data_7ED5 # _model_server_result.job_id dmmPYbd8utr1vNuxZxHLRg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-21 08:58:54' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7ed5 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"L","auth_seq_id":1006}' # _entry.id 7ED5 # _exptl.entry_id 7ED5 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 7 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 3 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7ED5 _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7ED5 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 6 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 7 I N N ? 7 L N N ? 7 M N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 E O3' U 20 I U 32 1_555 N PA AT9 . I AT9 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.59 ? metalc ? metalc1 A OD1 ASN 233 A ASN 209 1_555 I MG MG . A MG 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.094 ? metalc ? metalc2 A OD2 ASP 242 A ASP 218 1_555 I MG MG . A MG 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.7 ? metalc ? metalc3 A OD1 ASP 242 A ASP 218 1_555 M MG MG . A MG 1007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.214 ? metalc ? metalc4 A OD2 ASP 242 A ASP 218 1_555 M MG MG . A MG 1007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.345 ? metalc ? metalc5 A ND1 HIS 319 A HIS 295 1_555 G ZN ZN . A ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.086 ? metalc ? metalc6 A SG CYS 325 A CYS 301 1_555 G ZN ZN . A ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? metalc ? metalc7 A SG CYS 330 A CYS 306 1_555 G ZN ZN . A ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.355 ? metalc ? metalc8 A SG CYS 334 A CYS 310 1_555 G ZN ZN . A ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.336 ? metalc ? metalc9 A SG CYS 511 A CYS 487 1_555 H ZN ZN . A ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? metalc ? metalc10 A O ASP 642 A ASP 618 1_555 L MG MG . A MG 1006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.624 ? metalc ? metalc11 A OD2 ASP 642 A ASP 618 1_555 L MG MG . A MG 1006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.83 ? metalc ? metalc12 A ND1 HIS 666 A HIS 642 1_555 H ZN ZN . A ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.07 ? metalc ? metalc13 A SG CYS 669 A CYS 645 1_555 H ZN ZN . A ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? metalc ? metalc14 A SG CYS 670 A CYS 646 1_555 H ZN ZN . A ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? metalc ? metalc15 I MG MG . A MG 1003 1_555 J O3A AT9 . A AT9 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.37 ? metalc ? metalc16 J O3B AT9 . A AT9 1004 1_555 M MG MG . A MG 1007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.31 ? metalc ? metalc17 K O3A AT9 . A AT9 1005 1_555 L MG MG . A MG 1006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.483 ? metalc ? metalc18 K O3B AT9 . A AT9 1005 1_555 L MG MG . A MG 1006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.982 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 E N1 G 1 I G 13 1_555 F N3 C 30 J C 47 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 E N2 G 1 I G 13 1_555 F O2 C 30 J C 47 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 E O6 G 1 I G 13 1_555 F N4 C 30 J C 47 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 E N3 C 2 I C 14 1_555 F N1 G 29 J G 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 E N4 C 2 I C 14 1_555 F O6 G 29 J G 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 E O2 C 2 I C 14 1_555 F N2 G 29 J G 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 E N3 U 3 I U 15 1_555 F N1 A 28 J A 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 E O4 U 3 I U 15 1_555 F N6 A 28 J A 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 E N1 A 4 I A 16 1_555 F N3 U 27 J U 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 E N6 A 4 I A 16 1_555 F O4 U 27 J U 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 E N3 U 5 I U 17 1_555 F N1 A 26 J A 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 E O4 U 5 I U 17 1_555 F N6 A 26 J A 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 E N1 G 6 I G 18 1_555 F N3 C 25 J C 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 E N2 G 6 I G 18 1_555 F O2 C 25 J C 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 E O6 G 6 I G 18 1_555 F N4 C 25 J C 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 E N3 U 7 I U 19 1_555 F N1 A 24 J A 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 E O4 U 7 I U 19 1_555 F N6 A 24 J A 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-C PAIR' hydrog18 E O6 G 8 I G 20 1_555 F N4 C 23 J C 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 E N1 A 9 I A 21 1_555 F N3 U 22 J U 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 E N6 A 9 I A 21 1_555 F O4 U 22 J U 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog21 E N1 G 10 I G 22 1_555 F O2 U 22 J U 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog22 E O6 G 10 I G 22 1_555 F N3 U 22 J U 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 E N1 A 11 I A 23 1_555 F N3 U 20 J U 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 E N6 A 11 I A 23 1_555 F O4 U 20 J U 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 E N3 U 12 I U 24 1_555 F N1 A 19 J A 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 E O4 U 12 I U 24 1_555 F N6 A 19 J A 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'U-A PAIR' hydrog27 E N3 U 13 I U 25 1_555 F N1 A 18 J A 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 E N1 A 14 I A 26 1_555 F N3 U 17 J U 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 E N6 A 14 I A 26 1_555 F O4 U 17 J U 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 E N1 A 15 I A 27 1_555 F N3 U 16 J U 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 E N6 A 15 I A 27 1_555 F O4 U 16 J U 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 E N1 G 16 I G 28 1_555 F N3 C 15 J C 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 E N2 G 16 I G 28 1_555 F O2 C 15 J C 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 E O6 G 16 I G 28 1_555 F N4 C 15 J C 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'U-A PAIR' hydrog35 E N3 U 17 I U 29 1_555 F N1 A 14 J A 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 E N3 U 18 I U 30 1_555 F N1 A 13 J A 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 E O4 U 18 I U 30 1_555 F N6 A 13 J A 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 E N1 A 19 I A 31 1_555 F N3 U 12 J U 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 E N6 A 19 I A 31 1_555 F O4 U 12 J U 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'U-A PAIR' hydrog40 E N3 U 20 I U 32 1_555 F N1 A 11 J A 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 7ED5 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code G 6 ZN A 1 1001 1001 ZN ZN . H 6 ZN A 1 1002 1002 ZN ZN . I 7 MG A 1 1003 1003 MG MG . J 8 AT9 A 1 1004 1004 AT9 AT9 . K 8 AT9 A 1 1005 1005 AT9 AT9 . L 7 MG A 1 1006 1006 MG MG . M 7 MG A 1 1007 1007 MG MG . N 8 AT9 I 1 101 101 AT9 AT9 . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id L _atom_site.label_entity_id 7 _atom_site.Cartn_x 124.998 _atom_site.Cartn_y 130.456 _atom_site.Cartn_z 125.262 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 77.24 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 1006 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 12 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 24 _model_server_stats.query_time_ms 285 _model_server_stats.encode_time_ms 1 _model_server_stats.element_count 1 #