data_7K5K
#
_model_server_result.job_id            lSk_js-25h2a8L5giAFDMw 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-18 16:28:05' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          7k5k 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"V","auth_seq_id":701}' 
#
_entry.id    7K5K 
#
_exptl.entry_id    7K5K 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              60.009 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CARBONATE ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    6 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            7K5K 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 7K5K 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    hexameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      6 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 G N N 
? 2 J N N 
? 2 M N N 
? 2 P N N 
? 2 S N N 
? 2 V N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A NZ LYS 318 A LYS 390 1_555 I MN MN . A MN 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.806 ? 
metalc ? metalc2 A OD2 ASP 323 A ASP 395 1_555 H MN MN . A MN 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.687 ? 
metalc ? metalc3 A OD2 ASP 323 A ASP 395 1_555 I MN MN . A MN 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.481 ? 
metalc ? metalc4 A OD2 ASP 343 A ASP 415 1_555 I MN MN . A MN 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.213 ? 
metalc ? metalc5 A O ASP 403 A ASP 475 1_555 H MN MN . A MN 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.722 ? 
metalc ? metalc6 A OD1 ASP 403 A ASP 475 1_555 H MN MN . A MN 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.843 ? 
metalc ? metalc7 A OE1 GLU 405 A GLU 477 1_555 H MN MN . A MN 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.485 ? 
metalc ? metalc8 A OE2 GLU 405 A GLU 477 1_555 I MN MN . A MN 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.595 ? 
metalc ? metalc9 B NZ LYS 318 B LYS 390 1_555 K MN MN . B MN 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.01 ? 
metalc ? metalc10 B OD2 ASP 323 B ASP 395 1_555 K MN MN . B MN 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.754 ? 
metalc ? metalc11 B OD2 ASP 323 B ASP 395 1_555 L MN MN . B MN 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.46 ? 
metalc ? metalc12 B OD2 ASP 343 B ASP 415 1_555 K MN MN . B MN 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.075 ? 
metalc ? metalc13 B O ASP 403 B ASP 475 1_555 L MN MN . B MN 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.811 ? 
metalc ? metalc14 B OD1 ASP 403 B ASP 475 1_555 L MN MN . B MN 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? 
metalc ? metalc15 B OE2 GLU 405 B GLU 477 1_555 K MN MN . B MN 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.759 ? 
metalc ? metalc16 B OE1 GLU 405 B GLU 477 1_555 L MN MN . B MN 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.581 ? 
metalc ? metalc17 C NZ LYS 318 C LYS 390 1_555 N MN MN . C MN 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.067 ? 
metalc ? metalc18 C OD2 ASP 323 C ASP 395 1_555 N MN MN . C MN 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.373 ? 
metalc ? metalc19 C OD2 ASP 323 C ASP 395 1_555 O MN MN . C MN 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.715 ? 
metalc ? metalc20 C OD2 ASP 343 C ASP 415 1_555 N MN MN . C MN 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.183 ? 
metalc ? metalc21 C O ASP 403 C ASP 475 1_555 O MN MN . C MN 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.75 ? 
metalc ? metalc22 C OD1 ASP 403 C ASP 475 1_555 O MN MN . C MN 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.824 ? 
metalc ? metalc23 C OE2 GLU 405 C GLU 477 1_555 N MN MN . C MN 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.589 ? 
metalc ? metalc24 C OE1 GLU 405 C GLU 477 1_555 O MN MN . C MN 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.454 ? 
metalc ? metalc25 D NZ LYS 318 D LYS 390 1_555 Q MN MN . D MN 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.071 ? 
metalc ? metalc26 D OD2 ASP 323 D ASP 395 1_555 Q MN MN . D MN 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.291 ? 
metalc ? metalc27 D OD2 ASP 323 D ASP 395 1_555 R MN MN . D MN 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.739 ? 
metalc ? metalc28 D OD2 ASP 343 D ASP 415 1_555 Q MN MN . D MN 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.115 ? 
metalc ? metalc29 D O ASP 403 D ASP 475 1_555 R MN MN . D MN 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.752 ? 
metalc ? metalc30 D OD1 ASP 403 D ASP 475 1_555 R MN MN . D MN 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.823 ? 
metalc ? metalc31 D OE2 GLU 405 D GLU 477 1_555 Q MN MN . D MN 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.589 ? 
metalc ? metalc32 D OE1 GLU 405 D GLU 477 1_555 R MN MN . D MN 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.454 ? 
metalc ? metalc33 E NZ LYS 318 E LYS 390 1_555 U MN MN . E MN 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.808 ? 
metalc ? metalc34 E OD2 ASP 323 E ASP 395 1_555 T MN MN . E MN 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.686 ? 
metalc ? metalc35 E OD2 ASP 323 E ASP 395 1_555 U MN MN . E MN 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.489 ? 
metalc ? metalc36 E OD2 ASP 343 E ASP 415 1_555 U MN MN . E MN 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.22 ? 
metalc ? metalc37 E O ASP 403 E ASP 475 1_555 T MN MN . E MN 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.722 ? 
metalc ? metalc38 E OD1 ASP 403 E ASP 475 1_555 T MN MN . E MN 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.842 ? 
metalc ? metalc39 E OE1 GLU 405 E GLU 477 1_555 T MN MN . E MN 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.485 ? 
metalc ? metalc40 E OE2 GLU 405 E GLU 477 1_555 U MN MN . E MN 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.595 ? 
metalc ? metalc41 F NZ LYS 318 F LYS 390 1_555 W MN MN . F MN 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.998 ? 
metalc ? metalc42 F OD2 ASP 323 F ASP 395 1_555 W MN MN . F MN 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.77 ? 
metalc ? metalc43 F OD2 ASP 323 F ASP 395 1_555 X MN MN . F MN 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.462 ? 
metalc ? metalc44 F OD2 ASP 343 F ASP 415 1_555 W MN MN . F MN 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.073 ? 
metalc ? metalc45 F O ASP 403 F ASP 475 1_555 X MN MN . F MN 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.811 ? 
metalc ? metalc46 F OD1 ASP 403 F ASP 475 1_555 X MN MN . F MN 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? 
metalc ? metalc47 F OE2 GLU 405 F GLU 477 1_555 W MN MN . F MN 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.758 ? 
metalc ? metalc48 F OE1 GLU 405 F GLU 477 1_555 X MN MN . F MN 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.581 ? 
#
_chem_comp.formula           'C O3 -2' 
_chem_comp.formula_weight    60.009 
_chem_comp.id                CO3 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CARBONATE ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C O1 CO3 doub 70 n n 
C O2 CO3 sing 71 n n 
C O3 CO3 sing 72 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     7K5K 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
G 2 CO3 A 1 701 601 CO3 CO3 . 
H 3 MN A 1 702 3 MN MN . 
I 3 MN A 1 703 4 MN MN . 
J 2 CO3 B 1 701 601 CO3 CO3 . 
K 3 MN B 1 702 5 MN MN . 
L 3 MN B 1 703 6 MN MN . 
M 2 CO3 C 1 701 601 CO3 CO3 . 
N 3 MN C 1 702 1 MN MN . 
O 3 MN C 1 703 2 MN MN . 
P 2 CO3 D 1 701 601 CO3 CO3 . 
Q 3 MN D 1 702 7 MN MN . 
R 3 MN D 1 703 8 MN MN . 
S 2 CO3 E 1 701 601 CO3 CO3 . 
T 3 MN E 1 702 9 MN MN . 
U 3 MN E 1 703 10 MN MN . 
V 2 CO3 F 1 701 601 CO3 CO3 . 
W 3 MN F 1 702 11 MN MN . 
X 3 MN F 1 703 12 MN MN . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C C CO3 . . . V 2 112.236 96.451 99.98 1 23.64 ? C CO3 701 F 1 
HETATM 2 O O1 CO3 . . . V 2 113.245 96.599 99.192 1 23.64 ? O1 CO3 701 F 1 
HETATM 3 O O2 CO3 . . . V 2 112.203 97.062 101.117 1 23.64 ? O2 CO3 701 F 1 
HETATM 4 O O3 CO3 . . . V 2 111.262 95.679 99.64 1 23.64 ? O3 CO3 701 F 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              12 
_model_server_stats.parse_time_ms           9 
_model_server_stats.create_model_time_ms    48 
_model_server_stats.query_time_ms           336 
_model_server_stats.encode_time_ms          2 
_model_server_stats.element_count           4 
#