data_7KJ4 # _model_server_result.job_id 8H9Zz63N424Nms5hZRmDRw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-21 11:19:50' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7kj4 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"NA","auth_seq_id":1310}' # _entry.id 7KJ4 # _exptl.entry_id 7KJ4 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 42 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7KJ4 _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7KJ4 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 6 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 EA N N ? 4 FA N N ? 4 GA N N ? 4 HA N N ? 4 IA N N ? 4 JA N N ? 4 KA N N ? 4 LA N N ? 4 MA N N ? 4 NA N N ? 4 OA N N ? 4 PA N N ? 4 QA N N ? 4 RA N N ? 4 SA N N ? 4 TA N N ? 4 UA N N ? 4 VA N N ? 4 WA N N ? 4 XA N N ? 4 YA N N ? 4 ZA N N ? 4 AB N N ? 4 BB N N ? 4 CB N N ? 4 DB N N ? 4 EB N N ? 4 FB N N ? 4 GB N N ? 4 HB N N ? 4 IB N N ? 4 JB N N ? 4 KB N N ? 4 LB N N ? 4 MB N N ? 4 NB N N ? 4 OB N N ? 4 PB N N ? 4 QB N N ? 4 RB N N ? 4 SB N N ? 4 TB N N # _pdbx_entity_branch.entity_id 3 _pdbx_entity_branch.type oligosaccharide # _pdbx_entity_branch_link.link_id 1 _pdbx_entity_branch_link.details ? _pdbx_entity_branch_link.entity_id 3 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 2 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 NAG _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 C1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 O1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 . _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 O4 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 HO4 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 . _pdbx_entity_branch_link.value_order sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 3 n G NAG 1 G 1 NAG A 1312 NAG 3 n G NAG 2 G 2 NAG A 1313 NAG 3 n H NAG 1 H 1 NAG A 1315 NAG 3 n H NAG 2 H 2 NAG A 1316 NAG 3 n I NAG 1 I 1 NAG A 1317 NAG 3 n I NAG 2 I 2 NAG A 1318 NAG 3 n J NAG 1 J 1 NAG B 1312 NAG 3 n J NAG 2 J 2 NAG B 1313 NAG 3 n K NAG 1 K 1 NAG B 1315 NAG 3 n K NAG 2 K 2 NAG B 1316 NAG 3 n L NAG 1 L 1 NAG B 1317 NAG 3 n L NAG 2 L 2 NAG B 1318 NAG 3 n M NAG 1 M 1 NAG C 1312 NAG 3 n M NAG 2 M 2 NAG C 1313 NAG 3 n N NAG 1 N 1 NAG C 1315 NAG 3 n N NAG 2 N 2 NAG C 1316 NAG 3 n O NAG 1 O 1 NAG C 1317 NAG 3 n O NAG 2 O 2 NAG C 1318 NAG 3 n P NAG 1 P 1 NAG D 901 NAG 3 n P NAG 2 P 2 NAG D 902 NAG 3 n Q NAG 1 Q 1 NAG D 903 NAG 3 n Q NAG 2 Q 2 NAG D 904 NAG 3 n R NAG 1 R 1 NAG D 905 NAG 3 n R NAG 2 R 2 NAG D 906 NAG 3 n S NAG 1 S 1 NAG D 908 NAG 3 n S NAG 2 S 2 NAG D 909 NAG 3 n T NAG 1 T 1 NAG D 910 NAG 3 n T NAG 2 T 2 NAG D 911 NAG 3 n U NAG 1 U 1 NAG E 901 NAG 3 n U NAG 2 U 2 NAG E 902 NAG 3 n V NAG 1 V 1 NAG E 903 NAG 3 n V NAG 2 V 2 NAG E 904 NAG 3 n W NAG 1 W 1 NAG E 905 NAG 3 n W NAG 2 W 2 NAG E 906 NAG 3 n X NAG 1 X 1 NAG E 908 NAG 3 n X NAG 2 X 2 NAG E 909 NAG 3 n Y NAG 1 Y 1 NAG E 910 NAG 3 n Y NAG 2 Y 2 NAG E 911 NAG 3 n Z NAG 1 Z 1 NAG F 901 NAG 3 n Z NAG 2 Z 2 NAG F 902 NAG 3 n AA NAG 1 a 1 NAG F 903 NAG 3 n AA NAG 2 a 2 NAG F 904 NAG 3 n BA NAG 1 b 1 NAG F 905 NAG 3 n BA NAG 2 b 2 NAG F 906 NAG 3 n CA NAG 1 c 1 NAG F 908 NAG 3 n CA NAG 2 c 2 NAG F 909 NAG 3 n DA NAG 1 d 1 NAG F 910 NAG 3 n DA NAG 2 d 2 NAG F 911 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 118 A CYS 131 1_555 A SG CYS 153 A CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 278 A CYS 291 1_555 A SG CYS 288 A CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.996 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 323 A CYS 336 1_555 A SG CYS 348 A CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 366 A CYS 379 1_555 A SG CYS 419 A CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 378 A CYS 391 1_555 A SG CYS 512 A CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 467 A CYS 480 1_555 A SG CYS 475 A CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 525 A CYS 538 1_555 A SG CYS 577 A CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 604 A CYS 617 1_555 A SG CYS 636 A CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 649 A CYS 662 1_555 A SG CYS 658 A CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 725 A CYS 738 1_555 A SG CYS 747 A CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 730 A CYS 743 1_555 A SG CYS 736 A CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 1019 A CYS 1032 1_555 A SG CYS 1030 A CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.017 ? disulf ? disulf13 A SG CYS 1069 A CYS 1082 1_555 A SG CYS 1113 A CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? disulf ? disulf14 B SG CYS 118 B CYS 131 1_555 B SG CYS 153 B CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.017 ? disulf ? disulf15 B SG CYS 278 B CYS 291 1_555 B SG CYS 288 B CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? disulf ? disulf16 B SG CYS 323 B CYS 336 1_555 B SG CYS 348 B CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.51 ? disulf ? disulf17 B SG CYS 366 B CYS 379 1_555 B SG CYS 419 B CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf18 B SG CYS 378 B CYS 391 1_555 B SG CYS 512 B CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf19 B SG CYS 467 B CYS 480 1_555 B SG CYS 475 B CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf20 B SG CYS 525 B CYS 538 1_555 B SG CYS 577 B CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf21 B SG CYS 604 B CYS 617 1_555 B SG CYS 636 B CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf22 B SG CYS 649 B CYS 662 1_555 B SG CYS 658 B CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf23 B SG CYS 725 B CYS 738 1_555 B SG CYS 747 B CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf24 B SG CYS 730 B CYS 743 1_555 B SG CYS 736 B CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf25 B SG CYS 1019 B CYS 1032 1_555 B SG CYS 1030 B CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? disulf ? disulf26 B SG CYS 1069 B CYS 1082 1_555 B SG CYS 1113 B CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.015 ? disulf ? disulf27 C SG CYS 118 C CYS 131 1_555 C SG CYS 153 C CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? disulf ? disulf28 C SG CYS 278 C CYS 291 1_555 C SG CYS 288 C CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.011 ? disulf ? disulf29 C SG CYS 323 C CYS 336 1_555 C SG CYS 348 C CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.73 ? disulf ? disulf30 C SG CYS 366 C CYS 379 1_555 C SG CYS 419 C CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf31 C SG CYS 378 C CYS 391 1_555 C SG CYS 512 C CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? disulf ? disulf32 C SG CYS 467 C CYS 480 1_555 C SG CYS 475 C CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf33 C SG CYS 525 C CYS 538 1_555 C SG CYS 577 C CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf34 C SG CYS 604 C CYS 617 1_555 C SG CYS 636 C CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf35 C SG CYS 649 C CYS 662 1_555 C SG CYS 658 C CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf36 C SG CYS 725 C CYS 738 1_555 C SG CYS 747 C CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? disulf ? disulf37 C SG CYS 730 C CYS 743 1_555 C SG CYS 736 C CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf38 C SG CYS 1019 C CYS 1032 1_555 C SG CYS 1030 C CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.009 ? disulf ? disulf39 C SG CYS 1069 C CYS 1082 1_555 C SG CYS 1113 C CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf40 D SG CYS 123 D CYS 133 1_555 D SG CYS 131 D CYS 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf41 D SG CYS 334 D CYS 344 1_555 D SG CYS 351 D CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf42 D SG CYS 520 D CYS 530 1_555 D SG CYS 532 D CYS 542 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.006 ? disulf ? disulf43 E SG CYS 123 E CYS 133 1_555 E SG CYS 131 E CYS 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.515 ? disulf ? disulf44 E SG CYS 334 E CYS 344 1_555 E SG CYS 351 E CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.065 ? disulf ? disulf45 E SG CYS 520 E CYS 530 1_555 E SG CYS 532 E CYS 542 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf46 F SG CYS 123 F CYS 133 1_555 F SG CYS 131 F CYS 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf47 F SG CYS 334 F CYS 344 1_555 F SG CYS 351 F CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? disulf ? disulf48 F SG CYS 520 F CYS 530 1_555 F SG CYS 532 F CYS 542 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 152 A ASN 165 1_555 QA C1 NAG . A NAG 1313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 269 A ASN 282 1_555 HA C1 NAG . A NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.298 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 318 A ASN 331 1_555 IA C1 NAG . A NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 644 A ASN 657 1_555 MA C1 NAG . A NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.409 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 696 A ASN 709 1_555 NA C1 NAG . A NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.506 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 704 A ASN 717 1_555 OA C1 NAG . A NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 788 A ASN 801 1_555 G C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 1121 A ASN 1134 1_555 I C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? covale ? covale9 B ND2 ASN 318 B ASN 331 1_555 VA C1 NAG . B NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale10 B ND2 ASN 603 B ASN 616 1_555 YA C1 NAG . B NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.288 ? covale ? covale11 B ND2 ASN 644 B ASN 657 1_555 ZA C1 NAG . B NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? covale ? covale12 B ND2 ASN 696 B ASN 709 1_555 AB C1 NAG . B NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale13 B ND2 ASN 704 B ASN 717 1_555 BB C1 NAG . B NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? covale ? covale14 B ND2 ASN 788 B ASN 801 1_555 J C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? covale ? covale15 B ND2 ASN 1085 B ASN 1098 1_555 K C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale16 B ND2 ASN 1121 B ASN 1134 1_555 L C1 NAG . L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.349 ? covale ? covale17 C ND2 ASN 269 C ASN 282 1_555 HB C1 NAG . C NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale18 C ND2 ASN 318 C ASN 331 1_555 IB C1 NAG . C NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.515 ? covale ? covale19 C ND2 ASN 603 C ASN 616 1_555 LB C1 NAG . C NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.46 ? covale ? covale20 C ND2 ASN 696 C ASN 709 1_555 NB C1 NAG . C NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale ? covale21 C ND2 ASN 788 C ASN 801 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale22 C ND2 ASN 1085 C ASN 1098 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale23 D ND2 ASN 43 D ASN 53 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.586 ? covale ? covale24 D ND2 ASN 80 D ASN 90 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.541 ? covale ? covale25 D ND2 ASN 93 D ASN 103 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.409 ? covale ? covale26 D ND2 ASN 312 D ASN 322 1_555 RB C1 NAG . D NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? covale ? covale27 D ND2 ASN 422 D ASN 432 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.543 ? covale ? covale28 E ND2 ASN 43 E ASN 53 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.223 ? covale ? covale29 E ND2 ASN 80 E ASN 90 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? covale ? covale30 E ND2 ASN 93 E ASN 103 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? covale ? covale31 E ND2 ASN 312 E ASN 322 1_555 SB C1 NAG . E NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale32 E ND2 ASN 422 E ASN 432 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? covale ? covale33 E ND2 ASN 536 E ASN 546 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale34 F ND2 ASN 43 F ASN 53 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale35 F ND2 ASN 80 F ASN 90 1_555 AA C1 NAG . a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.567 ? covale ? covale36 F ND2 ASN 536 F ASN 546 1_555 DA C1 NAG . d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.579 ? covale ? covale37 G O4 NAG . G NAG 1 1_555 G C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? covale ? covale38 H O4 NAG . H NAG 1 1_555 H C1 NAG . H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.501 ? covale ? covale39 I O4 NAG . I NAG 1 1_555 I C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ? covale ? covale40 J O4 NAG . J NAG 1 1_555 J C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.469 ? covale ? covale41 K O4 NAG . K NAG 1 1_555 K C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.474 ? covale ? covale42 L O4 NAG . L NAG 1 1_555 L C1 NAG . L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ? covale ? covale43 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.46 ? covale ? covale44 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.47 ? covale ? covale45 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ? covale ? covale46 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale47 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale48 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale49 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale50 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale51 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? covale ? covale52 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale53 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.464 ? covale ? covale54 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? covale ? covale55 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale56 Z O4 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.462 ? covale ? covale57 AA O4 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 NAG . a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale58 BA O4 NAG . b NAG 1 1_555 BA C1 NAG . b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale59 CA O4 NAG . c NAG 1 1_555 CA C1 NAG . c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale60 DA O4 NAG . d NAG 1 1_555 DA C1 NAG . d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 235 n n C1 O1 NAG sing 236 n n C1 O5 NAG sing 237 n n C1 H1 NAG sing 238 n n C2 C3 NAG sing 239 n n C2 N2 NAG sing 240 n n C2 H2 NAG sing 241 n n C3 C4 NAG sing 242 n n C3 O3 NAG sing 243 n n C3 H3 NAG sing 244 n n C4 C5 NAG sing 245 n n C4 O4 NAG sing 246 n n C4 H4 NAG sing 247 n n C5 C6 NAG sing 248 n n C5 O5 NAG sing 249 n n C5 H5 NAG sing 250 n n C6 O6 NAG sing 251 n n C6 H61 NAG sing 252 n n C6 H62 NAG sing 253 n n C7 C8 NAG sing 254 n n C7 N2 NAG sing 255 n n C7 O7 NAG doub 256 n n C8 H81 NAG sing 257 n n C8 H82 NAG sing 258 n n C8 H83 NAG sing 259 n n N2 HN2 NAG sing 260 n n O1 HO1 NAG sing 261 n n O3 HO3 NAG sing 262 n n O4 HO4 NAG sing 263 n n O6 HO6 NAG sing 264 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 7KJ4 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code EA 4 NAG A 1 1301 1301 NAG NAG . FA 4 NAG A 1 1302 1302 NAG NAG . GA 4 NAG A 1 1303 1303 NAG NAG . HA 4 NAG A 1 1304 1304 NAG NAG . IA 4 NAG A 1 1305 1305 NAG NAG . JA 4 NAG A 1 1306 1306 NAG NAG . KA 4 NAG A 1 1307 1307 NAG NAG . LA 4 NAG A 1 1308 1308 NAG NAG . MA 4 NAG A 1 1309 1309 NAG NAG . NA 4 NAG A 1 1310 1310 NAG NAG . OA 4 NAG A 1 1311 1311 NAG NAG . PA 4 NAG A 1 1312 1314 NAG NAG . QA 4 NAG A 1 1313 1319 NAG NAG . RA 4 NAG B 1 1301 1301 NAG NAG . SA 4 NAG B 1 1302 1302 NAG NAG . TA 4 NAG B 1 1303 1303 NAG NAG . UA 4 NAG B 1 1304 1304 NAG NAG . VA 4 NAG B 1 1305 1305 NAG NAG . WA 4 NAG B 1 1306 1306 NAG NAG . XA 4 NAG B 1 1307 1307 NAG NAG . YA 4 NAG B 1 1308 1308 NAG NAG . ZA 4 NAG B 1 1309 1309 NAG NAG . AB 4 NAG B 1 1310 1310 NAG NAG . BB 4 NAG B 1 1311 1311 NAG NAG . CB 4 NAG B 1 1312 1314 NAG NAG . DB 4 NAG B 1 1313 1319 NAG NAG . EB 4 NAG C 1 1301 1301 NAG NAG . FB 4 NAG C 1 1302 1302 NAG NAG . GB 4 NAG C 1 1303 1303 NAG NAG . HB 4 NAG C 1 1304 1304 NAG NAG . IB 4 NAG C 1 1305 1305 NAG NAG . JB 4 NAG C 1 1306 1306 NAG NAG . KB 4 NAG C 1 1307 1307 NAG NAG . LB 4 NAG C 1 1308 1308 NAG NAG . MB 4 NAG C 1 1309 1309 NAG NAG . NB 4 NAG C 1 1310 1310 NAG NAG . OB 4 NAG C 1 1311 1311 NAG NAG . PB 4 NAG C 1 1312 1314 NAG NAG . QB 4 NAG C 1 1313 1319 NAG NAG . RB 4 NAG D 1 701 907 NAG NAG . SB 4 NAG E 1 701 907 NAG NAG . TB 4 NAG F 1 701 907 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . NA 4 171.891 213.029 258.941 1 23.72 ? C1 NAG 1310 A 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . NA 4 172.458 214.292 259.701 1 23.85 ? C2 NAG 1310 A 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . NA 4 171.388 214.764 260.722 1 23.96 ? C3 NAG 1310 A 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . NA 4 170.08 215.109 259.963 1 24.02 ? C4 NAG 1310 A 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . NA 4 169.593 213.841 259.2 1 23.95 ? C5 NAG 1310 A 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . NA 4 168.332 214.11 258.388 1 24.38 ? C6 NAG 1310 A 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . NA 4 174.918 214.044 259.846 1 23.95 ? C7 NAG 1310 A 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . NA 4 176.086 213.595 260.668 1 24.16 ? C8 NAG 1310 A 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . NA 4 173.706 213.911 260.379 1 23.83 ? N2 NAG 1310 A 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . NA 4 171.868 215.926 261.413 1 24.15 ? O3 NAG 1310 A 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . NA 4 169.091 215.52 260.905 1 24.41 ? O4 NAG 1310 A 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . NA 4 170.645 213.379 258.272 1 23.78 ? O5 NAG 1310 A 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . NA 4 168.492 215.19 257.472 1 24.4 ? O6 NAG 1310 A 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . NA 4 175.082 214.504 258.707 1 23.97 ? O7 NAG 1310 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 24 _model_server_stats.parse_time_ms 12 _model_server_stats.create_model_time_ms 56 _model_server_stats.query_time_ms 282 _model_server_stats.encode_time_ms 7 _model_server_stats.element_count 14 #