data_7JL2 # _model_server_result.job_id 0Dug7xmfzd9P0bj7eOCxRw _model_server_result.datetime_utc '2025-07-09 14:01:43' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7jl2 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"R","auth_seq_id":1102}' # _entry.id 7JL2 # _exptl.entry_id 7JL2 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 427.201 _entity.id 6 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" _entity.pdbx_number_of_molecules 3 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7JL2 _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7JL2 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 8 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 6 J N N ? 6 N N N ? 6 R N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 C SG CYS 621 A CYS 907 1_555 I ZN ZN . A ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.338 ? metalc ? metalc2 C SG CYS 624 A CYS 910 1_555 I ZN ZN . A ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? metalc ? metalc3 C SG CYS 676 A CYS 962 1_555 I ZN ZN . A ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? metalc ? metalc4 C SG CYS 678 A CYS 964 1_555 I ZN ZN . A ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.333 ? metalc ? metalc5 J O1B ADP . A ADP 1102 1_555 L MG MG . A MG 1104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.939 ? metalc ? metalc6 E SG CYS 621 C CYS 907 1_555 M ZN ZN . C ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.337 ? metalc ? metalc7 E SG CYS 624 C CYS 910 1_555 M ZN ZN . C ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? metalc ? metalc8 E SG CYS 676 C CYS 962 1_555 M ZN ZN . C ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? metalc ? metalc9 E SG CYS 678 C CYS 964 1_555 M ZN ZN . C ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? metalc ? metalc10 N O1B ADP . C ADP 1102 1_555 P MG MG . C MG 1104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.939 ? metalc ? metalc11 G SG CYS 621 E CYS 907 1_555 Q ZN ZN . E ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.337 ? metalc ? metalc12 G SG CYS 624 E CYS 910 1_555 Q ZN ZN . E ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? metalc ? metalc13 G SG CYS 676 E CYS 962 1_555 Q ZN ZN . E ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? metalc ? metalc14 G SG CYS 678 E CYS 964 1_555 Q ZN ZN . E ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? metalc ? metalc15 R O1B ADP . E ADP 1102 1_555 T MG MG . E MG 1104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.939 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 A N1 G 1 X G 1 1_555 B N3 C 44 Y C 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 A N2 G 1 X G 1 1_555 B O2 C 44 Y C 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 A O6 G 1 X G 1 1_555 B N4 C 44 Y C 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 A N3 C 3 X C 3 1_555 B N1 G 42 Y G 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 A N4 C 3 X C 3 1_555 B O6 G 42 Y G 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 A O2 C 3 X C 3 1_555 B N2 G 42 Y G 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 A N3 U 4 X U 4 1_555 B N1 A 41 Y A 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 A O4 U 4 X U 4 1_555 B N6 A 41 Y A 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 A N1 G 5 X G 5 1_555 B N3 C 40 Y C 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 A N2 G 5 X G 5 1_555 B O2 C 40 Y C 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 A O6 G 5 X G 5 1_555 B N4 C 40 Y C 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 A N1 A 6 X A 6 1_555 B N3 U 39 Y U 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 A N6 A 6 X A 6 1_555 B O4 U 39 Y U 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 A N3 C 7 X C 7 1_555 B N1 G 38 Y G 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 A N4 C 7 X C 7 1_555 B O6 G 38 Y G 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 A O2 C 7 X C 7 1_555 B N2 G 38 Y G 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 A N3 U 8 X U 8 1_555 B N1 A 37 Y A 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 A O4 U 8 X U 8 1_555 B N6 A 37 Y A 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-C PAIR' hydrog19 A O6 G 9 X G 9 1_555 B N4 C 36 Y C 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-U PAIR' hydrog20 A N6 A 10 X A 10 1_555 B O4 U 35 Y U 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 A N3 C 11 X C 11 1_555 B N1 G 34 Y G 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 A N4 C 11 X C 11 1_555 B O6 G 34 Y G 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 A O2 C 11 X C 11 1_555 B N2 G 34 Y G 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 A N3 U 12 X U 12 1_555 B N1 A 33 Y A 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 A O4 U 12 X U 12 1_555 B N6 A 33 Y A 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 A N1 G 13 X G 13 1_555 B N3 C 32 Y C 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 A N2 G 13 X G 13 1_555 B O2 C 32 Y C 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 A O6 G 13 X G 13 1_555 B N4 C 32 Y C 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-C PAIR' hydrog29 A O6 G 16 X G 16 1_555 B N4 C 29 Y C 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 A N3 C 18 X C 18 1_555 B N1 G 27 Y G 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 A N4 C 18 X C 18 1_555 B O6 G 27 Y G 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 A O2 C 18 X C 18 1_555 B N2 G 27 Y G 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'U-A PAIR' hydrog33 A O4 U 19 X U 19 1_555 B N6 A 26 Y A 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 A N1 G 20 X G 20 1_555 B N3 C 25 Y C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 A N2 G 20 X G 20 1_555 B O2 C 25 Y C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 A O6 G 20 X G 20 1_555 B N4 C 25 Y C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 A N1 A 21 X A 21 1_555 B N3 U 24 Y U 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 A N6 A 21 X A 21 1_555 B O4 U 24 Y U 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'C-G PAIR' hydrog39 A N4 C 22 X C 22 1_555 B O6 G 23 Y G 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 A N3 U 23 X U 23 1_555 B N1 A 22 Y A 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 A O4 U 23 X U 23 1_555 B N6 A 22 Y A 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 A N1 G 24 X G 24 1_555 B N3 C 21 Y C 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 A N2 G 24 X G 24 1_555 B O2 C 21 Y C 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 A O6 G 24 X G 24 1_555 B N4 C 21 Y C 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 A N1 A 25 X A 25 1_555 B N3 U 20 Y U 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 A N6 A 25 X A 25 1_555 B O4 U 20 Y U 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 A N3 C 26 X C 26 1_555 B N1 G 19 Y G 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 A N4 C 26 X C 26 1_555 B O6 G 19 Y G 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 A O2 C 26 X C 26 1_555 B N2 G 19 Y G 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 A N3 U 27 X U 27 1_555 B N1 A 18 Y A 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 A O4 U 27 X U 27 1_555 B N6 A 18 Y A 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 A N1 G 28 X G 28 1_555 B N3 C 17 Y C 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 A N2 G 28 X G 28 1_555 B O2 C 17 Y C 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 A O6 G 28 X G 28 1_555 B N4 C 17 Y C 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog55 A N1 G 31 X G 31 1_555 B N3 C 14 Y C 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog56 A N2 G 31 X G 31 1_555 B O2 C 14 Y C 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 A O6 G 31 X G 31 1_555 B N4 C 14 Y C 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog58 A N1 A 32 X A 32 1_555 B N3 U 13 Y U 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog59 A N6 A 32 X A 32 1_555 B O4 U 13 Y U 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog60 A N3 C 33 X C 33 1_555 B N1 G 12 Y G 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog61 A N4 C 33 X C 33 1_555 B O6 G 12 Y G 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog62 A O2 C 33 X C 33 1_555 B N2 G 12 Y G 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog63 A N3 U 34 X U 34 1_555 B N1 A 11 Y A 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog64 A O4 U 34 X U 34 1_555 B N6 A 11 Y A 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog65 A N1 G 35 X G 35 1_555 B N3 C 10 Y C 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog66 A N2 G 35 X G 35 1_555 B O2 C 10 Y C 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog67 A O6 G 35 X G 35 1_555 B N4 C 10 Y C 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog68 A N1 A 36 X A 36 1_555 B N3 U 9 Y U 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog69 A N6 A 36 X A 36 1_555 B O4 U 9 Y U 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog70 A N3 C 37 X C 37 1_555 B N1 G 8 Y G 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog71 A N4 C 37 X C 37 1_555 B O6 G 8 Y G 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog72 A O2 C 37 X C 37 1_555 B N2 G 8 Y G 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog73 A N3 U 38 X U 38 1_555 B N1 A 7 Y A 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog74 A O4 U 38 X U 38 1_555 B N6 A 7 Y A 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog75 A N1 G 39 X G 39 1_555 B N3 C 6 Y C 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog76 A N2 G 39 X G 39 1_555 B O2 C 6 Y C 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog77 A O6 G 39 X G 39 1_555 B N4 C 6 Y C 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog78 A N1 A 40 X A 40 1_555 B N3 U 5 Y U 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog79 A N6 A 40 X A 40 1_555 B O4 U 5 Y U 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog80 A N3 C 41 X C 41 1_555 B N1 G 4 Y G 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog81 A N4 C 41 X C 41 1_555 B O6 G 4 Y G 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog82 A O2 C 41 X C 41 1_555 B N2 G 4 Y G 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog83 A N3 U 42 X U 42 1_555 B N1 A 3 Y A 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog84 A O4 U 42 X U 42 1_555 B N6 A 3 Y A 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog85 A N1 G 43 X G 43 1_555 B N3 C 2 Y C 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog86 A N2 G 43 X G 43 1_555 B O2 C 2 Y C 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog87 A O6 G 43 X G 43 1_555 B N4 C 2 Y C 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog88 A N1 A 44 X A 44 1_555 B N3 U 1 Y U 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog89 A N6 A 44 X A 44 1_555 B O4 U 1 Y U 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'C10 H15 N5 O10 P2' _chem_comp.formula_weight 427.201 _chem_comp.id ADP _chem_comp.mon_nstd_flag n _chem_comp.name "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag PB O1B ADP doub 40 n n PB O2B ADP sing 41 n n PB O3B ADP sing 42 n n PB O3A ADP sing 43 n n O2B HOB2 ADP sing 44 n n O3B HOB3 ADP sing 45 n n PA O1A ADP doub 46 n n PA O2A ADP sing 47 n n PA O3A ADP sing 48 n n PA O5' ADP sing 49 n n O2A HOA2 ADP sing 50 n n O5' C5' ADP sing 51 n n C5' C4' ADP sing 52 n n C5' "H5'1" ADP sing 53 n n C5' "H5'2" ADP sing 54 n n C4' O4' ADP sing 55 n n C4' C3' ADP sing 56 n n C4' H4' ADP sing 57 n n O4' C1' ADP sing 58 n n C3' O3' ADP sing 59 n n C3' C2' ADP sing 60 n n C3' H3' ADP sing 61 n n O3' HO3' ADP sing 62 n n C2' O2' ADP sing 63 n n C2' C1' ADP sing 64 n n C2' H2' ADP sing 65 n n O2' HO2' ADP sing 66 n n C1' N9 ADP sing 67 n n C1' H1' ADP sing 68 n n N9 C8 ADP sing 69 n y N9 C4 ADP sing 70 n y C8 N7 ADP doub 71 n y C8 H8 ADP sing 72 n n N7 C5 ADP sing 73 n y C5 C6 ADP sing 74 n y C5 C4 ADP doub 75 n y C6 N6 ADP sing 76 n n C6 N1 ADP doub 77 n y N6 HN61 ADP sing 78 n n N6 HN62 ADP sing 79 n n N1 C2 ADP sing 80 n y C2 N3 ADP doub 81 n y C2 H2 ADP sing 82 n n N3 C4 ADP sing 83 n y # _atom_sites.entry_id 7JL2 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code I 5 ZN A 1 1101 1102 ZN ZN . J 6 ADP A 1 1102 2001 ADP ADP . K 7 ALF A 1 1103 2002 ALF ALF . L 8 MG A 1 1104 2003 MG MG . M 5 ZN C 1 1101 1102 ZN ZN . N 6 ADP C 1 1102 2001 ADP ADP . O 7 ALF C 1 1103 2002 ALF ALF . P 8 MG C 1 1104 2003 MG MG . Q 5 ZN E 1 1101 1102 ZN ZN . R 6 ADP E 1 1102 2001 ADP ADP . S 7 ALF E 1 1103 2002 ALF ALF . T 8 MG E 1 1104 2003 MG MG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 P PB ADP . . . R 6 154.213 150.176 94.702 1 76.19 ? PB ADP 1102 E 1 HETATM 2 O O1B ADP . . . R 6 153.649 148.941 94.059 1 76.19 ? O1B ADP 1102 E 1 HETATM 3 O O2B ADP . . . R 6 153.297 150.834 95.699 1 76.19 ? O2B ADP 1102 E 1 HETATM 4 O O3B ADP . . . R 6 155.645 150.063 95.152 1 76.19 ? O3B ADP 1102 E 1 HETATM 5 P PA ADP . . . R 6 155.082 150.838 92.186 1 76.19 ? PA ADP 1102 E 1 HETATM 6 O O1A ADP . . . R 6 154.114 150.648 91.053 1 76.19 ? O1A ADP 1102 E 1 HETATM 7 O O2A ADP . . . R 6 156.013 149.721 92.554 1 76.19 ? O2A ADP 1102 E 1 HETATM 8 O O3A ADP . . . R 6 154.272 151.224 93.503 1 76.19 ? O3A ADP 1102 E 1 HETATM 9 O O5' ADP . . . R 6 155.884 152.21 92.003 1 76.19 ? O5' ADP 1102 E 1 HETATM 10 C C5' ADP . . . R 6 156.543 152.553 90.793 1 76.19 ? C5' ADP 1102 E 1 HETATM 11 C C4' ADP . . . R 6 157.024 153.991 90.936 1 76.19 ? C4' ADP 1102 E 1 HETATM 12 O O4' ADP . . . R 6 158.11 154.087 91.86 1 76.19 ? O4' ADP 1102 E 1 HETATM 13 C C3' ADP . . . R 6 157.534 154.565 89.631 1 76.19 ? C3' ADP 1102 E 1 HETATM 14 O O3' ADP . . . R 6 156.52 155.378 89.044 1 76.19 ? O3' ADP 1102 E 1 HETATM 15 C C2' ADP . . . R 6 158.717 155.423 90.012 1 76.19 ? C2' ADP 1102 E 1 HETATM 16 O O2' ADP . . . R 6 158.385 156.802 89.85 1 76.19 ? O2' ADP 1102 E 1 HETATM 17 C C1' ADP . . . R 6 158.985 155.15 91.48 1 76.19 ? C1' ADP 1102 E 1 HETATM 18 N N9 ADP . . . R 6 160.388 154.718 91.658 1 76.19 ? N9 ADP 1102 E 1 HETATM 19 C C8 ADP . . . R 6 160.782 153.62 92.32 1 76.19 ? C8 ADP 1102 E 1 HETATM 20 N N7 ADP . . . R 6 162.131 153.501 92.315 1 76.19 ? N7 ADP 1102 E 1 HETATM 21 C C5 ADP . . . R 6 162.62 154.549 91.635 1 76.19 ? C5 ADP 1102 E 1 HETATM 22 C C6 ADP . . . R 6 163.964 155.033 91.254 1 76.19 ? C6 ADP 1102 E 1 HETATM 23 N N6 ADP . . . R 6 165.075 154.35 91.612 1 76.19 ? N6 ADP 1102 E 1 HETATM 24 N N1 ADP . . . R 6 164.044 156.177 90.544 1 76.19 ? N1 ADP 1102 E 1 HETATM 25 C C2 ADP . . . R 6 162.945 156.862 90.185 1 76.19 ? C2 ADP 1102 E 1 HETATM 26 N N3 ADP . . . R 6 161.696 156.481 90.496 1 76.19 ? N3 ADP 1102 E 1 HETATM 27 C C4 ADP . . . R 6 161.469 155.355 91.21 1 76.19 ? C4 ADP 1102 E 1 # _model_server_stats.io_time_ms 24 _model_server_stats.parse_time_ms 11 _model_server_stats.create_model_time_ms 34 _model_server_stats.query_time_ms 239 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 27 #