data_7JGR # _model_server_result.job_id W9u2hEL7LJvwVNKri15b6w _model_server_result.datetime_utc '2024-10-19 19:21:59' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7jgr # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"Q","auth_seq_id":902}' # _entry.id 7JGR # _exptl.entry_id 7JGR _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 11 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7JGR _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7JGR _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details nonameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 9 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 11 K N N ? 11 M N N ? 11 O N N ? 11 Q N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 C OG1 THR 66 D THR 63 1_555 K MG MG . D MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.114 ? metalc ? metalc2 J O1G ATP . D ATP 901 1_555 K MG MG . D MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.756 ? metalc ? metalc3 J O2B ATP . D ATP 901 1_555 K MG MG . D MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.178 ? metalc ? metalc4 D OG1 THR 48 E THR 48 1_555 M MG MG . E MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.236 ? metalc ? metalc5 D OD2 ASP 126 E ASP 126 1_555 M MG MG . E MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.865 ? metalc ? metalc6 L O3G ATP . E ATP 901 1_555 M MG MG . E MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.139 ? metalc ? metalc7 L O2B ATP . E ATP 901 1_555 M MG MG . E MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? metalc ? metalc8 F OG1 THR 169 A THR 605 1_555 O MG MG . A MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.166 ? metalc ? metalc9 N O3G ATP . A ATP 1001 1_555 O MG MG . A MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.164 ? metalc ? metalc10 N O2B ATP . A ATP 1001 1_555 O MG MG . A MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.199 ? metalc ? metalc11 G OG1 THR 66 G THR 304 1_555 Q MG MG . G MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.089 ? metalc ? metalc12 P O3G ATP . G ATP 901 1_555 Q MG MG . G MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.161 ? metalc ? metalc13 P O2B ATP . G ATP 901 1_555 Q MG MG . G MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.128 ? hydrog 'DA-DT PAIR' hydrog1 H N1 DA 24 H DA 1 1_555 I N3 DT 61 I DT 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 H N1 DG 25 H DG 2 1_555 I N3 DC 60 I DC 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 H N2 DG 25 H DG 2 1_555 I O2 DC 60 I DC 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 H O6 DG 25 H DG 2 1_555 I N4 DC 60 I DC 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 H N1 DA 26 H DA 3 1_555 I N3 DT 59 I DT 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 H N6 DA 26 H DA 3 1_555 I O4 DT 59 I DT 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 H N3 DT 27 H DT 4 1_555 I N1 DA 58 I DA 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 H O4 DT 27 H DT 4 1_555 I N6 DA 58 I DA 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 H N3 DT 28 H DT 5 1_555 I N1 DA 57 I DA 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 H O4 DT 28 H DT 5 1_555 I N6 DA 57 I DA 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 H N3 DT 29 H DT 6 1_555 I N1 DA 56 I DA 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 H O4 DT 29 H DT 6 1_555 I N6 DA 56 I DA 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 H N3 DT 30 H DT 7 1_555 I N1 DA 55 I DA 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 H O4 DT 30 H DT 7 1_555 I N6 DA 55 I DA 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 H N1 DA 31 H DA 8 1_555 I N3 DT 54 I DT 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 H N6 DA 31 H DA 8 1_555 I O4 DT 54 I DT 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 H N3 DT 32 H DT 9 1_555 I N1 DA 53 I DA 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 H O4 DT 32 H DT 9 1_555 I N6 DA 53 I DA 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 H N1 DG 33 H DG 10 1_555 I N3 DC 52 I DC 59 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 H N2 DG 33 H DG 10 1_555 I O2 DC 52 I DC 59 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 H O6 DG 33 H DG 10 1_555 I N4 DC 52 I DC 59 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 H N3 DT 34 H DT 11 1_555 I N1 DA 51 I DA 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 H O4 DT 34 H DT 11 1_555 I N6 DA 51 I DA 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 H N3 DT 35 H DT 12 1_555 I N1 DA 50 I DA 57 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 H O4 DT 35 H DT 12 1_555 I N6 DA 50 I DA 57 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 H N3 DT 36 H DT 13 1_555 I N1 DA 49 I DA 56 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 H O4 DT 36 H DT 13 1_555 I N6 DA 49 I DA 56 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 H N1 DA 37 H DA 14 1_555 I N3 DT 48 I DT 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 H N6 DA 37 H DA 14 1_555 I O4 DT 48 I DT 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 H N1 DG 38 H DG 15 1_555 I N3 DC 47 I DC 54 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 H N2 DG 38 H DG 15 1_555 I O2 DC 47 I DC 54 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 H O6 DG 38 H DG 15 1_555 I N4 DC 47 I DC 54 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 H N1 DA 39 H DA 16 1_555 I N3 DT 46 I DT 53 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 H N6 DA 39 H DA 16 1_555 I O4 DT 46 I DT 53 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 H N3 DT 40 H DT 17 1_555 I N1 DA 45 I DA 52 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 H O4 DT 40 H DT 17 1_555 I N6 DA 45 I DA 52 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED WATSON-CRICK' hydrog37 H N3 DC 41 H DC 18 1_555 I N2 DG 44 I DG 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED WATSON-CRICK' hydrog38 H O2 DC 41 H DC 18 1_555 I N1 DG 44 I DG 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DT-DA PAIR' hydrog39 H O4 DT 42 H DT 19 1_555 I N6 DA 43 I DA 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 H N3 DT 43 H DT 20 1_555 I N1 DA 42 I DA 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 H O4 DT 43 H DT 20 1_555 I N6 DA 42 I DA 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 H N3 DT 44 H DT 21 1_555 I N1 DA 41 I DA 48 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 H O4 DT 44 H DT 21 1_555 I N6 DA 41 I DA 48 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 H N3 DT 45 H DT 22 1_555 I N1 DA 40 I DA 47 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 H O4 DT 45 H DT 22 1_555 I N6 DA 40 I DA 47 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 H N1 DA 46 H DA 23 1_555 I N3 DT 39 I DT 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 H N6 DA 46 H DA 23 1_555 I O4 DT 39 I DT 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 H N3 DT 47 H DT 24 1_555 I N1 DA 38 I DA 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 H O4 DT 47 H DT 24 1_555 I N6 DA 38 I DA 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DC PAIR' hydrog50 H N2 DG 48 H DG 25 1_555 I O2 DC 37 I DC 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 H N3 DC 49 H DC 26 1_555 I N1 DG 36 I DG 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 H N4 DC 49 H DC 26 1_555 I O6 DG 36 I DG 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 H O2 DC 49 H DC 26 1_555 I N2 DG 36 I DG 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 H N3 DT 50 H DT 27 1_555 I N1 DA 35 I DA 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog55 H O4 DT 50 H DT 27 1_555 I N6 DA 35 I DA 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog56 H N3 DT 51 H DT 28 1_555 I N1 DA 34 I DA 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 H O4 DT 51 H DT 28 1_555 I N6 DA 34 I DA 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog58 H N1 DG 52 H DG 29 1_555 I N3 DC 33 I DC 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog59 H N2 DG 52 H DG 29 1_555 I O2 DC 33 I DC 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog60 H O6 DG 52 H DG 29 1_555 I N4 DC 33 I DC 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog61 H N3 DC 53 H DC 30 1_555 I N1 DG 32 I DG 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog62 H N4 DC 53 H DC 30 1_555 I O6 DG 32 I DG 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog63 H O2 DC 53 H DC 30 1_555 I N2 DG 32 I DG 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog64 H N3 DT 54 H DT 31 1_555 I N1 DA 31 I DA 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog65 H O4 DT 54 H DT 31 1_555 I N6 DA 31 I DA 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog66 H N3 DT 55 H DT 32 1_555 I N1 DA 30 I DA 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog67 H O4 DT 55 H DT 32 1_555 I N6 DA 30 I DA 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DT-DA PAIR' hydrog68 H O4 DT 56 H DT 33 1_555 I N6 DA 29 I DA 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog69 H N3 DT 57 H DT 34 1_555 I N1 DA 28 I DA 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog70 H O4 DT 57 H DT 34 1_555 I N6 DA 28 I DA 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 7JGR _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code J 10 ATP D 1 901 901 ATP ATP . K 11 MG D 1 902 902 MG MG . L 10 ATP E 1 901 901 ATP ATP . M 11 MG E 1 902 902 MG MG . N 10 ATP A 1 1001 1001 ATP ATP . O 11 MG A 1 1002 1002 MG MG . P 10 ATP G 1 901 901 ATP ATP . Q 11 MG G 1 902 902 MG MG . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id Q _atom_site.label_entity_id 11 _atom_site.Cartn_x 104.609 _atom_site.Cartn_y 140.038 _atom_site.Cartn_z 161.572 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 144.3 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 902 _atom_site.auth_asym_id G _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 80 _model_server_stats.parse_time_ms 11 _model_server_stats.create_model_time_ms 114 _model_server_stats.query_time_ms 520 _model_server_stats.encode_time_ms 13 _model_server_stats.element_count 1 #