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_model_server_result.datetime_utc      '2024-12-23 10:35:26' 
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_model_server_result.query_name        ligand 
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_model_server_result.entry_id          7k1d 
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_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"J","auth_seq_id":1102}' 
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_entry.id    7K1D 
#
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_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
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_entity.details                     ? 
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_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            (3R)-3-{4-[(3R)-4-(3,4-difluorobenzene-1-carbonyl)morpholin-3-yl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}-N-hydroxy-4-(naphthalen-2-yl)butanamide 
_entity.pdbx_number_of_molecules    2 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
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_cell.length_c            90.468 
_cell.Z_PDB               12 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
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_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        170 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 65' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    dimeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      2 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 D N N 
? 3 J N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A NE2 HIS 79 A HIS 108 1_555 C ZN ZN . A ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.227 ? 
metalc ? metalc2 A NE2 HIS 83 A HIS 112 1_555 C ZN ZN . A ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.289 ? 
metalc ? metalc3 A OE1 GLU 160 A GLU 189 1_555 C ZN ZN . A ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.178 ? 
metalc ? metalc4 C ZN ZN . A ZN 1101 1_555 D O38 VQD . A VQD 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.097 ? 
metalc ? metalc5 B NE2 HIS 79 B HIS 108 1_555 I ZN ZN . B ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.223 ? 
metalc ? metalc6 B NE2 HIS 83 B HIS 112 1_555 I ZN ZN . B ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.237 ? 
metalc ? metalc7 B OE1 GLU 160 B GLU 189 1_555 I ZN ZN . B ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
metalc ? metalc8 I ZN ZN . B ZN 1101 1_555 J O01 VQD . B VQD 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.676 ? 
metalc ? metalc9 I ZN ZN . B ZN 1101 1_555 J O38 VQD . B VQD 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.062 ? 
#
_chem_comp.formula           'C27 H25 F2 N5 O4' 
_chem_comp.formula_weight    521.515 
_chem_comp.id                VQD 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              (3R)-3-{4-[(3R)-4-(3,4-difluorobenzene-1-carbonyl)morpholin-3-yl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}-N-hydroxy-4-(naphthalen-2-yl)butanamide 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
F31 C30 VQD sing 421 n n 
C30 C29 VQD doub 422 n y 
C30 C32 VQD sing 423 n y 
C29 C28 VQD sing 424 n y 
F33 C32 VQD sing 425 n n 
C32 C34 VQD doub 426 n y 
C28 C27 VQD doub 427 n y 
C34 C27 VQD sing 428 n y 
C27 C26 VQD sing 429 n n 
C26 O35 VQD doub 430 n n 
C26 N25 VQD sing 431 n n 
C23 C24 VQD sing 432 n n 
C23 O22 VQD sing 433 n n 
C24 N25 VQD sing 434 n n 
C11 C10 VQD doub 435 n y 
C11 C12 VQD sing 436 n y 
N25 C20 VQD sing 437 n n 
C10 C09 VQD sing 438 n y 
C12 C13 VQD doub 439 n y 
O22 C21 VQD sing 440 n n 
C20 C21 VQD sing 441 n n 
C20 C19 VQD sing 442 n n 
C09 C08 VQD doub 443 n y 
C09 C14 VQD sing 444 n y 
C13 C14 VQD sing 445 n y 
C08 C07 VQD sing 446 n y 
C14 C15 VQD doub 447 n y 
C19 N36 VQD sing 448 n y 
C19 C18 VQD doub 449 n y 
N36 N37 VQD doub 450 n y 
C18 N17 VQD sing 451 n y 
C07 C06 VQD sing 452 n n 
C07 C16 VQD doub 453 n y 
C15 C16 VQD sing 454 n y 
N37 N17 VQD sing 455 n y 
N17 C05 VQD sing 456 n n 
C06 C05 VQD sing 457 n n 
C05 C04 VQD sing 458 n n 
C04 C03 VQD sing 459 n n 
C03 O38 VQD doub 460 n n 
C03 N02 VQD sing 461 n n 
N02 O01 VQD sing 462 n n 
C10 H1 VQD sing 463 n n 
C11 H2 VQD sing 464 n n 
C12 H3 VQD sing 465 n n 
C13 H4 VQD sing 466 n n 
C15 H5 VQD sing 467 n n 
C16 H6 VQD sing 468 n n 
C18 H7 VQD sing 469 n n 
C20 H8 VQD sing 470 n n 
C21 H9 VQD sing 471 n n 
C21 H10 VQD sing 472 n n 
C04 H11 VQD sing 473 n n 
C04 H12 VQD sing 474 n n 
C05 H13 VQD sing 475 n n 
C06 H14 VQD sing 476 n n 
C06 H15 VQD sing 477 n n 
C08 H16 VQD sing 478 n n 
C23 H17 VQD sing 479 n n 
C23 H18 VQD sing 480 n n 
C24 H19 VQD sing 481 n n 
C24 H20 VQD sing 482 n n 
C28 H21 VQD sing 483 n n 
C29 H22 VQD sing 484 n n 
C34 H23 VQD sing 485 n n 
N02 H24 VQD sing 486 n n 
O01 H25 VQD sing 487 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     7K1D 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.003783 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0.002184 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.004369 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.011054 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 2 ZN A 1 1101 1101 ZN ZN . 
D 3 VQD A 1 1102 5 VQD BDM . 
E 4 DIO A 1 1103 4 DIO DIO . 
F 4 DIO A 1 1104 5 DIO DIO . 
G 4 DIO A 1 1105 6 DIO DIO . 
H 5 EPE A 1 1106 2 EPE EPE . 
I 2 ZN B 1 1101 1101 ZN ZN . 
J 3 VQD B 1 1102 1 VQD BDM . 
K 4 DIO B 1 1103 1 DIO DIO . 
L 4 DIO B 1 1104 2 DIO DIO . 
M 4 DIO B 1 1105 3 DIO DIO . 
N 5 EPE B 1 1106 1 EPE EPE . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C C10 VQD . . . J 3 -80.053 -73.483 9.448 1 53.74 ? C10 VQD 1102 B 1 
HETATM 2 C C11 VQD . . . J 3 -78.813 -73.544 8.826 1 53.03 ? C11 VQD 1102 B 1 
HETATM 3 C C12 VQD . . . J 3 -77.642 -73.712 9.576 1 56 ? C12 VQD 1102 B 1 
HETATM 4 C C13 VQD . . . J 3 -77.707 -73.813 10.96 1 50.58 ? C13 VQD 1102 B 1 
HETATM 5 C C14 VQD . . . J 3 -78.979 -73.754 11.606 1 55.25 ? C14 VQD 1102 B 1 
HETATM 6 C C15 VQD . . . J 3 -79.049 -73.856 13.026 1 48.7 ? C15 VQD 1102 B 1 
HETATM 7 C C16 VQD . . . J 3 -80.287 -73.793 13.649 1 48.09 ? C16 VQD 1102 B 1 
HETATM 8 C C18 VQD . . . J 3 -83.951 -71.034 12.454 1 52.64 ? C18 VQD 1102 B 1 
HETATM 9 C C19 VQD . . . J 3 -83.613 -69.839 11.722 1 49.26 ? C19 VQD 1102 B 1 
HETATM 10 C C20 VQD . . . J 3 -84.367 -69.19 10.542 1 41.64 ? C20 VQD 1102 B 1 
HETATM 11 C C21 VQD . . . J 3 -85.869 -69.299 10.627 1 45.53 ? C21 VQD 1102 B 1 
HETATM 12 C C03 VQD . . . J 3 -83.621 -72.49 16.804 1 47.83 ? C03 VQD 1102 B 1 
HETATM 13 C C04 VQD . . . J 3 -84.052 -72.223 15.357 1 42.89 ? C04 VQD 1102 B 1 
HETATM 14 C C05 VQD . . . J 3 -82.895 -72.23 14.365 1 49.08 ? C05 VQD 1102 B 1 
HETATM 15 C C06 VQD . . . J 3 -82.801 -73.561 13.624 1 44.64 ? C06 VQD 1102 B 1 
HETATM 16 C C07 VQD . . . J 3 -81.459 -73.633 12.902 1 46.08 ? C07 VQD 1102 B 1 
HETATM 17 C C08 VQD . . . J 3 -81.402 -73.522 11.521 1 44.83 ? C08 VQD 1102 B 1 
HETATM 18 C C09 VQD . . . J 3 -80.128 -73.592 10.872 1 55.46 ? C09 VQD 1102 B 1 
HETATM 19 C C23 VQD . . . J 3 -85.753 -70.845 8.766 1 59.35 ? C23 VQD 1102 B 1 
HETATM 20 C C24 VQD . . . J 3 -84.229 -70.814 8.811 1 46.86 ? C24 VQD 1102 B 1 
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HETATM 22 C C27 VQD . . . J 3 -82.52 -68.934 7.142 1 49.03 ? C27 VQD 1102 B 1 
HETATM 23 C C28 VQD . . . J 3 -82.867 -68.098 6.104 1 51.52 ? C28 VQD 1102 B 1 
HETATM 24 C C29 VQD . . . J 3 -82.42 -68.367 4.832 1 59.18 ? C29 VQD 1102 B 1 
HETATM 25 C C30 VQD . . . J 3 -81.619 -69.476 4.617 1 58.08 ? C30 VQD 1102 B 1 
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HETATM 29 F F33 VQD . . . J 3 -80.484 -71.426 5.448 1 62.35 ? F33 VQD 1102 B 1 
HETATM 30 N N02 VQD . . . J 3 -84.048 -73.728 17.468 1 65.44 ? N02 VQD 1102 B 1 
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HETATM 33 N N36 VQD . . . J 3 -82.497 -69.371 12.271 1 49.12 ? N36 VQD 1102 B 1 
HETATM 34 N N37 VQD . . . J 3 -82.141 -70.175 13.25 1 49.3 ? N37 VQD 1102 B 1 
HETATM 35 O O01 VQD . . . J 3 -83.732 -74.101 18.795 1 51.73 ? O01 VQD 1102 B 1 
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HETATM 37 O O35 VQD . . . J 3 -82.843 -67.515 9.02 1 56.09 ? O35 VQD 1102 B 1 
HETATM 38 O O38 VQD . . . J 3 -82.958 -71.682 17.361 1 43.87 ? O38 VQD 1102 B 1 
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