data_7KGG
#
_model_server_result.job_id            FV9crVKqsIi8lF38En8KMA 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-03-05 18:38:46' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          7kgg 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"J","auth_seq_id":1103}' 
#
_entry.id    7KGG 
#
_exptl.entry_id    7KGG 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              314.404 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            ETHIDIUM 
_entity.pdbx_number_of_molecules    3 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            7KGG 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 7KGG 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    trimeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      3 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 J N N 
? 3 K N N 
? 3 L N N 
#
_chem_comp.formula           'C21 H20 N3 1' 
_chem_comp.formula_weight    314.404 
_chem_comp.id                ET 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              ETHIDIUM 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 C2 ET doub 83 n y 
C1 C13 ET sing 84 n y 
C1 H1 ET sing 85 n n 
C2 C3 ET sing 86 n y 
C2 H2 ET sing 87 n n 
C3 C4 ET doub 88 n y 
C3 N23 ET sing 89 n n 
C4 C14 ET sing 90 n y 
C4 H4 ET sing 91 n n 
N5 C6 ET doub 92 n y 
N5 C14 ET sing 93 n y 
N5 C21 ET sing 94 n n 
C6 C11 ET sing 95 n y 
C6 C15 ET sing 96 n y 
C7 C8 ET doub 97 n y 
C7 C11 ET sing 98 n y 
C7 H7 ET sing 99 n n 
C8 C9 ET sing 100 n y 
C8 N24 ET sing 101 n n 
C9 C10 ET doub 102 n y 
C9 H9 ET sing 103 n n 
C10 C12 ET sing 104 n y 
C10 H10 ET sing 105 n n 
C11 C12 ET doub 106 n y 
C12 C13 ET sing 107 n y 
C13 C14 ET doub 108 n y 
C15 C16 ET doub 109 n y 
C15 C20 ET sing 110 n y 
C16 C17 ET sing 111 n y 
C16 H16 ET sing 112 n n 
C17 C18 ET doub 113 n y 
C17 H17 ET sing 114 n n 
C18 C19 ET sing 115 n y 
C18 H18 ET sing 116 n n 
C19 C20 ET doub 117 n y 
C19 H19 ET sing 118 n n 
C20 H20 ET sing 119 n n 
C21 C22 ET sing 120 n n 
C21 H211 ET sing 121 n n 
C21 H212 ET sing 122 n n 
C22 H221 ET sing 123 n n 
C22 H222 ET sing 124 n n 
C22 H223 ET sing 125 n n 
N23 H231 ET sing 126 n n 
N23 H232 ET sing 127 n n 
N24 H241 ET sing 128 n n 
N24 H242 ET sing 129 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     7KGG 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
D 2 PTY A 1 1101 1101 PTY PTY . 
E 2 PTY A 1 1102 1102 PTY PTY . 
F 2 PTY B 1 1101 1101 PTY PTY . 
G 2 PTY B 1 1102 1102 PTY PTY . 
H 2 PTY C 1 1101 1101 PTY PTY . 
I 2 PTY C 1 1102 1102 PTY PTY . 
J 3 ET C 1 1103 1201 ET ET . 
K 3 ET C 1 1104 1202 ET ET . 
L 3 ET C 1 1105 1203 ET ET . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C C1 ET . . . J 3 198.367 148.621 166.201 1 29.92 ? C1 ET 1103 C 1 
HETATM 2 C C2 ET . . . J 3 199.022 148.323 165.026 1 29.92 ? C2 ET 1103 C 1 
HETATM 3 C C3 ET . . . J 3 198.671 148.966 163.819 1 29.92 ? C3 ET 1103 C 1 
HETATM 4 C C4 ET . . . J 3 197.654 149.899 163.898 1 29.92 ? C4 ET 1103 C 1 
HETATM 5 N N5 ET . . . J 3 195.964 151.154 165.135 1 29.92 ? N5 ET 1103 C 1 
HETATM 6 C C6 ET . . . J 3 195.294 151.476 166.266 1 29.92 ? C6 ET 1103 C 1 
HETATM 7 C C7 ET . . . J 3 194.887 151.21 168.7 1 29.92 ? C7 ET 1103 C 1 
HETATM 8 C C8 ET . . . J 3 195.153 150.632 169.939 1 29.92 ? C8 ET 1103 C 1 
HETATM 9 C C9 ET . . . J 3 196.184 149.661 169.973 1 29.92 ? C9 ET 1103 C 1 
HETATM 10 C C10 ET . . . J 3 196.87 149.327 168.823 1 29.92 ? C10 ET 1103 C 1 
HETATM 11 C C11 ET . . . J 3 195.597 150.86 167.523 1 29.92 ? C11 ET 1103 C 1 
HETATM 12 C C12 ET . . . J 3 196.623 149.895 167.548 1 29.92 ? C12 ET 1103 C 1 
HETATM 13 C C13 ET . . . J 3 197.322 149.563 166.328 1 29.92 ? C13 ET 1103 C 1 
HETATM 14 C C14 ET . . . J 3 196.991 150.195 165.12 1 29.92 ? C14 ET 1103 C 1 
HETATM 15 C C15 ET . . . J 3 194.236 152.49 166.136 1 29.92 ? C15 ET 1103 C 1 
HETATM 16 C C16 ET . . . J 3 194.431 153.797 166.582 1 29.92 ? C16 ET 1103 C 1 
HETATM 17 C C17 ET . . . J 3 193.416 154.743 166.452 1 29.92 ? C17 ET 1103 C 1 
HETATM 18 C C18 ET . . . J 3 192.193 154.403 165.878 1 29.92 ? C18 ET 1103 C 1 
HETATM 19 C C19 ET . . . J 3 191.996 153.103 165.435 1 29.92 ? C19 ET 1103 C 1 
HETATM 20 C C20 ET . . . J 3 193.008 152.154 165.565 1 29.92 ? C20 ET 1103 C 1 
HETATM 21 C C21 ET . . . J 3 195.611 151.819 163.834 1 29.92 ? C21 ET 1103 C 1 
HETATM 22 C C22 ET . . . J 3 196.147 153.244 163.722 1 29.92 ? C22 ET 1103 C 1 
HETATM 23 N N23 ET . . . J 3 199.336 148.665 162.623 1 29.92 ? N23 ET 1103 C 1 
HETATM 24 N N24 ET . . . J 3 194.475 150.957 171.104 1 29.92 ? N24 ET 1103 C 1 
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