data_7JKU # _model_server_result.job_id el92aHVnfdUULmGpzYMzuA _model_server_result.datetime_utc '2025-01-10 22:31:03' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7jku # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":104}' # _entry.id 7JKU # _exptl.entry_id 7JKU _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 39.098 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'POTASSIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7JKU _cell.length_a 32.042 _cell.length_b 39.11 _cell.length_c 59.02 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7JKU _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 18 _symmetry.space_group_name_Hall 'P 2 2ab (z,x,y)' _symmetry.space_group_name_H-M 'P 2 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 B N N ? 2 C N N ? 2 D N N ? 2 E N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A O6 DG 4 A DG 4 1_555 B K K . A K 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.795 ? metalc ? metalc2 A O6 DG 4 A DG 4 1_555 B K K . A K 101 2_545 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.795 ? metalc ? metalc3 A O6 DG 4 A DG 4 1_555 C K K . A K 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.603 ? metalc ? metalc4 A O6 DG 5 A DG 5 1_555 C K K . A K 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.652 ? metalc ? metalc5 A O6 DG 5 A DG 5 1_555 D K K . A K 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.649 ? metalc ? metalc6 A O6 DG 6 A DG 6 1_555 D K K . A K 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.647 ? metalc ? metalc7 A O6 DG 6 A DG 6 1_555 E K K . A K 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.906 ? metalc ? metalc8 A O6 DG 7 A DG 7 1_555 E K K . A K 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.656 ? metalc ? metalc9 A O6 DG 10 A DG 10 1_555 B K K . A K 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.738 ? metalc ? metalc10 A O6 DG 10 A DG 10 1_555 B K K . A K 101 2_545 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.738 ? metalc ? metalc11 A O6 DG 10 A DG 10 1_555 C K K . A K 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.639 ? metalc ? metalc12 A O6 DG 11 A DG 11 1_555 C K K . A K 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.756 ? metalc ? metalc13 A O6 DG 11 A DG 11 1_555 D K K . A K 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.677 ? metalc ? metalc14 A O6 DG 12 A DG 12 1_555 D K K . A K 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.705 ? metalc ? metalc15 A O6 DG 12 A DG 12 1_555 E K K . A K 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.913 ? metalc ? metalc16 A O6 DG 13 A DG 13 1_555 E K K . A K 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.604 ? metalc ? metalc17 A O6 DG 16 A DG 16 1_555 B K K . A K 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.699 ? metalc ? metalc18 A O6 DG 16 A DG 16 1_555 B K K . A K 101 2_545 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.699 ? metalc ? metalc19 A O6 DG 16 A DG 16 1_555 C K K . A K 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.881 ? metalc ? metalc20 A O6 DG 17 A DG 17 1_555 C K K . A K 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.776 ? metalc ? metalc21 A O6 DG 17 A DG 17 1_555 D K K . A K 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.732 ? metalc ? metalc22 A O6 DG 18 A DG 18 1_555 D K K . A K 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.645 ? metalc ? metalc23 A O6 DG 18 A DG 18 1_555 E K K . A K 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.92 ? metalc ? metalc24 A O6 DG 19 A DG 19 1_555 E K K . A K 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.64 ? metalc ? metalc25 A O6 DG 22 A DG 22 1_555 B K K . A K 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.609 ? metalc ? metalc26 A O6 DG 22 A DG 22 1_555 B K K . A K 101 2_545 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.609 ? metalc ? metalc27 A O6 DG 22 A DG 22 1_555 C K K . A K 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.742 ? metalc ? metalc28 A O6 DG 23 A DG 23 1_555 C K K . A K 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.707 ? metalc ? metalc29 A O6 DG 23 A DG 23 1_555 D K K . A K 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.768 ? metalc ? metalc30 A O6 DG 24 A DG 24 1_555 D K K . A K 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.733 ? metalc ? metalc31 A O6 DG 24 A DG 24 1_555 E K K . A K 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.949 ? metalc ? metalc32 A O6 DG 25 A DG 25 1_555 E K K . A K 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.652 ? metalc ? metalc33 E K K . A K 104 1_555 F O HOH . A HOH 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.191 ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog1 A N1 DG 4 A DG 4 1_555 A O6 DG 10 A DG 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog2 A N2 DG 4 A DG 4 1_555 A N7 DG 10 A DG 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog3 A N7 DG 4 A DG 4 1_555 A N2 DG 22 A DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog4 A O6 DG 4 A DG 4 1_555 A N1 DG 22 A DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog5 A N1 DG 5 A DG 5 1_555 A O6 DG 11 A DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog6 A N2 DG 5 A DG 5 1_555 A N7 DG 11 A DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog7 A N7 DG 5 A DG 5 1_555 A N2 DG 23 A DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog8 A O6 DG 5 A DG 5 1_555 A N1 DG 23 A DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DT MISPAIR' hydrog9 A N2 DG 6 A DG 6 1_555 A O4 DT 9 A DT 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog10 A N1 DG 6 A DG 6 1_555 A O6 DG 12 A DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog11 A N2 DG 6 A DG 6 1_555 A N7 DG 12 A DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog12 A N7 DG 6 A DG 6 1_555 A N2 DG 24 A DG 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog13 A O6 DG 6 A DG 6 1_555 A N1 DG 24 A DG 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog14 A N1 DG 7 A DG 7 1_555 A O6 DG 13 A DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog15 A N2 DG 7 A DG 7 1_555 A N7 DG 13 A DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog16 A N7 DG 7 A DG 7 1_555 A N2 DG 25 A DG 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog17 A O6 DG 7 A DG 7 1_555 A N1 DG 25 A DG 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog18 A N1 DG 10 A DG 10 1_555 A O6 DG 16 A DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog19 A N2 DG 10 A DG 10 1_555 A N7 DG 16 A DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog20 A N1 DG 11 A DG 11 1_555 A O6 DG 17 A DG 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog21 A N2 DG 11 A DG 11 1_555 A N7 DG 17 A DG 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog22 A N1 DG 12 A DG 12 1_555 A O6 DG 18 A DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog23 A N2 DG 12 A DG 12 1_555 A N7 DG 18 A DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog24 A N1 DG 13 A DG 13 1_555 A O6 DG 19 A DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog25 A N2 DG 13 A DG 13 1_555 A N7 DG 19 A DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog26 A N1 DG 16 A DG 16 1_555 A O6 DG 22 A DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog27 A N2 DG 16 A DG 16 1_555 A N7 DG 22 A DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DT MISPAIR' hydrog28 A N2 DG 17 A DG 17 1_555 A O2 DT 21 A DT 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog29 A N1 DG 17 A DG 17 1_555 A O6 DG 23 A DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog30 A N2 DG 17 A DG 17 1_555 A N7 DG 23 A DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DT MISPAIR' hydrog31 A N3 DG 18 A DG 18 1_555 A N3 DT 21 A DT 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog32 A N1 DG 18 A DG 18 1_555 A O6 DG 24 A DG 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog33 A N2 DG 18 A DG 18 1_555 A N7 DG 24 A DG 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog34 A N1 DG 19 A DG 19 1_555 A O6 DG 25 A DG 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog35 A N2 DG 19 A DG 19 1_555 A N7 DG 25 A DG 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'K 1' _chem_comp.formula_weight 39.098 _chem_comp.id K _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'POTASSIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 7JKU _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.031209 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.025569 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.016943 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 K A 1 101 1 K K . C 2 K A 1 102 2 K K . D 2 K A 1 103 3 K K . E 2 K A 1 104 4 K K . F 3 HOH A 1 201 41 HOH HOH . F 3 HOH A 2 202 44 HOH HOH . F 3 HOH A 3 203 31 HOH HOH . F 3 HOH A 4 204 61 HOH HOH . F 3 HOH A 5 205 34 HOH HOH . F 3 HOH A 6 206 27 HOH HOH . F 3 HOH A 7 207 66 HOH HOH . F 3 HOH A 8 208 36 HOH HOH . F 3 HOH A 9 209 40 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol K _atom_site.label_atom_id K _atom_site.label_comp_id K _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id E _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x -4.793 _atom_site.Cartn_y -13.773 _atom_site.Cartn_z 7.84 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 77.44 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id K _atom_site.auth_comp_id K _atom_site.auth_seq_id 104 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 10 _model_server_stats.parse_time_ms 12 _model_server_stats.create_model_time_ms 5 _model_server_stats.query_time_ms 324 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #