data_7KMD # _model_server_result.job_id Xl0ycc-lgkbJH2wWS4YKWg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-17 12:24:10' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7kmd # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"Z","auth_seq_id":702}' # _entry.id 7KMD # _exptl.entry_id 7KMD _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 13 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 9 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 7KMD _cell.length_a 127.016 _cell.length_b 127.016 _cell.length_c 316.538 _cell.Z_PDB 6 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7KMD _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 173 _symmetry.space_group_name_Hall 'P 6c' _symmetry.space_group_name_H-M 'P 63' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 6 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 13 R N N ? 13 S N N ? 13 T N N ? 13 U N N ? 13 V N N ? 13 W N N ? 13 X N N ? 13 Y N N ? 13 Z N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 7 oligosaccharide 8 oligosaccharide 9 oligosaccharide 10 oligosaccharide 11 oligosaccharide 12 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 7 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 7 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 7 4 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 4 ? 7 5 4 MAN MAN C1 O1 . O6 HO6 . sing 5 ? 7 6 5 MAN MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 6 ? 7 7 4 MAN MAN C1 O1 . O3 HO3 . sing 7 ? 7 8 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 8 ? 7 9 8 MAN MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 9 ? 8 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 10 ? 9 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 11 ? 9 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 12 ? 10 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 13 ? 10 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 14 ? 10 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 15 ? 10 5 4 MAN MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 16 ? 10 6 5 MAN MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 17 ? 10 7 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 18 ? 10 8 7 MAN MAN C1 O1 . O3 HO3 . sing 19 ? 10 9 7 MAN MAN C1 O1 . O6 HO6 . sing 20 ? 11 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 21 ? 11 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 22 ? 11 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 23 ? 11 5 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 24 ? 12 1 2 NAG NAG C8 H81 . O6 HO6 . sing 25 ? 12 3 2 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 26 ? 12 4 3 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 27 ? 12 5 4 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 28 ? 12 6 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 7 n G NAG 1 B 1 NAG G 505 NAG 7 n G NAG 2 B 2 NAG G 506 NAG 7 n G BMA 3 B 3 BMA G 507 BMA 7 n G MAN 4 B 4 MAN G 509 MAN 7 n G MAN 5 B 5 MAN G 511 MAN 7 n G MAN 6 B 6 MAN G 512 MAN 7 n G MAN 7 B 7 MAN G 510 MAN 7 n G MAN 8 B 8 MAN G 508 MAN 7 n G MAN 9 B 9 MAN G 513 MAN 8 n H NAG 1 C 1 NAG G 515 NAG 8 n H NAG 2 C 2 NAG G 516 NAG 9 n I NAG 1 D 1 NAG G 519 NAG 9 n I NAG 2 D 2 NAG G 554 NAG 9 n I BMA 3 D 3 BMA G 555 BMA 8 n J NAG 1 F 1 NAG G 521 NAG 8 n J NAG 2 F 2 NAG G 522 NAG 10 n K NAG 1 I 1 NAG G 523 NAG 10 n K NAG 2 I 2 NAG G 524 NAG 10 n K BMA 3 I 3 BMA G 525 BMA 10 n K MAN 4 I 4 MAN G 530 MAN 10 n K MAN 5 I 5 MAN G 531 MAN 10 n K MAN 6 I 6 MAN G 532 MAN 10 n K MAN 7 I 7 MAN G 526 MAN 10 n K MAN 8 I 8 MAN G 529 MAN 10 n K MAN 9 I 9 MAN G 527 MAN 11 n L NAG 1 J 1 NAG G 534 NAG 11 n L NAG 2 J 2 NAG G 535 NAG 11 n L BMA 3 J 3 BMA G 536 BMA 11 n L MAN 4 J 4 MAN G 559 MAN 11 n L MAN 5 J 5 MAN G 537 MAN 12 n M NAG 1 K 1 NAG G 538 NAG 12 n M NAG 2 K 2 NAG G 540 NAG 12 n M NAG 3 K 3 NAG G 541 NAG 12 n M BMA 4 K 4 BMA G 542 BMA 12 n M MAN 5 K 5 MAN G 543 MAN 12 n M NAG 6 K 6 NAG G 539 NAG 9 n N NAG 1 M 1 NAG G 546 NAG 9 n N NAG 2 M 2 NAG G 547 NAG 9 n N BMA 3 M 3 BMA G 548 BMA 8 n O NAG 1 N 1 NAG G 552 NAG 8 n O NAG 2 N 2 NAG G 553 NAG 9 n P NAG 1 O 1 NAG G 560 NAG 9 n P NAG 2 O 2 NAG G 561 NAG 9 n P BMA 3 O 3 BMA G 562 BMA 9 n Q NAG 1 P 1 NAG T 665 NAG 9 n Q NAG 2 P 2 NAG T 666 NAG 9 n Q BMA 3 P 3 BMA T 670 BMA # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 22 A CYS 22 1_555 A SG CYS 104 A CYS 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 158 A CYS 158 1_555 A SG CYS 214 A CYS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf3 B SG CYS 22 E CYS 21 1_555 B SG CYS 90 E CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf4 B SG CYS 29 E CYS 28 1_555 B SG CYS 30 E CYS 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf5 B SG CYS 91 E CYS 90 1_555 B SG CYS 99 E CYS 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf6 B SG CYS 138 E CYS 137 1_555 B SG CYS 197 E CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf7 C SG CYS 23 G CYS 54 1_555 C SG CYS 43 G CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf8 C SG CYS 88 G CYS 119 1_555 C SG CYS 183 G CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf9 C SG CYS 95 G CYS 126 1_555 C SG CYS 174 G CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf10 C SG CYS 100 G CYS 131 1_555 C SG CYS 129 G CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf11 C SG CYS 196 G CYS 218 1_555 C SG CYS 225 G CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf12 C SG CYS 206 G CYS 228 1_555 C SG CYS 217 G CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf13 C SG CYS 274 G CYS 296 1_555 C SG CYS 308 G CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf14 C SG CYS 354 G CYS 377 1_555 C SG CYS 412 G CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf15 C SG CYS 361 G CYS 384 1_555 C SG CYS 385 G CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf16 C SG CYS 468 G CYS 501 1_555 D SG CYS 81 T CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf17 D SG CYS 74 T CYS 598 1_555 D SG CYS 80 T CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf18 E SG CYS 18 L CYS 17 1_555 E SG CYS 86 L CYS 85 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf19 E SG CYS 136 L CYS 135 1_555 E SG CYS 195 L CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf20 F SG CYS 22 H CYS 22 1_555 F SG CYS 95 H CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf21 F SG CYS 159 H CYS 138 1_555 F SG CYS 215 H CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? covale ? covale1 C ND2 ASN 57 G ASN 88 1_555 G C1 NAG . B NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale2 C ND2 ASN 99 G ASN 130 1_555 R C1 NAG . G NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale3 C ND2 ASN 128 G ASN 156 1_555 H C1 NAG . C NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale4 C ND2 ASN 132 G ASN 160 1_555 V C1 NAG . G NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale5 C ND2 ASN 175 G ASN 197 1_555 P C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale6 C ND2 ASN 208 G ASN 230 1_555 I C1 NAG . D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale7 C ND2 ASN 212 G ASN 234 1_555 J C1 NAG . F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale8 C ND2 ASN 219 G ASN 241 1_555 O C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale9 C ND2 ASN 240 G ASN 262 1_555 M C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale10 C ND2 ASN 254 G ASN 276 1_555 W C1 NAG . G NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale11 C ND2 ASN 267 G ASN 289 1_555 N C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale12 C ND2 ASN 273 G ASN 295 1_555 L C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale13 C ND2 ASN 279 G ASN 301 1_555 U C1 NAG . G NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale14 C ND2 ASN 309 G ASN 332 1_555 K C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale15 C ND2 ASN 368 G ASN 391 1_555 X C1 NAG . G NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale16 C ND2 ASN 380 G ASN 413 1_555 S C1 NAG . G NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale17 C ND2 ASN 409 G ASN 442 1_555 T C1 NAG . G NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale18 C ND2 ASN 415 G ASN 448 1_555 M C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale19 D ND2 ASN 87 T ASN 611 1_555 Y C1 NAG . T NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale20 D ND2 ASN 101 T ASN 625 1_555 Q C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale21 D ND2 ASN 113 T ASN 637 1_555 Z C1 NAG . T NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale22 G O4 NAG . B NAG 1 1_555 G C1 NAG . B NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.375 ? covale ? covale23 G O4 NAG . B NAG 2 1_555 G C1 BMA . B BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? covale ? covale24 G O6 BMA . B BMA 3 1_555 G C1 MAN . B MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.373 ? covale ? covale25 G O3 BMA . B BMA 3 1_555 G C1 MAN . B MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? covale ? covale26 G O6 MAN . B MAN 4 1_555 G C1 MAN . B MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? covale ? covale27 G O3 MAN . B MAN 4 1_555 G C1 MAN . B MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? covale ? covale28 G O2 MAN . B MAN 5 1_555 G C1 MAN . B MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? covale ? covale29 G O2 MAN . B MAN 8 1_555 G C1 MAN . B MAN 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.373 ? covale ? covale30 H O4 NAG . C NAG 1 1_555 H C1 NAG . C NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.375 ? covale ? covale31 I O4 NAG . D NAG 1 1_555 I C1 NAG . D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? covale ? covale32 I O4 NAG . D NAG 2 1_555 I C1 BMA . D BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? covale ? covale33 J O4 NAG . F NAG 1 1_555 J C1 NAG . F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.376 ? covale ? covale34 K O4 NAG . I NAG 1 1_555 K C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? covale ? covale35 K O4 NAG . I NAG 2 1_555 K C1 BMA . I BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? covale ? covale36 K O3 BMA . I BMA 3 1_555 K C1 MAN . I MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.373 ? covale ? covale37 K O6 BMA . I BMA 3 1_555 K C1 MAN . I MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? covale ? covale38 K O2 MAN . I MAN 4 1_555 K C1 MAN . I MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? covale ? covale39 K O2 MAN . I MAN 5 1_555 K C1 MAN . I MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? covale ? covale40 K O3 MAN . I MAN 7 1_555 K C1 MAN . I MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? covale ? covale41 K O6 MAN . I MAN 7 1_555 K C1 MAN . I MAN 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? covale ? covale42 L O4 NAG . J NAG 1 1_555 L C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? covale ? covale43 L O4 NAG . J NAG 2 1_555 L C1 BMA . J BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? covale ? covale44 L O3 BMA . J BMA 3 1_555 L C1 MAN . J MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.375 ? covale ? covale45 L O6 BMA . J BMA 3 1_555 L C1 MAN . J MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.375 ? covale ? covale46 M C8 NAG . K NAG 1 1_555 M O6 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? covale ? covale47 M O4 NAG . K NAG 1 1_555 M C1 NAG . K NAG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? covale ? covale48 M O4 NAG . K NAG 2 1_555 M C1 NAG . K NAG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.375 ? covale ? covale49 M O4 NAG . K NAG 3 1_555 M C1 BMA . K BMA 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.375 ? covale ? covale50 M O3 BMA . K BMA 4 1_555 M C1 MAN . K MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? covale ? covale51 N O4 NAG . M NAG 1 1_555 N C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.376 ? covale ? covale52 N O4 NAG . M NAG 2 1_555 N C1 BMA . M BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? covale ? covale53 O O4 NAG . N NAG 1 1_555 O C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.376 ? covale ? covale54 P O4 NAG . O NAG 1 1_555 P C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? covale ? covale55 P O4 NAG . O NAG 2 1_555 P C1 BMA . O BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? covale ? covale56 Q O4 NAG . P NAG 1 1_555 Q C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? covale ? covale57 Q O4 NAG . P NAG 2 1_555 Q C1 BMA . P BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 283 n n C1 O1 NAG sing 284 n n C1 O5 NAG sing 285 n n C1 H1 NAG sing 286 n n C2 C3 NAG sing 287 n n C2 N2 NAG sing 288 n n C2 H2 NAG sing 289 n n C3 C4 NAG sing 290 n n C3 O3 NAG sing 291 n n C3 H3 NAG sing 292 n n C4 C5 NAG sing 293 n n C4 O4 NAG sing 294 n n C4 H4 NAG sing 295 n n C5 C6 NAG sing 296 n n C5 O5 NAG sing 297 n n C5 H5 NAG sing 298 n n C6 O6 NAG sing 299 n n C6 H61 NAG sing 300 n n C6 H62 NAG sing 301 n n C7 C8 NAG sing 302 n n C7 N2 NAG sing 303 n n C7 O7 NAG doub 304 n n C8 H81 NAG sing 305 n n C8 H82 NAG sing 306 n n C8 H83 NAG sing 307 n n N2 HN2 NAG sing 308 n n O1 HO1 NAG sing 309 n n O3 HO3 NAG sing 310 n n O4 HO4 NAG sing 311 n n O6 HO6 NAG sing 312 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 7KMD _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.007873 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.004545 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.009091 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.003159 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code R 13 NAG G 1 601 514 NAG NAG . S 13 NAG G 1 602 533 NAG NAG . T 13 NAG G 1 603 544 NAG NAG . U 13 NAG G 1 604 545 NAG NAG . V 13 NAG G 1 605 549 NAG NAG . W 13 NAG G 1 606 550 NAG NAG . X 13 NAG G 1 607 551 NAG NAG . Y 13 NAG T 1 701 668 NAG NAG . Z 13 NAG T 1 702 669 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . Z 13 32.54 -48.485 -67.914 1 140.54 ? C1 NAG 702 T 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . Z 13 31.164 -48.897 -68.446 1 148.02 ? C2 NAG 702 T 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . Z 13 30.097 -48.718 -67.367 1 148.52 ? C3 NAG 702 T 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . Z 13 30.506 -49.443 -66.091 1 159.56 ? C4 NAG 702 T 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . Z 13 31.902 -49.005 -65.657 1 155.64 ? C5 NAG 702 T 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . Z 13 32.417 -49.77 -64.46 1 152.84 ? C6 NAG 702 T 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . Z 13 30.675 -46.833 -69.725 1 139.57 ? C7 NAG 702 T 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . Z 13 30.306 -46.285 -71.071 1 114.09 ? C8 NAG 702 T 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . Z 13 30.81 -48.164 -69.654 1 151.08 ? N2 NAG 702 T 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . Z 13 28.857 -49.231 -67.84 1 139.8 ? O3 NAG 702 T 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . Z 13 29.578 -49.157 -65.051 1 166.44 ? O4 NAG 702 T 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . Z 13 32.838 -49.224 -66.723 1 146.57 ? O5 NAG 702 T 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . Z 13 31.682 -49.456 -63.285 1 148.04 ? O6 NAG 702 T 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . Z 13 30.841 -46.102 -68.751 1 136.36 ? O7 NAG 702 T 1 # _model_server_stats.io_time_ms 74 _model_server_stats.parse_time_ms 27 _model_server_stats.create_model_time_ms 16 _model_server_stats.query_time_ms 227 _model_server_stats.encode_time_ms 13 _model_server_stats.element_count 14 #