CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.45 ? metalc ? metalc3 A OD2 ASP 156 A ASP 151 1_555 F CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.209 ? metalc ? metalc4 B O ARG 151 B ARG 146 1_555 H CA CA . B CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.438 ? metalc ? metalc5 B OD2 ASP 156 B ASP 151 1_555 G CA CA . B CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.565 ? metalc ? metalc6 B OD2 ASP 156 B ASP 151 1_555 H CA CA . B CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.32 ? metalc ? metalc7 C OD1 ASP 156 C ASP 151 1_555 I CA CA . C CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.915 ? metalc ? metalc8 C OD2 ASP 156 C ASP 151 1_555 I CA CA . C CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.728 ? metalc ? metalc9 C OD2 ASP 178 C ASP 173 1_555 I CA CA . C CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.924 ? metalc ? metalc10 D O ARG 151 D ARG 146 1_555 J CA CA . D CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.401 ? metalc ? metalc11 D O ILE 154 D ILE 149 1_555 J CA CA . D CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.439 ? metalc ? metalc12 D OD2 ASP 156 D ASP 151 1_555 J CA CA . D CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.904 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 E N1 G 10 X G -1 1_555 E N3 C 82 X C 72 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 E N2 G 10 X G -1 1_555 E O2 C 82 X C 72 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 E O6 G 10 X G -1 1_555 E N4 C 82 X C 72 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 E N1 G 11 X G 1 1_555 E N3 C 81 X C 71 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 E N2 G 11 X G 1 1_555 E O2 C 81 X C 71 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 E O6 G 11 X G 1 1_555 E N4 C 81 X C 71 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 E N3 U 12 X U 2 1_555 E N1 A 80 X A 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 E O4 U 12 X U 2 1_555 E N6 A 80 X A 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 E N1 G 13 X G 3 1_555 E N3 C 79 X C 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 E N2 G 13 X G 3 1_555 E O2 C 79 X C 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 E O6 G 13 X G 3 1_555 E N4 C 79 X C 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 E N1 G 14 X G 4 1_555 E N3 C 78 X C 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 E N2 G 14 X G 4 1_555 E O2 C 78 X C 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 E O6 G 14 X G 4 1_555 E N4 C 78 X C 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 E N3 C 15 X C 5 1_555 E N1 G 77 X G 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 E N4 C 15 X C 5 1_555 E O6 G 77 X G 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 E O2 C 15 X C 5 1_555 E N2 G 77 X G 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 E N3 U 16 X U 6 1_555 E N1 A 76 X A 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 E O4 U 16 X U 6 1_555 E N6 A 76 X A 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 E N1 A 17 X A 7 1_555 E N3 U 75 X U 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 E N6 A 17 X A 7 1_555 E O4 U 75 X U 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED HOOGSTEEN' hydrog22 E N3 U 18 X U 8 1_555 E N7 A 24 X A 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED HOOGSTEEN' hydrog23 E O2 U 18 X U 8 1_555 E N6 A 24 X A 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_2_PAIR hydrog24 E N6 A 19 X A 9 1_555 E N7 A 32 X A 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_2_PAIR hydrog25 E N7 A 19 X A 9 1_555 E N6 A 32 X A 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 E N1 G 20 X G 10 1_555 E N3 C 34 X C 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 E N2 G 20 X G 10 1_555 E O2 C 34 X C 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 E O6 G 20 X G 10 1_555 E N4 C 34 X C 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 E N3 C 21 X C 11 1_555 E N1 G 33 X G 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 E N4 C 21 X C 11 1_555 E O6 G 33 X G 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 E O2 C 21 X C 11 1_555 E N2 G 33 X G 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 E N3 U 22 X U 12 1_555 E N1 A 32 X A 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 E O4 U 22 X U 12 1_555 E N6 A 32 X A 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 E N3 C 23 X C 13 1_555 E N1 G 31 X G 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 E N4 C 23 X C 13 1_555 E O6 G 31 X G 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 E O2 C 23 X C 13 1_555 E N2 G 31 X G 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED WATSON-CRICK' hydrog37 E N1 G 25 X G 15 1_555 E O2 C 57 X C 47 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED WATSON-CRICK' hydrog38 E N2 G 25 X G 15 1_555 E N3 C 57 X C 47 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-U MISPAIR' hydrog39 E N1 G 27 X G 17 1_555 E O2 U 64 X U 54 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 E N1 G 28 X G 18 1_555 E N3 C 65 X C 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 E N2 G 28 X G 18 1_555 E O2 C 65 X C 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 E O6 G 28 X G 18 1_555 E N4 C 65 X C 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_7_PAIR hydrog43 E N7 G 31 X G 21 1_555 E N1 G 55 X G 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_7_PAIR hydrog44 E O6 G 31 X G 21 1_555 E N2 G 55 X G 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'C-G PAIR' hydrog45 E N4 C 35 X C 25 1_555 E O6 G 52 X G 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 E N3 C 36 X C 26 1_555 E N1 G 52 X G 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 E N4 C 36 X C 26 1_555 E O6 G 52 X G 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 E O2 C 36 X C 26 1_555 E N2 G 52 X G 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 E N3 U 37 X U 27 1_555 E N1 A 51 X A 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 E O4 U 37 X U 27 1_555 E N6 A 51 X A 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-C PAIR' hydrog51 E O6 G 38 X G 28 1_555 E N4 C 50 X C 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 E N1 G 39 X G 29 1_555 E N3 C 49 X C 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 E N2 G 39 X G 29 1_555 E O2 C 49 X C 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 E O6 G 39 X G 29 1_555 E N4 C 49 X C 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog55 E N1 G 58 X G 48 1_555 E O2 U 74 X U 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog56 E O6 G 58 X G 48 1_555 E N3 U 74 X U 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 E N3 U 59 X U 49 1_555 E N1 A 73 X A 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog58 E O4 U 59 X U 49 1_555 E N6 A 73 X A 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog59 E N1 G 60 X G 50 1_555 E N3 C 72 X C 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog60 E N2 G 60 X G 50 1_555 E O2 C 72 X C 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog61 E O6 G 60 X G 50 1_555 E N4 C 72 X C 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog62 E N1 G 61 X G 51 1_555 E N3 C 71 X C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog63 E N2 G 61 X G 51 1_555 E O2 C 71 X C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog64 E O6 G 61 X G 51 1_555 E N4 C 71 X C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog65 E N1 G 62 X G 52 1_555 E N3 C 70 X C 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog66 E N2 G 62 X G 52 1_555 E O2 C 70 X C 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog67 E O6 G 62 X G 52 1_555 E N4 C 70 X C 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED HOOGSTEEN' hydrog68 E N3 U 63 X U 53 1_555 E N7 A 67 X A 57 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED HOOGSTEEN' hydrog69 E O2 U 63 X U 53 1_555 E N6 A 67 X A 57 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 7E8O _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.006836 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.006836 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.006975 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code F 3 CA A 1 301 3 CA CA . G 3 CA B 1 301 1 CA CA . H 3 CA B 1 302 2 CA CA . I 3 CA C 1 301 4 CA CA . J 3 CA D 1 301 6 CA CA . K 4 HOH B 1 401 5 HOH HOH . K 4 HOH B 2 402 6 HOH HOH . K 4 HOH B 3 403 9 HOH HOH . K 4 HOH B 4 404 8 HOH HOH . L 4 HOH X 1 101 1 HOH HOH . L 4 HOH X 2 102 4 HOH HOH . L 4 HOH X 3 103 2 HOH HOH . L 4 HOH X 4 104 3 HOH HOH . L 4 HOH X 5 105 7 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id H _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x -25.487 _atom_site.Cartn_y 21.431 _atom_site.Cartn_z -10.552 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 115.86 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 302 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 25 _model_server_stats.parse_time_ms 35 _model_server_stats.create_model_time_ms 8 _model_server_stats.query_time_ms 330 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #