data_7L87 # _model_server_result.job_id 5S4Zsw4SlJzf0mRucH0rvg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-17 14:43:24' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7l87 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"HB","auth_seq_id":701}' # _entry.id 7L87 # _exptl.entry_id 7L87 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 9 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 13 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 8 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 9 VA N N ? 9 WA N N ? 9 XA N N ? 9 YA N N ? 9 ZA N N ? 9 AB N N ? 9 BB N N ? 9 CB N N ? 9 DB N N ? 9 EB N N ? 9 FB N N ? 9 GB N N ? 9 HB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide 7 oligosaccharide 8 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 6 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 6 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 4 ? 6 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 5 ? 7 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 6 ? 7 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 7 ? 8 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 8 ? 8 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 9 ? 8 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 10 ? 8 5 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 5 n I NAG 1 G 1 NAG C 601 NAG 5 n I NAG 2 G 2 NAG C 602 NAG 5 n J NAG 1 I 1 NAG C 606 NAG 5 n J NAG 2 I 2 NAG C 607 NAG 5 n K NAG 1 J 1 NAG C 609 NAG 5 n K NAG 2 J 2 NAG C 610 NAG 5 n L NAG 1 K 1 NAG C 611 NAG 5 n L NAG 2 K 2 NAG C 648 NAG 6 n M NAG 1 M 1 NAG C 612 NAG 6 n M NAG 2 M 2 NAG C 613 NAG 6 n M BMA 3 M 3 BMA C 614 BMA 6 n M MAN 4 M 4 MAN C 615 MAN 5 n N NAG 1 N 1 NAG C 618 NAG 5 n N NAG 2 N 2 NAG C 619 NAG 5 n O NAG 1 O 1 NAG C 620 NAG 5 n O NAG 2 O 2 NAG C 621 NAG 5 n P NAG 1 P 1 NAG C 623 NAG 5 n P NAG 2 P 2 NAG C 649 NAG 7 n Q NAG 1 Q 1 NAG C 624 NAG 7 n Q NAG 2 Q 2 NAG C 625 NAG 7 n Q BMA 3 Q 3 BMA C 626 BMA 5 n R NAG 1 R 1 NAG C 635 NAG 5 n R NAG 2 R 2 NAG C 636 NAG 5 n S NAG 1 S 1 NAG C 637 NAG 5 n S NAG 2 S 2 NAG C 638 NAG 5 n T NAG 1 T 1 NAG C 643 NAG 5 n T NAG 2 T 2 NAG C 644 NAG 5 n U NAG 1 U 1 NAG C 645 NAG 5 n U NAG 2 U 2 NAG C 646 NAG 5 n V NAG 1 V 1 NAG A 601 NAG 5 n V NAG 2 V 2 NAG A 602 NAG 5 n W NAG 1 W 1 NAG A 606 NAG 5 n W NAG 2 W 2 NAG A 607 NAG 5 n X NAG 1 X 1 NAG A 609 NAG 5 n X NAG 2 X 2 NAG A 610 NAG 5 n Y NAG 1 Y 1 NAG A 611 NAG 5 n Y NAG 2 Y 2 NAG A 648 NAG 8 n Z NAG 1 Z 1 NAG A 612 NAG 8 n Z NAG 2 Z 2 NAG A 613 NAG 8 n Z BMA 3 Z 3 BMA A 614 BMA 8 n Z MAN 4 Z 4 MAN A 615 MAN 8 n Z MAN 5 Z 5 MAN A 617 MAN 5 n AA NAG 1 a 1 NAG A 618 NAG 5 n AA NAG 2 a 2 NAG A 619 NAG 5 n BA NAG 1 b 1 NAG A 620 NAG 5 n BA NAG 2 b 2 NAG A 621 NAG 5 n CA NAG 1 c 1 NAG A 623 NAG 5 n CA NAG 2 c 2 NAG A 649 NAG 7 n DA NAG 1 d 1 NAG A 624 NAG 7 n DA NAG 2 d 2 NAG A 625 NAG 7 n DA BMA 3 d 3 BMA A 626 BMA 5 n EA NAG 1 e 1 NAG A 635 NAG 5 n EA NAG 2 e 2 NAG A 636 NAG 5 n FA NAG 1 f 1 NAG A 637 NAG 5 n FA NAG 2 f 2 NAG A 638 NAG 5 n GA NAG 1 g 1 NAG A 643 NAG 5 n GA NAG 2 g 2 NAG A 644 NAG 5 n HA NAG 1 h 1 NAG A 645 NAG 5 n HA NAG 2 h 2 NAG A 646 NAG 5 n IA NAG 1 i 1 NAG D 601 NAG 5 n IA NAG 2 i 2 NAG D 602 NAG 5 n JA NAG 1 j 1 NAG D 606 NAG 5 n JA NAG 2 j 2 NAG D 607 NAG 5 n KA NAG 1 k 1 NAG D 609 NAG 5 n KA NAG 2 k 2 NAG D 610 NAG 5 n LA NAG 1 l 1 NAG D 611 NAG 5 n LA NAG 2 l 2 NAG D 648 NAG 8 n MA NAG 1 m 1 NAG D 612 NAG 8 n MA NAG 2 m 2 NAG D 613 NAG 8 n MA BMA 3 m 3 BMA D 614 BMA 8 n MA MAN 4 m 4 MAN D 615 MAN 8 n MA MAN 5 m 5 MAN D 617 MAN 5 n NA NAG 1 n 1 NAG D 618 NAG 5 n NA NAG 2 n 2 NAG D 619 NAG 5 n OA NAG 1 o 1 NAG D 620 NAG 5 n OA NAG 2 o 2 NAG D 621 NAG 5 n PA NAG 1 p 1 NAG D 623 NAG 5 n PA NAG 2 p 2 NAG D 649 NAG 7 n QA NAG 1 q 1 NAG D 624 NAG 7 n QA NAG 2 q 2 NAG D 625 NAG 7 n QA BMA 3 q 3 BMA D 626 BMA 5 n RA NAG 1 r 1 NAG D 635 NAG 5 n RA NAG 2 r 2 NAG D 636 NAG 5 n SA NAG 1 s 1 NAG D 637 NAG 5 n SA NAG 2 s 2 NAG D 638 NAG 5 n TA NAG 1 t 1 NAG D 643 NAG 5 n TA NAG 2 t 2 NAG D 644 NAG 5 n UA NAG 1 u 1 NAG D 645 NAG 5 n UA NAG 2 u 2 NAG D 646 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 C SG CYS 51 C CYS 54 1_555 C SG CYS 71 C CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? disulf ? disulf2 C SG CYS 116 C CYS 119 1_555 C SG CYS 202 C CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? disulf ? disulf3 C SG CYS 123 C CYS 126 1_555 C SG CYS 193 C CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf4 C SG CYS 128 C CYS 131 1_555 C SG CYS 146 C CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf5 C SG CYS 215 C CYS 218 1_555 C SG CYS 244 C CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf6 C SG CYS 225 C CYS 228 1_555 C SG CYS 236 C CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf7 C SG CYS 293 C CYS 296 1_555 C SG CYS 327 C CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf8 C SG CYS 374 C CYS 378 1_555 C SG CYS 440 C CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf9 C SG CYS 381 C CYS 385 1_555 C SG CYS 413 C CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf10 C SG CYS 496 C CYS 501 1_555 D SG CYS 87 E CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf11 D SG CYS 80 E CYS 598 1_555 D SG CYS 86 E CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf12 E SG CYS 51 A CYS 54 1_555 E SG CYS 71 A CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf13 E SG CYS 116 A CYS 119 1_555 E SG CYS 202 A CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf14 E SG CYS 123 A CYS 126 1_555 E SG CYS 193 A CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf15 E SG CYS 128 A CYS 131 1_555 E SG CYS 146 A CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf16 E SG CYS 215 A CYS 218 1_555 E SG CYS 244 A CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf17 E SG CYS 225 A CYS 228 1_555 E SG CYS 236 A CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf18 E SG CYS 293 A CYS 296 1_555 E SG CYS 327 A CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf19 E SG CYS 374 A CYS 378 1_555 E SG CYS 440 A CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf20 E SG CYS 381 A CYS 385 1_555 E SG CYS 413 A CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? disulf ? disulf21 E SG CYS 496 A CYS 501 1_555 F SG CYS 87 B CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf22 F SG CYS 80 B CYS 598 1_555 F SG CYS 86 B CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf23 G SG CYS 51 D CYS 54 1_555 G SG CYS 71 D CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf24 G SG CYS 116 D CYS 119 1_555 G SG CYS 202 D CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.067 ? disulf ? disulf25 G SG CYS 123 D CYS 126 1_555 G SG CYS 193 D CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf26 G SG CYS 128 D CYS 131 1_555 G SG CYS 146 D CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf27 G SG CYS 215 D CYS 218 1_555 G SG CYS 244 D CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf28 G SG CYS 225 D CYS 228 1_555 G SG CYS 236 D CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf29 G SG CYS 293 D CYS 296 1_555 G SG CYS 327 D CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf30 G SG CYS 374 D CYS 378 1_555 G SG CYS 440 D CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf31 G SG CYS 381 D CYS 385 1_555 G SG CYS 413 D CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? disulf ? disulf32 G SG CYS 496 D CYS 501 1_555 H SG CYS 87 F CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf33 H SG CYS 80 F CYS 598 1_555 H SG CYS 86 F CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? covale ? covale1 C ND2 ASN 85 C ASN 88 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.513 ? covale ? covale2 C ND2 ASN 130 C ASN 133 1_555 I C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.513 ? covale ? covale3 C ND2 ASN 145 C ASN 156 1_555 J C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale4 C ND2 ASN 149 C ASN 160 1_555 VA C1 NAG . C NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.524 ? covale ? covale5 C ND2 ASN 194 C ASN 197 1_555 K C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ? covale ? covale6 C ND2 ASN 231 C ASN 234 1_555 L C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale ? covale7 C ND2 ASN 259 C ASN 262 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale8 C ND2 ASN 273 C ASN 276 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? covale ? covale9 C ND2 ASN 292 C ASN 295 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.418 ? covale ? covale10 C ND2 ASN 298 C ASN 301 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ? covale ? covale11 C ND2 ASN 328 C ASN 332 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? covale ? covale12 C ND2 ASN 335 C ASN 339 1_555 WA C1 NAG . C NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.524 ? covale ? covale13 C ND2 ASN 351 C ASN 355 1_555 XA C1 NAG . C NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale14 C ND2 ASN 382 C ASN 386 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.515 ? covale ? covale15 C ND2 ASN 388 C ASN 392 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale16 C ND2 ASN 443 C ASN 448 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale17 D ND2 ASN 93 E ASN 611 1_555 YA C1 NAG . E NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? covale ? covale18 E ND2 ASN 85 A ASN 88 1_555 HA C1 NAG . h NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ? covale ? covale19 E ND2 ASN 130 A ASN 133 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? covale ? covale20 E ND2 ASN 134 A ASN 137 1_555 BB C1 NAG . A NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? covale ? covale21 E ND2 ASN 145 A ASN 156 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale22 E ND2 ASN 149 A ASN 160 1_555 ZA C1 NAG . A NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? covale ? covale23 E ND2 ASN 194 A ASN 197 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? covale ? covale24 E ND2 ASN 231 A ASN 234 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.507 ? covale ? covale25 E ND2 ASN 259 A ASN 262 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.515 ? covale ? covale26 E ND2 ASN 273 A ASN 276 1_555 AA C1 NAG . a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.524 ? covale ? covale27 E ND2 ASN 292 A ASN 295 1_555 BA C1 NAG . b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.52 ? covale ? covale28 E ND2 ASN 298 A ASN 301 1_555 CA C1 NAG . c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.528 ? covale ? covale29 E ND2 ASN 328 A ASN 332 1_555 DA C1 NAG . d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ? covale ? covale30 E ND2 ASN 335 A ASN 339 1_555 AB C1 NAG . A NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.527 ? covale ? covale31 E ND2 ASN 351 A ASN 355 1_555 CB C1 NAG . A NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale32 E ND2 ASN 382 A ASN 386 1_555 EA C1 NAG . e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.52 ? covale ? covale33 E ND2 ASN 388 A ASN 392 1_555 FA C1 NAG . f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? covale ? covale34 E ND2 ASN 443 A ASN 448 1_555 GA C1 NAG . g NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.528 ? covale ? covale35 F ND2 ASN 93 B ASN 611 1_555 DB C1 NAG . B NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale36 G ND2 ASN 85 D ASN 88 1_555 UA C1 NAG . u NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.515 ? covale ? covale37 G ND2 ASN 130 D ASN 133 1_555 IA C1 NAG . i NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.515 ? covale ? covale38 G ND2 ASN 134 D ASN 137 1_555 GB C1 NAG . D NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale39 G ND2 ASN 145 D ASN 156 1_555 JA C1 NAG . j NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale40 G ND2 ASN 149 D ASN 160 1_555 EB C1 NAG . D NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.516 ? covale ? covale41 G ND2 ASN 194 D ASN 197 1_555 KA C1 NAG . k NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.516 ? covale ? covale42 G ND2 ASN 231 D ASN 234 1_555 LA C1 NAG . l NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.498 ? covale ? covale43 G ND2 ASN 259 D ASN 262 1_555 MA C1 NAG . m NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.516 ? covale ? covale44 G ND2 ASN 273 D ASN 276 1_555 NA C1 NAG . n NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.517 ? covale ? covale45 G ND2 ASN 292 D ASN 295 1_555 OA C1 NAG . o NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? covale ? covale46 G ND2 ASN 298 D ASN 301 1_555 PA C1 NAG . p NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? covale ? covale47 G ND2 ASN 328 D ASN 332 1_555 QA C1 NAG . q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? covale ? covale48 G ND2 ASN 335 D ASN 339 1_555 FB C1 NAG . D NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.525 ? covale ? covale49 G ND2 ASN 382 D ASN 386 1_555 RA C1 NAG . r NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.515 ? covale ? covale50 G ND2 ASN 388 D ASN 392 1_555 SA C1 NAG . s NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? covale ? covale51 G ND2 ASN 443 D ASN 448 1_555 TA C1 NAG . t NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ? covale ? covale52 H ND2 ASN 93 F ASN 611 1_555 HB C1 NAG . F NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.517 ? covale ? covale53 I O4 NAG . G NAG 1 1_555 I C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale54 J O4 NAG . I NAG 1 1_555 J C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.499 ? covale ? covale55 K O4 NAG . J NAG 1 1_555 K C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.508 ? covale ? covale56 L O4 NAG . K NAG 1 1_555 L C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? covale ? covale57 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale58 M O4 NAG . M NAG 2 1_555 M C1 BMA . M BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale59 M O3 BMA . M BMA 3 1_555 M C1 MAN . M MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale60 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? covale ? covale61 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.424 ? covale ? covale62 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale63 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale64 Q O4 NAG . Q NAG 2 1_555 Q C1 BMA . Q BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.513 ? covale ? covale65 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.501 ? covale ? covale66 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale67 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? covale ? covale68 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? covale ? covale69 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ? covale ? covale70 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale71 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ? covale ? covale72 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.501 ? covale ? covale73 Z O4 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.516 ? covale ? covale74 Z O4 NAG . Z NAG 2 1_555 Z C1 BMA . Z BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale75 Z O3 BMA . Z BMA 3 1_555 Z C1 MAN . Z MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? covale ? covale76 Z O6 BMA . Z BMA 3 1_555 Z C1 MAN . Z MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? covale ? covale77 AA O4 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 NAG . a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.518 ? covale ? covale78 BA O4 NAG . b NAG 1 1_555 BA C1 NAG . b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.508 ? covale ? covale79 CA O4 NAG . c NAG 1 1_555 CA C1 NAG . c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? covale ? covale80 DA O4 NAG . d NAG 1 1_555 DA C1 NAG . d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale81 DA O4 NAG . d NAG 2 1_555 DA C1 BMA . d BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.525 ? covale ? covale82 EA O4 NAG . e NAG 1 1_555 EA C1 NAG . e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.502 ? covale ? covale83 FA O4 NAG . f NAG 1 1_555 FA C1 NAG . f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.53 ? covale ? covale84 GA O4 NAG . g NAG 1 1_555 GA C1 NAG . g NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? covale ? covale85 HA O4 NAG . h NAG 1 1_555 HA C1 NAG . h NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? covale ? covale86 IA O4 NAG . i NAG 1 1_555 IA C1 NAG . i NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? covale ? covale87 JA O4 NAG . j NAG 1 1_555 JA C1 NAG . j NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? covale ? covale88 KA O4 NAG . k NAG 1 1_555 KA C1 NAG . k NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? covale ? covale89 LA O4 NAG . l NAG 1 1_555 LA C1 NAG . l NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ? covale ? covale90 MA O4 NAG . m NAG 1 1_555 MA C1 NAG . m NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? covale ? covale91 MA O4 NAG . m NAG 2 1_555 MA C1 BMA . m BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ? covale ? covale92 MA O3 BMA . m BMA 3 1_555 MA C1 MAN . m MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.52 ? covale ? covale93 MA O6 BMA . m BMA 3 1_555 MA C1 MAN . m MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? covale ? covale94 NA O4 NAG . n NAG 1 1_555 NA C1 NAG . n NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.516 ? covale ? covale95 OA O4 NAG . o NAG 1 1_555 OA C1 NAG . o NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.513 ? covale ? covale96 PA O4 NAG . p NAG 1 1_555 PA C1 NAG . p NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.503 ? covale ? covale97 QA O4 NAG . q NAG 1 1_555 QA C1 NAG . q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale98 QA O4 NAG . q NAG 2 1_555 QA C1 BMA . q BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.525 ? covale ? covale99 RA O4 NAG . r NAG 1 1_555 RA C1 NAG . r NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ? covale ? covale100 SA O4 NAG . s NAG 1 1_555 SA C1 NAG . s NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? covale ? covale101 TA O4 NAG . t NAG 1 1_555 TA C1 NAG . t NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? covale ? covale102 UA O4 NAG . u NAG 1 1_555 UA C1 NAG . u NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.517 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 283 n n C1 O1 NAG sing 284 n n C1 O5 NAG sing 285 n n C1 H1 NAG sing 286 n n C2 C3 NAG sing 287 n n C2 N2 NAG sing 288 n n C2 H2 NAG sing 289 n n C3 C4 NAG sing 290 n n C3 O3 NAG sing 291 n n C3 H3 NAG sing 292 n n C4 C5 NAG sing 293 n n C4 O4 NAG sing 294 n n C4 H4 NAG sing 295 n n C5 C6 NAG sing 296 n n C5 O5 NAG sing 297 n n C5 H5 NAG sing 298 n n C6 O6 NAG sing 299 n n C6 H61 NAG sing 300 n n C6 H62 NAG sing 301 n n C7 C8 NAG sing 302 n n C7 N2 NAG sing 303 n n C7 O7 NAG doub 304 n n C8 H81 NAG sing 305 n n C8 H82 NAG sing 306 n n C8 H83 NAG sing 307 n n N2 HN2 NAG sing 308 n n O1 HO1 NAG sing 309 n n O3 HO3 NAG sing 310 n n O4 HO4 NAG sing 311 n n O6 HO6 NAG sing 312 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 7L87 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code VA 9 NAG C 1 601 608 NAG NAG . WA 9 NAG C 1 602 634 NAG NAG . XA 9 NAG C 1 603 650 NAG NAG . YA 9 NAG E 1 701 762 NAG NAG . ZA 9 NAG A 1 601 608 NAG NAG . AB 9 NAG A 1 602 634 NAG NAG . BB 9 NAG A 1 603 650 NAG NAG . CB 9 NAG A 1 604 651 NAG NAG . DB 9 NAG B 1 701 762 NAG NAG . EB 9 NAG D 1 601 608 NAG NAG . FB 9 NAG D 1 602 634 NAG NAG . GB 9 NAG D 1 603 650 NAG NAG . HB 9 NAG F 1 701 762 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . HB 9 186.377 153.828 150.873 1 58 ? C1 NAG 701 F 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . HB 9 187.682 154.217 150.043 1 56.69 ? C2 NAG 701 F 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . HB 9 188.567 152.935 149.885 1 58.13 ? C3 NAG 701 F 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . HB 9 188.936 152.369 151.301 1 61.49 ? C4 NAG 701 F 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . HB 9 187.613 152.05 152.093 1 58.8 ? C5 NAG 701 F 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . HB 9 187.869 151.589 153.534 1 62.59 ? C6 NAG 701 F 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . HB 9 187.083 156.042 148.444 1 60.44 ? C7 NAG 701 F 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . HB 9 186.615 156.49 147.087 1 59.21 ? C8 NAG 701 F 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . HB 9 187.242 154.728 148.711 1 57.1 ? N2 NAG 701 F 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . HB 9 189.776 153.283 149.183 1 56.87 ? O3 NAG 701 F 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . HB 9 189.7 151.17 151.136 1 60.64 ? O4 NAG 701 F 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . HB 9 186.77 153.277 152.183 1 57.4 ? O5 NAG 701 F 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . HB 9 188.499 152.586 154.34 1 62.63 ? O6 NAG 701 F 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . HB 9 187.312 156.905 149.308 1 56.56 ? O7 NAG 701 F 1 # _model_server_stats.io_time_ms 15 _model_server_stats.parse_time_ms 16 _model_server_stats.create_model_time_ms 28 _model_server_stats.query_time_ms 350 _model_server_stats.encode_time_ms 43 _model_server_stats.element_count 14 #