data_7L0Z # _model_server_result.job_id g2ByJWZPhK-gp4_6mqxDzw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-20 00:45:23' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7l0z # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":104}' # _entry.id 7L0Z # _exptl.entry_id 7L0Z _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 202.34 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description SPERMINE _entity.pdbx_number_of_molecules 3 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 91.364 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7L0Z _cell.length_a 150.564 _cell.length_b 48.692 _cell.length_c 30.612 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7L0Z _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 5 _symmetry.space_group_name_Hall 'C 2y' _symmetry.space_group_name_H-M 'C 1 2 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 C N N ? 3 D N N ? 3 E N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A O6 G 15 G G 15 1_555 K K K . G K 110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.245 ? metalc ? metalc2 A O6 G 15 G G 15 1_555 L K K . G K 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.745 ? metalc ? metalc3 A O6 G 16 G G 16 1_555 K K K . G K 110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.578 ? metalc ? metalc4 A OP2 G 19 G G 19 1_555 I NA NA . G NA 108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.398 ? metalc ? metalc5 A O6 G 19 G G 19 1_555 K K K . G K 110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.275 ? metalc ? metalc6 A O6 G 19 G G 19 1_555 L K K . G K 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.988 ? metalc ? metalc7 A O6 G 20 G G 20 1_555 K K K . G K 110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.497 ? metalc ? metalc8 A O2' A 32 G A 32 1_555 J NA NA . G NA 109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.446 ? metalc ? metalc9 A O2' A 32 G A 32 1_555 J NA NA . G NA 109 2_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.446 ? metalc ? metalc10 A O6 G 46 G G 46 1_555 K K K . G K 110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.769 ? metalc ? metalc11 A O6 G 49 G G 49 1_555 K K K . G K 110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.65 ? metalc ? metalc12 A O6 G 49 G G 49 1_555 L K K . G K 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.925 ? metalc ? metalc13 A O6 G 51 G G 51 1_555 K K K . G K 110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.708 ? metalc ? metalc14 A O6 G 53 G G 53 1_555 K K K . G K 110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.37 ? metalc ? metalc15 A O6 G 53 G G 53 1_555 L K K . G K 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.005 ? metalc ? metalc16 A O2' U 54 G U 54 1_555 L K K . G K 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.106 ? metalc ? metalc17 A O2 U 54 G U 54 1_555 L K K . G K 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.828 ? metalc ? metalc18 A O6 G 55 G G 55 1_555 L K K . G K 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.858 ? metalc ? metalc19 F MG MG . G MG 105 1_555 G O1 PO4 . G PO4 106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.955 ? metalc ? metalc20 F MG MG . G MG 105 1_555 G O1 PO4 . G PO4 106 2_456 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.955 ? metalc ? metalc21 F MG MG . G MG 105 1_555 H O1 PO4 . G PO4 107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.484 ? metalc ? metalc22 F MG MG . G MG 105 1_555 H O4 PO4 . G PO4 107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.622 ? metalc ? metalc23 F MG MG . G MG 105 1_555 H O1 PO4 . G PO4 107 2_456 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.484 ? metalc ? metalc24 F MG MG . G MG 105 1_555 H O4 PO4 . G PO4 107 2_456 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.622 ? metalc ? metalc25 I NA NA . G NA 108 1_555 M O HOH . G HOH 211 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.61 ? metalc ? metalc26 I NA NA . G NA 108 1_555 M O HOH . G HOH 235 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.092 ? metalc ? metalc27 L K K . G K 111 1_555 M O HOH . G HOH 234 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.98 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 A N1 G 1 G G 1 1_555 A N3 C 69 G C 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 A N2 G 1 G G 1 1_555 A O2 C 69 G C 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 A O6 G 1 G G 1 1_555 A N4 C 69 G C 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 A N1 G 2 G G 2 1_555 A N3 C 68 G C 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 A N2 G 2 G G 2 1_555 A O2 C 68 G C 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 A O6 G 2 G G 2 1_555 A N4 C 68 G C 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 A N1 G 3 G G 3 1_555 A N3 C 67 G C 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 A N2 G 3 G G 3 1_555 A O2 C 67 G C 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 A O6 G 3 G G 3 1_555 A N4 C 67 G C 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 A N1 A 4 G A 4 1_555 A N3 U 66 G U 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 A N6 A 4 G A 4 1_555 A O4 U 66 G U 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 A N1 G 5 G G 5 1_555 A N3 C 65 G C 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 A N2 G 5 G G 5 1_555 A O2 C 65 G C 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 A O6 G 5 G G 5 1_555 A N4 C 65 G C 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 A N3 U 6 G U 6 1_555 A N1 A 64 G A 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 A O4 U 6 G U 6 1_555 A N6 A 64 G A 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 A N1 A 7 G A 7 1_555 A N3 U 63 G U 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 A N6 A 7 G A 7 1_555 A O4 U 63 G U 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 A N3 C 8 G C 8 1_555 A N1 G 62 G G 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 A N4 C 8 G C 8 1_555 A O6 G 62 G G 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 A O2 C 8 G C 8 1_555 A N2 G 62 G G 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 A N1 G 9 G G 9 1_555 A N3 C 61 G C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 A N2 G 9 G G 9 1_555 A O2 C 61 G C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 A O6 G 9 G G 9 1_555 A N4 C 61 G C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 A N1 G 10 G G 10 1_555 A N3 C 60 G C 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 A N2 G 10 G G 10 1_555 A O2 C 60 G C 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 A O6 G 10 G G 10 1_555 A N4 C 60 G C 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_16_PAIR hydrog28 A N3 U 11 G U 11 1_555 A O4 U 59 G U 59 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_16_PAIR hydrog29 A O2 U 11 G U 11 1_555 A N3 U 59 G U 59 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 A N1 G 12 G G 12 1_555 A N3 C 58 G C 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 A N2 G 12 G G 12 1_555 A O2 C 58 G C 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 A O6 G 12 G G 12 1_555 A N4 C 58 G C 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_8_PAIR hydrog33 A N1 A 13 G A 13 1_555 A N1 G 57 G G 57 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_8_PAIR hydrog34 A N6 A 13 G A 13 1_555 A O6 G 57 G G 57 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-G MISPAIR' hydrog35 A N2 G 14 G G 14 1_555 A O6 G 56 G G 56 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog36 A N1 G 15 G G 15 1_555 A O6 G 19 G G 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog37 A N2 G 15 G G 15 1_555 A N7 G 19 G G 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog38 A N7 G 15 G G 15 1_555 A N2 G 49 G G 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog39 A O6 G 15 G G 15 1_555 A N1 G 49 G G 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog40 A N1 G 16 G G 16 1_555 A O6 G 20 G G 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog41 A N2 G 16 G G 16 1_555 A N7 G 20 G G 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog42 A N7 G 16 G G 16 1_555 A N2 G 46 G G 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog43 A O6 G 16 G G 16 1_555 A N1 G 46 G G 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'C-U MISPAIR' hydrog44 A N4 C 18 G C 18 1_555 A O4 U 47 G U 47 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 A N3 C 18 G C 18 1_555 A N1 G 55 G G 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 A N4 C 18 G C 18 1_555 A O6 G 55 G G 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 A O2 C 18 G C 18 1_555 A N2 G 55 G G 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog48 A N1 G 19 G G 19 1_555 A O6 G 53 G G 53 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog49 A N2 G 19 G G 19 1_555 A N7 G 53 G G 53 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog50 A N1 G 20 G G 20 1_555 A O6 G 51 G G 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog51 A N2 G 20 G G 20 1_555 A N7 G 51 G G 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 A N3 U 22 G U 22 1_555 A N1 A 45 G A 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 A O4 U 22 G U 22 1_555 A N6 A 45 G A 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 A N3 C 23 G C 23 1_555 A N1 G 44 G G 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog55 A N4 C 23 G C 23 1_555 A O6 G 44 G G 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog56 A O2 C 23 G C 23 1_555 A N2 G 44 G G 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 A N3 C 24 G C 24 1_555 A N1 G 41 G G 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog58 A N4 C 24 G C 24 1_555 A O6 G 41 G G 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog59 A O2 C 24 G C 24 1_555 A N2 G 41 G G 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog60 A N1 A 25 G A 25 1_555 A N3 U 40 G U 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog61 A N6 A 25 G A 25 1_555 A O4 U 40 G U 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog62 A N1 G 26 G G 26 1_555 A N3 C 39 G C 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog63 A N2 G 26 G G 26 1_555 A O2 C 39 G C 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog64 A O6 G 26 G G 26 1_555 A N4 C 39 G C 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog65 A N3 U 27 G U 27 1_555 A N1 A 38 G A 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog66 A O4 U 27 G U 27 1_555 A N6 A 38 G A 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog67 A N1 A 28 G A 28 1_555 A N3 U 37 G U 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog68 A N6 A 28 G A 28 1_555 A O4 U 37 G U 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog69 A N1 G 29 G G 29 1_555 A N3 C 36 G C 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog70 A N2 G 29 G G 29 1_555 A O2 C 36 G C 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog71 A O6 G 29 G G 29 1_555 A N4 C 36 G C 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog72 A N1 G 30 G G 30 1_555 A N3 C 35 G C 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog73 A N2 G 30 G G 30 1_555 A O2 C 35 G C 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog74 A O6 G 30 G G 30 1_555 A N4 C 35 G C 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'U-G MISPAIR' hydrog75 A O2 U 31 G U 31 1_555 A N1 G 34 G G 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog HOOGSTEEN hydrog76 A N3 U 42 G U 42 1_555 A N7 A 45 G A 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog HOOGSTEEN hydrog77 A O4 U 42 G U 42 1_555 A N6 A 45 G A 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog78 A N7 G 46 G G 46 1_555 A N2 G 51 G G 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog79 A O6 G 46 G G 46 1_555 A N1 G 51 G G 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'U-U MISPAIR' hydrog80 A O2 U 47 G U 47 1_555 A N3 U 54 G U 54 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog81 A N7 G 49 G G 49 1_555 A N2 G 53 G G 53 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog82 A O6 G 49 G G 49 1_555 A N1 G 53 G G 53 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'C10 H26 N4' _chem_comp.formula_weight 202.34 _chem_comp.id SPM _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name SPERMINE _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag N1 C2 SPM sing 154 n n N1 HN11 SPM sing 155 n n N1 HN12 SPM sing 156 n n C2 C3 SPM sing 157 n n C2 H21 SPM sing 158 n n C2 H22 SPM sing 159 n n C3 C4 SPM sing 160 n n C3 H31 SPM sing 161 n n C3 H32 SPM sing 162 n n C4 N5 SPM sing 163 n n C4 H41 SPM sing 164 n n C4 H42 SPM sing 165 n n N5 C6 SPM sing 166 n n N5 HN5 SPM sing 167 n n C6 C7 SPM sing 168 n n C6 H61 SPM sing 169 n n C6 H62 SPM sing 170 n n C7 C8 SPM sing 171 n n C7 H71 SPM sing 172 n n C7 H72 SPM sing 173 n n C8 C9 SPM sing 174 n n C8 H81 SPM sing 175 n n C8 H82 SPM sing 176 n n C9 N10 SPM sing 177 n n C9 H91 SPM sing 178 n n C9 H92 SPM sing 179 n n N10 C11 SPM sing 180 n n N10 HN0 SPM sing 181 n n C11 C12 SPM sing 182 n n C11 H111 SPM sing 183 n n C11 H112 SPM sing 184 n n C12 C13 SPM sing 185 n n C12 H121 SPM sing 186 n n C12 H122 SPM sing 187 n n C13 N14 SPM sing 188 n n C13 H131 SPM sing 189 n n C13 H132 SPM sing 190 n n N14 HN41 SPM sing 191 n n N14 HN42 SPM sing 192 n n # _atom_sites.entry_id 7L0Z _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.006642 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000158 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.020537 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.032676 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 2ZY G 1 101 101 2ZY 2ZY . C 3 SPM G 1 102 102 SPM SPM . D 3 SPM G 1 103 103 SPM SPM . E 3 SPM G 1 104 104 SPM SPM . F 4 MG G 1 105 105 MG MG . G 5 PO4 G 1 106 106 PO4 PO4 . H 5 PO4 G 1 107 107 PO4 PO4 . I 6 NA G 1 108 108 NA NA . J 6 NA G 1 109 109 NA NA . K 7 K G 1 110 110 K K . L 7 K G 1 111 111 K K . M 8 HOH G 1 201 201 HOH HOH . M 8 HOH G 2 202 202 HOH HOH . M 8 HOH G 3 203 203 HOH HOH . M 8 HOH G 4 204 204 HOH HOH . M 8 HOH G 5 205 205 HOH HOH . M 8 HOH G 6 206 206 HOH HOH . M 8 HOH G 7 207 207 HOH HOH . M 8 HOH G 8 208 208 HOH HOH . M 8 HOH G 9 209 209 HOH HOH . M 8 HOH G 10 210 210 HOH HOH . M 8 HOH G 11 211 211 HOH HOH . M 8 HOH G 12 212 212 HOH HOH . M 8 HOH G 13 213 213 HOH HOH . M 8 HOH G 14 214 214 HOH HOH . M 8 HOH G 15 215 215 HOH HOH . M 8 HOH G 16 216 216 HOH HOH . M 8 HOH G 17 217 217 HOH HOH . M 8 HOH G 18 218 218 HOH HOH . M 8 HOH G 19 219 219 HOH HOH . M 8 HOH G 20 220 220 HOH HOH . M 8 HOH G 21 221 221 HOH HOH . M 8 HOH G 22 222 222 HOH HOH . M 8 HOH G 23 223 223 HOH HOH . M 8 HOH G 24 224 224 HOH HOH . M 8 HOH G 25 225 225 HOH HOH . M 8 HOH G 26 226 226 HOH HOH . M 8 HOH G 27 227 227 HOH HOH . M 8 HOH G 28 228 228 HOH HOH . M 8 HOH G 29 229 229 HOH HOH . M 8 HOH G 30 230 230 HOH HOH . M 8 HOH G 31 231 231 HOH HOH . M 8 HOH G 32 232 232 HOH HOH . M 8 HOH G 33 233 233 HOH HOH . M 8 HOH G 34 234 234 HOH HOH . M 8 HOH G 35 235 235 HOH HOH . M 8 HOH G 36 236 236 HOH HOH . M 8 HOH G 37 237 237 HOH HOH . M 8 HOH G 38 238 238 HOH HOH . M 8 HOH G 39 239 239 HOH HOH . M 8 HOH G 40 240 240 HOH HOH . M 8 HOH G 41 241 241 HOH HOH . M 8 HOH G 42 242 242 HOH HOH . M 8 HOH G 43 243 243 HOH HOH . M 8 HOH G 44 244 244 HOH HOH . M 8 HOH G 45 245 245 HOH HOH . M 8 HOH G 46 246 246 HOH HOH . M 8 HOH G 47 247 247 HOH HOH . M 8 HOH G 48 248 248 HOH HOH . M 8 HOH G 49 249 249 HOH HOH . M 8 HOH G 50 250 250 HOH HOH . M 8 HOH G 51 251 251 HOH HOH . M 8 HOH G 52 252 252 HOH HOH . M 8 HOH G 53 253 253 HOH HOH . M 8 HOH G 54 254 254 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 N N1 SPM . . . E 3 -49.44 -6.002 -7.991 1 69.4 ? N1 SPM 104 G 1 HETATM 2 C C2 SPM . . . E 3 -48.636 -4.889 -8.455 1 66.91 ? C2 SPM 104 G 1 HETATM 3 C C3 SPM . . . E 3 -47.677 -4.439 -7.357 1 64.86 ? C3 SPM 104 G 1 HETATM 4 C C4 SPM . . . E 3 -46.954 -3.142 -7.714 1 62.59 ? C4 SPM 104 G 1 HETATM 5 N N5 SPM . . . E 3 -46.533 -2.466 -6.501 1 60.42 ? N5 SPM 104 G 1 HETATM 6 C C6 SPM . . . E 3 -45.904 -1.192 -6.812 1 57.4 ? C6 SPM 104 G 1 HETATM 7 C C7 SPM . . . E 3 -45.015 -0.754 -5.651 1 54.33 ? C7 SPM 104 G 1 HETATM 8 C C8 SPM . . . E 3 -45.122 0.745 -5.336 1 51.23 ? C8 SPM 104 G 1 HETATM 9 C C9 SPM . . . E 3 -44.019 1.198 -4.389 1 48.65 ? C9 SPM 104 G 1 HETATM 10 N N10 SPM . . . E 3 -44.366 2.427 -3.676 1 46.89 ? N10 SPM 104 G 1 HETATM 11 C C11 SPM . . . E 3 -43.284 2.842 -2.788 1 44.76 ? C11 SPM 104 G 1 HETATM 12 C C12 SPM . . . E 3 -43.427 4.316 -2.376 1 43.55 ? C12 SPM 104 G 1 HETATM 13 C C13 SPM . . . E 3 -42.073 4.981 -2.074 1 42.29 ? C13 SPM 104 G 1 HETATM 14 N N14 SPM . . . E 3 -42.177 6.23 -1.303 1 41.15 ? N14 SPM 104 G 1 # _model_server_stats.io_time_ms 10 _model_server_stats.parse_time_ms 16 _model_server_stats.create_model_time_ms 4 _model_server_stats.query_time_ms 221 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 14 #