data_7ELS # _model_server_result.job_id z1a0_VnZVlj7U2XAAqfpLw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-27 19:57:58' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7els # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":101}' # _entry.id 7ELS # _exptl.entry_id 7ELS _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 523.18 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7ELS _cell.length_a 79.721 _cell.length_b 93.052 _cell.length_c 40.052 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7ELS _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 18 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression B,L,M,N,O,P,Q,R,S,U 1 1 A,C,D,E,F,G,H,I,J,K,T 1 2 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 1_457 x-1,y,z+2 1 0 0 0 1 0 0 0 1 -79.721 0 80.104 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 L N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A P G 1 A G 2 1_555 C O3' GTP . A GTP 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.528 ? covale ? covale2 B P G 1 B G 2 1_555 L O3' GTP . B GTP 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.564 ? metalc ? metalc1 A OP1 G 1 A G 2 1_555 I MG MG . A MG 107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.374 ? metalc ? metalc2 A OP1 G 6 A G 7 1_555 D MG MG . A MG 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.891 ? metalc ? metalc3 A OP2 G 6 A G 7 1_555 F MG MG . A MG 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? metalc ? metalc4 A OP1 C 21 A C 22 1_555 O MG MG . B MG 104 1_653 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.551 ? metalc ? metalc5 A OP1 C 32 A C 33 1_555 D MG MG . A MG 102 2_565 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.411 ? metalc ? metalc6 A O5' C 32 A C 33 1_555 D MG MG . A MG 102 2_565 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.981 ? metalc ? metalc7 A OP1 C 33 A C 34 1_555 G MG MG . A MG 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.074 ? metalc ? metalc8 A OP2 C 33 A C 34 1_555 G MG MG . A MG 105 2_565 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.861 ? metalc ? metalc9 A OP1 G 34 A G 35 1_555 G MG MG . A MG 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.835 ? metalc ? metalc10 A O5' G 34 A G 35 1_555 G MG MG . A MG 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.861 ? metalc ? metalc11 A OP1 G 35 A G 36 1_555 G MG MG . A MG 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.518 ? metalc ? metalc12 A OP2 A 37 A A 38 1_555 E MG MG . A MG 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.183 ? metalc ? metalc13 A OP2 C 45 A C 46 1_555 J MG MG . A MG 108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.396 ? metalc ? metalc14 D MG MG . A MG 102 1_555 T O HOH . A HOH 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.093 ? metalc ? metalc15 D MG MG . A MG 102 1_555 T O HOH . A HOH 210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.898 ? metalc ? metalc16 D MG MG . A MG 102 1_555 T O HOH . A HOH 214 2_565 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.937 ? metalc ? metalc17 E MG MG . A MG 103 1_555 T O HOH . A HOH 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.995 ? metalc ? metalc18 E MG MG . A MG 103 1_555 T O HOH . A HOH 211 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.942 ? metalc ? metalc19 E MG MG . A MG 103 1_555 T O HOH . A HOH 213 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? metalc ? metalc20 E MG MG . A MG 103 1_555 T O HOH . A HOH 218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.864 ? metalc ? metalc21 E MG MG . A MG 103 1_555 T O HOH . A HOH 219 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.353 ? metalc ? metalc22 F MG MG . A MG 104 1_555 K O6 AZA . A AZA 109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.241 ? metalc ? metalc23 F MG MG . A MG 104 1_555 T O HOH . A HOH 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.893 ? metalc ? metalc24 F MG MG . A MG 104 1_555 T O HOH . A HOH 206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.238 ? metalc ? metalc25 F MG MG . A MG 104 1_555 T O HOH . A HOH 208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.915 ? metalc ? metalc26 F MG MG . A MG 104 1_555 T O HOH . A HOH 221 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.197 ? metalc ? metalc27 G MG MG . A MG 105 1_555 T O HOH . A HOH 209 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.06 ? metalc ? metalc28 G MG MG . A MG 105 1_555 T O HOH . A HOH 216 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? metalc ? metalc29 H MG MG . A MG 106 1_555 T O HOH . A HOH 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.619 ? metalc ? metalc30 H MG MG . A MG 106 1_555 T O HOH . A HOH 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.533 ? metalc ? metalc31 H MG MG . A MG 106 1_555 T O HOH . A HOH 217 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.148 ? metalc ? metalc32 H MG MG . A MG 106 1_555 T O HOH . A HOH 223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.992 ? metalc ? metalc33 H MG MG . A MG 106 1_555 T O HOH . A HOH 225 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.146 ? metalc ? metalc34 I MG MG . A MG 107 1_556 B OP1 C 10 B C 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.43 ? metalc ? metalc35 J MG MG . A MG 108 1_555 L O1A GTP . B GTP 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.74 ? metalc ? metalc36 J MG MG . A MG 108 1_555 L O2A GTP . B GTP 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? metalc ? metalc37 B OP2 G 1 B G 2 1_555 R MG MG . B MG 107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.904 ? metalc ? metalc38 B OP2 G 6 B G 7 1_555 M MG MG . B MG 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.871 ? metalc ? metalc39 B OP1 C 21 B C 22 1_555 O MG MG . B MG 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.844 ? metalc ? metalc40 B O3' C 33 B C 34 1_555 P MG MG . B MG 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.618 ? metalc ? metalc41 B OP2 A 37 B A 38 1_555 N MG MG . B MG 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.087 ? metalc ? metalc42 M MG MG . B MG 102 1_555 S O6 AZA . B AZA 108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.441 ? metalc ? metalc43 M MG MG . B MG 102 1_555 U O HOH . B HOH 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.136 ? metalc ? metalc44 M MG MG . B MG 102 1_555 U O HOH . B HOH 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.796 ? metalc ? metalc45 M MG MG . B MG 102 1_555 U O HOH . B HOH 207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.469 ? metalc ? metalc46 M MG MG . B MG 102 1_555 U O HOH . B HOH 211 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.796 ? metalc ? metalc47 N MG MG . B MG 103 1_555 U O HOH . B HOH 208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.086 ? metalc ? metalc48 N MG MG . B MG 103 1_555 U O HOH . B HOH 209 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.229 ? metalc ? metalc49 N MG MG . B MG 103 1_555 U O HOH . B HOH 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.884 ? metalc ? metalc50 N MG MG . B MG 103 1_555 U O HOH . B HOH 216 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.525 ? metalc ? metalc51 N MG MG . B MG 103 1_555 U O HOH . B HOH 218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.129 ? metalc ? metalc52 O MG MG . B MG 104 1_555 U O HOH . B HOH 206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 ? metalc ? metalc53 O MG MG . B MG 104 1_555 U O HOH . B HOH 213 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.989 ? metalc ? metalc54 Q MG MG . B MG 106 1_555 U O HOH . B HOH 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.248 ? metalc ? metalc55 Q MG MG . B MG 106 1_555 U O HOH . B HOH 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.13 ? metalc ? metalc56 Q MG MG . B MG 106 1_555 U O HOH . B HOH 217 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.801 ? metalc ? metalc57 Q MG MG . B MG 106 1_555 U O HOH . B HOH 221 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.105 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 A N1 G 1 A G 2 1_555 A N3 C 44 A C 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 A N2 G 1 A G 2 1_555 A O2 C 44 A C 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 A O6 G 1 A G 2 1_555 A N4 C 44 A C 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 A N1 A 2 A A 3 1_555 A N3 U 43 A U 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 A N6 A 2 A A 3 1_555 A O4 U 43 A U 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 A N1 G 3 A G 4 1_555 A N3 C 42 A C 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 A N2 G 3 A G 4 1_555 A O2 C 42 A C 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 A O6 G 3 A G 4 1_555 A N4 C 42 A C 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog9 A N3 U 4 A U 5 1_555 A O6 G 41 A G 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog10 A O2 U 4 A U 5 1_555 A N1 G 41 A G 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 A N1 A 5 A A 6 1_555 A N3 U 40 A U 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 A N6 A 5 A A 6 1_555 A O4 U 40 A U 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-G MISPAIR' hydrog13 A O6 G 6 A G 7 1_555 A N2 G 41 A G 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-U PAIR' hydrog14 A N6 A 8 A A 9 1_555 A O2 U 40 A U 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-U MISPAIR' hydrog15 A N2 G 9 A G 10 1_555 A O2 U 39 A U 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 A N3 C 10 A C 11 1_555 A N1 G 34 A G 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 A N4 C 10 A C 11 1_555 A O6 G 34 A G 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 A O2 C 10 A C 11 1_555 A N2 G 34 A G 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 A N3 U 12 A U 13 1_555 A N1 A 37 A A 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 A O4 U 12 A U 13 1_555 A N6 A 37 A A 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 A N3 U 13 A U 14 1_555 A N1 A 36 A A 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 A O4 U 13 A U 14 1_555 A N6 A 36 A A 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 A N3 C 14 A C 15 1_555 A N1 G 35 A G 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 A N4 C 14 A C 15 1_555 A O6 G 35 A G 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 A O2 C 14 A C 15 1_555 A N2 G 35 A G 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-C MISPAIR' hydrog26 A N6 A 15 A A 16 1_555 A O2 C 32 A C 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 A N1 G 16 A G 17 1_555 A N3 C 31 A C 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 A N2 G 16 A G 17 1_555 A O2 C 31 A C 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 A O6 G 16 A G 17 1_555 A N4 C 31 A C 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 A N3 C 17 A C 18 1_555 A N1 G 30 A G 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 A N4 C 17 A C 18 1_555 A O6 G 30 A G 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 A O2 C 17 A C 18 1_555 A N2 G 30 A G 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 A N1 G 18 A G 19 1_555 A N3 C 29 A C 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 A N2 G 18 A G 19 1_555 A O2 C 29 A C 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 A O6 G 18 A G 19 1_555 A N4 C 29 A C 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 A N1 G 19 A G 20 1_555 A N3 C 28 A C 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 A N2 G 19 A G 20 1_555 A O2 C 28 A C 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 A O6 G 19 A G 20 1_555 A N4 C 28 A C 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 A N3 C 20 A C 21 1_555 A N1 G 27 A G 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 A N4 C 20 A C 21 1_555 A O6 G 27 A G 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 A O2 C 20 A C 21 1_555 A N2 G 27 A G 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 A N3 C 21 A C 22 1_555 A N1 G 26 A G 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 A N4 C 21 A C 22 1_555 A O6 G 26 A G 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 A O2 C 21 A C 22 1_555 A N2 G 26 A G 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-A MISPAIR' hydrog45 A N2 G 22 A G 23 1_555 A N7 A 25 A A 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_10_PAIR hydrog46 A N2 G 34 A G 35 1_555 A N1 A 38 A A 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_10_PAIR hydrog47 A N3 G 34 A G 35 1_555 A N6 A 38 A A 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 B N1 G 1 B G 2 1_555 B N3 C 44 B C 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 B N2 G 1 B G 2 1_555 B O2 C 44 B C 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 B O6 G 1 B G 2 1_555 B N4 C 44 B C 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 B N1 A 2 B A 3 1_555 B N3 U 43 B U 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 B N6 A 2 B A 3 1_555 B O4 U 43 B U 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-C PAIR' hydrog53 B N2 G 3 B G 4 1_555 B O2 C 42 B C 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog54 B N3 U 4 B U 5 1_555 B O6 G 41 B G 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog55 B O2 U 4 B U 5 1_555 B N1 G 41 B G 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog56 B N1 A 5 B A 6 1_555 B N3 U 40 B U 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 B N6 A 5 B A 6 1_555 B O4 U 40 B U 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-G MISPAIR' hydrog58 B O6 G 6 B G 7 1_555 B N2 G 41 B G 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-G MISPAIR' hydrog59 B N6 A 7 B A 8 1_555 B N3 G 41 B G 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-U PAIR' hydrog60 B N6 A 8 B A 9 1_555 B O2 U 40 B U 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-U MISPAIR' hydrog61 B N2 G 9 B G 10 1_555 B O2 U 39 B U 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog62 B N3 C 10 B C 11 1_555 B N1 G 34 B G 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog63 B N4 C 10 B C 11 1_555 B O6 G 34 B G 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog64 B O2 C 10 B C 11 1_555 B N2 G 34 B G 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog65 B N3 U 12 B U 13 1_555 B N1 A 37 B A 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog66 B O4 U 12 B U 13 1_555 B N6 A 37 B A 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog67 B N3 U 13 B U 14 1_555 B N1 A 36 B A 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog68 B O4 U 13 B U 14 1_555 B N6 A 36 B A 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog69 B N3 C 14 B C 15 1_555 B N1 G 35 B G 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog70 B N4 C 14 B C 15 1_555 B O6 G 35 B G 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog71 B O2 C 14 B C 15 1_555 B N2 G 35 B G 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-C MISPAIR' hydrog72 B N6 A 15 B A 16 1_555 B N3 C 32 B C 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog73 B N1 G 16 B G 17 1_555 B N3 C 31 B C 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog74 B N2 G 16 B G 17 1_555 B O2 C 31 B C 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog75 B O6 G 16 B G 17 1_555 B N4 C 31 B C 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog76 B N3 C 17 B C 18 1_555 B N1 G 30 B G 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog77 B N4 C 17 B C 18 1_555 B O6 G 30 B G 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog78 B O2 C 17 B C 18 1_555 B N2 G 30 B G 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog79 B N1 G 18 B G 19 1_555 B N3 C 29 B C 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog80 B N2 G 18 B G 19 1_555 B O2 C 29 B C 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog81 B O6 G 18 B G 19 1_555 B N4 C 29 B C 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog82 B N1 G 19 B G 20 1_555 B N3 C 28 B C 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog83 B N2 G 19 B G 20 1_555 B O2 C 28 B C 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog84 B O6 G 19 B G 20 1_555 B N4 C 28 B C 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog85 B N3 C 20 B C 21 1_555 B N1 G 27 B G 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog86 B N4 C 20 B C 21 1_555 B O6 G 27 B G 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog87 B O2 C 20 B C 21 1_555 B N2 G 27 B G 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog88 B N3 C 21 B C 22 1_555 B N1 G 26 B G 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog89 B N4 C 21 B C 22 1_555 B O6 G 26 B G 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog90 B O2 C 21 B C 22 1_555 B N2 G 26 B G 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-A MISPAIR' hydrog91 B N2 G 22 B G 23 1_555 B N7 A 25 B A 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_10_PAIR hydrog92 B N2 G 34 B G 35 1_555 B N1 A 38 B A 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_10_PAIR hydrog93 B N3 G 34 B G 35 1_555 B N6 A 38 B A 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'C10 H16 N5 O14 P3' _chem_comp.formula_weight 523.18 _chem_comp.id GTP _chem_comp.mon_nstd_flag n _chem_comp.name "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag PG O1G GTP doub 131 n n PG O2G GTP sing 132 n n PG O3G GTP sing 133 n n PG O3B GTP sing 134 n n O2G HOG2 GTP sing 135 n n O3G HOG3 GTP sing 136 n n O3B PB GTP sing 137 n n PB O1B GTP doub 138 n n PB O2B GTP sing 139 n n PB O3A GTP sing 140 n n O2B HOB2 GTP sing 141 n n O3A PA GTP sing 142 n n PA O1A GTP doub 143 n n PA O2A GTP sing 144 n n PA O5' GTP sing 145 n n O2A HOA2 GTP sing 146 n n O5' C5' GTP sing 147 n n C5' C4' GTP sing 148 n n C5' H5' GTP sing 149 n n C5' "H5''" GTP sing 150 n n C4' O4' GTP sing 151 n n C4' C3' GTP sing 152 n n C4' H4' GTP sing 153 n n O4' C1' GTP sing 154 n n C3' O3' GTP sing 155 n n C3' C2' GTP sing 156 n n C3' H3' GTP sing 157 n n O3' HO3' GTP sing 158 n n C2' O2' GTP sing 159 n n C2' C1' GTP sing 160 n n C2' H2' GTP sing 161 n n O2' HO2' GTP sing 162 n n C1' N9 GTP sing 163 n n C1' H1' GTP sing 164 n n N9 C8 GTP sing 165 n y N9 C4 GTP sing 166 n y C8 N7 GTP doub 167 n y C8 H8 GTP sing 168 n n N7 C5 GTP sing 169 n y C5 C6 GTP sing 170 n n C5 C4 GTP doub 171 n y C6 O6 GTP doub 172 n n C6 N1 GTP sing 173 n n N1 C2 GTP sing 174 n n N1 HN1 GTP sing 175 n n C2 N2 GTP sing 176 n n C2 N3 GTP doub 177 n n N2 HN21 GTP sing 178 n n N2 HN22 GTP sing 179 n n N3 C4 GTP sing 180 n n # _atom_sites.entry_id 7ELS _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.012544 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.010747 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.024968 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 GTP A 1 101 1 GTP GTP . D 3 MG A 1 102 1 MG MG . E 3 MG A 1 103 2 MG MG . F 3 MG A 1 104 3 MG MG . G 3 MG A 1 105 4 MG MG . H 3 MG A 1 106 5 MG MG . I 3 MG A 1 107 11 MG MG . J 3 MG A 1 108 12 MG MG . K 4 AZA A 1 109 1 AZA LIG . L 2 GTP B 1 101 1 GTP GTP . M 3 MG B 1 102 6 MG MG . N 3 MG B 1 103 7 MG MG . O 3 MG B 1 104 8 MG MG . P 3 MG B 1 105 9 MG MG . Q 3 MG B 1 106 10 MG MG . R 3 MG B 1 107 13 MG MG . S 4 AZA B 1 108 2 AZA LIG . T 5 HOH A 1 201 9 HOH HOH . T 5 HOH A 2 202 22 HOH HOH . T 5 HOH A 3 203 12 HOH HOH . T 5 HOH A 4 204 2 HOH HOH . T 5 HOH A 5 205 24 HOH HOH . T 5 HOH A 6 206 11 HOH HOH . T 5 HOH A 7 207 44 HOH HOH . T 5 HOH A 8 208 10 HOH HOH . T 5 HOH A 9 209 16 HOH HOH . T 5 HOH A 10 210 8 HOH HOH . T 5 HOH A 11 211 3 HOH HOH . T 5 HOH A 12 212 20 HOH HOH . T 5 HOH A 13 213 5 HOH HOH . T 5 HOH A 14 214 6 HOH HOH . T 5 HOH A 15 215 40 HOH HOH . T 5 HOH A 16 216 14 HOH HOH . T 5 HOH A 17 217 19 HOH HOH . T 5 HOH A 18 218 4 HOH HOH . T 5 HOH A 19 219 1 HOH HOH . T 5 HOH A 20 220 33 HOH HOH . T 5 HOH A 21 221 13 HOH HOH . T 5 HOH A 22 222 32 HOH HOH . T 5 HOH A 23 223 23 HOH HOH . T 5 HOH A 24 224 45 HOH HOH . T 5 HOH A 25 225 21 HOH HOH . U 5 HOH B 1 201 53 HOH HOH . U 5 HOH B 2 202 37 HOH HOH . U 5 HOH B 3 203 34 HOH HOH . U 5 HOH B 4 204 50 HOH HOH . U 5 HOH B 5 205 39 HOH HOH . U 5 HOH B 6 206 30 HOH HOH . U 5 HOH B 7 207 51 HOH HOH . U 5 HOH B 8 208 28 HOH HOH . U 5 HOH B 9 209 29 HOH HOH . U 5 HOH B 10 210 48 HOH HOH . U 5 HOH B 11 211 52 HOH HOH . U 5 HOH B 12 212 46 HOH HOH . U 5 HOH B 13 213 31 HOH HOH . U 5 HOH B 14 214 25 HOH HOH . U 5 HOH B 15 215 47 HOH HOH . U 5 HOH B 16 216 26 HOH HOH . U 5 HOH B 17 217 35 HOH HOH . U 5 HOH B 18 218 27 HOH HOH . U 5 HOH B 19 219 49 HOH HOH . U 5 HOH B 20 220 36 HOH HOH . U 5 HOH B 21 221 38 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 P PG GTP . . . C 2 -21.832 30.698 12.637 1 125.27 ? PG GTP 101 A 1 HETATM 2 O O1G GTP . . . C 2 -20.392 30.259 12.498 1 133.95 ? O1G GTP 101 A 1 HETATM 3 O O2G GTP . . . C 2 -22.736 29.485 12.588 1 116.92 ? O2G GTP 101 A 1 HETATM 4 O O3G GTP . . . C 2 -22.013 31.403 13.965 1 122.69 ? O3G GTP 101 A 1 HETATM 5 O O3B GTP . . . C 2 -22.191 31.7 11.418 1 113.91 ? O3B GTP 101 A 1 HETATM 6 P PB GTP . . . C 2 -21.04 32.326 10.469 1 134.9 ? PB GTP 101 A 1 HETATM 7 O O1B GTP . . . C 2 -21.628 33.313 9.482 1 114.71 ? O1B GTP 101 A 1 HETATM 8 O O2B GTP . . . C 2 -19.974 33.028 11.289 1 128.32 ? O2B GTP 101 A 1 HETATM 9 O O3A GTP . . . C 2 -20.433 31.039 9.685 1 132.82 ? O3A GTP 101 A 1 HETATM 10 P PA GTP . . . C 2 -21.255 29.693 9.283 1 129.2 ? PA GTP 101 A 1 HETATM 11 O O1A GTP . . . C 2 -20.701 29.175 7.972 1 114.93 ? O1A GTP 101 A 1 HETATM 12 O O2A GTP . . . C 2 -21.16 28.598 10.322 1 126.31 ? O2A GTP 101 A 1 HETATM 13 O O5' GTP . . . C 2 -22.794 30.135 9.072 1 105.44 ? O5' GTP 101 A 1 HETATM 14 C C5' GTP . . . C 2 -23.147 30.876 7.924 1 102.86 ? C5' GTP 101 A 1 HETATM 15 C C4' GTP . . . C 2 -24.627 31.252 7.869 1 91.25 ? C4' GTP 101 A 1 HETATM 16 O O4' GTP . . . C 2 -25.215 31.402 9.145 1 83.09 ? O4' GTP 101 A 1 HETATM 17 C C3' GTP . . . C 2 -24.854 32.598 7.2 1 88.25 ? C3' GTP 101 A 1 HETATM 18 O O3' GTP . . . C 2 -24.794 32.531 5.791 1 94.98 ? O3' GTP 101 A 1 HETATM 19 C C2' GTP . . . C 2 -26.23 32.967 7.711 1 80.77 ? C2' GTP 101 A 1 HETATM 20 O O2' GTP . . . C 2 -27.217 32.349 6.924 1 73.58 ? O2' GTP 101 A 1 HETATM 21 C C1' GTP . . . C 2 -26.261 32.359 9.099 1 75.91 ? C1' GTP 101 A 1 HETATM 22 N N9 GTP . . . C 2 -25.982 33.411 10.09 1 72.87 ? N9 GTP 101 A 1 HETATM 23 C C8 GTP . . . C 2 -25.061 33.317 11.102 1 75.46 ? C8 GTP 101 A 1 HETATM 24 N N7 GTP . . . C 2 -25.085 34.464 11.813 1 70.67 ? N7 GTP 101 A 1 HETATM 25 C C5 GTP . . . C 2 -26.014 35.282 11.275 1 64.3 ? C5 GTP 101 A 1 HETATM 26 C C6 GTP . . . C 2 -26.43 36.557 11.623 1 65.9 ? C6 GTP 101 A 1 HETATM 27 O O6 GTP . . . C 2 -25.912 37.122 12.586 1 64.72 ? O6 GTP 101 A 1 HETATM 28 N N1 GTP . . . C 2 -27.421 37.179 10.888 1 66.64 ? N1 GTP 101 A 1 HETATM 29 C C2 GTP . . . C 2 -27.989 36.524 9.812 1 66.1 ? C2 GTP 101 A 1 HETATM 30 N N2 GTP . . . C 2 -28.946 37.12 9.101 1 60.33 ? N2 GTP 101 A 1 HETATM 31 N N3 GTP . . . C 2 -27.564 35.252 9.476 1 63.44 ? N3 GTP 101 A 1 HETATM 32 C C4 GTP . . . C 2 -26.592 34.637 10.194 1 64.43 ? C4 GTP 101 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 10 _model_server_stats.parse_time_ms 31 _model_server_stats.create_model_time_ms 4 _model_server_stats.query_time_ms 435 _model_server_stats.encode_time_ms 14 _model_server_stats.element_count 32 #