data_7KCM # _model_server_result.job_id XX2ZsqtJzVgrmAYpW4mlWw _model_server_result.datetime_utc '2025-02-22 22:22:04' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7kcm # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":802}' # _entry.id 7KCM # _exptl.entry_id 7KCM _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7KCM _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7KCM _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 E N N ? 4 H N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OD1 ASN 66 A ASN 119 1_555 E MG MG . A MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.01 ? metalc ? metalc2 A O ASN 118 A ASN 171 1_555 F K K . A K 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.796 ? metalc ? metalc3 A O THR 121 A THR 174 1_555 F K K . A K 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.096 ? metalc ? metalc4 A O ARG 124 A ARG 177 1_555 F K K . A K 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.113 ? metalc ? metalc5 A O GLY 149 A GLY 202 1_555 F K K . A K 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.787 ? metalc ? metalc6 A OH TYR 153 A TYR 206 1_555 F K K . A K 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.86 ? metalc ? metalc7 D O3G ANP . A ANP 801 1_555 E MG MG . A MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.994 ? metalc ? metalc8 D O1B ANP . A ANP 801 1_555 E MG MG . A MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.118 ? metalc ? metalc9 D O2A ANP . A ANP 801 1_555 E MG MG . A MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.572 ? metalc ? metalc10 B OD1 ASN 66 B ASN 119 1_555 H MG MG . B MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? metalc ? metalc11 B O ASN 118 B ASN 171 1_555 I K K . B K 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.769 ? metalc ? metalc12 B O THR 121 B THR 174 1_555 I K K . B K 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.979 ? metalc ? metalc13 B O ARG 124 B ARG 177 1_555 I K K . B K 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.883 ? metalc ? metalc14 B O GLY 149 B GLY 202 1_555 I K K . B K 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.766 ? metalc ? metalc15 B OH TYR 153 B TYR 206 1_555 I K K . B K 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.858 ? metalc ? metalc16 G O3G ANP . B ANP 801 1_555 H MG MG . B MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? metalc ? metalc17 G O1B ANP . B ANP 801 1_555 H MG MG . B MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? metalc ? metalc18 G O2A ANP . B ANP 801 1_555 H MG MG . B MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.932 ? metalc ? metalc19 C SG CYS 67 C CYS 93 1_555 J FE2 FES . C FES 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? metalc ? metalc20 C SG CYS 72 C CYS 98 1_555 J FE2 FES . C FES 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? metalc ? metalc21 C SG CYS 75 C CYS 101 1_555 J FE1 FES . C FES 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? metalc ? metalc22 C SG CYS 87 C CYS 113 1_555 J FE1 FES . C FES 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 7KCM _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code D 3 ANP A 1 801 801 ANP ANP . E 4 MG A 1 802 805 MG MG . F 5 K A 1 803 901 K K . G 3 ANP B 1 801 801 ANP ANP . H 4 MG B 1 802 805 MG MG . I 5 K B 1 803 901 K K . J 6 FES C 1 201 330 FES FES . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id E _atom_site.label_entity_id 4 _atom_site.Cartn_x 148.148 _atom_site.Cartn_y 135.938 _atom_site.Cartn_z 154.081 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 46.79 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 802 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 16 _model_server_stats.parse_time_ms 26 _model_server_stats.create_model_time_ms 16 _model_server_stats.query_time_ms 280 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 1 #