data_7L09 # _model_server_result.job_id rm1Hn-bt4BwRiQMZk1Y4CA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-21 09:26:18' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7l09 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"TA","auth_seq_id":1204}' # _entry.id 7L09 # _exptl.entry_id 7L09 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 8 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 32 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7L09 _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7L09 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details heptameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 7 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 8 U N N ? 8 V N N ? 8 W N N ? 8 X N N ? 8 Y N N ? 8 Z N N ? 8 AA N N ? 8 BA N N ? 8 CA N N ? 8 DA N N ? 8 EA N N ? 8 FA N N ? 8 GA N N ? 8 HA N N ? 8 IA N N ? 8 JA N N ? 8 KA N N ? 8 LA N N ? 8 MA N N ? 8 NA N N ? 8 OA N N ? 8 PA N N ? 8 QA N N ? 8 RA N N ? 8 SA N N ? 8 TA N N ? 8 UA N N ? 8 VA N N ? 8 WA N N ? 8 XA N N ? 8 YA N N ? 8 ZA N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 4 oligosaccharide 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide 7 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 4 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 5 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 4 ? 5 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 5 ? 5 5 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 6 ? 6 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 7 ? 6 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 8 ? 6 4 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 9 ? 6 5 4 MAN MAN C1 O1 . O6 HO6 . sing 10 ? 6 6 5 MAN MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 11 ? 6 7 4 BMA MAN C1 O1 . O3 HO3 . sing 12 ? 6 8 3 BMA BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 13 ? 7 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 14 ? 7 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 15 ? 7 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 16 ? 7 5 3 BMA BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 4 n H NAG 1 D 1 NAG A 1 NAG 4 n H NAG 2 D 2 NAG A 2 NAG 5 n I NAG 1 E 1 NAG A 3 NAG 5 n I NAG 2 E 2 NAG A 4 NAG 5 n I BMA 3 E 3 BMA A 5 BMA 5 n I MAN 4 E 4 MAN A 6 MAN 5 n I MAN 5 E 5 MAN A 7 MAN 6 n J NAG 1 F 1 NAG A 8 NAG 6 n J NAG 2 F 2 NAG A 9 NAG 6 n J BMA 3 F 3 BMA A 10 BMA 6 n J MAN 4 F 4 MAN A 11 MAN 6 n J MAN 5 F 5 MAN A 12 MAN 6 n J MAN 6 F 6 MAN A 13 MAN 6 n J BMA 7 F 7 BMA A 14 BMA 6 n J BMA 8 F 8 BMA A 15 BMA 4 n K NAG 1 G 1 NAG A 16 NAG 4 n K NAG 2 G 2 NAG A 17 NAG 4 n L NAG 1 I 1 NAG B 7 NAG 4 n L NAG 2 I 2 NAG B 8 NAG 4 n M NAG 1 J 1 NAG B 1 NAG 4 n M NAG 2 J 2 NAG B 2 NAG 4 n N NAG 1 N 1 NAG B 3 NAG 4 n N NAG 2 N 2 NAG B 4 NAG 4 n O NAG 1 O 1 NAG B 5 NAG 4 n O NAG 2 O 2 NAG B 6 NAG 4 n P NAG 1 P 1 NAG C 1 NAG 4 n P NAG 2 P 2 NAG C 2 NAG 4 n Q NAG 1 Q 1 NAG C 3 NAG 4 n Q NAG 2 Q 2 NAG C 4 NAG 4 n R NAG 1 R 1 NAG C 5 NAG 4 n R NAG 2 R 2 NAG C 6 NAG 4 n S NAG 1 S 1 NAG C 7 NAG 4 n S NAG 2 S 2 NAG C 8 NAG 7 n T NAG 1 T 1 NAG C 9 NAG 7 n T NAG 2 T 2 NAG C 10 NAG 7 n T BMA 3 T 3 BMA C 11 BMA 7 n T MAN 4 T 4 MAN C 12 MAN 7 n T BMA 5 T 5 BMA C 13 BMA # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 105 A CYS 131 1_555 A SG CYS 140 A CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 265 A CYS 291 1_555 A SG CYS 275 A CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.116 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 310 A CYS 336 1_555 A SG CYS 335 A CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 353 A CYS 379 1_555 A SG CYS 406 A CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 365 A CYS 391 1_555 A SG CYS 499 A CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.088 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 512 A CYS 538 1_555 A SG CYS 564 A CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.062 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 591 A CYS 617 1_555 A SG CYS 623 A CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 636 A CYS 662 1_555 A SG CYS 645 A CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 712 A CYS 738 1_555 A SG CYS 734 A CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.883 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 717 A CYS 743 1_555 A SG CYS 723 A CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 1006 A CYS 1032 1_555 A SG CYS 1017 A CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.157 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 1056 A CYS 1082 1_555 A SG CYS 1100 A CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.005 ? disulf ? disulf13 B SG CYS 105 B CYS 131 1_555 B SG CYS 140 B CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf14 B SG CYS 265 B CYS 291 1_555 B SG CYS 275 B CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf15 B SG CYS 310 B CYS 336 1_555 B SG CYS 335 B CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf16 B SG CYS 353 B CYS 379 1_555 B SG CYS 406 B CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.05 ? disulf ? disulf17 B SG CYS 365 B CYS 391 1_555 B SG CYS 499 B CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? disulf ? disulf18 B SG CYS 512 B CYS 538 1_555 B SG CYS 564 B CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? disulf ? disulf19 B SG CYS 591 B CYS 617 1_555 B SG CYS 623 B CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf20 B SG CYS 636 B CYS 662 1_555 B SG CYS 645 B CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? disulf ? disulf21 B SG CYS 712 B CYS 738 1_555 B SG CYS 734 B CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf22 B SG CYS 717 B CYS 743 1_555 B SG CYS 723 B CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf23 B SG CYS 1006 B CYS 1032 1_555 B SG CYS 1017 B CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf24 B SG CYS 1056 B CYS 1082 1_555 B SG CYS 1100 B CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf25 C SG CYS 105 C CYS 131 1_555 C SG CYS 140 C CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf26 C SG CYS 265 C CYS 291 1_555 C SG CYS 275 C CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? disulf ? disulf27 C SG CYS 310 C CYS 336 1_555 C SG CYS 335 C CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf28 C SG CYS 353 C CYS 379 1_555 C SG CYS 406 C CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.05 ? disulf ? disulf29 C SG CYS 365 C CYS 391 1_555 C SG CYS 499 C CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? disulf ? disulf30 C SG CYS 512 C CYS 538 1_555 C SG CYS 564 C CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? disulf ? disulf31 C SG CYS 591 C CYS 617 1_555 C SG CYS 623 C CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf32 C SG CYS 636 C CYS 662 1_555 C SG CYS 645 C CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.057 ? disulf ? disulf33 C SG CYS 712 C CYS 738 1_555 C SG CYS 734 C CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf34 C SG CYS 717 C CYS 743 1_555 C SG CYS 723 C CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf35 C SG CYS 1006 C CYS 1032 1_555 C SG CYS 1017 C CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf36 C SG CYS 1056 C CYS 1082 1_555 C SG CYS 1100 C CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf37 D SG CYS 22 H CYS 22 1_555 D SG CYS 96 H CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? disulf ? disulf38 D SG CYS 152 H CYS 142 1_555 D SG CYS 208 H CYS 208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf39 E SG CYS 23 K CYS 23 1_555 E SG CYS 88 K CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.096 ? disulf ? disulf40 E SG CYS 134 K CYS 134 1_555 E SG CYS 194 K CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.063 ? disulf ? disulf41 F SG CYS 23 L CYS 23 1_555 F SG CYS 88 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.126 ? disulf ? disulf42 F SG CYS 134 L CYS 134 1_555 F SG CYS 194 L CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf43 G SG CYS 22 M CYS 22 1_555 G SG CYS 96 M CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.062 ? disulf ? disulf44 G SG CYS 152 M CYS 142 1_555 G SG CYS 208 M CYS 208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 35 A ASN 61 1_555 U C1 NAG . A NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.228 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 96 A ASN 122 1_555 V C1 NAG . A NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 139 A ASN 165 1_555 AA C1 NAG . A NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.525 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 256 A ASN 282 1_555 CA C1 NAG . A NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 305 A ASN 331 1_555 W C1 NAG . A NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.52 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 317 A ASN 343 1_555 X C1 NAG . A NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.508 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 590 A ASN 616 1_555 DA C1 NAG . A NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.502 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 631 A ASN 657 1_555 BA C1 NAG . A NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 683 A ASN 709 1_555 EA C1 NAG . A NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.524 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 691 A ASN 717 1_555 J C1 NAG . F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 775 A ASN 801 1_555 I C1 NAG . E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 1048 A ASN 1074 1_555 Z C1 NAG . A NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.423 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 1072 A ASN 1098 1_555 K C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? covale ? covale14 B ND2 ASN 35 B ASN 61 1_555 OA C1 NAG . B NAG 1210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.507 ? covale ? covale15 B ND2 ASN 96 B ASN 122 1_555 PA C1 NAG . B NAG 1211 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale16 B ND2 ASN 139 B ASN 165 1_555 NA C1 NAG . B NAG 1209 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.525 ? covale ? covale17 B ND2 ASN 256 B ASN 282 1_555 FA C1 NAG . B NAG 1201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale18 B ND2 ASN 305 B ASN 331 1_555 GA C1 NAG . B NAG 1202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? covale ? covale19 B ND2 ASN 317 B ASN 343 1_555 HA C1 NAG . B NAG 1203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.508 ? covale ? covale20 B ND2 ASN 577 B ASN 603 1_555 IA C1 NAG . B NAG 1204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.502 ? covale ? covale21 B ND2 ASN 590 B ASN 616 1_555 JA C1 NAG . B NAG 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? covale ? covale22 B ND2 ASN 631 B ASN 657 1_555 KA C1 NAG . B NAG 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? covale ? covale23 B ND2 ASN 683 B ASN 709 1_555 LA C1 NAG . B NAG 1207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.499 ? covale ? covale24 B ND2 ASN 691 B ASN 717 1_555 L C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.498 ? covale ? covale25 B ND2 ASN 775 B ASN 801 1_555 M C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ? covale ? covale26 B ND2 ASN 1048 B ASN 1074 1_555 MA C1 NAG . B NAG 1208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ? covale ? covale27 B ND2 ASN 1072 B ASN 1098 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale28 B ND2 ASN 1108 B ASN 1134 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? covale ? covale29 C ND2 ASN 35 C ASN 61 1_555 TA C1 NAG . C NAG 1204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.506 ? covale ? covale30 C ND2 ASN 96 C ASN 122 1_555 UA C1 NAG . C NAG 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale31 C ND2 ASN 139 C ASN 165 1_555 SA C1 NAG . C NAG 1203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.526 ? covale ? covale32 C ND2 ASN 256 C ASN 282 1_555 VA C1 NAG . C NAG 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? covale ? covale33 C ND2 ASN 305 C ASN 331 1_555 WA C1 NAG . C NAG 1207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.52 ? covale ? covale34 C ND2 ASN 317 C ASN 343 1_555 XA C1 NAG . C NAG 1208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.507 ? covale ? covale35 C ND2 ASN 577 C ASN 603 1_555 YA C1 NAG . C NAG 1209 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.502 ? covale ? covale36 C ND2 ASN 590 C ASN 616 1_555 ZA C1 NAG . C NAG 1210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ? covale ? covale37 C ND2 ASN 631 C ASN 657 1_555 QA C1 NAG . C NAG 1201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale38 C ND2 ASN 683 C ASN 709 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale39 C ND2 ASN 691 C ASN 717 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.499 ? covale ? covale40 C ND2 ASN 775 C ASN 801 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ? covale ? covale41 C ND2 ASN 1048 C ASN 1074 1_555 RA C1 NAG . C NAG 1202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ? covale ? covale42 C ND2 ASN 1072 C ASN 1098 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? covale ? covale43 C ND2 ASN 1108 C ASN 1134 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale44 H O4 NAG . D NAG 1 1_555 H C1 NAG . D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.515 ? covale ? covale45 I O4 NAG . E NAG 1 1_555 I C1 NAG . E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? covale ? covale46 I O4 NAG . E NAG 2 1_555 I C1 BMA . E BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? covale ? covale47 I O3 BMA . E BMA 3 1_555 I C1 MAN . E MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale48 I O6 BMA . E BMA 3 1_555 I C1 MAN . E MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? covale ? covale49 J O4 NAG . F NAG 1 1_555 J C1 NAG . F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale50 J O4 NAG . F NAG 2 1_555 J C1 BMA . F BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? covale ? covale51 J O6 BMA . F BMA 3 1_555 J C1 MAN . F MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? covale ? covale52 J O3 BMA . F BMA 3 1_555 J C1 BMA . F BMA 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.469 ? covale ? covale53 J O6 MAN . F MAN 4 1_555 J C1 MAN . F MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale54 J O3 MAN . F MAN 4 1_555 J C1 BMA . F BMA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? covale ? covale55 J O2 MAN . F MAN 5 1_555 J C1 MAN . F MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? covale ? covale56 K O4 NAG . G NAG 1 1_555 K C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale57 L O4 NAG . I NAG 1 1_555 L C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.499 ? covale ? covale58 M O4 NAG . J NAG 1 1_555 M C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.506 ? covale ? covale59 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.499 ? covale ? covale60 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale61 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.5 ? covale ? covale62 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.503 ? covale ? covale63 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.498 ? covale ? covale64 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.515 ? covale ? covale65 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale66 T O4 NAG . T NAG 2 1_555 T C1 BMA . T BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale67 T O3 BMA . T BMA 3 1_555 T C1 MAN . T MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale68 T O6 BMA . T BMA 3 1_555 T C1 BMA . T BMA 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 283 n n C1 O1 NAG sing 284 n n C1 O5 NAG sing 285 n n C1 H1 NAG sing 286 n n C2 C3 NAG sing 287 n n C2 N2 NAG sing 288 n n C2 H2 NAG sing 289 n n C3 C4 NAG sing 290 n n C3 O3 NAG sing 291 n n C3 H3 NAG sing 292 n n C4 C5 NAG sing 293 n n C4 O4 NAG sing 294 n n C4 H4 NAG sing 295 n n C5 C6 NAG sing 296 n n C5 O5 NAG sing 297 n n C5 H5 NAG sing 298 n n C6 O6 NAG sing 299 n n C6 H61 NAG sing 300 n n C6 H62 NAG sing 301 n n C7 C8 NAG sing 302 n n C7 N2 NAG sing 303 n n C7 O7 NAG doub 304 n n C8 H81 NAG sing 305 n n C8 H82 NAG sing 306 n n C8 H83 NAG sing 307 n n N2 HN2 NAG sing 308 n n O1 HO1 NAG sing 309 n n O3 HO3 NAG sing 310 n n O4 HO4 NAG sing 311 n n O6 HO6 NAG sing 312 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 7L09 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code U 8 NAG A 1 1301 1301 NAG NAG . V 8 NAG A 1 1302 1302 NAG NAG . W 8 NAG A 1 1303 1303 NAG NAG . X 8 NAG A 1 1304 1304 NAG NAG . Y 8 NAG A 1 1305 1305 NAG NAG . Z 8 NAG A 1 1306 1306 NAG NAG . AA 8 NAG A 1 1307 1307 NAG NAG . BA 8 NAG A 1 1308 1308 NAG NAG . CA 8 NAG A 1 1309 1309 NAG NAG . DA 8 NAG A 1 1310 1310 NAG NAG . EA 8 NAG A 1 1311 1311 NAG NAG . FA 8 NAG B 1 1201 1201 NAG NAG . GA 8 NAG B 1 1202 1202 NAG NAG . HA 8 NAG B 1 1203 1203 NAG NAG . IA 8 NAG B 1 1204 1204 NAG NAG . JA 8 NAG B 1 1205 1205 NAG NAG . KA 8 NAG B 1 1206 1206 NAG NAG . LA 8 NAG B 1 1207 1207 NAG NAG . MA 8 NAG B 1 1208 1208 NAG NAG . NA 8 NAG B 1 1209 1209 NAG NAG . OA 8 NAG B 1 1210 1210 NAG NAG . PA 8 NAG B 1 1211 1211 NAG NAG . QA 8 NAG C 1 1201 1201 NAG NAG . RA 8 NAG C 1 1202 1202 NAG NAG . SA 8 NAG C 1 1203 1203 NAG NAG . TA 8 NAG C 1 1204 1204 NAG NAG . UA 8 NAG C 1 1205 1205 NAG NAG . VA 8 NAG C 1 1206 1206 NAG NAG . WA 8 NAG C 1 1207 1207 NAG NAG . XA 8 NAG C 1 1208 1208 NAG NAG . YA 8 NAG C 1 1209 1209 NAG NAG . ZA 8 NAG C 1 1210 1210 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . TA 8 124.09 146.978 192.293 1 182.35 ? C1 NAG 1204 C 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . TA 8 124.926 146.458 191.056 1 182.35 ? C2 NAG 1204 C 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . TA 8 124.192 146.898 189.761 1 182.35 ? C3 NAG 1204 C 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . TA 8 122.754 146.312 189.76 1 182.35 ? C4 NAG 1204 C 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . TA 8 121.998 146.826 191.022 1 182.35 ? C5 NAG 1204 C 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . TA 8 120.596 146.243 191.143 1 182.35 ? C6 NAG 1204 C 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . TA 8 127.351 146.449 191.585 1 182.35 ? C7 NAG 1204 C 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . TA 8 128.647 147.203 191.523 1 182.35 ? C8 NAG 1204 C 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . TA 8 126.275 147.047 191.081 1 182.35 ? N2 NAG 1204 C 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . TA 8 124.915 146.412 188.617 1 182.35 ? O3 NAG 1204 C 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . TA 8 122.075 146.732 188.576 1 182.35 ? O4 NAG 1204 C 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . TA 8 122.738 146.431 192.234 1 182.35 ? O5 NAG 1204 C 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . TA 8 119.834 146.933 192.126 1 182.35 ? O6 NAG 1204 C 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . TA 8 127.287 145.321 192.094 1 182.35 ? O7 NAG 1204 C 1 # _model_server_stats.io_time_ms 21 _model_server_stats.parse_time_ms 17 _model_server_stats.create_model_time_ms 43 _model_server_stats.query_time_ms 291 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 14 #